background image

 

 

Drobnoustroje środowisk 
ekstremalnych – 
charakterystyka i znaczenie

Stanisław Błażejak

Warszawa 2007

background image

 

 

Ekstremofile

Ekstremofile

Organizmy tolerujące lub wymagające do życia skrajnych 
warunków środowiskowych,

 

W większości ekstremofile to organizmy jednokomórkowe 
należące  do  królestwa  Archaea  
(Archaebacteria).  Wśród 
drobnoustrojów  ekstremofilnych  znajdują  się  również 
bakterie  właściwe  (Eubacteria
)  oraz  niektóre  organizmy 
eukariotyczne  (drożdże  i  pleśnie)  –  wg  systematyki  C. 
Woese’a,

 

Podstawą  określenia  podobieństwa  między  organizmami 
wg  Woese’a  jest  sekwencja  DNA  kodującego  rRNA  (16S 
rRNA dla prokariotów i 18S rRNA dla eukariotów)

background image

 

 

Filogenetyczny podział organizmów wg C. 

Filogenetyczny podział organizmów wg C. 

Woese’a

Woese’a

background image

 

 

Domena 

Domena 

Archaea

Archaea

Osobna  grupa  bakterii,  która  pojawiła  się  na  Ziemi 
przeszło  3,5  mld  lat  temu  o  nieco  innej  morfologii  niż 
Eubacteria  
(inna budowa rRNA, błony cytoplazmatycznej 
–  fosfolipidy  zbudowane  z  L-glicerolu,  zamiast  z  D-
glicerolu,  brak  typowej  mureiny  w  strukturach  ściany 
komórkowej, różnice w transkrypcji, translacji i replikacji 
DNA), która obejmuje:

Euryarchaeota,

Crenarchaeota,

Korarchaeota

background image

 

 

Euryarchaeota

Euryarchaeota

Metanogeny 

– bakterie występujące w środowiskach beztlenowych 

(anaeroby):  bagna,  nawóz,  ścieki,  żwacz.  Są  chemoautotrofami, 
wykorzystują wodór jako źródło elektronów do redukcji dwutlenku 
węgla 

(produktem 

reakcji 

jest 

metan). 

Dotychczas 

zsekwencjonowano  genomy  dwóch  metanogenów:  Methanococcus 
janashii 
Methanobacterium thermoautotrophicum.

Halofile 

–  znalezione  w  Morzu  Martwym  i  Great  Salt  Lake  (USA). 

Utrzymują równowagę osmotyczną przez zwiększenie stężenia soli 

w komórkach.

Termoacidofile 

– żyją w temp. 50-100˚C oraz niskim pH. Większość 

gatunków  utlenia  siarkę.  Mogą  być  aerobami  lub  anaerobami, 
występują  w  gorących  źródłach  i  podwodnych  kominach 
geotermalnych w miejscach styku płyt tektonicznych.

background image

 

 

Crenarchaeota

Crenarchaeota

Są  to  przede  wszystkim  hipertermofile,  żyją  w  temp.  80-
120˚C,  niektóre  nie  rosną  w  temp.  poniżej    80˚C  (Pyrococcus 
furiosus,  Pyrolobus  fumarii
),  często  wymagają  kwaśnego 
środowiska. 

Chemoorganotrofy 

lub 

chemolitoautotrofy, 

anaeroby  obligatoryjne  lub  fakultatywne,  aeroby.  Metabolizm 
większości gatunków opiera się na redukcji siarki. Dotychczas 
zsekwencjonowano genom Aeropyrum pernix.

Korarchaeota

Korarchaeota

Istnienie tego typu Archaea zasugerowano w 1996 r. Bakterie 
izolowano z gorących źródeł Yellowstone, jednak nie udało się 
ich hodować w warunkach laboratoryjnych.

background image

 

 

Podział ekstremofili w zależności od 

Podział ekstremofili w zależności od 

środowiska wzrostu:

środowiska wzrostu:

Acidofile

 – drobnoustroje środowisk kwaśnych,

Alkalofile 

– drobnoustroje środowisk zasadowych,

Anaeroby

 – drobnoustroje środowisk beztlenowych,

Barofile 

–  drobnoustroje  bytujace  w  środowiskach  wysokiego 

ciśnienia hydrostatycznego,

Halofile

 – drobnoustroje środowisk silnie zasolonych

Metalotoleranty

  –  drobnoustroje  środowisk  o  wyskiej  koncentracji 

metali ciężkich (kadm, rtęć, ołów, cynk, miedź, arsen…),

Psychrofile

 – drobnoustroje wymagające do  wzrostu niskiej temp.,

Termofile

 – drobnoustroje wymagające do wzrostu wysokiej temp.,

Radiooporne

 – drobnoustroje rozwijające się w środowisku o silnym 

promieniowaniu jonizującym.

background image

 

 

Przykłady występowania ekstremofili w 

Przykłady występowania ekstremofili w 

różnych ekosystemach

różnych ekosystemach

Wysokie temp. 

