background image

Inny aspekt kontroli germinacji : antyterminacja 
)jawiska sprzyjają e wy oro  poli erazy RNA, doko ywa ie wy oru ko ty ua ji lu  ger i a ji 
transkrypcji. 
Po 1. Antyterminacja transkrypcji 

– za hodzi, gdy poli erazy ig oruje syg ały ger i a ji i ko ty uuje 

wydłuża ie ła u ha. 

Klu zowy  ele e te  jest  iałko a tyter i a yj e.  

Miejs e a tyter i a yj e jest położo e zaraz koło  iejs a pro otorowego. W ty   iejs u przyłą za 

się  iałko. Oddziaływuje o o z poli erazą tworzą  ko pleks. Skutkie  oddziaływa ia jest z ia a 

ko for a yj a oraz  rak reak ji  a syg ał ter i a yj y. 
Znaczenie biologiczne: 
dakteriofag la

da  a  ardzo krótki okres ży ia  ykl i ek yj y jest  ardzo krótki . dezpośred io po 

w ik ię iu do ko órki do hodzi do wielu  zy oś i,  p. do tra skryp ji. dakteriofag la

da  ie  a 

włas ej poli erazy. Wykorzystywa e są   startery. 

Sy teza  a sa y  po zątku daje   tra skrypty „ ajw ześ iejsze”. Te tra skrypty są względ ie 
kr

ótkie.  

)ależą o e od  iejs a ger i a ji. Te tra skyrpty kodują    iałka: oro i N 

– antyterminator – to  iałko przyłą za się w ge o ie do    iejs :  utL i  utR. 

A ty ter i ator przyłą za się za pro otore .  

Kolej y  ykl: „opóź io e w zes e” kodują  iałko Q, które jest kolej y  a tyter i atore . 

Ma y skoordy owa ą w  zasie ekspresję ge ów zależ ą od ko órek tra skryp yj y h.  
Kontrola germinacji transkrypcji 
 - atenuacja 
Zachodzi u   bbbaaakterii. 
Tra skryp ja i tra sla ja jest połą zo a.  RNA  ie ulega dojrzewaniu. 

Klu ze  do zaist ie ia ate ua ji jest fakt, że ter i a ja i tra sla ja są sprzężo e. )e zjawiskie  

ate ua ji  a y do  zy ie ia w reak ja h  iosy tezy a i okwasów. 

Opero  tryptofa owy ulega regula ji przez ate ua ję. 

Po rozpo zę iu tra skryp ji opero  tra skryptu  oże przyją    struktury  ają e dia etral ie róż e 
znaczenie dla operonu: 

  )  ałą spi ką – terminacja 

  ) dużą spi ką – elongacja – a tyter i a ja  zawiera sekwe je, w który h  ie  oże powsta  

ała spi ka  

Tylko jede  z  odeli  oże ist ie .  

Jak to się dzieje, że powstaje ktoraś z pętli? 

Skład: tra skrypt, ry oso , poli eraza 

Położe ie poli erazy i ry oso u jest i e w o u spi ka h. 
Duzia spinka 
Gdy w ko ór e jest  ała iloś  tryptofa u. Tra skryp ja opero u jest skute z a. W o u 

tra skrypta h, są krótkie ra ki od zytu kodo u tryptofa u. W po liżu 5’ ko a tra skryptu ry oso  

zatrzy uje się w  iejs u ra ki od zytu tryptofa u. Skutkuje to ty , że RNA tworzy strukturę dużej 

spi ki do włosów – a tyter i a ja. Ko órka wy zuwa  ałą iloś  tryptofa u. 

Mała spi ka 

Iloś  tryptofa u jest duża, tak  y ry oso   ógł poko a  opero y tryptofa owi. Ry oso  przesuwa 

się. Pozostaje alter atyw a struktura –  ałej spi ki – syg ał ger i a ji. 
Energetycznie faworyzowana struktura: duzia spinka. 
Regulacja 

zależ a od represora jest  ajważ iejsza  włą za, wyłą za opero , le z  ie jest poz a a.  

Ate ua ja dostraja tra skryp ję. 
Atenuacja u Bacillus subtilis 
 - brak represora 
 - 

ate ua ja  ie zależy od ry ooso u 

 - 

rak sprzęże ia tra skryp ji i tra sla ji 

 - 

duża i  ała spi ka. 

background image

Co jest  zy ikie  iloś i  tryptofa u? 

diałko TRAP –  iałko wiążą e RNA z opero e  tryptofa owego. Tworzy ko pleks z tryptofa e  i 

RNA powstają y   a opero ie tryptofa owy . 

