Dzisiaj były takie pytania:
2 - MAP-tau
3 - ch. Parkinsona
10 - wskaz zdanie prawdziwe
17 - analiza dot blot
25 - Kaspaza 12
26 - Replikacja DNA
Wersja 1:
- definicja eksonu
- co to są mutacje punktowe, podać 3 przykłady
Wersja 2:
- definicja allelu
- co to jest, na czym polega ekspresja
Wersja 3:
- definicja heterozygoty
I drugiego pytania niestety nie znam...
Pytania z dzisiaj:
1.Co to są telomery?
2. Co to są mod. posttranslacyjne?
1.co to jest gen, allel ?
2.dziedziczenie autosomalne recesywne
splicing
dziedziczenie autosomalne dominujace.
1. homozygota
2. mutacja zmiany sensu
1) telomery
2) modyfikacje postranslacyjne
Mutacja ze zmianą ramki odczytu.
Dziedziczenie autosomalne dominujące.
ekson
translokacja chromosomalna
Etapy hybrydyzacji, jedno na dopasowanie metody do tego, co można nią wykryć/co jest potrzebne. Ostatniego nie pamiętam
Dlaczego PCR ulega zahamowaniu pod koniec.
pytania apoptozy i cyklu komórkowego: 1. co powoduje ufosforylowane białko RB? (testowe - 4 odp, coś wiązaniu/odłaczaniu czynnika E2F i jeszcze jakieś 2 możliwości wyboru, nie pamiętam dokładnie) i krótko opisać teorię zużycia.
Była wejściówka.
Moje pytania:
- co może służyć jako źródło DNA?
- czym są startery w reakcji PCR?
Poza tym widziałem jeszcze takie pytania:
- jakie cechy możemy uwidocznić za pomocą elektroforezy w żelu agarozowym?
- rozwiń nazwę PCR i powiedz, skąd wynika nazwa
DD (testowe) Fasl/prokinaza-8/i cos jeszcze ( 3 kombinacje tych 3 rzeczy) oraz teoria mutacji somatycznych
Moje notatki na nic sie zdaly, dzisiejsze pytania:
1. ufosforylowane bialko RB (to co wyzej)
2. błąd katastrofy Orgela
pytanka ze starzenia sie:
kaspazy- szlak mitochondrialny (test- do wyboru)
opisac starzenie sie na tle immunologicznym,
- składniki PCR sekwencyjnego
- kolejne etapy PCR
- do czego w PCR sekwencyjnym są potrzebne dideoksynukleotydy?
- wymień badania, które pozwolą na diagnozę mutacji punktowych DNA
1. Western blotting
b) białko na membranę
2.Dopasuj
Southern - DNA
Northern - mRNA
Western - białko
Eastern - Kamiński
3. Kolejność PCR
b) Denaturacja - Przyłączanie – Wydłużanie
dopasowanie: pcr, western, hybrydyzacja - startery, itp, potem nastepne opisz pcr, i ostatnie dodanie jakiego substratu robi z pcr metode jakas tam, nie pamietam. Chodzilo chyba o jakies nukleotydy. Generalnie byly zajecia z takim mlodym gosciem, i wszyscy spali i niku
Co do pytań z III laborek:
- do czego służy Western-blotting?
- dlaczego dodajemy SDS przed elektroforezą?
3 rodzaje pcr wymienic
jakie enzymy biora udzial w pcr
ędąc dzisiaj na wykładzie zanotowałem 7 z 11 pytań, które mogą pojawić się na zaliczeniu, nie patrzyłem do giełdy, nie wiem czy takie pytania tam są, nie wiadomo też czy dostaniemy slajdy, więc piszę je na forum. Dzisiejszy wykład dotyczył komórek macierzystych.
1. Klasyfikacja komórek macierzystych.
2. Dzięki jakiemu mechanizmowi biologicznemu komórki macierzyste są nieśmiertelne?
3. Jakie metody zastosowania komórek macierzystych należą do strategii biotechnologicznej a jakie do fizjologicznej?
4. Co oznacza termin reprogramowanie w odniesieniu do terapii komórkowej?
5. Które z metodologii stosowanych w terapii komórkowej umożliwiają wykonanie przesczepu autologicznego?
6. Dlaczego terapia komórkowa ma większe szanse być zastosowana w leczeniu chorych z Parkinsonem niż Alzheimerem?
7. Czy prawidłowe komórki GFAP-pozytywne to zawsze astrocyty?
Mieliśmy dzisiaj nowotwory, były dwie wersje, w jednej: wymień i krótko opisz etapy kancerogenezy, wymień dwa miejsca kontrolne w cyklu komórkowym, druga grupa miała scharakteryzować teorię Knudsona a drugiego pytania nie pamiętam.
