Paweł Mackiewicz, Jolanta Zakrzewska-Czerwińska, Stanisław Cebrat
Rys. 5. Zróżnicowanie filogenetyczne mikroorganizmów w obrębie (A) 704 sekwencjonowanych ge-nomów prokariotycznych (baza GOLD, www.genomesonline.org); (B) 177 szczepów izolowanych z próbek środowiskowych, weterynaryjnych i klinicznych (18); (C) 3767 kultur prokariotów pochodzących z Australijskiej Kolekcji Mikroorganizmów (www.biosci.uq.edu.au/micro/culture/culture.htm).
Selektywny wybór genomów do sekwencjonowania wynika z trudności izolowania niektórych mikroorganizmów ze środowiska oraz ich dalszego hodowania w klasycznych warunkach laboratoryjnych. Dotyczy to szczególnie mikroorganizmów, w tym wielu przedstawicieli Archaea, żyjących w skrajnych warunkach środowiskowych: halofili, termofili i acidoflli. Większość znanych i analizowanych genomów należy do mikroorganizmów charakteryzujących się szybkim wzrostem na standardowych, sztucznych podłożach w warunkach tlenowych i przy średnich temperaturach. Ocenia się, że te organizmy stanowią mniej niż 1% całego świata mikroorganizmów, czyli do odkrycia i zbadania pozostaje aż 99°o pozostałych (16). Rzeczywiście, przedstawiony rozkład sekwencjonowanych genomów odpowiada proporcjom
14 PRACE PRZEGLĄDOWE
Wyszukiwarka