1. Zaznacz niewłaściwe stwierdzenie dotyczące DNA:

   1. Helisa DNA ma średnice ok. 20 A

   2. Istnieją wyjątki od reguły, że para zasad znajduję się na jednej płaszczyźnie

   3. W komórkach dominuję lewoskrętna forma DNA

   4. Temperatura topnienia struktury dwuniciowej DNA zależy od stosunku par (

2. Endonukleazy restrykcyjne są enzymami które:

   1. Degradują DNA komórki bakteryjnej, w której są wytwarzane

   2. Przecinają nici DNA w obrębie rozpoznawanej sekwencji

   3. Nie przecinają DNA o odpowiednim wzorze metyzacji

   4. Są ewolucyjnie zachowane w Pro- i Eukaryota

3. Polimeraza III DNA z E. coli jest enzymem który:

   1. Jest niezbędny do usuwania primerów RNA w trakcie syntezy nici opóźnionej

   2. Posiada niższą wierność replikacji niż polimeraza I

   3. Replikuje obie nici DNA jednocześnie

   4. W odróżnieniu od polimerazy I nie posiada aktywności egzonukleazy 5’ do 3’

4. Inicjacja replikacji u E. coli:

   1. Zachodzi w wielu miejscach kolistego chromosomu jednocześnie

   2. Wymaga obecności ATP i białka DnaA (inicjatorowe białko)

   3. Wymaga obecności sekwencji bogatych w pary GC(AT)

   4. Jest procesem stymulowanym przez obecność cAMP

5. Inicjacja transkrypcji u Eukaryota może być stymulowana przez:

   1. Sekwencje Shine-Dalgarne , komplementarne do r-RNA

   2. Wiązanie się rybosomów do mRNA

   3. Białko CAP połączone z cAMP

   4. Czynniki transkrypcyjne wiążące się z sekwencjami DNA położonymi w znacznej (np. kilka tysięcy par zasad) odległości od promotora

6. Intron w transkrypcie zawierający rybosomalny RNA Tetrohymena thermophila jest rybozymem króry:

   1. Wykorzystuje w trakcie reakcji splicingu nukleotyd ATP?

   2. Wykorzystuje w trakcie reakcji splicingu nukleotyd CTP

   3. Tworzy strukturę dwuniciową z egzonem?

   4. Tworzy strukturę dwuniciową z innym intronem

7. Wycinanie intronów i łączenie intronów (splicing) mRNA jest procesem w którym:

   1. Katalizatorem jest polimeraza RNA

   2. Decydującą rolę odgrywa GTP

   3. Uczestniczą cząsteczki RNA znajdujące się w strukturze snRNP

   4. Egzony tworzą formę lassa (lariatu)

8. Inicjaca transkrypcji operonu laktozowego u E. coli jest hamowana przez glukozę. Zjawisko to związane są z tym, że:

   1. Glukoza wiąże się z receptorem Lac

   2. Białko CAP nie wiąże się z rejonem regulatorowym operonu loc

   3. Brakuje białka CAP w komórce

   4. W komórce rośnie stężenie cAMP

9. W strukturze białka mogą tworzyć się wiązania pomiędzy resztami aminokwasowymi. Wybierz w poniższej kombinacji parę która może utworzyć takie wiązanie.

   1. Hetydyna i arginina

   2. Kwas glutaminowy i leucyna

   3. Lizyna i kwas glutaminowy

   4. Tyrozyna i fenyloalanina

10. Inicjacja translacji:

    1. Zachodzi bez udziału GTP

    2. U eukariontów wymaga N-formylometioniny

    3. U eukariontów występuje przy pierwszym kodonie metioniny w transkrypcie

    4. U prokariontów następuje zawsze przy pierwszym kodonie metioniny w transkrycie

11. Podaj jakie nukleotydy są źródłem energii w translacji (włączając etap aktywacji aminokwasów przez syntetazy aminoacylo-tRNA)

