Pytania 2011
1.Jakie uszkodzenia są u pacjentów po radioterapii -> DSB, naprawiane przez HR, NHEJ, SSA
2. Jak można zbadać uszkodzenia w Xeroderma pigmentosum?
-UDS- niezaplanowana synteza DNA
- test na przeżywalność na UV
3. Schemat HR i NHEJ
a) podpisać białka
b) czynniki indukujące DSB:
- endogenne np. zatrzymanie widełek w czasie replikacji
-egzogenne np. prom. X
-fizjologiczne np. V(D)J rekombinacja
c) białka rozpoznające DSB, wspólne dla HR i NHEJ gama-H2AX
4. I etap biotransformacji
-opisać enzymy
- od czego zależy
-konsekwencje biotransformacji
5. uszkodzeni wprowadzane do proliferującej komórki
- DSB powstające w czasie załamania widełek replikacyjnych naprawiane tylko przez HR!!
-uszkodzenia naprawiane przez TLS i MMR!!! (systemy odpowiedzialne za naprawę uszkodzeń w czasie replikacji
6. o czym świadczy wysoki poziom foci gama-H2AX - o poziomie DSB i sprawności naprawy DSB, ale nie wskazuje czy w naprawę jest zaangażowane HR czy NHEJ
7. wymienić choroby z niestabilnością chromosomową : AT, ATLD, NBS, FA, BS, WRN i heterozygoty BRCA1/2 i opisać jedną z nich na poziomie pacjenta, komórki i genetycznym
Np. NBS -poziom pacjenta: małogłowie, zaburzenia immunologiczne, niewielkie upośledzenie umysłowe etc.
-na poziomie komórki: radiowrażliwość, niestabilność chromosomowa, RDS, zaburzona faza S cyklu komórkowego
- na poziomie genetycznym: mutacje w genie NBS, najczęściej dochodzi do mutacji del5 pz w pozycji 657 w eksonie 6
8. zaproponować doświadczenie jak można zbadać czy związek jest mutagenny i jak udowodnić jaki typ uszkodzenia był zaangażowany w naprawę uszkodzeń wprowadzonych przez ten związek
a) testy na mutagenność:
test oceny indukcji aberracji chromosomowych
test oceny indukcji mutacji punktowych
należy wykonać 2-3 z tych testów In vitro
po wyniku dodatnim
należy wykonać 2-3 testy In vivo
po wyniku dodatnim
długotrwałe badania na zwierzętach
b) detekcja uszkodzenia
c) test na przeżywalność mutanta tego związku i innych mutantów
1. Jakie białka koduja kompleks MRN? Podaj funkcje.
2. Wymień 5 czynników genotox. oraz typy uszkodzeń DNA.
3. Wymień metody umożliwiające wykrycie poj. Pęknieć
4. Wymień choroby związane z radiowrażliwością pacjentów (krótko! objawy kliniczne jednej wybranej choroby).
5. Wymień fazy cykly kom. i punkty kontrolne.
6. Jakiego rodzaju uszkodzenia usuwane są przez NER+ głowne etapy.
7.Rysunek jakiegos schematu (podpisac białka zaangażowane w porces).
8.Wymień przyklady reakcji charakter. dla fazy I biotransformacji ksenobiotyków.
9. Wymień sytsemy naprawy DNA zaangażowane w naprawę DSB.
10.Jakie znasz metody analizy uszkodzeń DNA w kom. ssaków.
11. jakie zespoły chorobowe związane są z NHEJ.
12. Wymień sposoby odp. kom. na uszkodzenie DNA.
13. Jakie znasz zastosowanie metody kometkowej.
1. Opisać NER
2. grupy komplementacyjne FA
3. defekt- choroba- szlak naprawy
4.uszkodzenia indukowane przez ROS+ opisać system naprawy
5. MMR- opisać + choroba
6. Funkcje cytochromu z biotransformacji
7. metody analizy pęknieć w DNA-wymienić+ zasada działania
8. XP ( opisać fenotyp , czy zmiany na poziomie komórkowym?)