ODDYCHANIE KOMÓRKOWE, Operon - biologia - notatki


0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic

0x08 graphic

0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic


0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic

0x08 graphic
0x08 graphic

0x08 graphic

0x08 graphic

0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic

ODDYCHANIE KOMÓRKOWE/WEWNĄTRZKOMÓRKOWE

* proces polegający na uwalnianiu energii w czasie utleniania prostych związków organicznych

* zachodzi w cytoplazmie (oddychanie cytoplazmatyczne) oraz we wnętrzu mitochondriom

UTLENIANIE GLUKOZY

* ważne paliwo biochemiczne (biologiczne)

* jej cząsteczki można łatwo utlenić do dwutlenku węgla i wody, a sporą część energii zmagazynować w ATP (resztę organizmy tracą w postaci ciepła)

C6H12O6 + 6 O2 -- 6 CO2 + 6 H2O + 2872 kJ (+666 kcal)

* bezpośrednie, gwałtowne spalanie glukozy prowadziłoby do śmierci termicznej każdej komórki

* na proces oddychania komórkowego składa się więc wiele reakcji katalizowanych enzymatycznie, co pozwala na stopniowe uwalnianie energii w małych porcjach (jest to rozwiązanie bezpieczne i skuteczne/wydajne)

* wstępne zaktywowanie glukozy przed jej ufosforylowaniem (kosztem ATP)

CZYNNIKI WPŁYWAJĄCE NA ODDYCHANIE KOMÓRKOWE

* intensywność oddychania zależy od organizmu, rodzaju komórki, jej wieku, liczby mitochondriów lub chwilowego zapotrzebowania na energię

- intensywność jest więc wysoka w komórkach młodych, w organizmach szybko rosnących (u roślin w tkankach twórczych), a także tam, gdzie wykonywana jest praca mechaniczna (np. w mięśniach szkieletowych) lub wytwarzane są duże ilości ciepła

- niewielka jest intensywność w komórkach zwierząt zapadających w sen zimowy

- bardzo niska jest intensywność procesu w komórkach przetrwalników, zarodników i nasion znajdujących się w stanie spoczynku

* istotnym czynnikiem wpływającym na intensywność oddychania komórkowego jest tlen oraz inne czynniki, oddziałujące na jego enzymy

* u osób uprawiających sport w takich narządach, jak serce, wątroba, czy mięśnie szkieletowe dochodzi do niewielkiego zwiększenia wydajności oddychania komórkowego, większa jest także sprawność m.in. układu sercowo-naczyniowego i płuc

- w komórkach tych narządów możliwe jest syntezowanie przenośników transportujących elektrony NADH cytoplazmatyczne bez ponoszenia strat

- odbywa się to z udziałem FAD, lecz na NAD+

* niektóre białka cytochromowe (cytochrom a oraz cytochrom a3, tworzące kompleks zwany oksydazą cytochromową) są końcowymi przenośnikami elektronów w łańcuchu oddechowym i bardzo łatwo ulegają zablokowaniu przez takie substancje, jak tlenek węgla (CO) czy cyjanek potasu (KCN)

- związki te są więc niebezpiecznymi truciznami

- tlenek węgla ponadto blokuje hemoglobinę

GLIKOLIZA

* pierwszy etap utleniania glukozy - zachodzi w cytoplazmie

* tworzy ciąg beztlenowych reakcji, w których glukoza rozkładana jest do 3-węglowego pirogronianu

* sumaryczna reakcja glikolizy uwzględniająca zysk energetyczny netto:

C6H12O6 + 2 ADP + Pi + 2 NAD+ -- 2 CH3COCOO- + 2 ATP + 2 NADH + 2H+ + H2O

* powstaje glukozo-6-fosforan i jest izomeryzowany do fruktozo-6-fosforanu

* podniesienie poziomu energetycznego procesu pośredniego przez ufosforylowanie kolejnej reszty fosforanowej z ATP

* powstaje fruktozo-1,6-difosforan i jest rozkładany do dwóch cząsteczek 3-węglowych: aldehydu-3-fosfoglicerynowego i fosfodihydroksyacetonu

* fosfodihydroksyaceton jest izomerowany do aldehydu, powtają więc dwie cząsteczki aldehydu-3-fosfoglicerynowego

* pierwsza zyskowna reakcja glikolizy - przekształcenie aldehydu-3-fosfoglicerynowego w kwas 1,3-difosfoglicerynowy

- podczas tej silnie egzoergiczne reakcji dochodzi do odwodorowania, czyli dehydrogenacji z udziałem NAD+ (dinukleotydu nikotynoamidoadeninowego), specjalnej cząsteczki umożliwiającej przenoszenie elektronów i jonów H+

