ożychar, Politechnika Wrocławska, W3 - chemiczny


BIOLOGIA MOLEKULARNA

1.Mamy jednoniciowe z 200 nukleotydami o składzie [%], bufor z Mg, polimerazę DNA, [γ-32P]dATP i pozostałe dNTP. Dysponujemy komplementarnym starterem do 20 reszty matrycy od konca 3. Jaka ilość w nowo zsyntetyzowanej nici DNA będzie mieć znakowany fosfor ?

Odp. 20/200= 1%

2. Jak aktywność posiadaja odwrotna transkryptaza retrowirusy ?

Odp. Polimeraza DNA zależna od RNA i polimeraza DNA zależna od DNA. Hybryd DNA-RNA, hydroliza RNA aktywności RNA-zowej

3.Bakteria hodowano ze źródłem azotu 15N nastepnie przeniesiono do środowiska z 14N , a po jednym pokoleniu znowu do 15N. Jakiego DNA można się spodziewac?

Odp. I 100%ciezkie, II 100% srednie, III 50% srednie, a 50% ciezkie

4. Gdzie znajduje się urydyno-5-fosforan ?

Odp. Nie ma go ani w RNA ani w DNA.

5. Przepływ informacji (zaczynamy od DNA)

Odp. a)Białka … powoduja translacje mRNA

b) tRNA powstaje w wyniku transkrypcji DNA (bo jest kodowany w DNA-bezposresnio z pre-mRNA

c)mRNA organizmow Eukariotycznych nie zawiera intrpnow, a pre-mRNA ma je.

6. Dany jest cDNA i trinukleotyd ATg kodujący `start'

AgCCACATAgCgA matryca

TCggTgTATCgCT kodujaca

Która nic jest matrycowa, a która kodujaca ?

Która tworzy przejsciowa hybryde RNA-DNA ? odp. matrycowa-gorna

Jaka sekwencje na powstający transkrypt ? odp. UCgCUAUgUggCU

7. Polimerazy DNA I i DNA III

Usuwaja starter i wypeniala puste miejca - NIE

Wymagaja startera - TAK

Aktywność nukleazowa 5 - 3 NIE

Obie sa w nukleoplazmie - NIE

Uczestnicza w transkrypcji DNA

8. Organizmy z Marsa. Posiadaja tylko 14 aminokwasow kodowanych podobnie jak ziemskie kodon XXXX, gdzie X = A,T. TTTT = stop, TTTA= nie znany kodon

Szukamy nieznanego kodonu.

Odp. Jeśli to kodon stop, to jest to kod uniwersalny NIE

Kod ten może być zdegenerowany jeśli nieznany kodon koduje aminokwas z tabelki

Antykodon komplementarny do `stop' to : TAAA

Gdy nie znamy kodonu to możemy powiedziec czy jest zdegenerowany czy nie NIE

9. Geny u Eukariota

Większość genow jest nieciagla, bo zawiera introny TAK

10. Czy uda nam się przeprowadzic PCR gdy denaturacja w zbyt niskiej temperaturze, hybrydyzacja w zbyt wysokiej?

Odp. NIE

11. Mamy dinukleotyd d(AGCATA) jak go możemy znakowac?

Odp. Trzeba mieć : odpowiedni bufor, kinaze polimerazowa, [γ-32P]dATP

12. Metoda badan Sangera.

Odp. Odcztac od dolu do gory, czyli 5-3. Napisac nic komplementarna=matrycowa i zapisac ja od 5-3.

13. Biochemiczna Kasia chciala zamienic kodon Cys: TGT,TGC na kodon Ala: GCT, GCC, GCA, GCG. Fragment DNA to :

5- CGG CCG GAA TGC GTC GTC CCG -3 kodujaca

3- GCC GGC CTT ACG CAG CAG GGC -5 matrycowa

Odp. wybrac starter hybrydyzujący z matryca zamieniając kodon Cys na Ala

14. Co potrzebujemy do PCR:

Odp. dNTP, startery, polimeraza DNA odporna na temperature, Mg 2+, matryca

15. Ligaza ze zwierzat

Zrodło energii : ATP

Czy bierze udzieal w naprawie DNA: TAK

Czy bierze udzial w syntezie DNA: TAK

Laczenie jednoniciowego DNA w kolo: NIE

Wiazanie fosfodiestrowe 5P 3OH : TAK

Zuzywa 2 wiazanie wysokoenergetyczne : TAK

16. mamy hybryd 19 ° , prawoskretna, waski i gleboki rowek to:

