background image

 

 

OGÓLNE ZASADY 

DIAGNOSTYKI 

MIKROBIOLOGICZNEJ

Katedra i Zakład Mikrobiologii 

Lekarskiej

Anna Majewska

background image

DROBNOUSTROJE

BAKTERIE

WIRUSY

GRZYBY

background image

 

 

background image

 

 

RODZAJE INTERAKCJI 

DROBNOUSTROJU Z ORGANIZMEM

          

DROBNOUSTROJE 

KOMENSALNE

DROBNOUSTROJE  
OPORTUNISTYCZNE

DROBNOUSTROJE PATOGENNE

background image

 

 

DIAGNOSTYKA 
MIKROBIOLOGICZNA

 

CEL:

 

   IDENTYFIKACJA CZYNNIKA  
    ETIOLOGICZNEGO 
ODPOWIEDZIALNEGO
    ZA ZAKAŻENIE 

   OKREŚLENIE JEGO PROFILU 
    WRAŻLIWOŚCI NA 
CHEMIOTERAPEUTYKI

   NADZÓR MIKROBIOLOGICZNY I      
        EPIDEMIOLOGICZNY
            

background image

 

 

POBRANIE   MATERIAŁU

   

TRANSPORT 

METODA  
DIAGNOSTYCZNA

background image

 

 

PRÓBKI MATERIAŁU DO BADANIA 

MIKROBIOLOGICZNEGO

       

WYMAZ Z GARDŁA I MIGAŁKÓW, 

PLWOCINA,  

       WYMAZ Z RANY, ROPA Z ROPNIA, 

       WYCINKI  TKANEK, 

        KREW, KAŁ, MOCZ, 

        POPŁUCZYNY  PĘCHERZYKOWO- 
OSKRZELOWE 

        PŁYN MÓZGOWO-RDZENIOWY, 

        WYMAZ ZE SPOJÓWKI, 

        ZESKROBINY  ROGÓWKOWE 

background image

 

 

ZASADY

PRZED ROZPOCZĘCIEM CHEMIOTERAPII

Z MIEJSC, W KTÓRYCH TOCZY SIĘ PROCES

 CHOROBOWY

W ODPOWIEDNIM CZASIE

POBRAĆ ODPOWIEDNIĄ ILOŚĆ/OBJĘTOŚĆ 

MATERIAŁU

ZACHOWAĆ ZASADY ASEPTYKI (SPRZĘT, 

DEZYNFEKCJA SKÓRY)

ZAPEWNIĆ WŁAŚCIWE WARUNKI 
PRZECHOWYWANIA I TRANSPORTU

(TERMICZNE, PODŁOŻA 
TRANSPORTOWE)

DOSTARCZYĆ DO PRACOWNI   
MIKROBIOLOGICZNEJ 

W MOŻLIWIE 

NAJKRÓTSZYM CZASIE

background image

 

 

  

METODY

BEZPOŚREDNIE

BEZPOŚREDNIE

                        

                        

 

 

POŚREDNIE

POŚREDNIE

 

 

                         

                         

  WYKRYCIE  DROBNOUSTROJU          WYKRYCIE 
SWOISTYCH   
  LUB JEGO   FRAGMENTU                       
PRZECIWCIAŁ
  W  MATERIALE  KLINICZNYM

background image

 

 

METODY

METODY NIEHODOWLANE

METODY NIEHODOWLANE

      

      

(SZYBKIE  

(SZYBKIE  

TESTY

TESTY

  

  

  

  

DIAGNOSTYCZNE)

DIAGNOSTYCZNE)

 

 

METODY KONWENCJINALNE

(HODOWLA DROBNOUSTROJÓW)

background image

 

 

    

    

  

  

 

 

METODY HODOWLI DROBNOUSTROJÓW 
POŁĄCZONE Z IZOLACJĄ I 
IDENTYFIKACJĄ MIKROORGANIZMU 
(NAJCZĘŚCIEJ DO GATUNKU) NAZYWANE 
SĄ METODAMI KONWENCJONALNYMI 
(KLASYCZNYMI).

