TEST Z BIOLOGII MOLEKULARNEJ 2010
41. Transpozon TnA ulega zwiększeniu ilości kopii w genomie gospodarza poprzez transpozycje:
a) konserwatywną
b) niereplikacyjna
c) replikacyjną (dobra odpowiedz)
d) ????
Odp: Transpozon (element mobilny)- sekwencja DNA zdolna do wbudowania (siebie lub
swojej kopii) w inne miejsce genomu (dowolne, bez żadnej homologii)
Transpozycja replikacyjna - ruchomy element ulega replikacji podczas procesu
transpozycji; jedna kopia pozostaje w dawnej pozycji, a druga kopia zostaje
wbudowana w nowe miejsce (transpozony pokrewne TnA)
26.denaturacja DNA polega na:
a)rozpadzie dna na nukleotydy
b)rozpadzie dna na fragmenty oligonukleotydów
c)rozpadzie podwojnej nici na pojedyncze
d)????????????????????
Odp: Denaturacja DNA zwana także "topieniem DNA" - separacja podwójnej nici DNA na dwie pojedyncze nici wskutek zerwania więzi wodorowych pomiędzy nićmi.
Która z cząsteczek RNA katalizuje reakcje samoskładania lub cięcia innego RNA:
1) rybozom (chyba chodziło o RYBOZYM )
2) spliceosom
3) chaperon
4) nukleaza
Odp: Tom Cech (nobel 1989)- wykrył, że są przypadki w genie rRNA jest intron, który się sam wycina; self-splicing samoskładanie RNA; atak nukleofilowy, bez udziału enzymów.Sklonował ten gen na RNA E.Coli bo u prokariota nie ma intronów, i te introny były wycinane. Wycinanie intronów to relikt prehistoryczny
- rybozymy - enzymy z RNA, Zjawisko składania RNA (ang. splicing),niektóre cząsteczki RNA zwane rybozymami mają zdolność samoskładania się.
Jaką rolę odgrywa metylacja adeniny w sekwencji GATC (albo coś takiego ) u E. coli?
"obrona" przed obcym DNA
b) inicjacja replikacji
c) do naprawy DNA
d) wszystkie poprawne
Odp: W komórkach E. coli prawie wszystkie sekwencje GATC podlegają metylacji, co reguluje wiele procesów komórkowych, między innymi: inicjację replikacji chromosomu, procesy naprawy DNA (naprawa błędnie sparowanych zasad) oraz moduluje wyrażanie się wielu genów.
Zad.4
Telomer jest to sekwencja powtarzających się nukleotydów na końcach cząsteczki, komplementarnych do sekwencji :
a) ?
b)telomerazy Rna I
c)
Z każdym podziałem komórki chromosom ulega skróceniu. W komórce istnieje mechanizm pozwalający wydłużać telomery. Odpowiada za to enzym telomeraza. Jest to kompleks białek i kwasu rybonukleinowego. W jego skład wchodzi m.in. nić RNA, będąca stałą częścią enzymu służąca jako matryca, oraz podjednostka katalityczna o aktywności odwrotnej transkryptazy hTERT (ang. human Telomerase Reverse Transcriptase), która na matrycy RNA odbudowuje nić DNA telomeru.
42.Granica Hayflicka - co to jest?
Liczba dopuszczlanych podzialow
Odp: Komórki mogą się dzielić jedynie określoną ilość razy aż do tz.” kryzysu” - jest to tzw. limit Hayflicka
Barierą długowieczności jest tzw. granica Hayflicka, czyli liczba dopuszczalnych podziałów komórki, po których komórka obumiera: w naturalnych warunkach nieco ponad pół setki
Cząsteczki DNA z różnych gatunków różnią się
a)budową fosfo- szkieletu (???)
b)typami nukleotydów
c)sekwencją zasad
d)wszystkimi wymienionymi powyżej
to było z tym OD260, DNA=0,8, nie pamietam jak to dokładnie brzmiało ;p
a) 40ug/ml
b)40 mg/ml
c)36ug/ml
d)36mg/ml
Introny - Są wycinane w jądrze komórkowym
Struktura Holidaya to intermediat
odp. rekombinacyjny lub replikacyjny
W tym pytaniu chodziło o przepisanie fragmentu DNA na komplementarną do niego nić RNA . Podany fragment DNA miał sekwencję TGCAGCACA .