A pytania, które wrzucił Grzeniu są na forum oficjalnym:
1. Klasyfikacja kom. macierzystych
2. Jaki mechanizm zapewnia kom. macierzystym nieśmiertelność?
3. Jakie metody zastosowania kom. macierzystych należą do strategii biotechnologicznej a jakie do fizjologicznej?
4. Czym różni sie klonowanie terapeutyczne od reprodukcyjnego?
5. Co to jest reprogramowanie w odniesieniu do terapii komórkowej?
6. Które z metodoligii stosowanej w terapii kom. umożliwiają wykonanie przeszczepu autologicznego?
7. Dlaczego terapia kom. ma większe szanse być zastosowana w leczeniu osób z chorobą Parkinsona niż z chorobą Alzheimera?
8. Czy prawidłowe komórki GFAP-pozytywne to zawsze typowe astrocyty?
9. Dlaczego terapia genowa w której zastosowane są komórki macierzyste może być skuteczniejsza od terapii genowej w której wykorzystywane są komórki dojrzałe?
10. Czy możliwe jest otrzymanie zwierząt chimerowych?
11. Jak obecność nowotworowych kom. macierzystych próbuje się wykorzystać w terapii przeciwnowotworowej?
U nas były takie:
- wymienić punkty regulacyjne cyklu komórkowego
- w jaki sposób translokacja uaktywnia protoonkogen
- mutacja jakiego/jakich genu/genów to chromosom Philadephia? (testowe)
- zdefiniować tor mutatorowy
Nowotwory:
1. W kolejności ustawic etapy rozwoju raka jelita grubego (testowe) - trzeba dac odpowiedź, w której utrata p53 jest na końcu.
2. Co nie prowadzi do rozwoju nowotworu (też testowe) - delecja protoonkogenu.
1. Etapy kancerogenezy ( wypisac )
2. Translokacja w chłoniaku Burkitta ( pytanie testowe )
Biotechnologia z dzisiaj:
1. Geny samobojcze moga miec zastosowanie w leczeniu ( 4 choroby do wyboru, poprawna nowotwory - odp. f )
2. Klonowanie DNa co to jest ( chyba pierwsza odpowiedz z listy )
Jedna grupa:
a) Na jaką chorobę choruje pacjent, gdy uszkodzony receptor HFE?
b) Jaki receptor jest uszkodzony w rodzinnej hipercholesterolemii?
Druga grupa:
a) Do czego prowadzi mutacja inaktywująca receptora RET?
b) Jakiego receptora może być mniej w rodzinnej hipercholesterolemii?
Trzecia grupa:
Jaki receptor jest uszkodzony w trombastenii Glanzmanna?
1.Przypasuj skrót do jego znaczenia (czy też rozwinięcia...:) - macie podane je podane w drugiej tabelce:
LOH
MDR
SSCP
FISH
2. Co to jest chromosom Philadelphia i jak on powstaje? kolejnosc procesow w pcr, dopasowac bialka w metodzie western blotting..
opisać sekwencjonowanie DNA i co to jest polimorfizm sekwencji minisatelitarnych
dopasować skróty technik do ich nazw długich i napisać co to chromosom filadelfia :)
linia DNA i dwa startery na początku i końcu. Do tego enzym restrykcyjny, który przecinał w jednym miejscu (tnąc na kawałki 29 i 15 nukleotydów). Pytanie do tego było jakie otrzymamy fragmenty, jeśli pacjent jest heterozygotyczny.
co to jest HRE
-dlaczego dystrofia beckera jest łagodniejsza od duchenna?
-ile lat przezywaja chorzy na z. Wernera?
-co to komórka pluripotencjalna?
-jaka mutacja gdy dziecko wymiotuje kałem?
-interpretacja rysunku- dot blot- który pacjent jest nosicielem a który chory
- co należy do strategii biotechnologicznej w kom macierzystych?
-jaka mutacja w zespole Marfana?
- na jakie badania skierowac pacjentkę z postępującym otępieniem, zmianami w eeg?
-jaka mutacja w rodzinnym parkinsonie?
-na czym opiera się metoda FISH?
-co to jest piętnowanie genowe?
- jakie białko kontroluje w punkcie G1/S?
-dlaczego jest przerost nadnerczy w mutacji cyp21?