Odp. hybryd DNA-RNA, ssRNA, A-DNA

17. Podjednostka δ

Zdolność inercji transkrypcji w miejscach paromotorowych: TAK

Znajduje się w polimerazie do paromotorowych rejonow RNA: TAK

Oddysocjowuje od enzymu: TAK

Ulatwia terminacja: NIE

18. Ogony poliA

Dolaczone przy udziale ligaz: NIE

Kodowane fragmenty polideoksyadenylanu: NIE

Dodawane przez polimerze poliA: TAK

Zuzywane ATP: TAK

19. Bialka rybosomowe

Powstaja w wyniku translacji rRNA: NIE

rRNA katalityczna i strukturalna funkcja

20. Czy cDNA powstaje w odwrotnej transkryptazie mRNA?

Odp. TAK

21. W mRNA introny sa?

Odp. wycięte

22. Replikaza RNA to

Odp. polimeraza RNA RNA zalezna

23. Czy prymaza syntezuje krotki fragment DNA? NIE

Czy DnaA przylanczaja do „+” superhelikalnego skretu: NIE

24. Naprawa dimeru trinukleotydowego (pirymidynowych?)

25. Rho

Aktywowane przez jednoniciowe RNA

Rozpoznaje sekwencje w matrycy DNA : NIE

Czy dziala helikaza DNA-RNA: TAK

Posiada niekodujace sekwencje

26. Które z następujących zdan okresla podwojna helise DNA typu WC

a) + dwa polinukleotydowe łańcuchy sa zwinieta wokół wspolnej osi

b) - tworzy pary A-C i G-T

c) + helisa ma pelny obrot o 34 st. Bo kazda para obraca się o 36 st. Względem sąsiedniej pary zasady i oddaloneo 3,4 A

d) + puryny i pirymidyny znajduja się w wewnętrznej stronie helisy, a szkielet fosfodiestrowy na zewnatrz

e) + sklad zasad analizowany z DNA wielu organizmow pokazuje ze ilość A i T jest rowne, tak jak ilość G i C

f) - można zmieniac sekwencje w jednej nici niezależnie od drugiej nici

27. a) podwojna nic DNA: sztywny pret, w specyficznej temperaturze pokazuje efekt kiper hroniczny, zawiera rone ilości zasad T i A

b) pojedyncza nic DNA: latwo reaguje z form aldehydem, zawiera rozne ilości G i C

28. polimeraza DNA I wymaga:

Odp. matrycy, dNTP, Mg 2+

29. Transkrypcja to przeply informacji :

Odp. DNA do RNA, RNA do DNA

30. Co jest wymagane do replikacji polimerazy RNA zaleznej od DNA, do produkcji transktyptu RNA:

Odp. ATP, CTP, GTP, UTP, Mg 2+, sekwencja terminalna (koncowa)

31. Jakie funkcje sa charakterystyczne dla tRNA:

Odp. zawiera antykodon,

może być polaczony z aminokwasem wiazaniem estrowym,

oddzialywuje z mRNA na drodze translacji,

może posiadac rozna liczne roznych sekwencji,

sluzy jako polaczenie miedzy mRNA a pojedynczym aminokwasem

32. Które reagenty bedauzyteczne do uwidacznienia fragmentow restrykcyjnych DNA, wyseparowanych i rozdzielonych przez elektroforeze w zelu agarozowym i pozostawione mokre w zelu?

Odp. bromek etydyny

- kiedy such zel to jeszcze: kinaza polinukleotydowa, [α-32P]ATP

33. Chemiczne syntetyzowane oligonukleotydy mogą być użyteczne:

Odp. do syntezy genow,

tworzenia łączników,

wprowadzania mutacji w klon DNA,

jako primer do sekwencjonowania DNA,

jako sonda do hybrydyzacji

34. Wprowadzenie genu w srodek wektora, który zawieraz odporność na antybiotyk to:

a)- prowadzi do przeniesienia odporności lekow

b) + jest nazywane inaktywacja inercyjna

c) + powoduje czułość komorki na antybiotyk

d) + może być uzywany di identyfikacji bakterii zawierających wektor z fragmentem DNA

