Rok III |
Semestr |
VI |
|||
|
|||||
Nazwa przedmiotu |
BIOLOgia molekularna |
||||
Jednostka organizacyjna |
Katedra i Zakład Biologii Molekularnej |
||||
Kierownik przedmiotu |
Prof. Dr hab. U. Mazurek |
||||
Kontakt |
telefon: |
32 364 10 20 |
e-mail: |
umazurek@sum.edu.pl |
|
Liczba godzin |
Wykłady |
15 |
|
|
|
|
Seminaria |
0 |
|
|
|
|
Ćwiczenia |
15 |
|
|
|
|
Ogółem |
|
|
|
|
Punkty ECTS |
|
||||
Opis przedmiotu |
Zasadnicze treści przedmiotu: Poznanie podstaw biologii molekularnej, niezbędnych do zrozumienia mechanizmów działania leku na poziomie przepływu informacji genetycznej w komórkach prokariotycznych, eukariotycznych i wirusach (wpływ leku na replikację, transkrypcję i translację), ze szczególnym zwróceniem uwagi na rekombinację i klonowanie DNA. Poznanie podstawowych metod biologii molekularnej stosowanych w biotechnologii leków, w diagnostyce laboratoryjnej, monitorowaniu skutecznosci leczenia (lekooporność) oraz terapii genowej. |
||||
|
Efekty kształcenia: Rozumienie budowy i funkcji kwasów nukleinowych i białek; opisu i analizy podłoża molekularnego procesów patologicznych; izolowania, oznaczania i amplifikacji kwasów nukleinowych; posługiwania się współczesnymi technikami badania genomu; stosowania technik biologii molekularnej w biotechnologii farmaceutycznej, terapii genowej i diagnostyce |
||||
Zaliczenie/Egzamin/ Metody Oceny |
Egzamin |
||||
Literatura |
1. Węgleński P. (red.) Genetyka molekularna. PWN, Warszawa 1995, 2007 2. Brown T.A. Genomy. PWN, Warszawa 2009 3. Słomski R. (red.): Analiza DNA teoria i praktyka. Wydawnictwo . . Uniwersytetu Przyrodniczego, Poznań 2008 4. Bal J. (red): Biologia molekularna w medycynie, elementy genetyki . . . klnicznej. PWN, Warszawa 2001 2006, 2008 |
||||
Uwagi |
|
||||
BIOLOGIA MOLEKULARNA III ROK 2009/2010
Lp. |
Data |
Temat |
uwagi |
1 |
15-19 luty |
Genomika strukturalna i funkcjonalna w naukach farmaceutycznych. |
|
2 |
22-26 luty |
Struktura i funkcja DNA od A-Z. |
|
3 |
01-05 marzec |
Replikacja DNA (inicjacja, elongacja i terminacja). Znaczenie replikacji DNA w diagnostyce klinicznej i terapii. |
|
4 |
08-12 marzec |
Mutageneza i polimorfizm genetyczny enzymów metabolizujących ksenobiotyki. |
|
5 |
15-19 marzec |
Porównanie replikacji i mechanizmów naprawy DNA w komórkach prokariotycznych, eukariotycznych i wirusach (kolokwium). |
|
6 |
22-26 marzec |
Rekombinacja i mechanizmy naprawy DNA. |
|
7 |
29 III - 02 IV |
Transkryptomika. Mechanizmy regulacji transkrypcji w komórkach prokariotycznych. |
|
8 |
12 - 16 kwiecień |
Eukariotyczne czynniki transkrypcyjne i regulacja transkrypcji. Czynniki epigenetyczne w regulacji ekspresji genów. |
|
9 |
19-23 kwiecień |
RNA w regulacji ekspresji genów (kolokwium) |
|
10 |
26 -30 kwiecień |
Prezentacja sprzętu i aparatury Katedry i Zakładu Biologii Molekularnej wykorzystywanej do analizy kwasów nukleinowych. |
|
11 |
03 - 07 maj |
Proteomika Synteza i obróbka proteomu. |
|
12 |
10 - 14 maj |
Mechanizmy regulacji translacji, modyfikacje potranslacyjne białek. |
|
13 |
17 - 21 maj |
Ksenobiotyki w regulacji aktywności translacyjnej. |
|
14 |
24-28 maj |
Porównanie mechanizmów translacji (kolokwium.) |
|
15 |
31V-04 czerwiec |
Perspektywy biologii molekularnej w medycynie i farmacji. |
|
Zagadnienia do przygotowania na ćwiczenie I
(15-19 luty 2010)
Genomika strukturalna i funkcjonalna w naukach farmaceutycznych
Genomika - dziedzina wiedzy XXI wieku- cele i zadania.
Genomika funkcjonalna: transkryptomika i proteomika.
Genomika strukturalna.
Genomika teoretyczna.
Genomika porównawcza.
Genomika indywidualnych różnic.
Farmakogenetyka a farmakogenomika.
Zadanie:
Podaj przykłady zastosowania genomiki strukturalnej i funkcjonalnej w naukach farmaceutycznych.
Zalecana literatura:
„Genomika - dziedzina wiedzy XXI wieku.” P. Mickiewicz, J. Zakrzewska-Czerwińska, S. Cebrat. Biotechnologia 3(70), 2005 str. 7-22.
Zagadnienia do przygotowania na ćwiczenie II
(22-26 luty 2010)
Struktura i funkcja DNA od A-Z
Powtórzenie wiadomości na temat struktury i funkcji DNA (nukleozydy, nukleotydy, wiązanie fosfodiestrowe, nukleoid, nukleosom).
Kwasy dezoksyrybonukleinowe (struktury jednoniciowe,struktury dwuniciowe, trójniciowe i czteroniciowe).
Tautomeria zasad, Reguły Chargaffa.
Sekwencje powtarzające się w DNA (sekwencje typu satelitarnego DNA).
Struktura chromosomu prokariotycznego.
Struktura chromosomu eukariotycznego.
Żródła obecności uracylu w DNA
Zadanie:
Sekwencja DNA 5' -AGTCTGACT-3' jest odpowiednikiem jakiej sekwencji RNA?
Zalecana literatura:
M. Bukowiecka-Matusiak. LA Wodniak. Struktura DNA od A-Z - biologiczne implikacje różnorodności strukturalnej DNA. Postępy Biochemii 2006 (52) 3.229-238.
Oliński R., Jurgowiak M. Uracyl w DNA - przyjaciel czy wróg? Postępy Biochemii 2009, vol. 55 nr 1, str 25 - 35
Zagadnienia do przygotowania na ćwiczenie III
(01-05 marca 2010)
Replikacja DNA (inicjacja, elongacja i terminacja). Znaczenie replikacji DNA w diagnostyce klinicznej i terapii.
Enzymy biorące udział w replikacji.
Etapy replikacji: inicjacja, elongacja, terminacja.
Replikacja DNA w komórkach eukariotycznych.
Replikacja DNA mitochondrialnego.
Replikacja DNA w komórkach prokariotycznych.
Replikacja DNA wirusowego.
Mechanizmy regulacji replikacji.
Mechanizmy wierności replikacji DNA
Zadanie:
Podaj przykłady leków które hamują poszczególne etapy replikacji.
Zalecana literatura:
Kowala Piaskowska A. Wirus zapalenia wątroby typu C - budowa i replikacja a możliwości terapeutyczne i zjawisko oporności Postępy Biochemii 2006, vol. 52, nr 4 str 399-407
Bębenek A. Mechanizmy wierności replikacji DNA. Postępy Biochemii 2008 vol. 54, nr 1, str 43-56