- jaki receptor nie działa w rodzinnej hipercholesterolemii?
to nie wszystkie ale więcej nie pamiętam:) mam nadzieję że przyda się jedynie przyszłym roczniko
-dekontaminacja prionow (poprawna odp- NaOH; pozostale odpowiedzi- zle- alkohol, autoklawowanie i cos jeszcze)
-technika PCR pozwalajaca na badanie wielu genow na raz (multiplex PCR, to TRZEBA było wybrać:)
-AD i jakie mutacje, jakie geny (poprawna odpowiedz to ta z gamma-sekretaza, te z APOE natomiast byly zle:)
-anemia sierpowata (wybrac wykres- prawidlowa odpowiedz wygladala tak, ze w warunkach zmniejszonego cisnienia parcjalnego tlenu krwinki byly sierpowate, a normalnych warunkach byly normalne:)
-mukowiscydoza, AD
- pytanie o mtDNA (odp: x) w efekcie pietnowania rodzicielskiego moze pochodzic od ojca (zle) x) nie podega zmianom bo nie zachodzi crossing-over (zle) x) umozliwiaja okreslenie jakie przebylo sie choroby (zle) x) w wypadku uszkodzenia powoduja choroby, ktore ujawnia sie w pozniejszym wieku
- E. coli coś tam (-> co wprowadzamy do E.coli, zeby produkowala ludzka insuline- gen hormonu, prohormonu czy tez moze preprohormonu:) , może z ziemniakiem
- co wykrywamy, czy co wzrasta przy nasiolnej apoptozie (-> odp- dobra odpowiedzia bylo wzrost aktywnosci kaspaz; poza tym byly jeszcze odpowiedzi- abnizenie aktywnosci kaspaz, spadek ekspresji BAX, wzrost ekspresji BOL2 i one akurat byly zle)
- dlaczego chromosomy sie skracaja przy kolejnych podzialach (odpowiedzi: x) polimeraza nie potrafi uzupelnic luki po starterze na koncu (tu nie pamietam)- chyba 5' x) telomeraza nie potrafi uzupelnic luki po starterze (...) wiecej odp nie pamietam:)
- te nukleotydy, starter i kiedy mutacje wykryjemy
- budowa bialka prionowego (procentowo- alfa felisy tyle %, beta struktur tyle...)
- mutacje w glejaku (takie byly odpowiedzi: a) amplifikacja MDM2, mutacja TP53 b) amplifikacja EGFR mutacja TP53 c) amplifikacja EGFR i amplifikacja MDM2 d)utrata heterozygotycznosci na chromosomie 10
- tego z modelami chorob nie jestem w stanie odtworzyc i chyba
tylko jeden autor wie o co w nim chodzilo
- terapia genowa w mukowiscydozie
- transgeniczna krowka (tzn jak zrobic zeby produkowala ludzkie
mleko-> wprowadzamy gen do zarodka i musi nam z tego wyrosnac krowa- natomiast NIE wprowadzamy genu do wymion doroslej krowy:)
- wynik elektroforezy- ustalic, czy tatus to tatus itp (tu akurat poprawna odpowiedzia bylo, ze tatus jest homozygota)
- pytanie o teorie opisujace zmiany molekularne lezace u podloza nowotworow (trzeba bylo wiedziec co mowi teoria standartowa, zmodyfikowana standartowa i teoria pananeoploidii)
- mutacja spowodowala zamiane aminokwasu na inny w obrebie genu promotorowego. mutacja ta: prawidlowa odp- bedzie szkodliwa, jesli bialko bedzie produkowane w nieprawidlowej ilosci
-protoonkogeny nie ulegaja przemianie w onkogen przez: x) amplifikacje x) delecje czesci lub calego genu x) mutacje punktowa x) integracje retro wirusa
1. Na czym polega epigenetyczne wyciszenie?
2. Czego potrzeba do analizy ekspresji genu mikromacierzami?
3. Gdzie znajdują się ciałka Levy'ego w chorobie Parkinsona z postępującym otępieniem?
4. W jaki sposób doprowadzić do powstania krowy z ludzką albuminą w mleku?
5. Dopasować definicje do komórki toti-, pluri- i multipotencjalnej
6. Jakie działania klasyfikujemy do metod inżynierii biotechnologicznej?
7. Jakie choroby zaliczamy do b-amyloidoz?
8. Na jakim fragmencie następuje działanie w szlaku beta-sekretazy?
9. Przychodzi pacjentka z chorobą Alzheimera w wywiadzie – badania na jakie geny zlecasz?
10. Z powodu jakiej procesu genu dla białka MAP-tau występują różnice pomiędzy izoformami tego białka ?
11. Jakie komórki obejmuje Limit Hayflicka?
12. O czym świadczy zmniejszenie działania białka Bax po chemioterapii w raku sutka?
13. Pacjent po wycięciu wyrostka robaczkowego, silny krwotok po 2 godzinach, żona mówi że przyjmuje „leki przeciwkrzepliwe” - co może być przyczyną?