e) - jest metoda niszczenia patogenicznych bakterii

35. Bardzo dlugi odcinek DNA z genu Eukariota ( > 100 kb)

a) - może być pakowany w fag

b) + może być wydzielana z chromosomow sztucznych drozdzy

c) - musi posiadac konce kohezyjne do klonowanie

d) + może być analizowany przez wędrówkę wzdłuż chromosomu

e) - mogą być wyseparowane przez elektroforeze w zelu polikryloamidowym

36. Technika PCR

a) + wykrywa bardzo male ilości bakterii i wirusow

b)- wprowadzanie normalnych genow do zwierzat posiadających uszkodzony gen

c) + bada DNA w archeologicznych probkach

d)+ monitoruje przebieg chemioterapii pewnych nowotworow

e) + identyfikacja zgodności genetycznych w analizowanych probkach. (test na ojcostwo)

37. A-DNA

Prawoskretna helisa,

Ma strukture podobna do podwojnej helisy RNA

Nici w helisie maja przeciwne zwroty

38. B-DNA

Ma stosunkowo szeroki i gleboki rowek

Ma prawoskretna helise

Ma 10,4 zasad na skret

Nici w helisie maja przeciwne zwroty

39. Z-DNA

Fosforany w szkielecie sa zygzakowate

Faworyzuje ujemne superhelisy

Nici w helisie maja przeciwne zwroty

40. Ligaza DNA

a) + katalizuje tworzenie się wiazania 3OH i 5P

b) + wymaga kofaktora NAD+ albo ATP zalezne od zrodła enzymu, dostarcza energii do tworzenia wiązań fosfodiestrowych

c) + mechanizm katalizowanej reakcji wymaga utworzenia związania kowalencyjnie enzym-adenylan

d) + katalizuje reakcje przez mechanizm który wymaga aktywacji fosforanem DNA przez formowanie wiazania fosfobezwodnikowego z AMP

e) + wymagana w replikacji DNA naprawy i rekombinacji

41. Topoizimeraza

a) + zmieniaja liczbe miejsc wiążących topoizimerow

b) + przerywaja i powoduja relaksacje wiązań fosfodiestrowych

c) - wymagaja NAD+ jako kofaktora do dostarczenia energii kolistych czasteczek w formy zrelaksowane

d) + tworzy kowalencyjny intermediat z substratem DNA

e) + mogą w szczególnym przypadku używać ATP do tworzenia ujemnej suprhelikalnego DNA z formy rozluźnionej

42. Polimeraza DNA I

Wymagana w naprawie DNA

Wymagana w replikacji

Potrzebuje primera i matrycy

Usuwa primer i wypełnię szczeliny podczas replikacji

43. Polimeraza DNA II

Potrzebuje primera z 3OH wolna i matrycy

Wymagana w naprawie DNA

Posiada aktywność nukleazowa 3-5

44. Polimeraza DNA III

Wymagana w replikacji

Potrzebuje primera i matrycy

Tworzy najwięcej DNA podczas replikacji

Posiada aktywność nukleazowa 3-5

45. Widelki replikacyjne - miejsce zrelaksowanego DNA

46. oriC - miejsce zrelaksowanego DNA, wiaze bialka dnaA, dnaB, dnaC, jest produktem inicjacji syntezy

47. nic opozniona - jest syntetyzowana nieciagle, kierunek syntezy jest przeciwny do kierunku widelek replikacyjnych

48. nic prowadzaca - jest syntetyzowana ciagle

49. fragmenty Okazaki - sa syntetyzowane ciagle, kierunek syntezy jest przeciwny do kierunku widelek replikacyjnych

50. helikaza DnaB - rozwiązane nici pochodzące z replikacji w powiazaniu z bialkami dnaA i dnaC

51. bialko wiążące pojedyncza nic SSB - stabilizuje rozwiniety DNA

52. gyraza DNA - łagodne dodanie superskretu, hydroliza ATP zmniejsza liczbe oplecen DNA

53. prymasa - polimeraza RNA

54. holoenzym polimerazy DNA III - syntetyzuje większość DNA

55. podjednostka ε polimerazy DNA III - wykonuje `czytani i sprawdzanie' większości syntez DNA

56. polimeraza DNA I - kierunek syntezy jest przeciwny do kierunku widelek replikacyjnych, wypełnię przerwy gdzie RNA wystąpił, zawieraz egzonukleaze 5-3

57. ligaza DNA - laczy konce nici opóźnionej ze soba, wykorzystuje NAD+ do wtorzenia wiązań fosfodiestrowych

