background image

 

 

Ekogenetyka -GENETYKA 

Ekogenetyka -GENETYKA 

POPULACJI

POPULACJI

background image

 

 

background image

 

 

Populacja mendlowska

   

     duża liczebność

    diploidalność

  

 rozmnażanie płciowe 

płodność par 

panmiksja

-stan 

→ puli genów 

 powstający w wyniku 

→ kojarzenia losowego.

kolejne pokolenia nie zachodzą na 
siebie
 

background image

 

 

Populację jako całość łączy pula 
genowa
 

 Pula genowa jest zbiorem wszystkich 
alleli tworzących genotypy osobników 
danej populacji.

 

background image

 

 

Pula genów

• suma genów obecnych u wszystkich 

osobników w populacji w danym czasie; 

• pula genowa, która zachowuje stały skład 

ilościowy i jakościowy przez szereg 

pokoleń jest w stanie równowagi; 

• może ona ulegać zmianom na skutek 

działania dryfu genetycznego, zmian 

systemu kojarzeń osobników, mutacji, 

doboru naturalnego oraz migracji

•  zmiany w częstościach genów i 

genotypów wywołane wymienionymi 

czynnikami są podstawą ewolucji. 

background image

 

 

Do czynników zaburzających 
równowagę                      i 
powodujących zmianę częstości 
występowania alleli należą :

-  nielosowe kojarzenie par (kojarzenie 
selektywne) powoduje nadmiar  homozygot lub 
heterozygot

 

-  migracje –wnoszą do populacji osobniki z 
genotypami z innej puli genowej

-  mutacje-prowadzą do powstania nowych 
alleli, niszczą istniejące allele

    selekcje –selekcja, czyli dobór obniża 
płodność, lub przeżywanie niektórych 
genotypów

-  dryf genetyczny (przypadek), daje 
zróżnicowane szanse w sukcesie 
poszczególnych alleli z jednego pokolenia na 
drugie

background image

 

 

• Dryf genetyczny (dryft genetyczny) polega na 

fluktuacji

 częstości neutralnego allelu genu w 

populacji, wynikające z losowego charakteru 

przekazywania genów przez rodziców potomstwu.

• Szybkość eliminacji allelu w populacji zależy od jej 

rozmiaru. Im mniejsza populacja, tym szybciej allel 

ulegnie eliminacji bądź zdominuje populację. 

Dlatego efekt dryfu genetycznego jest łatwiej 

obserwowalny w małych, izolowanych 

populacjach. Przypadkowa eliminacja bądź 

dominacja alleji jest też przyczyną zwiększenia 

homozygotyczności i zmniejszenia różnorodności 

populacji. W skrajnych przypadkach prowadzi do 

zwiększenia wsobności co jest przyczyną recesji 

genetycznej. Przeciwdziała temu mechanizm 

mutacji, który jest podstawowym elementem 

ewolucji biologicznej.

background image

 

 

Najważniejszym zastosowaniem prawa Hardy- 
Weinberga jest obliczanie częstości nosicieli  
(heterozygot) cech autosomalnych 
recesywnych z uwagi na to, że heterozygoty 
są bezobjawowe, a większość zmutowanych 
alleli w nich się znajduje.

Zgodnie z prawem Hardy- Weinberga częstość 
występowania homozygot chorób 
autosomalnych recesywnych wynosi q

2

.

Frekwencja nosicieli jest to częstość 
heterozygot-2pq.

background image

 

 

• Choroby pojedynczych genów powstają w 

wyniku mutacji jednego albo w obydwu 
allelach pary genów autosomalnych w 
chromosomach somatycznych, 
autosomach lub w chromosomie 
płciowym. Stanowią one dużą podgrupę 
ponad 6000 już znanych schorzeń oraz 
znacznie większej liczby chorób 
prawdopodobnie uwarunkowanych 
genetycznie. Ich częstotliwość przekracza 
częstość występowania chorób 
chromosomalnych. 

background image

 

 

• Recesywne autosomalne choroby 

jednogenowe to zwykle zaburzenia genów 

odpowiedzialnych za syntezę białek 

enzymatycznych. Często komórki mogą 

zupełnie dobrze funkcjonować przy bardzo 

niskim poziomie aktywności wytwarzanego 

białka enzymatycznego. W chorobach 

autosomalnych dziedziczonych recesywnie 

chory ma dwie kopie zmutowanych genów, 

których aktywność obniżona jest do zera, 

podczas gdy jego zdrowi rodzice - z jedną 

kopią normalną i jedną nieaktywną - posiadali 

50% normalnej aktywności enzymatycznej. 

background image

 

 

• W przeciwieństwie do przedstawionej grupy chorób, 

dominujące choroby autosomalne są zazwyczaj związane z 

produkcją białek strukturalnych albo nośnikowych, a nie 

enzymatycznych. Kiedy zmutowane geny kodują syntezę 

enzymów (np. w ostrej napadowej porfirii), albo syntezę 

białek receptorowych (np. gdy występuje niska gęstość 

receptorów lipoproteinowych w rodzinnej 

hipercholesterolemii), obniżenie o 50% aktywności 

enzymatycznej lub ilości receptorów przekracza margines 

bezpieczeństwa i wywołuje objawy choroby. 