SĄ SZCZEGÓLNIE ISTOTNE W 
BAKTERIOLOGII I MIKOLOGII, GDZIE 
OPRÓCZ IDENTYFIKACJI CZYNNIKA 
ETIOLOGICZNEGO POWINNY BYĆ 
WYKONANE TESTY WRAŻLIWOŚCI NA 
CHEMIOTERAPEUTYKI/ANTYBIOTYKI.

METODY 

METODY 

KONWENCJONALNE       

KONWENCJONALNE       

     

     

       

       

(HODOWLA)

(HODOWLA) 

    

IZOLACJA I IDENTYFIKACJA 

DROBNOUSTROJU 

background image

 

 

W POBRANYCH MATERIAŁACH 
WYSTĘPUJĄ RÓŻNE GATUNKI 
DROBNOUSTROJÓW, W CELU ICH 
WYIZOLOWANIA, NAMNOŻENIA I 
UZYSKANIA CZYSTEJ HODOWLI, PRÓBKI 
POSIEWA SIĘ NA ODPOWIEDNIE 
PODŁOŻA WZROSTOWE.

background image

 

 

HODOWLA DROBNOUSTROJÓW

STWORZYĆ WARUNKI W KTÓRYCH BYTUJĄ 

DROBNOUSTROJE

W A R U N K I  H O D O W L I

TLENOWE, MIKROAEROFILNE

BEZTLENOWE 

TEMPERATURA: 35-37°C, 22-30°C 

CIŚNIENIE OSMOTYCZNE - IZOTONICZNE

STĘŻENIE JONÓW WODOROWYCH (pH) - 6,8 - 7,5

P O D Ł O Ż A (POŻYWKI)  H O D O W L A 
N E

PŁYNNE, PÓŁPŁYNNE, STAŁE

PROSTE, WZBOGACONE, SPECJALNE , 
RÓŻNICUJĄCE, 

WYBIÓRCZE, WYBIÓRCZO - RÓŻNICUJĄCE

background image

 

 

IDENTYFIKACJA

•NA PODSTAWIE 
CHARAKTERYSTYCZNEGO

  

   

WZROSTU

 NA PODŁOŻACH

 

                                          

(MORFOLOGII  

KOLONII)

S. aureus

Salmonella spp.

background image

 

 

MORFOLOGIA KOLONII

KSZTAŁT

 - 

OKRGŁY, OWALNY, SOCZEWKOWATY, 

PROMIENISTY

• 

WIELKOŚĆ

  

ŚREDNICA KOLONII [W MM]

• 

BRZEG

 

RÓWNY, FALISTY, POSZARPANY

• 

POWIERZCHNIA 

GŁADKA, POMARSZCZONA, 

GRUBOZIARNISTA

• 

WYNIOSŁOŚĆ PONAD POWIERZCHNIĘ

 - 

PŁASKA, 

BRAK,                                                                            
                         

STOŻKOWATA

• 

KOLOR 

KOLONII, PODOŻA

• PRZEJRZYSTOŚĆ 

PRZEJRZYSTA, MĘTNA

• ZAPACH

 - 

DROŻDŻY, MIODU

• 

TYP HEMOLIZY

 - 

α, β, γ

background image

 

 

PRODUKCJA 

HEMOLIZYN

S. pyogenes

S. pneumoniae

C. perfringens - podwójna hemoliza

background image

 

 

WZROST NA PODŁOŻACH 
PŁYNNYCH
 

WZROST  DROBNOUSTROJÓW ZWIĄZANY 
JEST ZE SPOSOBEM ODDYCHANIA 
BAKTERII.