Ko pleks tworzy regular ą kulistą strukturę, która sil ie zależy od iloś i tryptofa u. Duża struktura 
powstaje, gdy jest spory zapas tryptofanu. 
 - 

ała iloś  trp –  rak TRAP. Tra skrypt jest prawidłowy,  ie  astępuje ter i a ja, powstaje duża 

spinka 
 - 

duża iloś  Trp – TRAP aktyw e, powstaje  ała spi ka i terminacja. 

Poli eraza  zase  się  ofa, towarzyszy te u wypar ie DNA od  atry y.  ’ ko ie  jest odrywa y od 

atry y. Może to  ie  fatal e skutki. 

A y zapo ie  pro le o , frag e t  usi  y  od ięty. 

Poli eraza RNA  a aktyw oś  poli erazową  hydrolity z ą   ie jest  iągle aktyw a. Potrze e są jej 

  zy iki  iałkowe: Gred i GreA  ie posiadają właś iwoś i  ukleazowy h, sty ulują poli erazę,  y 

jej aktyw oś   yła włą za a. 

Igła,  a której z ajdują się   wzaje

ie  aładowa e a i okwasy i Mg + do  hodzi do 

przem

iesz ze ia  e tru  aktyw ego, uaktyw ie ie  ukleazy. Odpowiedź jest i dukowa a  a 

iedo ór waru ków wzrostu. )

iejsza y jest pozio  tra skryp ji. 

W odpowiedzi ś isłej pośred i zą związki ppGpp i pppGpp  alar o y  

Są sy tezowa e w waru ka h  iedo oru a i okwasu przez  iałko RelA, które tworzy ko pleks z 

DksA. Wyłą za tra skryp ję. 

diałko DksA w ko pleksie z alar o e  oddziałwyuje podo ie jak polimeraza, co hamuje 

tra skryp ję.  
mRNA eukariotyczne 

– podlega dojrzewaniu 

mRNA bakteryjne 

– nie podlega procesowaniu 

 
rRNA. 
Ry oso al y RNA u E.  oli i  akterii jest tra skry owa y jako  ałoś . Pierwotna wersja rRNA to pre-

rRNA. Występuje w kilku kopia h. 

Należy wydzieli  frag e ty odpowiedzial e rRNA. )a  ię ie są odpowiedzial e ry o ukleazy. Miejs a 

takie są  harakterystyczne – dwuniciowe RNA. 
Rybonukleaza III E i F tnie 

–  ie  a właś iwoś i e do ukleazy. 

 
tRNA 
wszystkie pre-

tRNA podlegają dojrzewa iu,  ieważ e, gdzie się z ajdują. Dojrzewa ie  ie jest 

trywialne. Pre-tRNA 

przyj uje spe yfi z ą strukturę wyższego rzędu – liś ia ko i zy y z   

dodatkowy i struktura i spi ki do włosów. Dojrzewa ie  astępuje od  ’ ko a. 

Ry o ukleazy E i F od i ają struktury od  ’ ko a. 
RNaza D 

– od udowuje kolej e reszty idą  od  ’ ko a  7 reszt) 

RNaza P 

– od i a frag e t ze spi ką przy 5’ ko u. 

Powstaje dojrzała  ząste zka 

Na ko u  ’ z ajduje się  harakterysty z a sekwe ja CCA. 
RNaza Z 

– dobudowuje CCA –  iezależ a od  atry y RNazy 

RNaza P 

– złożo a z wielu podjed ostek, jed ą z  i h jest RNA, sko pleksowa y z  iałka i. diałko 

hybrydowe 

– relikt czasu. 

tRNA i rRNA są skutkie  pro esowa ia 
modyfikacje chemiczne 

– w większoś i z  i h reszty  ukrowe ulegają  odyfika jo ,  p.: 

pseudourydy a, dihydrourydy a, doty zy zasad  posz zegól y h ato ów . Są także takie 

odyfika je, w który h wy i a e są  ałe  ukleotydy. 

Liczba modyfikacji 

– w tRNA z ie iają i h  harakter  olekular y. )większa się spe yfi z oś  ty h 

ząste zek. ) ie io e tRNA  ają zwiększo ą zdol oś  do oddziaływa ia z większą iloś ią kodo ów.