Pytania 2011

1.Jakie uszkodzenia są u pacjentów po radioterapii -> DSB, naprawiane przez HR, NHEJ, SSA

2. Jak można zbadać uszkodzenia w Xeroderma pigmentosum?

-UDS- niezaplanowana synteza DNA

- test na przeżywalność na UV

3. Schemat HR i NHEJ

a) podpisać białka

b) czynniki indukujące DSB:

- endogenne np. zatrzymanie widełek w czasie replikacji

-egzogenne np. prom. X

-fizjologiczne np. V(D)J rekombinacja

c) białka rozpoznające DSB, wspólne dla HR i NHEJ gama-H2AX

4. I etap biotransformacji

-opisać enzymy

- od czego zależy

-konsekwencje biotransformacji

5. uszkodzeni wprowadzane do proliferującej komórki

- DSB powstające w czasie załamania widełek replikacyjnych naprawiane tylko przez HR!!

-uszkodzenia naprawiane przez TLS i MMR!!! (systemy odpowiedzialne za naprawę uszkodzeń w czasie replikacji

6. o czym świadczy wysoki poziom foci gama-H2AX - o poziomie DSB i sprawności naprawy DSB, ale nie wskazuje czy w naprawę jest zaangażowane HR czy NHEJ

7. wymienić choroby z niestabilnością chromosomową : AT, ATLD, NBS, FA, BS, WRN i heterozygoty BRCA1/2 i opisać jedną z nich na poziomie pacjenta, komórki i genetycznym

Np. NBS -poziom pacjenta: małogłowie, zaburzenia immunologiczne, niewielkie upośledzenie umysłowe etc.

-na poziomie komórki: radiowrażliwość, niestabilność chromosomowa, RDS, zaburzona faza S cyklu komórkowego

- na poziomie genetycznym: mutacje w genie NBS, najczęściej dochodzi do mutacji del5 pz w pozycji 657 w eksonie 6

8. zaproponować doświadczenie jak można zbadać czy związek jest mutagenny i jak udowodnić jaki typ uszkodzenia był zaangażowany w naprawę uszkodzeń wprowadzonych przez ten związek

a) testy na mutagenność:

test oceny indukcji aberracji chromosomowych

test oceny indukcji mutacji punktowych

należy wykonać 2-3 z tych testów In vitro

po wyniku dodatnim

należy wykonać 2-3 testy In vivo

po wyniku dodatnim

długotrwałe badania na zwierzętach

b) detekcja uszkodzenia

c) test na przeżywalność mutanta tego związku i innych mutantów

1. Jakie białka koduja kompleks MRN? Podaj funkcje.
2. Wymień 5 czynników genotox. oraz typy uszkodzeń DNA.
3. Wymień metody umożliwiające wykrycie poj. Pęknieć
4. Wymień choroby związane z radiowrażliwością pacjentów (krótko! objawy kliniczne jednej wybranej choroby).
5. Wymień fazy cykly kom. i punkty kontrolne.
6. Jakiego rodzaju uszkodzenia usuwane są przez NER+ głowne etapy.
7.Rysunek jakiegos schematu (podpisac białka zaangażowane w porces).
8.Wymień przyklady reakcji charakter. dla fazy I biotransformacji ksenobiotyków.
9. Wymień sytsemy naprawy DNA zaangażowane w naprawę DSB.
10.Jakie znasz metody analizy uszkodzeń DNA w kom. ssaków.
11. jakie zespoły chorobowe związane są z NHEJ.
12. Wymień sposoby odp. kom. na uszkodzenie DNA.
13. Jakie znasz zastosowanie metody kometkowej.

1. Opisać NER
2. grupy komplementacyjne FA
3. defekt- choroba- szlak naprawy
4.uszkodzenia indukowane przez ROS+ opisać system naprawy
5. MMR- opisać + choroba
6. Funkcje cytochromu z biotransformacji
7. metody analizy pęknieć w DNA-wymienić+ zasada działania
8. XP ( opisać fenotyp , czy zmiany na poziomie komórkowym?)