58. Mutacje:

5-bromouracyl - tranzycja

2-amonipuryna - tranzycja

Hydroksyamina - jednokierunkowa tranzycja

Akrydyna - inercja lub delecja

Kwas azotowy - tranzycja

Światło ultrafioletowe - blokada replikacji

59. Naprawa DNA uszkodzonego światłem ultrafioletowym

1. uvrABC enzym rozpoznaje uszkodzenia w helisie DNA wywolane dimerem tymidynowym

2. enzym fosforeaktywny absorbuje światło i odcina dimer tymidynowy w celu odtworzenie dwoch sasiednich reszt tyminy

3. uvrABC enzym (egzonulkeaza) hydrolizuje wiazanie fosfodiestrowe

4. polimeraza DNA I wypelnia przerwy wytworzone przez usuniecie oligonukleotydu utrzymuje dimer tymidynowyo 5. ligaza DNA zamyka nowosyttetyzowana nic do nieuszkodzonej DNA utworzyc nienaruszalna molekule.

60. Podjednostki polimerazy RNA :

α wiaze bialko regulatorowe

β wiaze trifosfanow rybonukleotydow

β wiaze matryce DNA

σ odszukuje miejsca promotorowe, pomaga zainicjowac synteze i oddysocjowuje od enzymu

61. Miejsca promotorowe E.coli

a) + mogą wykazywac rozna wydajność transkrypcji

b) + dla wkiekszosci genow zawiera rozne zgodne sekwencje

c) + okresla strone startu dla transkrypcji na matrycy DNA

d) - maja identyczne i określone sekwencje

e) - sa aktywne kiedy G lub C sa zamienione w ich -10 rejon w czasie mutacji (mutacja powoduje utrate aktywności)

f) + te które maja sekwencje prawie zgodne z sekwencjami zgodnymi i sa separowane przez 17 par zasad sa bardzo wydajne

62. Bombel transkrypcyjny

a) + czesc polimeryzacje enzymu

b) - podjednostka σ (utrata tej podjednostki, bo wtedy rdzen silniej się wiaze do matrycy DNA)

c) + w przybliżeniu 17 nukleozydow nici kodującej DNA w formie pojedynczej

d) - w przybliżeniu 12 nukleozydow konce 5 lini wydłużającej się RNA

e) + w przybliżeniu 12 bp helisy DNA-RNA

63. Polimeraza RNA I

Jest zlokalizowana w jąderku

Tworzy prekursory 18s 5,8s 28s rRNA

Syntezuje RNA w kierunku 5-3

Jest zbudowana z kilku podjednostek

64. polimeraza RNA II

Jest zlokalizowana w nukleoplazmie

Tworzy prekursorowi mRNA

Silnie inhibowany przez amanityne

Syntezuje RNA w kierunku 5-3

Jest zbudowana z kilku podjednostek

Ma podjednostke z powtarzalna sekwencja aminokwasow regulowana w fosforylacji

65. Polimeraza RNA III

Jest zlokalizowana w nukleoplazmie

Tworzy prekursorowi tRNA

Tworzy 5s rRNA

Syntezuje RNA w kierunku 5-3

Jest zbudowana z kilku podjednostek

66. I grupa splicingowa

Reakcje transestryfikacji zrywania i tworzenia wiązań

Wymaga nukleozyd guanozowy albo nukleotyd

67. II grupa splicingowa

Wymagane wiazanie 2-5 fosfodiestrowe

Reakcje transestryfikacji zrywania i tworzenia wiązań

Spliceosom jest wymagany

Produkt pośredni o kształcie lassa

68. Splicing mRNA

Wymagane wiazanie 2-5 fosfodiestrowe

Reakcje transestryfikacji zrywania i tworzenia wiązań

Spliceosom jest wymagany

Produkt pośredni o kształcie lassa

snRNPs sa wymagane

69. Splicing eukariotyczny tRNA

Aktywności ligazy i nukleazy sa potrzebne

II KOLOKWIUM

1.Miejsce wazne w splicingu spliceosomu

Gr 2OH atakuje: NIE

Gr adenylo-2OH atakuje: TAK

E1 tworzy lasso: NIE, bo intron

3OH E1 atakujeE2: TAK

5OH E1 atakuje E2: NIE

Zajdzie splicing

To nie skroci produktu

Powstanie takie samo bialko

2.Gdzie zachodzi aktywny splicing przez spliceosomy

ATP nie ma nic wspolnego

Tworzy się lasso

3. Nukleosomy (eukariota)

+Element wchodzący w sklad chromosomow

+upakowane DNA

- DNA jest otoczony przez histony (jest odwrotnie)

+ rdzen 140 pz

+ rdzen ma 4 rodzaje histonow (jest ich 8)

+ nulkeosomy scisle upakowane

4. splicing Tethahy..

