Biosynteza lipidów

§ Biosynteza lipidów przebiega innymi szlakami niż degradacja

§ Intermediaty biosyntezy są kowalencyjnie związane z grupami sulfhydrylowymi

białkowych

nośników

grup

acylowych

(ACP).

§ Synteza

kwasów

tłuszczowych

zachodzi

w

cytosolu,

§ U zwierząt enzymy zaangażowane w biosyntezę kwasów tłuszczowych są składnikiem

jednego

łańcucha

polipeptydowego,

§ U roślin i bakterii enzymy syntezy kwasów tłuszczowych występują oddzielnie

§ Koenzymem zaangażowanym w syntezę jest NADP/NADPH, w degradację

– NAD+/NADH

Strategia syntezy:

§ Łańcuchy kwasów tłuszczowych powstają przez łączenie dwuwęglowych jednostek pochodzących pośrednio z acetylo-CoA a bezpośrednio z malonylo-CoA

§ Jednostki octanowe aktywowane są przez tworzenie malonylo-CoA (z rozkładem

ATP)

§ Dodawanie dwuwęglowych fragmentów do rosnącego łańcucha napędzane jest

przez

dekarboksylację

malonylo-CoA

§ Wydłużanie łańcucha następuje aż do osiągnięcia 16 atomów C (kwas palmitynowy)

§ Inne enzymy dodają podwójne wiązanie i dodatkowe atomy węgla

§ Sumaryczna reakcja biosyntezy:

acetylo-CoA + 7 malonylo-CoA + 14NADPH + 14H+

palmitylo-CoA +7HCO -

3 +7CoASH +14NADP+

Podstawowym substratem biosyntezy lipidów jest acetylo-CoA pochodzący z: (1)

degradacji aminokwasów w cytosolu

(2)

utleniania kwasów tłuszczowych w mitochondriach

(3)

pirogronianu, który po transporcie do mitochondriów przekształcany jest przez

dehydrogenazę

pirogronianową

w

acetylo-CoA

§ Ilość cytosolowego acetylo-CoA (z degradacji aminokwasów) nie zaspokaja potrzeb biosyntezy, konieczny jest import z mitochondriów. Mitochondrialny acetylo-CoA nie może przejść przez błonę mitochondrialną. Łączy się ze szczawiooctanem,

tworząc

cytrynian

przechodzący

przez

błonę

mitochondrialną. W cytosolu cytrynian przekształcany jest przez liazę cytrynianową zależną od ATP w acetylo-CoA i szczawiooctan.

Szczawiooctan wraca do mitochondrium po przekształceniu w pirogronian

§ NADPH potrzebny do biosyntezy pochodzi ze szlaku pentozo-fosforanowego albo z reakcji dekarboksylującej dehydrogenazy jabłczanowej (tzw. enzymu jabłczanowego)

szczawiooctan + NADH+ + H+

jabłczan + NAD+

jabłczan + NADP

pirogronian + CO2 + NADPH + H+

§ Ilość produkowanego w ten sposób NADPH zależy od ilości dostępnego jabłczanu. Każdy cytrynian przechodzący do cytozolu daje 1 cząst. acetylo-CoA i 1 cząst. jabłczanu. Do powstania kwasu palmitynowego potrzeba 8

acetylo-CoA, 8 towarzyszących cząst. jabłczanu po przekształceniu w pirogronian da 8 cząst. NADPH. Pozostałe 6 cząst. NADPH potrzebnych do syntezy kwasu palmitynowego pochodzi ze szlaku pentozo-fosforanowego.

Jeśli jabłczan wraca do mitochondrium przed dekarboksylacją do pirogronianu, powstaje mniej NADPH, więcej NADPH musi być dostarczone przez szlak pentozofosforanowy

Synteza lipidów u prokariota ( E.coli)

Intermediaty syntezy kwasów tłuszczowych są kowalencyjnie dołączone (poprzez wiązanie tioestrowe z grupą fosfopantotenową) do ACP, małego (8.9

kDa) rozpuszczalnego białka. U E. Coli białko to stanowi ok. 0,25%

całkowitych białek rozpuszczalnych (ok. 60 000 kopii/komórkę). Prostetyczna grupa sulfhydrylowa jest przyłączona do Ser-36 w regionie łączącym pierwszy i trzeci odcinek α-helikalny ACP.

Bez reszty fosfopantotenowej ACP jest nieaktywne w biosyntezie kwasów tłuszczowych. Donorem tej grupy jest CoA a reakcja przeniesienia jest katalizowana przez syntazę ACP.

Pierwszym krokiem w biosyntezie kwasów tłuszczowych jest reakcja katalizowana przez karboksylazę acetylo-CoA.

Są to de facto dwie oddzielne reakcje

- ATP-zależna karboksylacja biotyny

- Przeniesienie grupy karboksylowej na acetylo-CoA

Sama karboksylacja biotyny katalizowana jest przez karboksylazę biotyny (homodimer, dwie podjednostki 55 kDa). Biotyna jest kowalencyjnie związana z 16,7 kDa białkiem zwanym biotynowym białkiem nośnikowym reszt karboksylowych (BCCP). Z tego białka reszta karboksylowa jest przekazywana na acetylo-CoA przez transkarboksylazę (heterotetramer).

Malonylo-CoA jest zużywany do syntezy kwasów tłuszczowych jedynie w postaci związanej z ACP. Przeniesienia CoA-ACP dokonuje transacylaza, produkt genu fabD.

Kolejnym etapem jest powstanie acetoacetylo-ACP poprzez kondensację reszty acetylowej z malonylo-ACP.

Może się to odbywać przy udziale dwóch syntaz:

- syntazy 3-ketoacylo-ACP III (1)

- syntazy 3-ketoacylo-ACP I lub II (2)

(1)

(2)

Reakcja ta jest pierwszą reakcją prowadzącą do powstania primera dla wydłużającego się łańcucha kwasu tłuszczowego

W kolejnych reakcjach zachodzą procesy:

- kondensacji

- redukcji I

- odwodnienia

- redukcji II

w wyniku czego powstaje wielowęglowy łańcuch kwasu tłuszczowego.

U E. coli powstają trzy główne kwasy tłuszczowe: v kwas palmitynowy (16:0)

v kwas palmitoolejowy (16:1 Δ9)

v kwas cis-wakcenowy (18:1 Δ11)

(1) – 3-hydroksydekanoilo-ACP-dehydraza

(2) – 3-ketoacylo-ACP syntaza I i II

(3) – 3-ketoacylo-ACP syntaza I

(4) – 3- ketoacylo-ACP syntaza II

Generalnie:

U eukariotów każda reakcja syntezy jest katalizowana przez odrębny enzym, z własnym genem, są to tzw. syntazy kwasów tłuszczowych typu II, wieloskładnikowe

Podobny układ spotyka się u roślin wyższych.