background image

 

 

Informacja genetyczna

Wykład 2 – próba definicji

background image

 

 

Układ termodynamiczny a 

układ cybernetyczny

• Układ termodynamiczny:  dowolny 

wyodrębniony fragment Wszechświata 
przeciwstawiany jego reszcie, zwanej 
otoczeniem u.t. U.t. izolowany, 
zamknięty, otwarty, izolowany 
adiabatycznie, mechanicznie itd. 

• Rodzaj u.t. jest funkcją własności jego 

ścianek (granicy, osłony, powierzchni 
brzegowej itp..)

background image

 

 

Układ termodynamiczny a układ 

cybernetyczny – układ biologiczny 

jako u.c.

Układ cybernetyczny – dowolny układ, w którym 

zachodzą procesy sterowania

Układ względnie odosobniony – u.t. zamknięty, 

mogący jednak oddziaływać z otoczeniem poprzez 

wyróżnione miejsca powierzchni brzegowej (wyjścia) 

lub ulegać oddziaływaniu poprzez inne wydzielone 

miejsca (wejścia). W pierwszym przybliżeniu 

otoczenie wpływa na stan wejść, a te na stan wyjść. 

Cybernetyka zajmuje się matematycznym 

modelowaniem transformacji stanów wejść u.c. w 

stany wyjść. Ponieważ sterowanie można rozpatrywać 

jako wpływanie na stan u. c. poprzez zmianę stanu 

wejść przez otoczenie (inne u.c. znajdujące się w 

otoczeniu i stany ich wyjść, wreszcie – stan wyjść 

otoczenia), definicję cybernetyki można by rozszerzyć 

jako naukę o procesach sterowania, tak rozumianych.

Czyli – jako poszukiwanie matematycznych 

prawidłowości pomiędzy stanami wyjść różnych u.c.

background image

 

 

Definicja sterowania i 

rodzaje sterowania

• Sterowanie – związek pomiędzy 

zmiennymi stanami u.c., innymi słowy:

• Wpływ (zmian) stanu jednego u.c. na 

(zmiany) stan(u) innego  u.c.

• Rozumianych (zgodnie z definicją u.w.o.) 

jako zmian stanów odpowiednich wejść i 

wyjść. Nie chodzi tu o zmiany stanu u.t. 

wynikające np. z uszkodzenia granicy u.

• Choć granica jest płynna…

background image

 

 

Definicja sterowania i 

rodzaje sterowania

Źródło energii

background image

 

 

Co to jest komunikat i z 

czego się składa?

To jest komunikat

Zwykły byt fizyczny”, czyli de facto proces, 

obiekt etc., za pośrednictwem którego układ 
sterujący wpływa na układ sterowany. W 
pewnym sensie – wyodrębniony fragment 
otoczenia układu sterującego i sterowanego. 
Czyli układ # 3 – tor sterowania (kanał… itd.)
Dlaczego A nie jest układem sterującym? 
Bo efekt energetyczny komunikatu jest 
nieproporcjonalnie duży  do energii 
komunikatu (e. sterowania), podczas gdy 
energia zasilająca (z układu A) – nie.
Ergo 1komunikat musi zawierać „coś 
jeszcze” oprócz energii/materii, z której się 
składa (materialnej formy k.). To coś 
antycypuje obecność wejść układu 2 – to coś 
to „treść” k., czyli

INFORMACJA

Komunikat: Aspekt materialny 
(nośnik) 

+ aspekt niematerialny 

(informacja)

Ergo 2: Sterowanie implikuje nieliniowość procesów,

Ergo 3: Nie można mówić
o sterowaniu układem 
w stanie równowagi 
termodynamicznej

background image

 

 

Definicje informacji i brak 

takiej definicji

• Rodzaje definicji: definicja werbalna i 

ostensywna

• Na poprzednim slajdzie podano 

ostensywną definicję informacji

• Czy istnieje definicja werbalna 

informacji – poprzez podanie 

differentia specifica i genus 

proximus?