• MOŻE ODBYWAĆ SIĘ 

NA POWIERZCHNI

    

POŻYWKI, 

• TWORZYĆ 

OSAD 

NA DNIE  NACZYNIA LUB 

   

POWODOWAĆ 

 ZMĘTNIENIE 

CAŁEJ POŻYWKI

background image

 

 

• 

NA PODSTAWIE WYNIKÓW

 

TESTÓW

   BIOCHEMICZNYCH

 

(KOMERCYJNE 

TESTY API) 

   OKREŚLAJĄCYCH ZDOLNOŚĆ

    

DROBNOUSTROJÓW DO NP.:

 

ROZKŁDU

 

   CUKRÓW, ALKOHOLI, ICH

 

WŁAŚCIWOŚCI 

    

PROTEOLITYCZNE, WYTWARZANIE    

    ENZYMÓW

IDENTYFIKACJA (2)

• 

NA PODSTAWIE OBRAZU MIKROSKOPOWEGO

background image

 

 

NAJBARDZIEJ 
ROZPOWSZECHNIONE SĄ 
KOMERCYJNE BIOCHEMICZNE 
TESTY DIAGNOSTYCZNE, NP.:

API 20 E

 - PRZEZNACZONE DLA 

BAKTERII Z RODZINY 
ENTEROBACTERIACEAE

API 20 A

 - DLA BAKTERII 

BEZTLENOWYCH

background image

 

 

API 20E

background image

 

 

METODY NIEHODOWLANE 

•ODCZYNY IMMUNOLOGICZNE

 

•METODY BIOLOGII MOLEKULARNEJ

 

•TYPOWANIE BAKTERIOFAGAMI

background image

 

 

METODY NIEHODOWLANE (1)

ODCZYNY IMMUNOLOGICZNE

 

 PRECYPITACJI
 AGLUTYNACJI
 IMMUNOFLUORESCENCJI,
 IMMUNOENZYMATYCZNE 
    

                   

                    

                   

background image

 

 

ODCZYN PRECYPITACJI

ROZPUSZCZALNE ANTYGENY POLIPEPTYDOWE LUB 
WIELOCUKROWE UZYSKUJE SIĘ Z TKANEK LUB Z 
DROBNOUSTROJÓW NA DRODZE EKSTRAKCJI 
KWASAMI, ENZYMATYCZNIE LUB W PODWYŻSZONEJ 
TEMPERATURZE.

DO ICH IDENTYFIKACJI STOSOWANE SĄ W OBECNOŚCI 
ELEKTROLITÓW ZNANE SWOISTE PRZECIWCIAŁA.

ZASTOSOWANIE:

 

OZNACZANIE GRUP SEROLOGICZNYCH 
PACIORKOWCÓW 
HEMOLIZUJĄCYCH WG LANCEFIELD (IDENTYFIKACJA 
WIELOCUKRU C)  -  PRECYPITACJA OBRĄCZKOWA.

IMMUNOPRECYPITACJA

 (IMMUNODYFUZJA) - METODA 

ELEKA DO WYKRYWANIA TOKSYNOTWÓRCZOŚCI 
MACZUGOWCÓW BŁONICY.

background image

 

 

AGLUTYNACJA LATEKSOWA

 

MIKROCZĄSTECZKI LATEKSU OPŁASZCZONE 
SĄ ZNANYMI PRZECIWCIAŁAMI, KTÓRE WIĄŻĄ 
SIĘ ZE SPECYFICZNYMI ANTYGENAMI, 
DOPROWADZAJĄC DO WIDOCZNEJ GOŁYM 
OKIEM AGLUTYNACJI.

WYKONANIE TESTÓW NIE WYMAGA UŻYCIA 
CZYSTYCH SZCZEPÓW DROBNOUSTROJÓW.