Pyrolobus fumarii - kominy geotermalne - 113˚C 

(brak     wzrostu < 90˚C),

Niskie temp.

 - Bacillus TA41- Ocean Antarktyczny - 4˚C,

Wysokie ciśnienie

  Methanococcus janashii - głębokie i gorące 

źródła oceaniczne - 85˚C, 250 atm.,

Wysokie pH

 - Clostridium paradoxum - ścieki - pH > 10,0,

Niskie pH

 - Metallosphaera sedula - wody kopalniane - pH < 2,0,

Wysokie zasolenie

  Halobacterium halobium - słone wody - 30% 

NaCl

background image

 

 

Termofile

Termofile

Termofile

  to  drobnoustroje  o  wysokiej  optymalnej  temp. 

wzrostu (powyżej 45˚C),

Hipertermofile 

to  drobnoustroje  o  optymalnej  temp. 

wzrostu powyżej 80˚C.

Większość  drobnoustrojów  o  wysokiej  optymalnej  temp. 
wzrostu  to  bakterie  G(+)  i  prztrwalnikujące  (Bacillus
  i 
Clostridium
). 

Występują 

także 

wśród 

rodzajów: 

Streptococcus,  Enterococcus,  Staphylococcus,  Sarcina  i 
Lactobacillus
,

Znane 

są 

również 

termofilne 

promieniowce 

(Thermomonospora 
i  Thermoactinomyces)  oraz  termofilne  gatunki  grzybów: 
Absidia ramosa
 i Aspergillus fumigatus

background image

 

 

Termofile - występowanie

Termofile - występowanie

Gorące źródła (30-80˚C),

Miejsca nagrzewane słońcem (skały, powierzchnie liści, ściółka 
leśna – 60-70˚C),

 

Samozagrzewająca się biomasa organiczna - termogeneza (70-
90˚C),

Głębiny oceanów z gorącymi prądami (powyżej 100˚C),

Wyloty wulkanów (ok. 115˚C),

Wyloty kominów geotermalnych (do 430˚C),

Gleby rejonów pustynnych

Woda podgrzewana dla potrzeb przemysłu i gospodarstw 
domowych (55-80˚C),

Ochładzające się wody z procesów technologicznych (30-90˚C),

background image

 

 

Termofile – poszukiwanie nowych gatunków w 

Termofile – poszukiwanie nowych gatunków w 

niezbadanych niszach ekologicznych

niezbadanych niszach ekologicznych

Naturalne  nisze  ekologiczne

  –  powierzchnie  nagrzewanych  słońcem 

drzew, powierzchnie liści, kwiatostany roślin, powierzchnie owadów, 
przechowywana  melasa,  nagrzewane słońcem  zbiorniki wodne, dna 
mórz i oceanów zwierające wodę o podwyższonym zasoleniu,

Siedliska  antropogeniczne

  –  instalacje  elektryczne,  przewody 

wysokiego  napięcia  i  ich  otoczenie  (gleba),  nagrzewające  się 
podczas  ruchu  systemy  paliwowe  samolotów,  izolacje  budynków, 
gorąca woda wodociągowa, asfalt i nawierzchnie dróg.

Badania nad termofilami skupione są w ośrodkach w strefie klimatu 
gorącego 

(Indie, 

Brazylia, 

Australia, 

kraje 

arabskie), 

środziemnomorskiego  (Włochy,  Francja),  a  także  USA,  Rosja, 
Kanada, Wielka Brytania.

background image

 

 

Termofile – czynniki warunkujące oporność na wysoką 

Termofile – czynniki warunkujące oporność na wysoką 

temperaturę

temperaturę

Oporność na inaktywację termiczną białek enzymatycznych i 
strukturalnych termofili wynika z:

Specyficznej  struktury  białek  (silne  upakowanie  hydrofobowego 
rdzenia),

Oligomeryzacji  białek  (białka  będące  monomerami  u  termofili 
bardzo  często występują jako dimery, których energia dysocjacji i 
denaturacji jest o wiele wyższa niż u mezofili),

Immobilizacji  końców  karboksylowych  i  aminowych,  co  utrudnia 
rozwijanie łańcuchów białka,

Odpowiedniego składu błony cytoplazmatycznej – lipidy o wyższej 
temp.  topnienia  oraz  więcej  kwasów  tłuszczowych  nasyconych  w 
porównaniu z
 lipidami mikroorganizmów ciepłolabilnych,