• Istnieją podejścia traktujące 

informację jako pojęcie pierwotne, 

podobne, ale nie tożsame 

materii/energii

• Czy obiekty zdefiniowane ostensywnie 

nie „wymagają” definicji werbalnych?

background image

 

 

Definicje informacji i brak takiej 

definicji

• Istnieje kilkadziesiąt definicji informacji, 

większość to definicje tautologiczne albo 
definiujące nieznane przez nieznane

• Dlaczego „nasza” definicja informacji jest 

tautologiczna:

Sterowanie – wpływanie u.c. na inny u.c. (odpowiednich 
stanów wejść i wyjść) za pośrednictwem informacji 
zawartej w komunikatach. Co to jest informacja – 
niematerialny aspekt komunikatu, czyli niematerialny 
aspekt dowolnego zjawiska fizycznego, umożliwiający 
sterowanie. Czyli – de facto zmieniający wyłącznie stan 
wejść sterowanego układu cybernetycznego. Czyli – o 
efektach energetycznych niewspółmiernie dużych w 
stosunku do energii sterującej. Co to znaczy 
„niewspółmiernie”?, to znaczy zmieniające tylko stan 
wejść.

itd….

background image

 

 

• wejście – pewien fragment granicy u.t., którego 

zmiana właściwości w sposób niewspółmierny 

wpływa na procesy zachodzące w u.t.

• stan wejścia – konkretna własność fizyczna (np. 

namagnesowanie, potencjał spoczynkowy, 

czynnościowy, itd….), zwykle, ale niekoniecznie, 

przybierająca dyskretne wartości 

 w u.t. musi zachodzić proces nieliniowy, czyli proces, w 

którym niewielkie zmiany parametrów początkowych 

(w czasie t

0

), wynikające ze zmian stanu wejścia mogą 

doprowadzić do nieprzewidywalnie różnych zmian 

parametrów po czasie t

0

+t. 

 układ powinien mieć własności anizotropowe, bo tylko 

wówczas można wyróżnić pewne fragmenty granicy u.t.

Definicje informacji i brak 

takiej definicji

background image

 

 

Definicje informacji i brak 

takiej definicji

Inne przykłady: N. Wiener:

I. jest nazwą treści zaczerpniętej 

ze świata zewnętrznego….

W. Nawrocki: I. to treści sygnału 

mające sens dla odbiorcy

I. to wszelka wiadomość 

wzbogacająca naszą wiedzę o 
świecie zewnętrznym.

I. to znaczenie komunikatu 

background image

 

 

Definicje informacji i brak takiej 

definicji

Definicja prof. Mazura:
System sterujący -  system, którego oddziaływanie  wywołuje pożądane 

zmiany w systemie sterowanym

S. sterowany – ten, w którym żądane zmiany są wywoływane
Tor sterowniczy – system, za którego pośrednictwem inny system oddziałuje 

na jeszcze inny system

Obwód sterowniczy – system w którym zachodzi sprzężenie zwrotne, 

utworzony z s.s.+ s.s. + wszystkie t.s.

Proces sterowniczy –  zjawiska (jakie????) zachodzące w o.s.

Komunikat – wyróżniony stan fizyczny t.s.
Zbiór poprzeczny k. – zbiór k. w dowolnym miejscu t.s.
Zbiór podłużny k. – zbiór k. należących do różnych z.p.k., powstałych z 

innych k., lub dających początek innym k.

Asocjacja k. – nieuporządkowana para k. wyodrębnionych z zpk, lub zpk., w 

p.s.

Asocjacja informacyjna – a.k. z poprzecznego z.k.
Transformacja – proces, jakiemu należy poddać jeden komunikat a.k., by 

otrzymać drugi element a.k.

INFORMACJA

 – TRANSFORMACJA JEDNEGO KOMUNIKATU ASOCJACJI 

INFORMACYJNEJ W DRUGI JEJ ELEMENT

background image

 

 

Definicje informacji i brak takiej 

definicji

Definicja prof. Chmieleckiego:
I. to wszelka wykryta różnica istotna dla funkcjonowania 

organizmu:

Kolekcja- czasoprzestrzennie uporządkowany podzbiór 

elementów (dowolnie powtarzających się) 
dowolnego zbioru wielkości fizykalnych.

Alfabet – zbiór stanów układu mogących być wykrytymi 

przez jakiś detektor

Kod wewnętrzny – kolekcja elementów alfabetu powstała 

w danym układzie

Kod zewnętrzny – dowolna kolekcja otoczenia układu, 

którą można przetworzyć na kolekcję alfabetu

Repertuar – zbiór różnic pomiędzy wszystkimi możliwymi 

kolekcjami alfabetu

INFORMACJA

 – DOWOLNA WYKRYTA KOLEKCJA 

REPERTUARU 

background image

 

 

Definicje informacji i brak takiej 

definicji

Dwie ostatnie definicje mają pewne 

zalety – zakładają jako konieczne 
istnienie odbiorcy informacji, 
czyli odbiorcy komunikatu, i 
warunkujące istnienie i. w 
komunikacie możliwością jego 
odbioru przez odbiorcę,

Rozważają REPERTUAR stanów czy 

to toru sterowniczego, czy też w 
ogóle konkretnego układu

.

background image

 

 

Inna ważna cecha 

informacji

• Informacja zawarta w komunikacie 

ZMIENIA ROZKŁAD 
PRAWDOPODOBIEŃSTWA stanów, 
w których może się znajdować 
układ: 

background image

 

 

Definicje informacji 

genetycznej

Podobne problemy: 

(Prof. Styrna): I.g. Instrukcje kierujące wszystkimi 

funkcjami komórki lub organizmu zapisane jako 

określone, swoiste sekwencje nukleotydów w 

kwasach nukleinowych w postaci kodu genetycznego.