+ potrzebny kofaktor GTP, GDP

+ kofaktor atakuje miejsce 5i traci PPi z konca 5

+ kieszen (zawiera czasteczki prekursorowego RNA)

+ nie potzrba ATP

- kofaktor atakuje miejsce 3

5. Oczyszczony preparat w 3 probowkach:

1. bufor, preRNA

2. bufor, rybonukleotyd

3. ekstrakt komorkowy,

Wszedzie zajdzie splicing

6. Kompleks cAMP-CAP

+ chroni przez DNAza -87 do -47

- po jego związaniu do atenuatora trp może być transkrypcja genow struktury (nie wiaze się do miejsc atenuatora)

- represor transkrypcji (aktywator)

+ w operonie ora wpływa na geny struktury

- chroni miejsca -48 do -5

+ w obecności ara wpływ na geny struktury

7. Bialko C operonu ara

+ wiaze z araO1 hamujac transkrypcje genu

- wiaze araO2 aktywuje geny struktury

+ w obecności cAMP-CAP geny struktury operonu i związanie arabinozowego do araO1 i araI

+ powoduje wypetlenie gdy zwiaze się z araO2 i araI

- wiaze się specyficznie z DNA w obecności arabinozy

8. Bakteriofag λ

+ syntetyzuje tylko represor λ w bakterii lizogenicznych

+ ssDNA = recA oddzialywuje z nim także represor λ

+ zostaje uwolnione z chromosomu bakteryjnego z kompleksu rexDNA

+ gdy nic nie atakuje zmienia to w fazie lizogenicznej jest on obecny z uwagi na represor który ulega autoregulacji

+ profag (DNA) jest także lizogenicznej gdy nie aktywuje zmiany bo represor λ

+ cro wiaze się do or3 i wtedy hamuje represor (gen c1)

- bialko cro związany z or1 to hamuje synteze represora

9. Operon arabinozowy

+ konstutywna synteza bialka C

+ w obecności cAMP-CAP i arabinozy nie da się zapętlić

- cAMP-CAP i araboni. może przeprowadzac transkrypcje genow struktury, nie znacznie obniżają szybkość (nie da się powiedziec jak jest naprawde)

- może syntezowac ara przy wykorzystaniu bialek powstałych z bialek struktury

10. Odcinek liderowy mRNA

- w obrebie genu trpD

+ transkrypcja operonu trp kontrolowana atenuatorem

+ krotki transkrypt liderowy konczy sekwencja poliU

+ reszty trp obecne obok siebie

+ niedobor trp bo brak tryptofanylo-tRNA rybosom zatrzymuje na kodujących trp

+ rybosom zatrzymuje tak ze transkrypcja ponizej atenuatora

+ koduje krotki peptyd testowy z 2 resztami trp

11. tRNA

+antykodon i miejsce wiazania aminokwasu na przeciwległym koncu

+ zawiera od 70-90 nukleotydow

+ duza czesc jest sparowana

+ CCA na koncu 3

+ wiele zmodyfikowanych nukleotydow

- zawiara ACC gdzie przyłączone aminokwasy (nie bo CCA)

- zudowany z heliakalnych końców tworzących litre U

12. Translacja mRNA u eukariota

- formylometionylo-tRNA rozpoczyna lancuch

?- kodon AUG wybierany przez parowanie rejonu mRNA

- mala podjednostka powyżej miejsca transkrypcji

+ konczy czynnik uwalniający (u prok one hydrolizuje GTP)