 

ZASTOSOWANIE

: IDENTYFIKACJA DWOINEK 

ZAPALENIA PŁUC, DO WYKRYWANIA 
CZYNNIKÓW ZAPALENIA OPON MÓZGOWO - 
RDZENIOWYCH (H. INFLUENZAES. 
PNEUMONIAE
).

background image

 

 

AGLUTYNACJA SZKIEŁKOWA

 

IDENTYFIKACJA  NIEZNANYCH  SZCZEPÓW 
BAKTERYJNYCH, 

PRZY  UŻYCIU  ZNANYCH  SWOISTYCH  
SUROWIC ODPORNOŚCIOWYCH. 

ZASTOSOWANIE:

 W DIAGNOSTYCE BAKTERII 

RODZAJÓW :

SALMONELLA, SHIGELLA, PSEUDOMONAS, 
NEISSERIA.

background image

 

 

Coli Lateks EPEC

background image

 

 

METODY 

IMMUNOFLUORESCENCYJNE

ODCZYN IMMUNOFLUORESCENCJI 
BEZPOŚREDNIEJ

PO UTRWALENIU PRÓBKI NAKRAPLA SIĘ 
WZORCOWE PRZECIWCIAŁA WYZNAKOWANE 
FLUOROCHROMEM. PO OKRESIE INKUBACJI 
PREPARAT UMIESZCZA SIĘ W MIKROSKOPIE 
FLUORESCENCYJNYM. 

JEŚLI W BADANYM MATERIALE ZNAJDOWAŁY 
SIĘ SPECYFICZNE DLA WYZNAKOWANYCH 
PRZECIWCIAŁ DROBNOUSTROJE, W POLU 
WIDZENIA MIKROSKOPU UWIDOCZNI SIĘ 
ŚWIECĄCY KOMPLEKS.

background image

 

 

ODCZYN IMMUNOFLUORESCENCJI 
POŚREDNIEJ

 

W REAKCJI BIORĄ UDZIAŁ 3 REAGUJĄCE 
SUBSTANCJE: 

•ZNANY ANTYGEN, 
•BADANA SUROWICA, 
•ZNAKOWANA FLUOROCHROMEM 
ANTYIMMUNOGLOBULINA ZWIERZĘCA 
PRZECIW POSZUKIWANYM 
PRZECIWCIAŁOM.

METODY IMMUNOFLUOROSCENCYJNE

background image

 

 

METODY IMMUNOENZYMATYCZNE (EIA, ELISA)

 

BEZPOŚREDNIE - BADANE ANTYGENY REAGUJĄ

 Z PRZECIWCIAŁAMI, KTÓRE, ZWIĄZANE SĄ Z ENZYMEM 
NP.: PEROKSYDAZĄ CHRZANOWĄ.

DLA UWIDOCZNIENIA KOMPLEKSU 
ANTYGENU Z PRZECIWCIAŁEM 
DODAJE SIĘ ODPOWIEDNIO 
DOBRANY SUBSTRAT 
I PO INKUBACJI 
ODCZYTUJE SIĘ WYNIK 
REAKCJI BARWNEJ 
JAKOŚCIOWO
LUB ILOŚCIOWO.

background image

 

 

METODY POŚREDNIE

ZASTOSOWANIE: DIAGNOSTYKA ZAKAŻEŃ 
WYWOŁANYCH PRZEZ DROBNOUSTROJE Z 
RODZAJU: 

BORRELIALEGIONELLA, CHLAMYDIA.

background image

 

 

METODY BIOLOGII 
MOLEKULARNEJ

 

POSZUKIWANIE KWASÓW 
NUKLEINOWYCH W MATERIALE 
KLINICZNYM LUB HODOWLI 
DROBNOUSTROJÓW; 

• 

PCR (METODA POLIMERYZACJI REAKCJI 

ŁAŃCUCHOWEJ),

• 

HYBRYDYZACJA KWASÓW 

NUKLEINOWYCH   

PRZY UŻYCIU SOND 

MOLEKULARNYCH           

METODY NIEHODOWLANE (2)

background image

 

 

METODA POLIMERAZOWEJ 

REAKCJI ŁAŃCUCHOWEJ (PCR)

 

POZWALA NA WYKRYCIE ZNIKOMEJ ILOŚCI 
DNA W BADANEJ PRÓBCE, 

NAWET GDY DROBNOUSTROJE W 
MATERIALE ZAKAŹNYM SĄ MARTWE. 