1. Potrzeba zdefiniowania instrukcji i kodu 

genetycznego

2. Niekoniecznie są to sekwencje nukleotydów i nie 

wszystkie

3. Wcale nie „w postaci kodu genetycznego” (nie tylko i 

nie w pełni).

4. Nie „w postaci” tylko, jeżeli już,  „kodujące swoiste 

sekwencje aminokwasów za pomocą”

O tym (1-4) będzie reszta kursu!

background image

 

 

Definicje informacji 

genetycznej

Zalety tej definicji:

(Prof. Styrna): I.g. Instrukcje kierujące wszystkimi funkcjami 

komórki lub organizmu zapisane jako określone, swoiste 

sekwencje nukleotydów w kwasach nukleinowych w 

postaci kodu genetycznego.

1.

Zwrócenie uwagi, że i.g. i sekwencje kwasów 

nukleinowych (same kwasy), to NIE TO SAMO

2.

Sugestia, że w definicji informacji g. (i w ogóle) ważne 

jest określenie SPOSOBU ZAPISU

3.

Pojawił się tu aspekt pragmatyczny informacji, jako 

główny wyróżnik (co tak naprawdę „robi” i.g.). 

Rzeczywiście – i.g. kieruje funkcjami komórki, ale nie 

wszystkimi i nie wprost. Warto zatem przy okazji 

zdefiniować informację biologiczną w ogóle, i jej 

przypisać ten wyróżnik, a i.g. wyodrębnić jako jeden z 

wariantów i.b…

background image

 

 

Definicje informacji 

genetycznej

INFORMACJA BIOLOGICZNA to taka INFORMACJA, która 

jest związana z procesami sterowania w układach żywych 

i u wirusów (kieruje wszystkimi funkcjami etc…).

No i tu pojawia się problem definicji układu żywego (i 

informacji ). Co do sterowania, to u.ż możemy 

traktować jako u.c. i jako u.w.o. Z tego wynika, że wiele 

zjawisk w u.ż. ma charakter cybernetyczny, jest 

komunikatami, posiada ów aspekt niematerialny, który 

powoduje, że zmiany w u.ż. wyrażone w kategoriach 

termodynamicznych  są nieproporcjonalne do energii 

potrzebnej do zaistnienia owych zjawisk. U.ż. posiadają 

zatem określone wejścia i wyjścia z określonym 

repertuarem stanów itd. 

Te (wejścia i) wyjścia, które służą do  odbioru (produkcji) 

sekwencji nukleotydów o charakterze komunikatów, 

dotyczą bezpośrednio obróbki informacji genetycznej.

background image

 

 

Definicje informacji 

genetycznej

Informacja genetyczna to taka INFORMACJA 

BIOLOGICZNA, która:

1. Jest zapisana i odczytywana w postaci 

sekwencji nukleotydów tworzących kwasy 
nukleinowe (to są nośniki i.g. i jej 
reprezentacje, czyli komunikatem genetycznym 
jest każdy kwas nukleinowy zawierający i.g.)

2. Jest dziedziczona przez kolejne pokolenia 

organizmów i wirusów

background image

 

 

Czym NIE JEST informacja 

genetyczna

• KODEM GENETYCZNYM

• DNA ani RNA

• SEKWENCJĄ nukleotydów

• Zbiorem genów (genomem)

• Nie jest też tożsama z każdą i.b. Determinuje to sposób 

zapisu!

Genomy, DNA/RNA to nośniki i.g.
Sekwencje nukleotydów, to POSTAĆ i.g. „zrozumiała” dla 

odczytującej komórki

Można je również rozumieć jako REPREZENTACJĘ 

informacji genetycznej zrozumiałą dla komórki.

A co to jest : …ATTGGCTG…?
To już jest metareprezentacja, czyli reprezentacja 

reprezentacji, zrozumiała dla genetyka 

A KOD GENETYCZNY TO KOD GENETYCZNY ()

background image

 

 

Pytanie na następny 

wykład

Jeśli nie informacja, to co?


Document Outline