• Choroba Huntingtona przekazywana jest jako cecha 

autosomalna dominująca , 

• Dystonia jest chorobą, w której dochodzi do wzmożenia 

napięcia niektórych grup mięśni (np. mięśni karku, szyi lub 

kończyn).

background image

 

 

Populacja składa się z N osobników gdzie:

N

D

 –liczba homozygot dominujących

N

H

 –liczba heterozygot

N

–liczba homozygot recesywnych 

W populacji istnieją tylko trzy genotypy dotyczące 
jednego locus, zatem: 

                          

N

+

 

N

+

 

N

=

 

N

background image

 

 

 Częstość genotypu jest to stosunek 
liczby osobników z danym genotypem do 
liczby osobników w całej populacji.

 

Częstość homozygot dominujących:   P

N

/ N

 częstość heterozygot:              P

= N

/ N

 częstość homozygot recesywnych:    P

= N

/

 

N

 

background image

 

 

       

N

+

 

N

+

 

N

=

 

N     / N

       

N

/ N + N

/ N + N

/

 

N = 1

 

        

P

+

 

P

+

 

P

= 1

 Na przykład:    

 N-1000 

 N

D

 (AA)-300 

 N

(Aa)-600 

 N

(aa)-100

P

= 300/1000 = 

0,3 

 P

= 600/1000 = 

0,6  

 P

= 100/1000 = 

0,1 

background image

 

 

Podstawowym pojęciem genetyki 
populacyjnej jest częstość, czyli 
frekwencja genu a dokładnie allelu. 
Jest to stosunek liczby alleli 
określonego rodzaju do liczby 
wszystkich alleli w danym miejscu 
genowym w populacji.

background image

 

 

Częstość genów, alleli opiera się na założeniu, 
że każdy osobnik diploidalny posiada 2 allele  
danego genu.

W populacji składającej się z N osobników jest 
2N alleli.

Homozygoty dominujące mają dwa allele A, zaś 
heterozygoty tylko jeden  allel A.

 

             Łączna liczba alleli dominujących A:   2N

+

 

N

H

    

Częstość allelu A określa się symbolem p

                          p  = (2N

+

 

N

) / 2N

                         p = 2N

D

/2N + N

/2N       

                               

p = P

p = P

+ ½

+ ½

 

 

P

P

H

H

background image

 

 

Częstość allelu 

 

a określamy symbolem  q

                    q = (2N

+

 

N

)/ 2N

                 q = 2N

/

 

2N

 

+ N

/

 

2N           

                           q = P

+

 

½ P

H

 P

+

 

P

+

 

P

= 1

 

p – ½ P

+

 

P

+ q – ½ P

1

      p + q = 1

background image

 

 

Zależności liczbowe między częstością genów a 
częstością genotypów w populacji określa wzór 
prawa Hard`ego-Weinberga:

                               (p+q)

=

  

p

2  

+ 2pq + q

2

Jeżeli przyjmiemy, że p wyraża częstość allelu 
dominującego A, a q częstość częstość allelu 
recesywnego a, to rozkład częstości genotypów 
przedstawia się następująco:

                      (A +a )

= AA + 2Aa +

 

aa

background image

 

 

• prawo Hardy’ego–Weinberga, prawo, które mówi, 

że jeśli w bardzo dużej populacji organizmów 

diploidalnych, rozmnażających się płciowo, o nie 

zachodzących na siebie pokoleniach i pełnej 

losowości kojarzeń, nie ma migracji, nie zachodzą 

mutacje i nie działa dobór naturalny, to częstości 

alleli i genotypów nie ulegają zmianom z pokolenia 

na pokolenie i pozostają w proporcji wyrażonej 

rozwinięciem wielomianu kwadratowego; 

• dla locus o dwu allelach A i a, których częstości są, 

odpowiednio p i q (p+q=1), częstość genotypów 

można obliczyć z dwumianu (p+q)

2

: częstość AA 

wynosi p

2

, częstość Aa, 2pq, a częstość aa, q

2

• jeśli w locus są 3 allele, to rozwinięciu należy 

poddać trójmian (p+q+r

2

.

background image

 

 

Każda populacja, w której rozkład 
częstości genotypów potwierdza tą 
zależność jest w stanie równowagi 
genetycznej, niezależnie od absolutnych 
wartości p i q i o ile na populację nie 
działają czynniki, które mogłyby 
zakłócać częstość genów, to w 
następnym pokoleniu częstość 
genotypów będzie taka sama.

PRAWO HARDY`EGO-

WEINBERGA

background image

 

 

ZADANIE 1.