ATP, GTP

1. Zaznacz odpowiedź nieprawidłową w poniższym stwierdzeniu.
   Białka opiekuńcze (chaperonowe) są istotne dla komórki ponieważ:

   1. Bez ich udziału niektóre białka nie osiągnęłyby właściwej struktury przestrzennej

   2. Biorą udział w zwijaniu nowo-syntetyzowanych peptydów

   3. Uczestniczą w transporcie białek przez błony lipidowo-białkowe

   4. Ochraniają DNA przed endonukleazami restrykcyjnymi

2. W automatycznym sekwencjonowaniu białek:

   1. W każdym cyklu skraca się łańcuch peptydowy o jeden aminokwas

   2. Wykorzystuję się fluorodinitrobenzen

   3. Możemy w jednym doświadczeniu oznaczyć sekwencje całego łańcucha mioglobiny

   4. Wykorzystuje się chromatografie cienkowarstwową do identyfikacji aminokwasów

3. Mutacja w genie kodującym łańcuch betta hemoglobiny spowodowała silniejsze niż w niezmutowanej hemoglobinie wiązanie kwasu difosforoglicerynowego(DPG). Zmutowana hemoglobina w porównaniu do niezmutowanej będzie:

   1. Wiązała tlen słabiej

   2. Wiązała tlen silniej

   3. Niezdolna do wiązania CO2

   4. Wiązała tlen tak samo

4. Podaj która z podanych poniżej cech wiązania peptydowego jest nieprawdziwa:

   1. Długość wiązania, czyli odległość między C a N jest większa niż w wiązaniu podwójnym.

   2. Atomy wiązania peptydowego znajdują się na jednej płaszczyźnie

   3. H z grupy N-H jest zawsze w pozycji cis do O z grupy C=O

   4. Brak rotacji wokół wiązania peptydowego

5. W katalizie enzymatycznej:

   1. Zmienia się energia swobodna produktów reakcji

   2. Zachodzi obniżenie energii swobodnej aktywacji

   3. Zachodzi podwyższenie energii swobodnej aktywacji

   4. Zmienia się energia swobodna substratów reakcji

6. Modyfikacja białek przez fosforylację jest istotnym elementem regulacji aktywności enzymów. Rodniki których aminokwasów mogą być ufosforylowane?

   1. Alanina

   2. Tryptofan

   3. Tyrozyna

   4. Histydyna – Ja bym dała to

7. Transkarbamoilaza asparaginianowa (ATCaza) jest enzymem allosterycznym katalizującym początkowy etap biosyntezy pirymidyn. Jej aktywność w komórce jest:

   1. Regulowana pozytywnie przez CTP

   2. Regulowana zgodnie z modelem sekwencyjnym Koshlanda

   3. Regulowana niezależnie od obecności ATP

   4. Regulowana negatywnie przez CTP

8. Syntetaza arginylo-tRNA posiada trzy substraty i w związku z tym można wyznaczyć trzy wartości stałej Michaclisa-Menten (Km). Wynoszą one dla Arg – 3x10^-2M, dla t-RNA – 4x10^-3 M, dla ATP – 3x10³M. Tak więc:

   1. Enzym ma najwyższe powinowactwo do tRNA

   2. Translacja jest niezależna od stanu energetycznego komórki

   3. Enzym jest regulowany allosterycznie

   4. Enzym ma najwyższe powinowactwo do ATP

9. W trakcie hydrolizy wiązania peptydowego przez chymotrypsynę następuje przemieszczenie ładunku w centrum aktywnym enzymu

   1. Jakie aminokwasy tworzą centrum aktywne tej proteazy? Ser, His, Asp

   2. Który aminokwas enzymu w centrum aktywnym wiąże się kowalencyjnie z peptydem? Ser

10. Zakreśl prawdziwą cechę nukleosomów:

    1. DNA jest owinięty prawoskrętnie wokół oktameru histonów

    2. Nukleosom jest strukturą zawierającą białka kwaśne

    3. Nukleosom zawiera osiem cząsteczek histonów po dwa z rodzaju: H1, H2A, H2B, H3

    4. Białka histonowe ulegają modyfikacji przez acetylację i fosforylację

11. Wybierz zestaw enzymów, które są niezbędne do konstrukcji hybrydowego (chimerycznego) plazmidu, w procesie klonowania wybranego fragmentu cząsteczki DNA:

    1. Endonukleaza restrykcyjna, polimeraza DNA

    2. Polimeraza DNA, ligaza

    3. Endonukleaza restrykcyjna, ligaza?

    4. Endonukleaza restrykcyjna, polimeraza RNA

12. Wybierz nieprawdziwe stwierdzenie dotyczące struktury genomów:

    1. Chromatyna zawierająca DNA i białka histonowe wchodzi w skład bakteryjnego chromosomu

    2. Chromosom prokariotyczny zawiera na ogół cząsteczkę kolistego DNA

    3. Białka histonowe są elementem strukturalnym i regulującym transkrypcje

    4. Genomy eukariotyczne zawierają wiele miejsc inicjacji replikacji DNA

13. Wybierz zespół danych najlepiej charakteryzujący genom człowieka:

    1. Długość genomu: 1,3x10⁴kb; liczba genomów: 6 000

    2. Długość genomu: 6,7x10¹⁰kb; liczba genomów: nieznana

    3. Długość genomu: 3,4x10⁶kb; liczba genomów: 25 000?

    4. Długość genomu: 4,6x10³kb; liczba genomów: 4 000

14. Topoizomeraza II (gyraza) sprowadza negatywne superskręty do cząsteczki DNA. Zaznacz nieprawidłowy opis tego procesu:

    1. Jest konieczny dla prawidłowej replikacji, transkrypcji, rekombinacji?

    2. Wymaga nacięcia obu nici podwójnej helisy

    3. Zachodzi z wykorzystaniem cząsteczki ATP

    4. Zwiększa liczbę opleceń jednej nici wokół drugiej w helisie DNA

15. Które zdanie najlepiej definiuje wiązanie wysokoenergetyczne:

    1. Jest to wiązanie chemiczne którego zerwanie jest praktycznie nieosiągalne w warunkach fizjologicznych dla organizmu

    2. Jest to wiązanie niezwykle stabilne w roztworach wodnych

    3. Jest to wiązanie którego hydroliza ma dużą dodatnią wartość ∆G

    4. Jest to wiązanie którego hydroliza wiąże się z uwolnieniem dużej ilości energii swobodnej

16. Przyczyną braku przepuszczalności dwuwarstwy względem jonów jest:

    1. Silne oddziaływanie jonów z powierzchnią dwuwarstwy

    2. Brak oddziaływania z resztami węglowodorowymi reszt kwasów tłuszczowych

    3. Konieczność utraty otoczki hydratacyjnej przez jon, co jest procesem termodynamicznie niekorzystnym

    4. Silne wiązanie się jonów z hydrofobowym rdzeniem dwuwarstwy

17. Białka są na ogół mniej ruchliwe w błonach od lipidów, ich ruchliwość może być dodatkowo ograniczona przez:

    1. Tworzenie wielkich agregatów w błonie, oddziaływanie z elementami cytoszkieletu lub innymi białkami

    2. Tworzenie wiązań kowalencyjnych między elementami penetrującymi błony a łańcuchami węglowodorowymi kwasów tłuszczowych

    3. Wzrost nienasycenia łańcuchów węglowodorowych kwasów tłuszczowych

    4. Obniżenie zawartości cholesterolu w błonie

18. W biosyntezie kwasów tłuszczowych synteza kwasów tłuszczowych przeprowadza wydłużanie łańcucha kwasu tłuszczowego poprzez dołączenie jednostek dwuwęglowych. Aktywowanym donorem jednostek dwuwęglowych jest:

    1. CO₂

    2. Acetyo-CoA ?

    3. Metanylo-CoA

    4. Butyrylo-CoA

19. NADH ma niską wartość potencjału redoks, czyli ma wysoki potencjał przekazywania elektronów o wysokiej energii. Dzieje się tak ponieważ:

    1. Reaktywny pierścień nikotynaminowy łatwo ulega fosforylacji w formie zredukowanej

    2. Reaktywny pierścień nikotynaminowy ma korzystniejszy rozkład elektronów w formie utlenionej, niż zredukowanej co stabilizuje formę utlenioną

    3. Zredukowane NADH jest niestabilne i ulega szybko hydrolizie

    4. Reaktywny pierścień nikotynaminowy ma korzystniejszy rozkład elektronów w formie zredukowanej, niż utlenionej co stabilizuje formę zredukowaną

20. ATP ma wysoki potencjał fosforylacyjny, ponieważ:

    1. Reszty fosforanowe w ATP nie są stabilizowane energią rezonansu i dochodzi do odpychania elektrostatycznego pomiędzy atomami tlenu?

    2. Z łatwością przekazuje reszty fosforanowe na acetylo-CoA

    3. Podczas syntezy ATP uwalniane jest dużo energii

    4. ATP przekazuje reszty fosforanowe na fosfokreatynę

21. Funkcja ATP w żywym organizmie polega na:

    1. Przesuwaniu równowagi sprzężonych reakcji w stronę uzyskania produktów

    2. Dostarczaniu reszt fosforanowych do fosforylacji enzymów (modyfikacja kowalencyjna enzymów)

    3. Działaniu jako modyfikator allosteryczny pewnych enzymów

    4. ATP jest istotne dla wszystkich wymienionych procesów

22. Reakcja termodynamicznie korzystna może umożliwić przebieg reakcji termodynamicznie nie korzystnej, poprzez odpowiednie sprzężenie. Sprzężenie to może zachodzić poprzez:

    1. Zastosowanie takich samych substratów dla obu reakcji

    2. Wytworzenie gradientu jonowego w poprzek błony biologicznej

    3. Wydzielenie ciepła w wyniku reakcji

    4. Uzyskanie takich samych produktów dla obu reakcji

23. Glikolizę najlepiej definiuje:

    1. Jest to proces przekształcania glukozy w pirogronian, przebiegający wyłącznie w warunkach tlenowych (ze względu na konieczność regeneracji NAD), wytwarzający niewielkie ilości ATP.

    2. Jest to proces przekształcania glukozy w pirogronian, przebiegający w warunkach tlenowych i beztlenowych, wytwarzający niewielkie ilości ATP.

    3. Jest to proces przekształcania glukozy w pirogronian, przebiegający w warunkach tlenowych i beztlenowych, zużywający niewielkie ilości ATP.

    4. Jest to proces przekształcania glukozy w acetylo-CoA, przebiegający w warunkach tlenowych i beztlenowych, zużywający niewielkie ilości ATP.

24. Etapem glikolizy podlegającym ścisłej kontroli jest:

    1. Reakcja przekształcania glukozo-6-fosforanu we fruktozo-6-fosforan

    2. Reakcja fosforylacji fruktozo-6-fosforanu do fruktozo-1,6-bifosforanu

    3. Reakcja utleniania aldehydu 3-fosfoglicerynowego do 1,3-bifosfoglicerynianu

    4. Reakcja przekształcania 2- fosfoglicerynianu w fosfoenolopirogronian

25. Aktywator allosteryczny fosfofruktoinazy z wątroby jest wytwarzany w odpowiedzi na:

    1. Wysokie stężenie ATP i cytrynianu

    2. Niskie stężenie glukozy i wysokie stężenie glukagonu we krwi

    3. Wysokie stężenie glukozy we krwi i wysoki poziom glukozo-6-fosforanu

    4. Wysoki poziom glukagonu we krwi i wysoki poziom cAMP

26. Pdczas glikolizy pierwsza reakcja fosforylacji substratowej zachodzi w wyniki utlenienia aldehydu do kwasu karboksylowego. Proces ten obejmuje kilka etapów:

