DNA składa się nukleotydu i jest połączone z zasadami…
Między adenina i tyminą występuje wiązanie… podwójne
opisz i narysuj transkrypcje RNA
na czym polega splicing
wymień aminokwasy posiadające pierścienie aromatyczne (fenyloalanina, tryptofan, tyrozyna)
wymień aminokwasy posiadające gr hydroksylowe (seryna, cysteina, metionina, treonina)
na czym polega elektroforez dwustopniowa - ogniskowanie izoelektryczne(ustala się gradient pH elektroforezy, nakłada próbkę i przykłada napięcie, białka migrują do pH=pI) + elektroforeza
dlaczego niepolarna cząsteczka ulega w wodzie agregacji - z powodu wzrostu entropii wody, - 4 typ oddziaływań słabych w ukł. biologicznych
ile wynosi energia wiązania Van der Walsa - 2-4kJ/mol
wodorowe- 5-30kJ/mol
elektrostatyczne - 5,9kJ/mol
w Ph =12 która z gr w glicynie jest obdarzona ładunkiem - COO-
III-rzędowa struktura DNA u eukariota (narysować) - chromatyna:]
bialka
pierwszorzędowa-określa sekwencję aminokwasów
drugorzędowa- opisuje wzajemne przestrzenne ułożenie reszt aminokwasowych, sąsiadujących ze sobą w sekwencji liniowej
trzeciorzędowa- odnosi się do powiązań przestrzennych i wzajemnego ułożenia reszt aminokwasowych oddalonych od siebie w sekwencji liniowej oraz lokalizacji mostków dwusiarczkowych.
cechy wiązania peptydowego - jest płaskie, 4 cząst. leżą w jednej płaszczyźnie (OCNH), - ma charakter wiązania podwójnego
jakie są odpowiedzi komórki na zmiany w środowisku zewnętrznym
podaj dwa przykłady przyczyn ewolucji - zmienność gatunkowa czyli organizmy się różnią, mutują się, - dobór naturalny, przeżywają i się rozmnażają tylko organizmy najsilniejsze
co to są priony- infekcyjne białka, występujące powszechnie w każdym organizmie i całkowicie niegroźne. Dopiero w sytuacji, gdy zmieniają one swoją naturalną konformację, stają się białkiem prionowym infekcyjnym. Np. zmiana alfa-helisy na beta-kartkę
na czym polega test Elisa- jeden z najpowszechniej stosowanych testów w badaniach biomedycznych, zarówno naukowych, jak i diagnostycznych. Służy on do wykrycia określonych białek w badanym materiale z użyciem przeciwciał poliklonalnych lub monoklonalnych skoniugowanych z odpowiednim enzymem.
Zasada działania testu ELISA polega na tym, że przeciwciało związane z określonym enzymem może specyficznie rozpoznawać dane białko (zawarte w materiale biologicznym), które wcześniej zostało unieruchomione na podłożu. Po dodaniu przeciwciał następuje utworzenie kompleksów immunologicznych, zatem przeciwciało także zostaje unieruchomione. Po wypłukaniu niezwiązanego przeciwciała i dodaniu substratu dla enzymu związanego z przeciwciałem zajdzie reakcja enzymatyczna, czemu z kolei będzie towarzyszyło pojawienie się produktu. Wykrycie jego obecności (może to być np. produkt barwny powstający z bezbarwnego substratu) świadczy o obecności danego białka w badanym materiale. Mierząc z kolei ilość powstającego produktu można także przeprowadzić analizę ilościową.
jaka cząsteczka może być antygenem - może być każda substancja, która wykazuje dwie cechy: immunogenność, czyli zdolność wzbudzenia przeciwko sobie odpowiedzi odpornościowej swoistej, oraz antygenowość, czyli zdolność do reagowania z przeciwciałami oraz TCR(receptor obecny na powierzchni limfocytu T)
w jaki sposób białko tworzy swoja prawdziwa konformacje - poprzez fałdowanie kooperatywne, oraz stopniową stabilizację struktur przejściowych
jak się wykrywa biało enzymatyczne?
co to jest chromosom? Jak powstaje?