Szybkiego  metabololizmu  –  przyspieszona  resynteza  t-RNA 
w  przypadku  rozkładu  lub  inaktywacji  termicznej  (skuteczne 
systemy naprawcze)

background image

 

 

Termofile – czynniki warunkujące oporność na 

Termofile – czynniki warunkujące oporność na 

wysoką temperaturę

wysoką temperaturę

Obecność białek szoku cieplnego 

Hsp60 (heat shock protein)

Synteza 

białek 

szoku 

jest 

zjawiskiem 

powszechnym 

występującym 
u  prokariotów  i  eukariotów.  Białka  te  nazwano  białkami  szoku 
termicznego, 

ponieważ 

pierwszym 

zidentyfikowanym 

czynnikiem  środowiska,  który  wywoływał  ich  biosyntezę  była 
podwyższona  temperatura.  Białka  szoku  powstają  również  pod 
wpływem, 

metali 

(np.  metalotioneiny  i  fitochelatyny),  wolnych  rodników  oraz 
innych trucizn. 

Uważa  się,  że  białka  szoku  stają  się  białkami  opiekuńczymi 
wobec  innych  białek  pełniących  ważne  funkcje  życiowe, 
chroniąc 

je 

przed 

utratą 

aktywności 

pod 

wpływem 

niekorzystnych zmian w środowisku.

background image

 

 

Klasy białek Hsp

Klasy białek Hsp

Hsp  25

  –  najmniejsze  białka  opiekuńcze  (20-30  kDa);  mają  za 

zadanie wiązanie białek, tak by nie dopuścić do ich agregacji,

Hsp 60

 – głównym przedstawicielem jest białko GroEL występujące w 

komórkach  E.  coli  –  typowe  białko  szoku  termicznego,  którego 
zawartość  w  komórkach  wzrasta  w  odpowiedzi  na  podwyższoną 
temperaturę,

Hsp 70

 – wspomagają białka opiekuńcze innych klas,

Hsp  90

  –  rozpoznają  i  wiążą  białka  w  stanach  nienatywnych, 

zapobiegając ich agregacji,

Hsp  104

  –  występują  u  drożdży  i  decydują  o  ich  wrażliwości  na 

temperaturę;  biorą  udział  w  procesie  naprawiania  struktury  białek 
wywołanych podwyższona temperaturą.

Wśród białek opiekuńczych zwraca się uwagę na dwie izomerazy:

PPI

 – izomeraza peptydylopropylowa; katalizuję reakcje izomeryzacji 

cis/trans  reszt  prolinowych,  gdy  proces  zwijania  łańcucha  został 
zablokowany przez niewłaściwy izomer reszty prolinowej

PDI

  –  izomeraza  dwusiarczkowa;  katalizuje  tworzenie  lub  redukcję 

mostków dwusiarczkowych jeśli okażą się niewłaściwe dla natywnej 
struktury białka (mostki -S-S- zwiększają ciepłooporność białek)

background image

 

 

Termofile – oddziaływanie na środowisko

Termofile – oddziaływanie na środowisko

Pożądane 

–  kompostowanie  surowców  roślinnych;  w 

warunkach  podwyższonej  temperatury  grzyby  termofilne 
stanowią  przeważająca  część  flory  i  skutecznie  prowadzą 
degradację 

substratów 

organicznych 

przy 

pomocy 

enzymów zewnątrzkomórkowych, 

Niepożądane

  –  składowanie  słomy,  ziarna,  mąki,  pasz  i 

innych 

surowców 

pochodzenia 

roślinnego. 

tym 

przypadku 

obecność 

grzybów 

termofilnych 

może 

doprowadzić 

do 

zjawiska 

samozagrzewania. 

Nagromadzenie energii wytwarzanej przez drobnoustroje w 
postaci  ciepła    (w  warunkach  odpowiedniej  wilgotności) 
prowadzi do wzrostu temperatury nawet do 80˚C.

background image

 

 

Termofile – przykłady zastosowania

Termofile – przykłady zastosowania

Pozyskiwanie  enzymów  stosowanych  w  reakcjach  PCR 
wytwarzane  przez  hipertermofilne  szczepy  Archae-  

Eubacteria:
  Thermus  aquaticus  –  Taq-pol,  Thermus 
thermophilus  –  Tth-
pol,  Thermus  flavus  –  Tfl-pol
Bacillus  stearothermophilus  –  Bst-pol
  lub  Pyrococcus 
furiosus
 – Pfu-pol,

Przemysłowa 

produkcja 

kwasu 

mlekowego 

– 

Lactobacillus delbrueckii ssp. delbrueckii,

Bakterie  jogurtowe  i  inne  probiotyczne  bakterie 
mlekowe  –  Lactobacillus  delbrueckii  ssp.  bulgaricus, 
Sterptococcus thermophilus, Lactobacillus acidophilus,

background image

 

 

amylazy

 

(np. 

