LR Zadanie 1

Oblicz prawdopodobieństwo poniższych rodowodów zakładając następujące

częstości markera: 1 -0,1; 2-0,2; 3-0,3.

0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic

Porównaj wyniki obliczając LR. Zinterpretuj wynik.

LR Zadanie 2

0x08 graphic
Przyjmując następujące częstości alleli locus A: 1 -0.1; 2 -0,2; 3 -0,3

oblicz szanse, że mężczyzna oznaczony `?' jest spokrewniony z pozostałymi osobami, tak jak pokazano. Jako alternatywę przyjmij, że nie jest on w ogóle spokrewniony z pokazanymi osobami.

0x08 graphic

LR Zadanie 3

Oblicz prawdopodobieństwo poniższego rodowodu przyjmując dziedziczenie autosomalne dominujące, 100% penetrację i częstość zmutowanego genu w populacji - 0,01; 0,02; 0,03; 0,04.

Zapisz wynik w formie log10

0x08 graphic

Powtórz obliczenia przyjmując dziedziczenie autosomalne recesywne.

Jaki zapis jest wygodniejszy?

Który rodzaj dziedziczenia jest bardziej prawdopodobny i ile razy?

LR Zadanie 1 (odpowiedź)

Oblicz prawdopodobieństwo poniższych rodowodów zakładając następujące

częstości markera: 1 -0,1; 2-0,2; 3-0,3.

Porównaj wyniki obliczając LR. Zinterpretuj wynik.

0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic
0x08 graphic

L= 0,0006 L= 0,00006

LR=10

LR Zadanie 2 (odpowiedź)

0x08 graphic
Przyjmując następujące częstości alleli locus A: 1 -0.1; 2 -0,2; 3 -0,3

oblicz szanse, że mężczyzna oznaczony `?' jest spokrewniony z pozostałymi osobami, tak jak pokazano. Jako alternatywę przyjmij, że nie jest on w ogóle spokrewniony z pokazanymi osobami.

0x08 graphic

0,5/2ab= 0,5/ 0,12=4.17

LR Zadanie 3 (odpowiedź)

Oblicz prawdopodobieństwo poniższego rodowodu przyjmując dziedziczenie autosomalne dominujące, 100% penetrację i częstość zmutowanego genu w populacji - 0,01, 0,02, 0,03, 0.04.

0,009801, 0,019208, 0,028227, 0,036864

dD**3+d**2*D**2

=A1*(1-A1)*(1-A1)*(1-A1)+A1*A1*(1-A1)*(1-A1)

0x08 graphic

Powtórz obliczenia przyjmując dziedziczenie recesywne.

d**3 (1-d) =A1*A1*A1*(1-A1)

0,00000099, 0,00000784, 0,00002619, 0,00006144

Który rodzaj dziedziczenia jest bardziej prawdopodobny i ile razy?

23

12

11

23

12

11

1 2

3 3

2 3

2 3

?

23

12

11

23

12

11

1 2

3 3

2 3

2 3

?