HYBRYDYZACJA KWASÓW 

NUKLEINOWYCH - PRZY UŻYCIU 

SOND

   MOLEKULARNYCH. 

BADANIE TRWA OK. 2 GODZ. I UMOŻLIWIA 
W ZALEŻNOŚCI OD RODZAJU 
DROBNOUSTROJU 

WYKRYCIE DNA PRZY ILOŚCI 10 

3

 

DROBNOUSTROJÓW.

background image

 

 

INNE METODY IDENTYFIKACJI

ANALIZA CHROMATOGRAFI GAZOWEJ  

METODA STOSOWANA JEST DO JAKOŚCIOWEGO LUB 
ILOŚCIOWEGO ROZDZIAŁU SUBSTANCJI (SKŁADNIKÓW 
KOMÓREK BAKTERYJNYCH LUB PRODUKTÓW ICH 
METABOLIZMU) O MAŁEJ MASIE CZĄSTECZKOWEJ. 

WYSOCE PRECYZYJNA I CZUŁA. 

STOSOWANA JEST GŁÓWNIE DO IDENTYFIKACJI 
PRODUKTÓW METABOLIZMU BAKTERII 
BEZTLENOWYCH (KWASY TŁUSZCZOWE). 

POZWALA TEŻ NA SZYBKĄ IDENTYFIKACJĘ GRZYBÓW I 
BAKTERII Z RODZAJÓW MYCOBACTERIUM, NEISSERIA.

background image

 

 

TYPOWANIE 
BAKTERIOFAGAMI

MA NA CELU IDENTYFIKACJĘ 
OKREŚLONYCH GATUNKÓW 
WYHODOWANYCH BAKTERII (RZADKO) 
LUB OZNACZANIE ICH TYPÓW 
FAGOWYCH.

OZNACZANIE TYPÓW FAGOWYCH

 

STOSOWANE JEST W DOCHODZENIU 
EPIDEMIOLOGICZNYM, W CELU 
USTALENIA ŹRÓDŁA ZAKAŻENIA I DRÓG 
SZERZENIA W ŚRODOWISKU 
SZPITALNYM I POZASZPITALNYM.

background image

 

 

OKREŚLENIE 

LEKOWRAŻLIWOŚCI

POZWALA NA WYBÓR CHEMIOTERAPEUTYKU 

NAJWĘŻSZYM 

ZAKRESIE DZIAŁANIA I 

NAJWIĘKSZEJ

 SKUTECZNOŚCI PRZECIWKO 

WYIZOLOWANEMU DROBNOUSTROJOWI.

background image

 

 

DOSTĘPNE  SĄ  KOMERCYJNE  METODY 
OZNACZANIA LEKOOPORNOŚCI  BAKTERII WG 
SYSTEMU ATB:

   ATB G - DLA RODZINY 
ENTEROBACTERIACEAE

   ATB - STAPH 5 - DLA GRONKOWCÓW

   ATB - ANA - DLA BAKTERII BEZTLENOWYCH

WYKRYWANIE MECHANIZMÓW OPORNOŚCI 
BAKTERII NA LEKI - TESTY SPECJALNE              
                                           

background image

 

 

METODA DYFUZYJNO - KRĄŻKOWA

background image

 

 

Aglutynacja lateksowa

WYKRYWANIE BIAŁKA PBP 2’ - IDENTYFIKACJA 
GRONKOWCÓW OPORNYCH NA METYCYLINĘ 
(MRSA, MRCNS)

background image

 

 


Document Outline