2. system replikacji DNA, jakie enzymy biorą w niej udział. Schemat
3. Co to są przeciwciała monoklonalne. Jak powstają?
4. Jaki test immunologiczny jest najlepszy do wykrycia jakiegos białka w komórce?
5. Dlaczego struktura białka samoistnie dąży do uporządkowania, pomimo spadającej entropii?
6. Co to są białka poryny?
7. Skład aminokwasowy i znaczenie biologiczne oksytocyny i glutationu
8. W przypadku enzymu aby wykryc go poddajemy go testowi na:
9. 2 dowody molekularne na istnienie ewolucji
dlaczego replikacja DNA jest semikonserwatywna
narysować i opisać III-rzędową strukturę DNA eukariota
opisać na czym polega i do czego służy test ELISA
jak komórka reaguje na zmiany środowiska (ewolucja)
wymień i krótko opisz 5 metod analizy białek
co to są priony, dlaczego choroba prionowa uważana była za zakaźną
jakie aminokwasy występują na powierzchni białka jeśli znajduje się ono w środowisku wodnym
w jaki sposób białka przyjmują konformacje, co jest diagram Ramahandrama (czy jakos tak)
podaj przyczyny ewolucji
jakie cząsteczki mogą być antygenami
dlaczego czasteczki niepolarne ulegaja agregacji w wodzie
1. molekularne dowody istnienia ewolucji
2. co to jest chromosom, jego struktura, schemat
3. replikacja DNA, enzymy, schemat
4. Co to jest poryna jakie funkcje pełnią aminokwasy, które ją budują
5. Glutation - skład aminokwasowy i funkcje w komórce
6. przeciwciała monoklonalne - schemat powstawania i co to jest
7. jak zlokalizować wiązania siarczkowe w łańcuchu peptydowym
8. jaka jest energia wiązania wodorowego
9. co oznacza, że replikacja jest semikonserwatywna
10. jak wykryć enzym, chodziło chyba o metodę western blotting
1. chodziło o budowę DNA
2. do poryny jeszcze było jakie funkcje pełnią aminokwasy, które ją budują
3. początek syntezy białka u bakterii
4. aminokwasy w bialkach jaka mają konformacje L i podać wyjątek ( ale ten wyjątek nie pamiętam czy był do tego pytania:P)
5. glicyna w pH=7
6. dlaczego następuje uporządkowanie struktury bialka, mimo, że entropia rosnie jakoś tak - chodziło tu chyba o oddzialywania hydrofobowe
7. co to jest diagram Ramachandrana
8. był podany peptyd i trzeba było napisac aminokwas, ktory jest na N- końcu
Sygnał start dla bakterii - narysować (chyba? nie pamiętam)
Ile jest wiązań wodorowych pomiędzy G i C?
Z jakich powtarzających się elementów składa się DNA
1. Przyczyny ewolucji
2. Transkrypcja RNA, schemat, enzym, etapy
3. Test ELISA
4. Dlaczego cząsteczki niepolarne ulegają agregacji?
5. 3rzędowa struktura DNA - schemat i opis
6. Jak komórka reaguje na zmiany środowiska?
7. Co to są priony?
8. W jaki sposób białka przyjmują konformację
9. Cechy wiązania peptydowego
10. Jakie cząsteczki mogą byc antygenami
11. Na czym polega splicing?\
12. Energia wiązania van der Waalsa
13. Glicyna w pH=13
14. aminokwasy aromatyczne - 2 przyklady
15. aminokwasy z grupą OH - 2 przyklady
16. Typ wiązań między tyminą a adeniną
17. Różnice miedzy DNA i RNA
18. Rodzaje zasad w DNA
19. Gdzie w białku znajduja sie pętle i zwroty
20. Co to jest elektroforeza dwustopniowa?
1. co to jest chromosom? Jak powstaje?
2. system replikacji DNA, jakie enzymy biorą w niej udział. Schemat
3. Co to są przeciwciała monoklonalne. Jak powstają?
4. Jaki test immunologiczny jest najlepszy do wykrycia jakiegos białka w komórce?
5. Dlaczego struktura białka samoistnie dąży do uporządkowania, pomimo rosnacej entropii?
6. Co to są białka poryny?
7. Skład aminokwasowy i znaczenie biologiczne oksytocyny i glutationu
8. W przypadku enzymu aby wykryc go poddajemy go testowi na:
9. 2 dowody molekularne na istnienie ewolucji
10. dlaczego replikacja DNA jest semikonserwatywna
1. narysować i opisać III-rzędową strukturę DNA eukariota
2. opisać na czym polega i do czego służy test ELISA
3. jak komórka reaguje na zmiany środowiska (ewolucja)
4. wymień i krótko opisz 5 metod analizy białek
5. co to są priony, dlaczego choroba prionowa uważana była za zakaźną
6. jakie aminokwasy występują na powierzchni białka jeśli znajduje się ono w środowisku wodnym
7. w jaki sposób białka przyjmują konformacje, co jest diagram Ramahandrama (czy jakos tak)
8. podaj przyczyny ewolucji
9. jakie cząsteczki mogą być antygenami
10. dlaczego czasteczki niepolarne ulegaja agregacji w wodzie
Pytania z biochemii
bialko natywne
chromosom, jak powstaje jakis rysunek
wiazanie peptydowe jakiego typu - trans i ze w prolinie cis
diagram ramachandrana
transkrypcja z rysunkiem i enzymy
ultrawirowanie w gradiencie stężeń
liza Komorek szpiczaka
przeciwciała monoklonalane
aminokwasy zasadowe?
test elisa
podstawowa jednostka dna- co tworzy rdzen
12, kinetyka i termodynamika dzialania enzymu
13. reakcje spontaniczne
14.konformacje aminkowasow - L
15. glutation oksytocyna
16. w jakim miejscu antygen wiaze się z przzeciwcialem
17dlaczego struktur abialaka samoistnie dazy do uporządkowania mimo ze entropia rosnie