Biochemia 2- Lista 4

Fosforylacja oksydacyjna.

1. Wyjaśnij różnicę pomiędzy fosforylacją oksydacyjną a fosforylacją na poziomie substratu występującą (pojawiającą się) w glikolizie oraz cyklu kwasu cytrynowego.

2. Które z następujących stwierdzeń odnośnie potencjału oksydoredukcyjnego reakcji są poprawne?

1. Jest używany (wykorzystywany) do opisu przemieszczeń grup fosforanowych.

2. Jest niezwiązany z energią swobodną reakcji.

3. Może być użyty (wykorzystany) do przewidywania, kiedy dany związek zredukuje (będzie redukował) inny, uwzględniając odpowiedni katalizotor.

4. Może być użyty (wykorzystany) do przewidywania czy dana reakcja utlenienia zapewni wystarczającą ilość energii do tworzenia ATP z ADP i Pi.

5. Może być użyty (wykorzystany) od przewidywania szybkości pobierania tlenu podczas utleniania danego substratu.

3. Ułóż następujące komponenty (składniki) łańcucha oddechowego w odpowiedniej kolejności. Wskaż również, które są mobilnymi przenośnikami elektronowymi?

1. Cytochrom c

2. Oksydoreduktaza NADH-Q

3. Oksydaza cytochromu c

4. Ubichinon

5. Oksydoreduktaza Q-cytochrom c

4. Połącz kompleksy enzymatyczne łańcucha oddechowego z lewej kolumny z odpowiednimi grupami przenoszącymi elektron z kolumny prawej.

a) oksydaza cytochromu c	1) hem c1
b) oksydoreduktaza Q-cytochrom c	2) FAD
c) oksydoreduktaza NADH-Q	3) hem a3
d) reduktaza bursztynian-Q	4) hem bL
	5) kompleks żelazo-siarkowy
	6) CuA i CuB
	7) FMN
	8) hem a
	9) hem bH

5. Które z następujących stwierdzeń odnośnie ubichinolu są poprawne?

1. Jest mobilnym przenośnikiem elektronowym pomiędzy oksydoreduktazą cytochromu c a oksydazą cytochromu c.

2. Jest integralnym białkiem błonowym.

3. Jego utlenianie obejmuje równoczesny transfer dwóch elektronów do centrum Fe-S reduktazy cytochromowej.

4. Jest utleniany do ubichinonu przez (za pomocą) intermediat semichinonowy.

5. Jest cząsteczką rozpuszczalną w lipidach.

6. Które z następujących stwierdzeń odnośnie struktury i własności cytochromu c są NIEPOPRAWNE?

1. Jest integralnym białkiem błonowym.

2. Zawiera bardzo niewiele drugorzędowej struktury α- helisy lub β- harmonijki.

3. Nie posiada hemu.

4. Zachował wysoko konserwatywną konformację przez cały czas ewolucji.

5. Jest rozpuszczalny w wodzie.

7. Reaktywne formy tlenu (ROS)

1. Służą jako substraty dla enzymów, które czynią je mniej reaktywnymi.

2. Powstają z intermediatów generowanych podczas transportu elektronowego.

3. Są transportowane na zewnątrz komórki przez specjalne przenośniki.

4. Obejmują
   ,
   ,
   .

8. Które z następujących stwierdzeń odnośnie mitochondrialnego kompleksu syntetyzującego ATP są poprawne?

1. Zawiera więcej niż 10 podjednostek.

2. Jest zlokalizowany w przestrzeni międzybłonowej mitochondrium.

3. Zawiera podzespół stanowiący (tworzący) kanał protonowy.

4. Jest wrażliwy na inhibicję przez oligomycynę.

5. Przemieszcza (przenosi) ATP przez błony mitochondrialne.

9. Połącz główne podjednostki systemu syntetyzującego ATP z lewej kolumny z odpowiednimi kompenentami oraz funkcjami z kolumny prawej.

a) F0	1) zawiera kanał protonowy
b) F1	2) zawiera strony/miejsca katalityczne do syntezy ATP
	3) zawiera podjednostki α, β, γ, δ oraz ε
	4) zawiera sekwencje homologiczne do członków rodziny NTPaz zawierających pętlę P
	5) łączy brzegi wewnętrznej błony mitochondrialnej
	6) głównie występuje w matrix

10. Które z następujących stwierdzeń odnośnie mechanizmu syntezy ATP „zaproponowanego” przez syntazę ATP są poprawne?

1. Syntaza ATP tworzy ATP wyłącznie, gdy protony przepływają przez kompleks.

2. Syntaza ATP zawiera strony, które zmieniają jej powinowactwo do ATP w trakcie przepływu protonów przez kompleks.

3. Syntaza ATP wiąże ATP ściślej, kiedy protony przepływają przez kompleks.

4. Syntaza ATP posiada dwie strony aktywne na kompleks.

5. Syntaza ATP posiada aktywne strony, które nie są funkcjonalnie ekwiwalentne (równoważne) w danym czasie.

11. Wewnętrzna błona mitochondrialna zawiera translokazy, które są specyficznymi białkami transportowymi, dla których par substancji?

1. NAD⁺ i NADH

2. Glicerolo-3-fosforan i fosforan dihydroksyacetonu (fosfodihydroksyaceton)

3. AMP i ADP

4. Cytrynian i pirogronian

5. Glutaminiam i asparaginian

12. Jak wiele cząsteczek ATP jest generowanych podczas kompletnej degradacji oksydacyjnej każdego z następujących związków do CO₂ i H₂O? Załóż, że działa wahadło (czółenko) glicerolofosforanowe.

1. Acetylo-CoA

2. Fosfoenolpirogronian

3. Aldehyd 3-fosfoglicerynowy

13. Która z następujących odpowiedzi uzupełnia zdanie bardziej poprawnie?

Szybkość przepływu elektronów przez łańcuch transportu elektronowego jest regulowana najbardziej bezpośrednio przez

1. Stosunek (proporcję) ATP: ADP

2. Stężenie acetylo-COA

3. Szybkość fosforylacji oksydacyjnej

4. Hamowanie na zasadzie sprzężenia zwrotnego przez H₂O

5. Szybkość katalityczną oksydazy cytochromowej

14. Które z następujących odpowiedzi poprawnie uzupełnia zdanie?

Rozprzęgacze takie jak dinitrofenol (DNP) lub termogenina rozprzęgają transport elektronowy oraz fosforylację przez

1. Inhibitowanie reduktazy cytochromowej.

2. Dysocjowanie jednostek F₀ i F₁ syntazy ATP.

3. Blokowanie transportu elektronowego.

4. Rozpraszanie gradientu protonowego.

5. Blokowanie translokazy ATP-ADP.

15. Które z następujących są produktami reakcji dysmutazy ponadtlenkowej?

1. 
   

2. 
   

3. 
   

4. 
   

5. 
   

16. Połącz każdy inhibitor z lewej kolumny z jego głównym (podstawowym) efektem, umieszczonym w kolumnie prawej.

a) azydek	1) inhibicja transportu elektronowego
b) atraktylozyd	2) rozprzężenie transportu elektronowego i fosforylacji oksydacyjnej
c) rotenon	3) inhibicja translokacji ADP-ATP
d) dinitrofenol	4) inhibicja syntazy ATP
e) tlenek węgla (CO)
f) oligomycyna
g) antymycyna A

---