background image

Uszkodzenia i naprawa 

DNA

Joanna Łanuszewska

background image

Egzogenne i endogenne źródła 

uszkodzeń DNA

• Uszkodzenia egzogenne

– Słońce (promieniowanie UV)
– Grzyby (pleśnie) i substancje przez nie wydzielane
– Produkty spalania tytoniu
– Zanieczyszczenie powietrza (np. produkty spalania węgla i 

węglowodorów)

– Promieniowanie jonizujące (promieniowanie gamma, X)
– Leki i inne ksenobiontyki

• Uszkodzenia endogenne

– Uszkodzenia oksydacyjne
– Spontaniczne zaburzenia struktury (błędy polimerazy, spontaniczne 

deaminacje)

– Rekombinacja V(D)J
– Genetyczna podatność na uszkodzenia

background image

Konsekwencje uszkodzenia DNA – 

synteza białek

background image

Budowa DNA, chromatyna 

background image

Reaktywne atomy 

pierścieni puryn i pirymidyn

Tymina                        Adenina

Cytozyna                       Guanina

background image

Typy uszkodzeń DNA

background image

Mutacje w sekwencjach kodujących 

powodują różne uszkodzenia białek

 

background image

Odpowiedź na uszkodzenia 

DNA

background image

Naprawa DNA

background image

Powiązanie różnych rodzajów odpowiedzi 

komórkowej na uszkodzenia DNA

background image

Dlaczego naprawa DNA jest taka 

ważna?

Uszkodzenia  DNA  wiążą  się  z  czynnikami  rozpoznającymi,  lub 
innymi  białkami  chromatyny.  Samo  uszkodzenie,  jeśli  nie 
zostanie  naprawione,  może  hamować  syntezę  DNA  lub 
powodować mutację, jeśli błędny nukleotyd zostanie wstawiony 
naprzeciw uszkodzenia.

background image

Systemy naprawy DNA u 

ssaków

background image

Mechanizmy naprawy przez wycinanie:
 NER - foto-uszkodzenia, addukty DNA, wiązania sieciujące
 BER - alkilowe i hydroksylowe modyfikacje zasad
 MMR - nieprawidłowo sparowane nukleotydy

Mechanizmy naprawy bezpośredniej:
 fotoliazy, metylotransferazy

Mechanizmy naprawy dwuniciowych pęknięć DNA:
 NHEJ - łączenie końców nie homologicznych
 rekombinacja homologiczna

background image
background image

Rozpoznawanie uszkodzenia DNA

background image

Naprawa przez wycinanie ma identyczne etapy 

resyntezy DNA, różni się obecnością specyficznych 

białek rozpoznających i specyficznością zespołów 

wycinających uszkodzenie

 

background image

Usuwanie uszkodzonej lub źle wstawionej 

zasady

 

background image

Naprawa błędnie sparowanych

 

nukleotydów

background image

Naprawa błędnie sparowanych 

zasad – Procaryota i Eucaryota

background image

Naprawa błędnie sparowanych 

zasad odbywa się już w czasie 

replikacji DNA

background image

Naprawa przez wycinanie 

zasady (base excision repair – 

BER)

background image

Mechanizm działania glikozylaz na 

przykładzie glikozylazy DNA 

uracylowej

background image

Długa i krótka ścieżka naprawy 

BER

background image

Naprawa przez wycięcie 

nukleotydu (nucleotide excision 

repair – NER)

background image

Typy naprawy NER

• Naprawa  NER  biegnie  z  różną  szybkością  w  różnych 

rejonach genomu.

• Znacznie szybciej uszkodzenia są naprawiane na nici 

transkrybowanej.

• Obie  formy  naprawy  wykorzystują  ten  sam 

rdzeniowy 

kompleks 

naprawczy 

(XPA/RPA, 

XPF/ERCC1,  XPG,  TFIIH),  ale  naprawa  związana  z 

transkrypcją  wymaga  jeszcze  białek  CSA  i  CSB,  a 

naprawa 

genomu 

– 

białek 

rozpoznających 

uszkodzenie – XPE i XPC

background image

NER – naprawa genomu (global repair – 

GR)

background image

NER – naprawa związana z transkrypcją 

(transcription-coupled repair – TCR)

background image

Białka kodowane przez geny XP 

biorą udział w naprawie NER

background image

Jednym z elementów mechanizmu NER 
jest
czynnik transkrypcyjny TFIIH

TFII
H

Kompleks białek uczestniczących

w początkowych etapach 

mechanizmu NER

background image

Naprawa NER w 

chromatynie

background image

Uszkodzenia różnych fragmentów genomu 

naprawiane są z różnymi szybkościami

Szybka naprawa DNA

(potencjalnie) transkrybowanego

Wolna naprawa DNA

nie transkrybowanego

wpływ struktury chromatyny

Preferencyjna naprawa 

nici transkrybowanej

obecność polimerazy II RNA

background image

Typy naprawy podwójnych pęknięć 

DNA

Naprawa przez 

rekombinację 

homologiczną (HR)

Naprawa przez łączenie 

końców 

niehomologicznych 

(NHEJ)

background image

Białko ATM aktywuje białka 

naprawcze

background image

DNA-PK jest aktywowana przez 

podwójne pęknięcia DNA

 

DNA-PK ma 3 podjednostki

Struktura białka Ku związanego 
z DNA

background image

Białko Artemis jest nukleazą 

powiązaną z NHEJ

• Pacjenci Scid o podtypie radiowrażliwym 

mają uszkodzone białko Artemis

• ~70 kDa
• Należy do rodziny metalo-ß-laktamaz
• Oddziałuje z DNA-PK

CS

• Fosforylacja przez DNA-PK stymuluje 

aktywność nukleazową (obróbka końców 
DNA przed ligacją)

background image

Uszkodzenia białek systemu NHEJ 

powodują różne defekty w 

naprawie

background image

Naprawa NHEJ jest związana z 

macierzą jądrową

background image

Białko Ku pełni różne role w 

naprawie NHEJ i innych funkcjach 

komórki

Udział w regulacji
apoptozy

background image

Naprawa podwójnoniciowych 

pęknięć DNA w cyklu komórkowym

NHEJ – aktywny 
przez cały cykl 
komórkowy

HR – aktywny w fazie G2 i M

M

G1

S

G2

background image

Metylacja G – naprawa 

bezpośrednia

background image

Bezpośrednia naprawa dimerów 

tymidynowych – udział fotoliazy

background image

Naprawa wiązań krzyżowych 

(międzyniciowych)

background image

Białka chromatyny oddziałują z 

białkami naprawczymi


Document Outline