Biochemia 2-Lista 8

Biosynteza aminokwasów.

1. Zdefiniuj wiązanie azotu oraz wyjaśnij, dlaczego jest ono decydujące/kluczowe w utrzymaniu/zachowaniu życia na Ziemi?

2. Ułóż następujące komponenty, reagenty oraz produkty reakcji kompleksu nitrogenazy w ich poprawnej kolejności podczas transferu elektronów w wiązaniu azotu?

1. Utleniona ferredoksyna

2. Komponent reduktazy

3. Komponent nitrogenazy

4. NH₃

5. N₂

6. Zredukowana ferredoksyna

7. Źródło elektronów

3. Połącz komponenty strukturalne lub cechy z prawej kolumny z odpowiednimi komponentami reakcji nitrogenazy.

a) komponent reduktazy	1) kofaktor MoFe
b) komponent nitrogenazy	2) ugrupowanie [4Fe-4S]
	3) miejsce wiążące ATP-ADP
	4) miejsce wiążące N2
	5) tetramer α2β2
	6) dimer o indentycznych podjednostkach

4. Połącz enzym z reakcją, którą katalizuje

1. Syntetaza glutaminowa

2. Dehydrogenaza glutaminianowa

3. Syntaza glutaminianowa

5. Które z następujących reakcji pokazanych w zadaniu 4 wymagają następujących?

1. NH₄⁺

2. ATP

3. NADH

4. NADPH

6. Wszystkie organizmy włączają NH₄⁺ do glutaminianu i glutaminy, wykorzystując dehydrogenazę glutaminianową oraz syntetazę glutaminową. Dlaczego organizmy prokariotyczne mają dodatkowy enzym, syntazę glutaminianową, do spełniania tej funkcji?

7. Które z następujących aminokwasów są ważnymi komponentami diety dla dorosłego człowieka?

1. Alanina

2. Asparaginian

3. Histydyna

4. Tryptofan

5. Leucyna

6. Fenyloalanina

7. Glutamina

8. Asparagina

9. Glutaminian

10. Treonina

11. Metionina

8. Które z następujących aminokwasów są otrzymywane z pirogronianu?

1. Fenyloalanina

2. Alanina

3. Tyrozyna

4. Histydyna

5. Walina

6. Leucyna

7. Cysteina

8. Glicyna

9. Które z następujących aminokwasów są otrzymywane z α-ketoglutaranu?

1. Glutaminian

2. Prolina

3. Cysteina

4. Asparaginian

5. Glutamina

6. Arginina

7. Ornityna

8. Seryna

10. Które z następujących związków chemicznych dostarczają szkieletów węglowych sześciu biosyntetycznych rodzin aminokwasów? Nazwij szlaki metaboliczne, z których pochodzi każdy ze związków prekursorowych.

1. Pirogronian

2. Szczawiooctan

3. α-ketoglutaran

4. Bursztynian

5. 2-deoksyryboza

6. 3-fosfoglicerynian

7. Rybozo-5-fosforan

8. Glukozo-6-fosforan

9. Fosfoenolpirogronian

10. Erytrozo-4-fosforan

11. α-ketomaślan

11. Trzy koenzymy są włączone w przenoszenie aktywowanych jedno-węglowych podjednostek. Połącz aktywowaną grupę z prawej kolumny z odpowiednim koenzymem z kolumny lewej.

a) tetrahydrofolian	1) -CH3
b) S-adenozylometionina	2) -CH2-
c) biotyna	3) -CHO
	4) -CHNH
	5) -CH=
	6) -CO2-

12. Która z następujących odpowiedzi uzupełnia poprawnie zdanie?

Główne źródło jedno-węglowych jednostek do tworzenia tetrahydrofolianowej pochodnej N⁵,N¹⁰-metylenotetrahydrofolianu jest przekształceniem

1. Metioniny do homocysteiny.

2. Deoksyurydyno-5'-fosforanu do deoksytymidyno-5'-fosforanu.

3. 3-fosfoglicerynianu do seryny.

4. Seryny do glicyny.

13. Dlaczego S-adenozylometionina posiada wyższy potencjał przenoszenia grup metylowych od N⁵-metylotetrahydrofolianu?

14. S-adenozylometionina jest włączona bezpośrednio, w którą/- z następujących reakcji?

1. Transfer grupy metylowej do fosfatydyloetanolaminy.

2. Synteza glicyny z seryny.

3. Metylacja DNA.

4. Przekształcenie homocysteiny w metioninę.

5. Synteza etylenu w roślinach.

15. Jak wiele wysoko-energetycznych wiązań jest zużywanych podczas syntezy S-adenozylometioniny z ATP i metioniny?

16. Przekształcenie homocysteiny w metioninę włącza, który/-e z następujących kofaktorów?

1. N⁵-metylotetrahydrofolian

2. N⁵,N¹⁰-metylenotetrahydrofolian

3. Metylokobalamina

4. Fosforan pirydoksalu (PLP)

17. Które z następujących są intermediatami w szlaku biosyntezy za równo fenyloalaniny, jak i tryptofanu?

1. Antranilan

2. Choryzmian

3. Szikimian

4. Prefenian

18. Dwa miejsca wiążące dla indolu na podjednostkach α i β syntetazy tryptofanowej znajdują się w odległości około 25 A. Wyjaśnij, w jaki sposób indol jest transferowany pomiędzy tymi miejscami.

19. Dla następującego szlaku biosyntezy A B C D E F G, który jest prawdopodobnie etapem kluczowym? Jaki związek prawdopodobnie hamuje ten kluczowy etap?

20. Ponieważ glutamina jest ważnym źródłem azotu w reakcjach biosyntezy, enzym, który ją syntetyzuje jest uważnie regulowany. Które z następujących związków chemicznych odgrywa rolę inhibitora syntetazy glutaminowej w E.coli?

1. Tryptofan

2. Histydyna

3. Karbamoilofosforan

4. Glukozamino-6-fosforan

5. AMP

6. CTP

7. Alanina

8. Glicyna

21. W jaki sposób modyfikacja kowalencyjna przyczynia się do regulacji syntetazy glutaminowej w E.coli?

22. Glutation składa się, z których z następujących aminokwasów?

1. Glutamina

2. Glutaminian

3. Metionina

4. Cysteina

5. Glicyna

23. Które z następujących odpowiedzi poprawnie uzupełniają zdanie?

Glutation

1. Oscyluje pomiędzy utlenioną a zredukowaną formą w komórce.

2. Jest włączany w detoksykacji H₂O₂ oraz organicznych nadtlenków

3. Przekazuje grupy amidowe ze swojej reszty γ-glutamylowej podczas reakcji biosyntetycznych.

4. Zawiera atom Se

24. Które z następujących stwierdzeń odnośnie tlenku azotu (NO) jest poprawne?

1. Jest wykorzystywany jako wziewny środek znieczulający (gaz wywołujący stan narkozy ogólnej podczas wdychania).

2. Jest „długowieczną” cząsteczką sygnałową.

3. Jest wytwarzany z asparaginy.

4. Jego synteza wymaga NADPH oraz O₂.

5. Jego synteza wymaga ATP ora NH₄⁺.

25. Które z następujących są intermediatami lub prekursorami w syntezie hemu?

1. Kwas α-aminolewulinianowy

2. Bilirubina

3. Porfobilinogen

4. Biliwerdyna

5. Glicyna

6. Bursztynylo-CoA

7. Fe²⁺

---