mutacja to
dziedziczona sekwencja dna
Białko RecA pełni kluczową rolę w rekombinacji uprawnionej na etapie:
a. asymilacji nici homologicznej ( lub a)
b. przesuwaniu złącza (też przesuwa złączę )
c. ... o zakończeniu rekombinacji (tego nie robi)
d. żadnym z ww. bo RecA bierze udział tylko w indukcji regulonu SOS
odp: Asymilacja jednej nici (pobranie 1 nici)- dzięki RecA jedna z nici DNA
Przemieszcza homologiczną nić dupleksu (1 nić asymilowana przez dupleks)
W rekombinacji uogolnionej (uprawnionej, to samo) Bialko RecA laczy sie z ssDNA i szuka dla niego homologicznych sekwencji. Wydaje mie sie, ze to odpowiedz a. Najważniejszymi regulatorami systemu SOS są białko RecA (aktywator operonów SOS) i LexA (rep resor wszystkich operonów SOS).
46. różnice w długości białek w różnych organach - edycja mRNA
Sekwencja 5'UG...AG3' : (to jest intron)
a) samowycinanie intronów jądrowych
b) wycinanie intronów jądrowych w intronie
c) wycinanie intronów jądrowych w sąsiednich egzonach
d) składanie tRNA
- 100% PCR.. Jeśli reakcja PCR zachodzi z wydajnością 100% , to z jaką krotnością jedna docelowa cząsteczka ulega amplifikacji po n cyklach? - 2^n
- co to lizozym
- białko Cro - Związanie się białka Cro powoduje wejście faga w cykl lityczny.
- p53 - białko o aktywności czynnika transkrypcyjnego, które wiążąc się z DNA w obszarze promotorowym, może modulować ekspresję wielu genów. W przypadku uszkodzeń DNA białko P53 zatrzymuje cykl komórkowy na etapie G1/S (tzw. cell cycle growth agrest)
- AP endonukleaza - Naprawa DNA przez wycinanie zasady polega na wycięciu zmutowanej zasady z helisy DNA i jej naprawę. W procesie biorą udział dwa typy enzymów, glikozylazy DNA i endonukleazy AP. Glikozylaza DNA przecina wiązanie β-N glikozydowe między uszkodzoną zasadą a cząsteczką deoksyrybozy, tworząc miejsce apurynowe/apirymidynowe. Endonukleaza AP rozpoznaje to miejsce i nacina DNA w kierunku 5' od miejsca AP tworząc wolny koniec 3'-OH
- siRNA - dwuniciowe cząsteczki RNA o długości ok. 20-25 par zasad, które powodują wyciszanie ekspresji genów o homologicznej sekwencji (interferencja RNA - RNAi) Rośliny (i inne organizmy eukariotyczne) wykorzystują mechanizm interferencji RNA powodowany przez siRNA do obrony przed wirusami.
- Wskazać błędną odpowiedź dotyczącą faga T4 - potrzebuje NAD+
- co jest czynnikiem mutagennym
- metylacja histonów H3 i H4 za to odpowiedzialna kondensacja chromatyny
- pergaminowatość skóry
- pani Franklin co zrobiła - dyfrakcja promieniowania X na DNA
- pytanie o kompleks Rb z E2F
- czym się różnią retrotranspozony od transpozonów?
- co zwiększa produktywność polimerazy delta?
- organizm o takim samym genotypie to - klon
- 5 metylo cytydyna w co mutuje? - w tymidynę
- co robi białko p16 - blokuje cyklinę D do CDK4 i CDK6
- Białkowy czynnik infekcyjny zdolny do namnazania sie (odkryty przez Stanleya B. Prusinera w 1982) -prion
pyt.37 gr.A
co katalizuje białko CRE - znalazłam tylko - CREB (cAMP response element-binding protein),czynnik transkrypcyjny CREB, uaktywniający ekspresję genów kodujących białka tworzące podjednostki, z których składane są nowe receptory glutaminianu w neuronach
pyt. 45 wersja A:
Brak kolonii na płytce stanowiącej kontrolę negatywną transformacji świadczy o:
d) prawidłowym przygotowaniu plytek z pożywką i antybiotykiem