1.Narysować peptyd z aminokwasów (kwasowy+zasadowy+niepolarny chyba)
  pytanie o aminokwasy niebiałkowe i narysować cykl mocznikowy z amino niebiałkowym

2. Wymienić klasy enzymów, z czym związana jest ta klasyfikacja, co to są koenzymy, jeszcze cos z liazami

Systematyka enzymow:

Klasa Typ reakcji

1. Oksydoreduktazy….……………………..Utlenianie, redukcja

2. Transferazy___________________Przenoszenie grup

3. Hydrolazy ……………………………………….Reakcje hydrolizy (przenoszenie grup funkcyjnych na czasteczki wody)

4. Liazy _________________________Utworzenie wiazan podwojnych poprzez dodanie lub usuniecie grupy

5. Izomerazy……………………………………….Izomeryzacja (wewnatrzczasteczkowe przeniesienie grup)

6. Ligazy ________________________Ligacja (polaczenie) dwoch substratow na koszt hydrolizy ATP

Ad 1 dehydrogenazy, reduktazy

Ad 2 metylotransferazy, fosfotransferazy i td

Ad 3 esterazy, lipazy, fosfatazy, glikozydazy, peptydazy, amidazy

Ad 4 przebiegaja bez udzialu wody, woda może być produktem, dekarboksylazy, syntazy

Ad 5 epimerazy

Ad 6 karboksylazy, syntetazy aminoacylotrna, syntetaza glutaminowa.

Oksydoeduktazy

Transferazy

Hydrolazy

Liazy

Izomerazy

Syntetazy (ligazy)

3. Wzór sumaryczny glikolizy

C6H12O6 (glukoza) + 2Pi + 2ADP + 2NAD -> 2 PIROGRONIANY + 2ATP + 2 NADPH + 2H + 2H2O

4. Enzym z kl. oksydoreduktaz, reakcja z nim

Np. dehydrogenaza jabłaczanowa => jabłczan + NAD => szczawiooctan + NADH + H

5. Cykl Krebsa, wzór sumaryczny,
  enzymy regulujące, co blokuje, wypisać reakcje z nimi

Acetylo CoA + 3NAD + FAD + GDP + Pi =>2CO2 + 3NADH + FADH2 + GTP + 2H + CoA

Cykl mocznikowy

Enzymy regulujące C.K.C.

• synteza cytrynianowa -> hamuje obecnośc cytrynianu i ATP

• dehydrogenaza izocytrynianowa -> NADH i ATP, aktywuje ją ADP

• dehydrogenaza alfa-ketoglutaranowa -> NADH i bursztynylo CoA

• dehydrogenaza pirogronianowa -> NADH i acetylo CoA

6. Rubisco (karboksylaza rybulozo - bisfosforanaowa) - reakcja przemiany w jakim procesie zachodzi

Reakcja rubisco zachodzi w fazie ciemnej fotosyntezy. Jest to kluczowa reakcja wiązania węgla w tej fazie fotosyntezy. Stanowi ona część cyklu Calvina

Rubisco- umiejscowiony w stromie kondensacja cząsteczki CO2 z rybulozo 1,5 bisfosforanem w wyniku czego tworzy się 6-cio węglowy intermediat pośredni szybko hydrolizującu do 2 czast. 3 fosfoglicerynianu. Reg. Akt (1) karboksylacja w Cyklu Calvina (normalne war. atm). (2) aktywność - oksygenowa gdy rubisco dołącza zamiast CO2 ->O2 wówczas powstaje fosfoglicerynian i 3-fosfoglicerynian ponieważ fosfoglicerynian może zostać odzyskany i użyty reakcji biosyntez co prowadzi do wydzielenia CO2 i NH4 proces fotoddychania.

7. Pytanie o jony amonowe, reduktaza azotanowa, jakaś syntetaza chyba glikozydowa

8. Na podstawie zasad azotanowych i sacharydów podać różnice w budowie chemicznej RNA i DNA
  DNA III, prymaza, replikacja

Replikacja- dokonuje się przez rozplecenie podwójnego heliksu na dwie nici i dobudowuje do każdej z nich dwie nowe Pojedyncze nici pierwotne DNA po rozkręceniu stanowia matryce. Polimeraza DNA która katalizuje syntezę DNA z trifosforanów deoksyrybonukleo zydów przy udziale startera(odcinka RNA z wolna grupą OH w pozycji3') i matrycy DNA Substratem replikacji jest zaspól czterech zasad a produktem difosforan który w reakcji nasennej katalizowanej przez difosfatazę nieorganiczna ulega rozkładowi do fosforanu dostarczając dodatkowa energie Wiązanie dniestrowe tworzy się przez równoczesne zaczepienie fosforanu nukleozydu na wolnej grupie OH przy C-3' istniejącego już łańcucha. Kierunek replikacji jest odwrotny do polarności łańcucha matrycy a wszystkie izolowane dotychczas polimerazy prowadza dobudowe łańcucha w kierunku 5'-3'. Dlatego tylko na 1 nici nastepuje wydłużenie łańcucha w kierunku zgodnym z ich przesuwaniem jest to proces ciągły. Synteza drugiej nici odbywa się w przeciwnym kierunku-ten proces nie jest ciagły, a łańcuch potomny jest syntetyzowany jednocześnie w wielu miejscach w postaci fragmentów Okazaki które SA nastepnie łączone Pierwsza z tych nici jest nazywana

Replikacja DNA − endoenergetyczny proces, w którym podwójna nić DNA (podwójna helisa) ulega skopiowaniu. Replikacja jest semikonserwatywna (półzachowawcza) - w każdej z dwóch uzyskanych podwójnych nici DNA będzie jedna nić macierzysta i jedna nowa. Nie licząc niewielkiego prawdopodobieństwa (ok. 1 błąd na 10⁹ nukleotydów, dla porównania błąd transkrypcji - 1 na 10⁴) wystąpienia błędu obie cząsteczki DNA będą identyczne. Proces ten zachodzi podczas interfazy

Substratami tego procesu są:

• matryca DNA;

• trifosforany deoksyrybonukleotydów (dNTP);

• ATP/CTP/GTP - energia dla helikaz.

W procesie tym stwierdzono wiele aktywności enzymatycznych (udział enzymów) tj.:

• helikazy - rozrywają wiązania wodorowe między nićmi matrycowego DNA, rozkręcając helisę i umożliwiając rozpoczęcie procesu;

• prymaza - syntetyzuje starter;

• polimerazy DNA - polimeryzuje zgodnie z zasadą komplementarności fosforany deoksyrybonukleotydów;

• egzonukleaza - usuwa startery RNA z nici;

• ligaza DNA - uzupełnia brakujące wiązania fosfodiestrowe w szkielecie nowozsyntetyzowanej nici DNA;

• różne enzymy pomocnicze.

Różnice między DNA a RNA