ZADANIE 1.

background image

 

 

Stosując prawo Hardiego-Wainberga oblicz 
częstość nosicieli chorób autosomalnych 
recesywnych w Europie.

JEDNOSTKA 

JEDNOSTKA 

CHOROBOWA

CHOROBOWA

CZĘSTOŚĆ

CZĘSTOŚĆ

URODZEŃ 

URODZEŃ 

 

 

CZĘSTOŚĆ 

CZĘSTOŚĆ 

NOSICIELI (2pq) 

NOSICIELI (2pq) 

ALKAPTONURIA

 1/100000

FENYLOKETONUR
IA

1/10000

ALBINIZM

1/40000

GŁUCHOTA 
WRODZ.

1/50000

MUKOWISCYDOZ

A

1/16000

UPOŚL. UMYSŁ.-

REC.

1/2000

GALAKTOZEMIA

1/30000

background image

 

 

Model rozwiązania zadania 

1

q² =1/1600                     p = 1-q

q = √ 1/1600                  p = 1- 0, 
025

q = 0, 025                      p = 0, 975 
      

2pq = 2 x 0, 975 x 0, 025 

2pq = 0, 049 

0, 049 x 1000 = 49 nosicieli na 
1000 mieszkańców Europy

background image

 

 

ZADANIE 2.

ZADANIE 2.

Serologiczne właściwości grup krwi MN u człowieka 
determinowane są przez parę alleli M i N. Za 
pomocą testu precypitacyjnego można odróżnić 
grupy: M, MN, N, które bezpośrednio odpowiadają 
genotypom MM, MN, NN . W zbadanej populacji 
ludzkiej liczącej 730 osobników grupę krwi M miały 
22 osoby, grupę MN - 216 osób, a grupę krwi N – 
492 osoby.

Oblicz częstość alleli i genotypów w badanej 
populacji.

background image

 

 

MODEL ROZWIĄZANIA ZADANIA 2.

N – 730  N

NH

 – 22       N

MN

 – 216    

N

NN

 – 

492

Obliczanie frekwencji genotypów :

P

D

 (MM) = N

MM

 / N = 22 / 730 = 0, 030

P

H

 (MN) = N

MN 

 / N = 216 / 730 = 0, 296

P

 (NN) = N

NN

  / N = 492 / 730 = 0, 624

P

D

 + P

H

 + P

R

 = 1 

Obliczanie frekwencji alleli :

 

p (M) = P

+ ½ P

H

 = 0, 030 + ½ 0, 296 = 0, 

178

q (N) = P

R

 + ½ P

H

 = 0, 674 + ½ 0, 296 = 0, 

822

background image

 

 

ZADANIE 3

 L

M   

L

L

M

  L

 L

N

  L

L

L

N

 

ABORYGENI

0,024 0,304 0,67

2

ESKIMOSI

0,662 0,310 0,02

8

NIEMCY

0,284 0,499 0,21

7

JAPOŃCZYCY

0,285 0,510 0,20

5

POLINEZYJCZYC
Y

0,125 0,417 0,45

8

POPULACJA

FREKWENCJE  
GENOTYPÓW

FREKWENCJE
ALLELI

Na podstawie frekwencji genotypów oblicz 
frekwencję alleli

background image

 

 

MODEL ROZWIĄZANIA ZADANIA 

MODEL ROZWIĄZANIA ZADANIA 

3

3

p = P

+ ½ P

 

p = 0, 024 + ½ 0, 304 

p = 0, 176

 

q = 0,672 + ½ 0, 304

q = 0,824

p + q = 1 

0, 176 + 0, 824 = 1

background image

 

 

ZADANIE 4

Układ grupowy krwi ABO u ludzi warunkują geny 
z następującego szeregu alleli wielokrotnych :  
L

A

,  L

,  l

  Stosując prawo Hardy- Weinberga ustal na 
podstawie frekwencji alleli frekwencje genotypów 
i fenotypów w badanych populacjach. 

background image

 

 

L

A

  L

B

  l

L

L

A

L

L

B

L

L

B

L

B

  l 

ll

L

A

 

l

gr
A

gr
B

gr

A
B

gr

O

(p

)

(q

)

(r)   

p

2

2p

q

q

2

 

   

2q

r   
 

r

2

2p

r

p

2

+

 

2p

q

2

+

 

2q

r

2p

q

r

2

0,
36

5

0,
16

3

0,
57

0

0,

26
2

0,

07
4

0,

65
7

0,
08
2

0,
10
9

0,
80
4

0,
06
7

0,
02
2

0,
91
0

POPULAC-

JA

POLACY

FRAN-
CUZI

FILIPIŃ- 

CZYCY

INDIANIE
Z AM. PD.  

 

FREKWENCJE  

 

ALLELI

        

 

FREKWENCJE   

GENOTYPÓW

FREKWENCJE   

FENOTYPÓW

   

background image

 

 

background image

 

 

background image

 

 

background image

 

 


Document Outline