+ biora udzial bialka wiążące z 5mRNA i inne czynniki inicjujące

+ może być regulowane przez kinazy białkowe

13. Translacja

+ aminokwasy dodawane do N-konca

+ aminokwasy aktywowane przez przyłączenia do tRNA

+ rozpoczęcie na kodonie przez specyficzne pre tRNA i kodonu

+ wiazanie peptydowe aminoacylo-tRNA miejsce A a reszta peptydylowa miejsca P

+ ….. od Estery

14. Dostępne mutanty: i+ typ dziki

ic konstytutywna mutacja

is niewrażliwy na atak

o+ sekwencja dzikiego typu

oc mutacja konstytutywna

z+ sekwencja dzika

mutacja konstytutywna = nieregulowana, prowadzi do konstytutywnej aktywności

  1. ic o+ z+

sekwencja nietypowa(nieregulowana) nie ma represora, bo substancja nieaktywna, -, niewrazliwa na laktoze = konstytutywna ekspresja zachodzi

  1. is o+ z+

niewrazliwa na laktoze bo ona nie jest zwiazana, -, laktoza jest obecna i tak (jest represja bo nie ma laktozy lub IPTG który …… represor)

  1. i+ oc z+

  2. ic o+ z+

represor nierozrozniany, typ dziki

  1. is o+ z+

typ dziki, bo z dominujący, brak syntezy genu

ic nie jest dominujący względem i+

1,2,3 ich synteza nie zalezy od laktozy

2 nie zalezy od IPTG

4 ma fenotyp typu dzikiego, lambda represor w układzie trans

15. Inicjacja translacji u prokariota

+ aminoacylo-tRNA wiaze się do miejsca P

- IF2 oddzialywuje z podjednostka duza

+ IF2 zdolny do hydrolizy GTP dzieki czemu dostarcza energii do translacji

- IF1 i IF3 dostarczaja aminoacylo-tRNA do rybosomu

- tRNA komplementarny do dużego segmentu

16. Translacja mRNA u prokariota

+ mRNA policistronowe

+ miejscem translacji jest kodom met AUG za sekwencja bogata w puryny komplementarna do 16s tRNA

- czynniki elongacyjne EF-Ts i EF-Tu

- formylimet-tRNA powstaje w reakcji

- EF-Ts wiaze nukleotyd podlegający hydrolizie

+ Tu oddzialuje z tRNA oprocz fmet-tRNA

17. Syntetaza aminoacylo-tRNA

- estry aminokwasow syntetyzowane na koncu 3 tRNA

- reakcja katalizowana I etepowa (nie bo II etepowa)

+ produkt przejściowy którego gr karboksylowa tworzy wiazanie bezwodnikowe z ortofosforanem

+ większość syntetazy ma walsciwosci korekcyjne

- wszystkie syntetazy rozpoznaja tRNA oddzialywuja z petla antykodonu

- potrzebne ATP

18. Rybosomy

Prokariota:

30s: 16s RNA, 21 bialek

50s: 5s i 23s RNA, 34 bialka

Eukariota:

40: 18s RNA

60s: 5s 5,8s 28 s RNA

19. Histony

- 140 par zasad otacza 8 bialek pistonowych

- bialka aktywatorami transkrypcji podjednostek

+ replikacja eukariotycznego chromosomu to kilka widelek

+ bialka kodowane przez pojedyncze kpie genow

+ sekwencje powtórzeniowe to znaczny % Dna eukariotycznego

+ silnie zasadowe bialka, ładunek `+'

+ bialka histonowe H1, H2A, H2B, H3, H4

- H1 rdzen nukleosomu

+ geny kodujące histony wielokrotnie powtorzone

- mRNA histonowe ulega adenylacji

- histony nie maja intronow

+ histony wiaza się z nicia wodzaca

20. bialka zaangażowane w regulacje transkrypcji

- musza aktywowac polimerze DNA (może!)

- musza aktywowac polimerze RNA (może!)

- musza mieć zdolność wchodzenia do jaderka

- mogą się wiazac do DNA w bialkach pecherzyja

- musi wiazac się do histonow (może!)

+ zdolność wchodzenia do jadra (ale tylko u Eukariota)

21. kontrola ekspresji genow

+ alternatywny splicing

+ sekwencje doprowadzające mRNA

+ rozluźnienie struktur upakowanych

+ regulacja tworzy kompleks inicjujacy transkrypcje

- … polipeptydow

22. Kontrola ekspresji genow u Eukariota

+ geny w rozluźnionej chromatydzie nieaktywne, zanim nie zostana zaktywowane

- eukariotyczna polimeraza RNA samodzielnie transkrybuja mRNA

+ aktywator i represor działają przez zmiany tworzenia kompleksu inicjującego

- wiekszosc genow znajduje się pod kontrola jednego aktywatora i represora (nie bo jest ich wiele)