14. Jaki defekt genetyczny występuje przy skąpodrzewiakach?
15. W jaki sposób następuje zachotowanie na PrPsc?
16. Jaki wariant genetyczny występuje we wszystkich przypadkach vCJD?
17. Jaki efekt daje rapamycyna stosowana u chorych ze stwardnieniem guzowatym?
18. Jakie wcześniejsze procesy są niezbędne do prawidłowego zadziałania Sildenafilu?
19. Krzyżówka genetyczna – określić, czy ojciec jest heterozygotą, homozygotą albo czy ma wadę sprzężoną z chromosomem X
20. Jak wyżej krzyżówka genetyczna, tyle że z wynikiem elektroforezy – określić który wynik pasuje do konkretnej osoby w tej krzyżówce genetycznej (w tym wypadku do chorej córki)
21. Czym charakteryzuje się histochemicznie beta-amyloid?
22. W jaki sposób wykryjemy mutację punktową w genie XYZ (takie długie ciągi kolejnych badań laboratoryjnych)?
1. Pytanie o telomery i telomerazę, czemu skraca się replikacja czy coś podobnego
2. Receptor w rodzinnej hipercholesterolemii (LDL)
3. Zespół łamliwego chromosomu (strzelałem)
4. Komórki pluripotencjalne, wybrać odpowiednią definicję ( mogą się różnicować we wszystkie komórki oprócz pępowiny i łożyska)
5. Kolejność badań w jakiejś chorobie (było w sumie z 10 typów badań) (strzelałem)
6. 4 zdjęcia, trzeba było określić czy pacjent jest zdrowy, chory czy nosiciel, pierwsze to była próba kontrolna (1-zdrowy, 2-chory, 3-nosiciel)
7. 2 zdjęcia, przedstawiające jakąś chorobę, trzeba było wybrać odpowiedni kwadracik i zdecydować czy tu jest ta mutacja
8. Jakie badania zlecisz w dominującej odmianie choroby Parkinsona, jakie białko będzie się badać (zaznaczyłem, że alfa synukleinę PSCA)
9. vCJD jest powodowany przez… (zaznaczyłem odpowiedź ze zjedzeniem mięsa)
10. FISH polega na (strzeliłem w badanie DNA przy użyciu fluorescencyjnych starterów)
11. Rak piersi HER2 (zaznaczyłem z trastuzomabem)
12. Hematopoetyczne zaburzenia… (zaznaczyłem że a i b są poprawne) było tam PCR/ABL i PML/RAR alfa i coś jeszcze
13. Choroba Picka i zaburzenia (zaznaczyłem że są ciała Picka i jest mutacja białka tau)
W 2 turze było jeszcze pytanie o mutację genu XYZ..należało wybrać odpowiednią kolejność badań (ja zaznaczyłam wyizolowanie DNA od pacjenta,sekwencyjny PCR,sekwencjonowanie DNA)
2.Było pytanie jaka mutacja przy Parkinsonie (zaznaczyłam Parkininę 2)
3.Jaką funkcję pełnią białka map tau?
4.Pacjent z otępieniem,brak obciązenia w wywiadzie rodzinnnym w kierunku chorób genetycznym.Co zlecisz?(badanie płynu m-r,chyba)
5.Jak uzskać szczepionkę z HbsAg?...były kwestie z roślinką którą można zakazić i zregenerować...wszczepić białkowy produkt i zregenerować roślinke..cos w tym stylu
6.Było coś z terapią genową..jak ustawić dalsze postępowanie aby otrzymać anty-Ki-ras?odpowiedzi były m.in a)zablokowanie onkogenu b)zablokowanie protoonkogenu c)pobudzenie apoptozy i zablokowanie protoonkogenu coś w tym stylu
7.Kaspaza 12....ale niestety nie pamiętam jakie były warianty z odpowiedzi
8.JCzym powinien charakteryzować się dobry starter?
Może jakby udało się jeszcze komuś coś napisać z tej 2 tury...bo przyznam,że cięzko było zapamiętać nawet nie te pytania ale warianty odpowiedzi pomiędzy którymi należało coś wybrać
Gdzie wystepuja ciala Levyego?
- jakies pojebane pytanie o mutacje chromosomow
- mutacja w hemochromatozie
- rokowanie nowotworu (podana wielkosc guza i mutacje KIT? w chromosomie 9 i 11?)
- mutacje w Alzheimerze
- co jest potrzebne do mikromacierzy?
- przyczyny pojawienia sie PRPsc
- zanik wieloukladowy to? amylidoza, odkladanie tau itd.
- co powoduje mutacja w promotorze
- jakis zespol, ktorego nie pamietam (moze ktos dopisze :P)
- komorki macierzyste: dziela sie asymetrycznie i odnawiaja (cos w tym stylu)