ENG Linkage cwiczenia, 4 ROK, GENETYKA, GIEŁDY


Linkage Problem 1

Calculate likelihood ratio and LOD score for the hypothesis that autosomal dominant disease is linked with locus A, whose alleles were typed in the family below. Assume  (theta)=0

0x08 graphic

Linkage Problem 2

Calculate likelihood ratio and LOD score for the hypothesis that autosomal dominant disease is linked with locus A, whose alleles were typed in the family below. Assume  (theta)=0,05, 0.1, 0,2. What can you conclude?

0x01 graphic

Linkage Problem 3

Calculate likelihood ratio and LOD score for the hypothesis that autosomal dominant disease is linked with locus A, whose alleles were typed in the families below. Assume  (theta)=0.

Assuming that in both families the same disease occurs calculate the total LOD score.

0x08 graphic
0x08 graphic

Linkage Zadanie 1 (Odpowiedź)

Oblicz iloraz prawdopodobieństw (szanse) i ich logarytm (LOD score) dla hipotezy, że choroba o dziedziczeniu autosomalnym dominującym jest sprzężona z locus A, którego allele oznaczono w przedstawionych poniżej rodzinach. Przyjmij  (theta)=0

0x08 graphic
0x01 graphic

LR 2 LOD 0,301030

Linkage Zadanie 2 (Odpowiedź)

Oblicz iloraz prawdopodobieństw (szanse) i ich logarytm (LOD score) dla hipotezy, że choroba o dziedziczeniu autosomalnym dominującym jest sprzężona z locus A, którego allele oznaczono w przedstawionych poniżej rodzinach. Przyjmij  (theta) =0,05, 0.1, 0,2. Jakie wnioski na temat lokalizacji genu wywołującego chorobę można wyciągnąć z obliczeń?

0x01 graphic

LR 32,2687697779, 39,6718580736 27,4877906944

LOD 1,50878 1,59848 1,4391398

Linkage Zadanie 3 (Odpowiedź)

Oblicz iloraz prawdopodobieństw (szanse) i ich logarytm (LOD score) dla hipotezy, że choroba o dziedziczeniu autosomalnym dominującym jest sprzężona z locus A, którego allele oznaczono w przedstawionych poniżej rodzinach. Przyjmij  (theta)=0. Zakładając, że w powyższych rodowodach występuje ta sama choroba jaki jest łączny LOD score?

0x08 graphic
0x08 graphic

16:1, 1,204 LR 8 LOD 0.903089

Razem 128:1 2,107

11

23

13

11

12

13

34

12

23

23

33

13

23

13

11

12

13

11

23

13

11

12

13

34

12

13

23

13

11

12

13

12

2 3

2 3

3 3

1 2



Wyszukiwarka

Podobne podstrony:
Linkage cwiczenia, 4 ROK, GENETYKA, GIEŁDY
Linkage cwiczenia Inne, 4 ROK, GENETYKA, GIEŁDY
odpowiedzi do testu, IV rok, Genetyka - giełdy
sadowka27.01.2012, VI rok, Genetyka, gena-prezki, 15 - Medycyna sądowa, giełdy, Giełdy - od kloca, i
giełda z sądówki, VI rok, Genetyka, gena-prezki, 15 - Medycyna sądowa, giełdy, Giełdy - od kloca, in
genetyka 3 cw, III rok, Genetyka kliniczna, Wykłady i ćwiczenia
genetyka protokoly, medycyna, I rok, biologia, giełdy, egzamin praktyczny
gielda 2 grupa 10.2008, VI rok, Genetyka, gena-prezki, 15 - Medycyna sądowa, giełdy, Giełdy - od klo
gr. 7, VI rok, Genetyka, gena-prezki, 15 - Medycyna sądowa, giełdy, Giełdy - od kloca, inne
GENETYKA KLINICZNA rozpiska, VI rok, VI rok, Genetyka, Genetyka, GENETYKA VI, !Giełdy
sądowa giełda przepisana ze zdjec, VI rok, Genetyka, gena-prezki, 15 - Medycyna sądowa, giełdy, Gieł
moja wersja ...sadowka27.01.2012, VI rok, Genetyka, gena-prezki, 15 - Medycyna sądowa, giełdy, Giełd
gielda 2 grupa, VI rok, Genetyka, gena-prezki, 15 - Medycyna sądowa, giełdy, Giełdy - od kloca, inne
Genetyka - Ćwiczenia 2010, III rok, Genetyka kliniczna

więcej podobnych podstron