background image

Podsumowanie ćwiczenia 8 

Testy wykrywania mutagenów 

środowiskowych

NQO

background image

DMS

background image

Ćwiczenie 9

Polimorfizmy genów naprawy DNA 

background image

RAR 

N

N

H

O

N

N

O

dRTP

NH

2

Go 

Go 

8-oxo-
dGMP

MTH1

Oxidative

 DNA 

damage

OGG1

NEIL1

Go 

Damage 

repaired 

Damage 

repaired 

BER 

BER 

Go 

or

DNA pol

AP 

AP 

Replication 

OGG2

Go 

Go 

AP 

MYH

MMR 

MMR 

TCR 

BER 

GGR 

RAR 

T

 

Replication 

Mutation 

Szlaki naprawy 8-oksyguaniny w komórkach 

ssaków

background image

Niektóre polimorfizmy genów naprawy DNA 

systemu BER

Gen

Zmiana 

genetyczna 

Zmiana aktywności 

enzymatycznej 

Ryzyko 

wystąpienia 

nowotworu 

OGG1 Ser326Cys

wycina 8-oksyG in vitro 

2-6 razy mniej 

efektywnie niż wariant 

podstawowy 326 Ser 

Płuca, 

prostaty, 
nosogardzieli

 

OGG1 Arg154His 

Obniżona aktywność, 

charakter mutatorowy, 

wycina 8-oksyG niezależnie 

od zasady leżącej naprzeciw 

w nici komplementarnej

 

w nowotworze  

trzustki, ryzyko 

nieokreślone 

XRCC1 Arg289His

 

Arg399Gln

Białko platformowe, brak 

aktywności 

enzymatycznej 

Płuca, piersi

MYH

Gly328Asp 
Tyr165Cys

 

obniżają aktywność 

glikozylazy wobec pary 
8-oksyG:A

 

Jelita grubego

 

MYH

Tyr90/stop  
Glu466/sto

Skrócone białka

 

Jelita grubego i 

okrężnicy 

background image

Wykonanie ćwiczenia:

PCR genów OGG1 i XRCC1 do oznaczenia polimorfizmów 

przy pomocy RFLP.

1. Cięcie restryktazą i elektroforeza agarozowa – każda 

grupa robi jedno DNA: (i) własne oraz (ii) od 
pacjentów o różnym genotypie, np. Ser326Ser, 
Cys326Cys, Ser326Cys

3. Dializa przygotowanych uprzednio produktów PCR (ok. 

140 bp.)

4. Elektroforeza kapilarna.


Document Outline