- dochodzi także do przyłączenia nieograniczonej reszty fosforanowej do kwasu

FOSFORYLACJA SUBSTRATOWA ADP + Pi -- ATP

* do jej przeprowadzenia wykorzystywane są wysokoenergetyczne wiązania cząsteczki 1,3-difosfoglicerynianu

* powstałe cząsteczki

3-fosfoglicerynianu są przekształcane w

2-fosfoglicerynian, który ulega odwodnieniu: powstają dwie cząsteczki fosfoenolopirogronianu

FOSFORYLACJA SUBSTRATOWA ADP + Pi -- ATP

* przeniesienie reszty fosforanowej z fosfoenopirogronianu na ADP

* produktem reakcji jest pirogronian

WYDAJNOŚĆ ENERGETYCZNA REAKCJI

* około 2% energii swobodnej wiązań glukozy można zgromadzić w ATP

- z 1 mola glukozy powstają netto 2 mole wiązań ATP (każdy mol ok. 30,5 kJ)

- całkowitemu spaleniu 1 mola towarzyszy wydzielenie 2868 kJ ciepła (2% - ok. 57 kJ)

* produktami glikolizy są 2 cząsteczki pirogronianu i 2 cząsteczki NADH

DALSZY ROZKŁAD PIROGRONIANU W WARUNKACH BEZTLENOWYCH

* w warunkach beztlenowych pirogronian nie może być dalej utleniany - glikoliza prowadziłaby do zwiększenie liczby zredukowanych cząsteczek NADH i zostałaby zablokowana przez brak NAD+

* w organizmie człowieka (w mięśniach) oraz u pewnych bakterii możliwe jest wówczas zredukowanie pirogronianu do mleczanu (wodorem z NADH)

* pozwala to bez straty dalej przeprowadzać glikolizę, ponieważ odtwarzany jest zapas niezredukowanego NAD+

CH3 ---- C --- COO- --- CH3 --- C --- COO-

Pirogronian mleczan

FERMENTACJA MLECZANOWA

* fermentacja kwasu mlekowego

* zachodzi, gdy reakcje przekształcania cukru - glukozy - w kwas mlekowy zachodzą w komórkach bakterii mlekowych

C6H12O6 + 2 ADP + 2 Pi -- 2 CH3CHOHCOO- + 2 ATP

FERMENTACJA ALKOHOLOWA

* przekształcanie przez niektóre mikroorganizmy (drożdże winne, pewne bakterie) glukozy w pirogronian i następnie pirogronianu w alkohol etylowy

C6H12O6 + 2 ADP + 2 Pi -- 2 CH3CH2OH + 2 ATP

CYKL KREBSA

* drugi etap utleniania glukozy - zachodzi w mitochondriach (matrix)

* pirogronian przemieszczaja się do mitochondriów z cytoplazmy

* reakcja ogólna cyklu dla jednej reszty acetylowej:

Acetylo-CoA + 3 NAD+ + 1 FAD+ + ADP + Pi -- 2 CO2 + 3 NADH + FADH2 + ATP + CoA

REAKCJA POMOSTOWA

* reakcja egzoergiczne, nieodwracalna

* zachodzi w matrix mitochondrium

* polega na oksydacyjnej dekarboksylacji pirogronianu

* podczas reakcji powstaje dwutlenek węgla

* dochodzi też do dehydrogenacji substratu (biorcą elektronów i jonów H+ jest NAD+), co prowadzi do powstania 2-węglowej grupy acetylowej, która przyłączana jest do cząsteczki koenzymu A (CoA)

* powstaje acetylo-CoA

CYKL

KREBSA

* kondensacja 4-węglowego szczwiooctanu z grupą acetylową dostarczoną przez acetylo-CoA

* produktem reakcji jest

6-węglowy trikarboksylowy cytrynian

* wszystkie te reakcje, podczas których powstaje wiele produktów pośrednich, prowadzą do odtworzenia 4-węglowego szczawiooctanu (cykl się zamyka)

DEKARBOKSYLACJA

* zachodzi dwukrotnie podczas cyklu

DEHYDROGENACJA

* zachodzi trzykrotnie z udziałem NAD+, powstają więc 3 cząsteczki NADH oraz jednokrotnie z udziałem innego przenośnika wodoru - dinukleotydu flawinoadeninowego, czyli FAD (powstaje jedna cząsteczka FADH2)

FOSFORYLACJA SUBSTRATOWA

* powstaje 1 cząsteczka - najpierw GTP, potem ATP

BILANS ENERGETYCZNY

* gdybyśmy doprowadzili do zatrzymania oddychania komórkowego, korzyści energetyczne byłyby znikome, nawet jeśli całość zysku pomnożyliśmy przez dwa (z 1 cząsteczki glukozy powstają przecież 2 cząsteczki pirogronianu)

* bilans energetyczny reakcji pomostowej wraz z cyklem Krebsa:

2 CH3COCOO- + 8 NAD+ + 2 FAD + 2 ADP + 2 Pi --- 6 CO2 + 8 NADH + 2 FADH2 + ATP

* w równaniu uwagę zwraca duża liczba cząsteczek zredukowanych przenośników

* ich nadwyżkowe elektrony są zasobne w energię, którą można wykorzystać w utlenianiu końcowym

UTLENIANIE KOŃCOWE

* trzeci etap utleniania glukozy - zachodzi w błonach grzebieni mitochondrialnych

* w błonach grzebieni znajdują się organiczne przenośniki tworzące swoisty łańcuch, w którym przemieszczają się elektrony

* sumaryczny zapis równania tlenowego rozkładu glukozy:

C6H12O6 + 6 O2 + 36 ADP + 36 Pi -- 6 CO2 +6 H2O + 36 ATP

PRZEBIEG PROCESU

* energia elektronów przypływających w łańcuchu oddechowym umożliwia wykonanie pracy osmotycznej polegającej na aktywnym przepompowaniu jonów H+ z matrix mitochondrium do przestrzeni błonowej

* w ten sposób po obu stronach błony grzebieni tworzy się gradient protonowy (wynikający ze znacznej różnicy stężeń jonów H+ po obu stronach błony)

* różnica potencjałów przekracza 200 mV

* nadwyżka jonów H+ może wracać do matrix tylko przez specjalne białka tworzące swoiste molekularne tunele w błonie

- jony H+ przemieszczające się w tunelach z dużą energią kinetyczną umożliwiają syntezę ATP

- przyjmuje się, że każda para elektronów z NADH pozwala na przepompowanie takiej liczby jonów H+, że możliwe jest zsyntezowanie 3 cząsteczek ATP

- elektrony z FADH2 obdarzone są mniejszą energią - każda para umożliwia zsyntezowanie 2 cząsteczek ATP (nadwyżkowe elektrony z FADH2 przekazywane są na łańcuch oddechowy w innym miejscu - o niższym poziomie energetycznym)

* przemieszczające się w łańcuchu oddechowym elektrony trafiają ostatecznie na tlen, co prowadzi do dołączenia jonów H+ (ze środowiska) i powstania wody (oprócz CO2) drugiego, końcowego produktu oddychania tlenowego

* jest to fosforylacja oksydacyjna - energii do pracy pompy protonowej umożliwiającej syntezę ATP dostarczają elektrony redukujące tlen

BILANS ENERGETYCZNY

* jeśli przyjąć, że z 1 cząsteczki pirogronianu uzyskuje się 4 cząsteczki NADH i 1 cząsteczkę FADH2

* zysk energetyczny wynosi 14 cząsteczek ATP (4*3 + 1*2)

* w glikolizie z każdej cząsteczki glukozy powstają dwie cząsteczki pirogronianu, więc bilans wyniesie

28 cząsteczek ATP

* dodając do tego cząsteczki ATP z fosforylacji substratowej, otrzymujemy 36 cząsteczek ATP

* powstające w glikolizie 2 cząsteczki NADH oddają elektrony i jony do wnętrza mitochondriom

- odbiorcą jest FAD, a zatem każda cząsteczka NADH w glikolizie syntezuje 2 cząsteczki ATP

* oznacza to około 38% wydajności

* z najnowszych badań wynika, że wydajność oddychania tlenowego jest nieco mniejsza i wynosi netto 30-32 moli ATP z każdego mola glukozy, przyczyną jest najprawdopodobniej mniejsza ilość powstającego ATP w wyniku fosforylacji oksydacyjnej

* oddychanie tlenowe dostarcza znacznie więcej energii niż oddychanie beztlenowe

Cecha

Oddychanie beztlenowe

(fermentacja mleczanowa)

Oddychanie tlenowe

Substrat oddechowy

glukoza

glukoza i tlen

Produkt końcowy

kwas mlekowy

dwutlenek węgla i woda

Miejsce zachodzenia

cytozol

cytozol i wnętrze mitochondrium

Etapy

glikoliza i odtwarzanie NAD+

glikoliza, reakcja pomostowa, cykl Krebsa, utlenianie końcowe

Liczba moli ATP z jednego mola glukozy:

* brutto

* netto

* 4 mole ATP

* 2 mole ATP

* 40 moli ATP

* 36 moli ATP (lub mniej)

UTLENIANIE TŁUSZCZOWCÓW

* tłuszcze są doskonałym, wysokokalorycznym paliwem biologicznym, ponieważ kwasy tłuszczowe zawierają wiele atomów wodoru (ich elektrony mają dużą energię potencjalną)

PRZEBIEG PROCESU

* kwasy tłuszczowe są enzymatycznie rozkładane na związki 2-węglowe (reszty octanowe) łączące się z CoA w acetylo-CoA