+ pufy aktywuja transkrypcje, luzno struktura

23. Telomerazy

+ nie uzupełnię nici opóźnionej

+ odwrotna transkryptaza 5-3

+ RNA jest matryca (nie starerem)

+ syntezuje nic w kierunku 5-3

+ wymaga matrycy

+ syntezuje nic bogata w G

- ma aktywność polimeraza RNA

24. Represor λ

- wiaze jako monomer

- ma miejsce wiazanie ara

+ wiaze specyficznie do sekwencji DNA rozpoznawanych przez bialko cro

+ rozne powinowactwo do miejsc OR

- rozne powinowactwo przez bialko lex A (nie bo rex A)

25. Splicing alternatywny

+ segregacje selektywna RNA

+ regulacja kompleksu inicjującego translacje

+ przetasowanie ekspresji genow

26. β - galaktozydaza

+ obecny w roznych stężeniach zalezne od źródła wegla uwywanego do wzrostu

+ jest produkowana z jednostki genu zwanej operonem

+ hydrolizuje wiazanie 1,4 β oligosacharydy laktozy i tworzy galaktore i glukoze

+ tworzy wiazanie 1,6 β oligosacharydu allolaktozy

- jest allosterycznie aktywowana przez niemetaboliczny składnik IPTG (izopropylotiogalaktozyd)

+ jej poziom wzrasta w koordynacji z primazy galaktozydowej acetylofransferazy tiogalaktozydowej

27. Operon laktozowy

i - koduje bialka które zakloca aktywność polimerazy RNA

- koduje bialko wiążące allolaktore

- jest genem regulatorowym

- koduje represor lac

p - jest promotorem lac operonu

- zawiera specyficzne sekwencje wiazania dla polimerazy RNA

- zawiara miejsce wiazania dla kompleksu cAMP-CAP

o - jest operonem lac

- zawiera specyficzne sekwencje wiazanie dla represora lac

z - koduje bialko wiążące allolaktore

y i a - koduje premaze galaktozydowa

- koduje represor lac

miejsce wiążące CAP - zawiara miejsce wiazania dla kompleksu cAMP-CAP

28. Bakteriofag λ w fazie litycznej

+ syntetyzuje 3 rozne klasy mRNA które sa wyznaczane poprzez czas po infekcji ich pojawienia

+ niosa programowana synteze bialek potrzebnych do replikacji genow i produkcja ich strukturalnych komponentow

+ tworza produkty genow N i Q które działają jako bialka regulacji pozytywnej, prowadzace sekwencyjna λ- kodującego bialka

- początkowo produkuje dwoe czasteczki jadra, pelni role inhibitora syntezy λ represora, a iina gra role konca transkrypcji

+ N i Q zapobiagaja konca transkrypcji

+ N powoduje produkcje bialka niezbędnego do replikacji DNA faga i rekombinacji

+ Q potrzebne gdy sa transkrybowane geny bialka glowki i ogonka wirusa oraz bialka konieczne do lizy komrki gospodarza

29. Operon Trp

+ kontrola ilości policystronowego mRNA tworzącego na poziomie inicjacji transkrypcji

+ kontrola ilości policystronowego mRNA tworzącego na poziomie terminacji transkrypcji (atenuator sygnal terminacji)

+ sekwencja i skoordynowana produkcja 5 enzymow metabolizmu tryptofanowego z pojedynczej nici RNA

- sekwencja i skoordynowana produkcja 5 enzymow metabolizmu trptofanowego z 5 roznych mRNA produkujących w roznych stężeniach

+ produkcja transkryptow roznych rozmiarow zalezna od poziomu tryptofanu w komorce

30. RNA liderowy operonu trp

+ mutacja delecji w DNA kodującym 3 koniec RNA daje powod do wzrostu poziomu biosyntezy enzymow biosentyzowanych przekształcających trp

+ krotki otwarcie ramki odczytu zawierającego kodon trp , wśród innych istnieje wewnątrz literowego RNA

+ liderowy RNA koduje peptyd którego zdlonosc syntezy monitoruje poziom trp-tRNA w komorce

- liderowe RNA zawiera wiazanie rybosomowe Shinego-Dalgaro ( nie bo sa dwie sekwencje)

+ liderowy RNA może tworzyc dwie alternatywne i wzajemnie wykluczające się drugorzędowe struktury