a)powstanie wiązania kowalencyjnego miedzy grupą…. b) atak ortofosforanu na tioeter… c)oderwanie jonu wodorowego i redukcja NAD+ , d)przeniesienie fosforanu wraz z jego wiązaniem…. e) w centrum aktywnym dochodzi do wymiany NADH na NAD+…

a. a,b,c,d,e

b. c,a,b,e,d

c. a,c,b,e,d

d. a,c,e,b,d

1. Dziedziczna choroba galaktozemia, objawiająca się zaćmą jest spowodowana:

   1. Niezdolnością organizmu do metabolizowania glukozy

   2. Niedoborem aktywności enzymu przekształcającego galaktozę w glukozę

   3. Nadmiernym przekształceniem galaktozy w glukozę

   4. Brakiem UTP, niezbędnego do przekształcania galaktozy w glukozę

2. Proces przekształacania pirogronianu w acetylo-CoA zachodzi w kompleksie dehydrogelazy…. ETAPY :

a)dekarboksylacja pirogronianu , B) przeniesienie grupy acetylowej na koenzym A , c)utlenienie grupy hydroksyetylowej , d) przeniesienie elektronu z FADH na NAD e)regeneracja utlenionej formy lipo amidu

odp . A. a,c,b,e,d

1. Zwierzęta nie potrafią przekształcić acetylo-CoA w glukozę, dlatego tworzenie acetylu-CoA z pirogronianu jest u nich nieodwracalne. W związku z tym aktywność kompleksu dehydrogenazy pirogronianowej jest ściśle regulowana. Wskaż właściwy sposób regulacji:

   1. Hamowanie przez duże stężenia acetylo-CoA i NADH oraz regulacja przez modyfikacje kowalencyjną

   2. Hamowanie przez AMP i stymulacja przez wysoki ładunek energetyczny komórki

   3. Stymulacja przez wysokie stężenie acetylo-CoA i NADH, regulacja przez fosforylację

   4. Hamowanie przez insulinę i stymulacja przez fosforylacje składnika E1

2. Cecha charakterystyczna funkcjonowania syntazy cytrynianowej jesr indukowane dopasowanie…Polega ono na :

c) kolejnych zmianach konformacj enzymu po związaniu szczawiooctanu (powstanie miejsce wiązania acyto-CoA….)

1. Fosforylację oksydacyjną najlepiej definiuje:

b) Jest to proces syntezy ATP zachodzący w wyniku przenoszenia elektronów z NADH lub FADH na O2 przez szereg przenośników elektronów. Energia pochodzi od siły proto…ycznej.

1. Błędne zdanie na temat fosforylacji oksydacyjnej:

c) pomiędzy reduktazą cytochromową a oksydacją cytochromową elektrony są przenoszone przez ubichinon

1. W kompleksie reduktazy cytochromowej dochodzi do przekazania elektronu z ubichinonu na cytochrom C. wskaż błędna zdanie:

1. W reduktazie w cytochromie SA 2 miejsca wiązania ubichinonu Q.. i Q.. każde z nich może przyłazczyc ubichinon do wolnej puli błonowej

1. Główną funkcją szlaku pentozo fosforanowego jest:

1. Wytwarzanie NADPH i rybozo-5-fosforanu

1. W procesie glukoneogezy u ssaków substratami do syntezy są :

1. Mleczan, alanina, glicerol

1. W odrębie fotosystemu I zachodzą nastepujące procesy:

1. Absorpcja energii świetlnej , wytworzenie bardzo sielnego reduktora, redukcja f…kazy, redukcja NADP do NADPH

1. Fotosystem II przyczynia się do powstanie gradientu protonowego przez:

b)foliozę wody (protony uwalniane do światła tylakoidów)

1. Proces syntezy ATP w syntezie ATP polega na :

1. Cyklicznych zmianach konformacji podjednostek katalicznych….[Fe]

1. Enzym RUBISCO wymaga aktywacji. Polega to na :

1. Związaniu jonu metalu dwuwartościowego oraz CO2 dzięki czemu powstaje karbaminian