* proces zachodzi w matrix mitochondriom i nazywamy go

Beta-oksydacją

* dochodzi do pofragmentowania cząsteczki kwasu tłuszczowego na 2-węglowe reszty octanowe dołączane do kolejnych cząsteczek koenzymu CoA

* powstające cząsteczki acetylo-CoA włączane są w cykle Krebsa i dalej zachodzi utlenianie końcowe w łańcuchu oddechowym

* inny produkt hydrolizy tłuszczów - glicerol - jest po przekształceniu w fosfodihyroksyaceton zużywany w glikolizie

BILANS ENERGETYCZNY

* efektem bezpośredniego, całkowitego utlenienia 1 mola np. kwasu palmitynowego (związku 16-węglowego) jest około 9780 kJ energii cieplnej

* w pośrednim procesie utleniania wewnątrzkomórkowego z mola kwasu palmitynowego powstaje netto około 125 moli wiązań ATP, co daje wydajność w granicach 38%, a więc porównywalną z utlenianiem glukozy

* z 1g tłuszczu uzyskuje się ponad

2 razy więcej energii niż z cukrów

* kwasy tłuszczowe są doskonałym źródłem energii dla mięśnia sercowego oraz mięśni szkieletowych (znajdują się tam w stanie relaksacji)

SYNTEZA TŁUSZCZÓW ZAPASOWYCH

* dochodzi do niej, gdy w organizmie znajduje się nadwyżka surowców energetycznych (np. glukozy), których nie można zużyć na chwilowe potrzeby, ani do syntezy glikogenu

* zasadnicze znaczenie ma synteza kwasów tłuszczowych, przeprowadzana przez złożone cytoplazmatyczne kompleksy enzymatyczne (jeśli syntezowane są fosfolipidy błonowe, ostatnie reakcje syntezy przeprowadzają kompleksy enzymatyczne wbudowane w błony siateczki śródplazmatycznej gładkiej

* głównym substratem w syntezie kwasów tłuszczowych jest acetylo-CoA

* acetylo-CoA jest też wyjściowym substratem syntezy cholesterolu

UTLENIANIE AMINOKWASÓW

* w organizmie człowieka (oraz zwierząt) zużycie własnych białek w komórkach na cele energetyczne jest ostatecznością (dzieje się tak w warunkach długotrwałego głodzenia)

PRZEBIEG PROCESU

* reakcje zużywania aminokwasów rozpoczynają się od odłączenia grupy aminowej (deaminacji)

* produktami tych reakcji są łańcuchy węglowe

(tzw. ketokwasy) oraz jon anionowy (NH4+)

* w komórkach człowieka łańcuchy węglowe po przemianach mogą być włączone w glikolizę (tak jest np. z produktami deaminacji alaniny i seryny) lub do cyklu Krebsa (jak glutamina czy arginina)

* jon amonowy jest silnie toksyczny, dlatego w organizmie człowieka jest szybko przekształcany w substancję mniej toksyczną i dobrze rozpuszczalną w wodzie - mocznik

* w ciągu doby wydalamy kilkanaście gramów mocznika w postaci stężonego moczu

* mocznik z krwią wędruje do nerek, gdzie jest wydalany

* nadmiar azotu z aminokwasów jest usuwany przez cykl ornitynowy

* rozkład nadwyżki zasad azotowych przedstawia się inaczej

- w komórkach człowieka puryny przekształcane są w kwas moczowy (niewielkie jego ilości wydalamy z moczem), a pirymidyny są rozkładane do mniejszych cząsteczek, które następnie włączane są do szlaków podstawowych

* organizmy licznych zwierząt przetwarzają NH4+ w kwas moczowy lub wydalają amoniak bez dalszych przekształceń

CYKL MOCZNIKOWY/ORNITYNOWY

* w rzeczywistości w komórkach człowieka zużycie większości aminokwasów rozpoczyna się od przeniesienia reszty aminowej (reakcja transminacji) z rozkładanego aminokwasu na jedną z dwóch par cząsteczek: glutaminian lub pirogronian

* pierwszy przekształca się wówczas w glutaminę a drugi w alaninę

* aminokwasy te wydzielane do krwi wędrują z nią do wątroby

* w komórkach wątrobowych glutamina i alanina ulegają deaminacji, a powstający jon amonowy natychmiast przetwarzany jest w tzw. karbamylofosforan

* związek ten jest włączany do cyklu mocznikowego (ornitynowego, aminokwasów niebiałkowych)

* cykl ten zachodzi częściowo w cytoplazmie i częściowo w mitochondriom, gdzie sprzężony jest z cyklem Krebsa

* cykl mocznikowy jest silnie endoergiczny (do wytworzenia 1 mola mocznika zużywane są 4 mole wiązań wysokoenergetycznych)



Wyszukiwarka