+ struktura literowego RNA In vivo zalezy od pozycji rybosomy translacyjnego go

31. lac represor - wiaze sekwencje DNA z rejonami o podwojnej symetrii

- przeszkadza w funkcjonowaniu plimerazy RNA przez związanie z DNA

λ represor - wiaze sekwencje DNA z rejonami o podwojnej symetrii

- przeszkadza w funkcjonowaniu plimerazy RNA przez związanie z DNA

- efekty regulatorowe sa antagonizowane bialkiem rho

- inaktywowane przez recA

- reguluje wlasna synteze

- wspodziala z powtarzalna sekwencja wariantow z ich operonami

- stymuluje inicjacje transkrypcji

- bierze udzial jako pozytywny i negatywny regulator

trp represor - wiaze sekwencje DNA z rejonami o podwojnej symetrii

- przeszkadza w funkcjonowaniu plimerazy RNa przez związanie z DNA

kompleks cAMP-CAP - wiaze sekwencje DNA z rejonami o podwojnej symetrii

- stymuluje transkrypcje roznych operonow katabolicznych

- stezenie zalezy od poziomu glukozy

- stymuluje inicjacje transkrypcji

bialko araC - reguluje wlasna synteze

- bierze udzial jako pozytywny i negatywny regulator

- przeszkadza w funkcjonowaniu plimerazy RNA przez związanie z DNA

- stymuluje inicjacje transkrypcji

bialka N i Q λ - stymuluje transkrypcje przez stlumienie terminacji transkrypcji

atenuator operonu trp - wymaga syntezy bialka do funkcjonowania

- zaley od ściśliwości powiazanie transkrypcji i translacji

- oddzalywuje przez poziom aminoacyloacylo-tRNA w komorce

- wymaga rybosomow

bialka rybosomalne - wymaga rybosomow

- kontrolowany przez represje translacyjna

- reguluje wlasna synteze

- oddzalywuje przez poziom aminoacyloacylo-tRNA w komorce

rRNAs i tRNAs - wymaga rybosomow

- oddzalywuje przez poziom aminoacyloacylo-tRNA w komorce

- wymaga PPPP

rekombinowany hin - przeksztalca orientacje promotora w stosunku do represora genu

- lamie i rozdziela wiazania fosfodiestrowe DNA

- wiaze sekwencje DNA z rejonami o podwojnej symetrii



Wyszukiwarka

Podobne podstrony:
ożychar, Politechnika Wrocławska, W3 - chemiczny
ożychar, Politechnika Wrocławska, W3 - chemiczny
ożychar, Politechnika Wrocławska, W3 - chemiczny
oleksyszyn, Politechnika Wrocławska, W3 - chemiczny
oleksyszyn, Politechnika Wrocławska, W3 - chemiczny
oleksyszyn, Politechnika Wrocławska, W3 - chemiczny
oleksyszyn, Politechnika Wrocławska, W3 - chemiczny
Technologia chemiczna W5, Politechnika Wrocławska- Wydział Chemiczny (W3), Podstawy technologii chem
Technologia chem - pyt na egz, Politechnika Wrocławska- Wydział Chemiczny (W3), technologia chemiczn
CWICZENIE 1, Politechnika Wrocławska- Wydział Chemiczny (W3), miernictwo i automatyka, Skrypt (analo
Eng Ger Pol, Politechnika Wrocławska- Wydział Chemiczny (W3), miernictwo i automatyka, Skrypt (analo
02 Identyfikacja polimerów, Politechnika Wrocławska - Wydział Chemiczny, Semestr VI, Tworzywa polim
cw 6 W3, Politechnika Wrocławska, W-5 Wydział Elektryczny, Fizyka G2, fiza laborki, fiza kalit, fizy
2b-pecherz, PWR Politechnika Wrocławska, INSTRUKCJE DLA STUDENTÓW Z TECHNOLOGII CHEMICZNEJ
14-odparaf, PWR Politechnika Wrocławska, INSTRUKCJE DLA STUDENTÓW Z TECHNOLOGII CHEMICZNEJ
Pomiary wybranych właściwości fizycznych i chemicznych dielektryków, Pim c8, Politechnika Wrocławska
Ożychar, W3 - chemiczny
15-smar, PWR Politechnika Wrocławska, INSTRUKCJE DLA STUDENTÓW Z TECHNOLOGII CHEMICZNEJ

więcej podobnych podstron