α-amylaza 

– 

Pyrococcus 

furiosus, 

Staphylothermus marinus, Sulfolobus solfataricus –  opt. temp. 
działania ok. 100˚C, pH 4,5-7,5.

pullulanazy

  (Thermotoga  maritima,  Desulfurococcus  mucosus, 

opt. temp. działania 85-100˚C, pH 5,0-7,0.),

celulazy  i  hemicelulazy

  (Thermotoga  maritima,  Thermatoga 

neapolitana, 95˚C, pH 6,0-7,5.),

pektynazy

ksylanazy 

(Pyrodictium abyssi, 110˚C, pH 5,5)

chitynazy

 

(Bacillus 

licheniformis 

X-7u, 

Streptomyces 

thermoviolaceus, Thermococcus chitonophagus)

proteinazy

 (Sulfolobus acidocaldarius, temp. 110˚C, pH 2,0) 

esterazy 

(Pyrococcus furiosus – ekspresja w komórkach E. coli

enzym  ten  ulega  50%inaktywacji  po  50  min  ogrzewania  w 
temp. 126˚C)

izomeraza glukozowa 

(Thermus flavus, temp. 90˚C, pH 7,0)

dehydrogenaza  alkoholowa 

(Thermoanaerobacter  ethanolicus- 

ekspresja genu w komórkach E. coli) 

Otrzymywanie enzymów do degradacji 

biopolimerów:

background image

 

 

Psychrofile

Psychrofile

Drobnoustroje  o  niskich  min.  temp.  wzrostu  (-23  - 
0˚C)

Nazewnictwo tej grupy jest niejednorodne:

psychrofile

kriofile

termofoby

organizmy zimnolubne

Podział:

psychrofile

 – optymalna temp wzrostu poniżej 20˚C

psychrotrofy

  –  organizmy  dające  wyraźny  wzrost  w 

temp.  0˚C,  niezależnie  od  optymalnej  temp. 
wzrostu

background image

 

 

Psychrofile i psychrotrofy – przykłady i 

Psychrofile i psychrotrofy – przykłady i 

występowanie

występowanie

Gramujemne pałeczki i przecinkowce:

Pseudomonas, 

Aeromonas, 

Alcaligenes, 

Yersinia, 

Chromobacterium, Flavobacterium, Vibrio

Gramdodatnie pałeczki i ziarniaki:

Micrococcus, Bacillus, Achromobacter

Drożdże i pleśnie:

Candida, 

Rhodotorula, 

Debaryomyces, 

Pichia, 

Aureobasidium  pullulans,  Botrytis  cinerea,  Geotrichum 
candidum

Glony:

Chlamydomonas  nivalis  (występują  powszechnie  na 
obszarach polarnych

Drobnoustroje  zimnolubne  stanowią  najliczniejszą  grupę 
mikroorganizmów 

rozpowszechnioną 

we 

różnych 

ekosystemach

  –  rejony  podbiegunowe,  wysokie  góry,  dna 

oceanów, osady głębokich jezior

background image

 

 

Psychrofie – wpływ niskiej temperatury na 

Psychrofie – wpływ niskiej temperatury na 

komórki

komórki

Zmniejszenie lub utrata płynności membran komórkowych 
–  prowadzi  do  zahamowania  lub  utraty  zdolności 
transportu  jonów  i  innych  składników  do  cytozolu 
komórkowego,

Usztywnienie 

drugorzędowej 

struktury 

kwasów 

nukleinowych  –  trudności  w  otwarciu  podwójnej  helisy 
DNA,  co  prowadzi  do  spowolnienia  tempa  replikacji, 
transkrypcji i translacji mRNA,

Zmniejszenie  szybkości  fałdowania  się  białek  (tworzenia 
III-  i  IV-  rzędowej  struktury)  –  trudności  w  powstawaniu 
mostków dwusiarczkowych,

Zmniejszenie 

szybkości 

reakcji 

enzymatycznych 

(spowolnienie  metabolizmu)  –  zgodnie  z  prawem  Van’t 
Hoffa,

Powstawanie 

kryształków 

lodu 

– 

mechaniczne 

uszkodzenia struktur komórkowych.

background image

 

 

Psychrofile  –  adaptacja  do  życia  w  niskich 

Psychrofile  –  adaptacja  do  życia  w  niskich 

temperaturach

temperaturach

Specyficzna  budowa  błony  cytoplazmatycznej

  –  większa  zawartość 

kwasów  tłuszczowych  nienasyconych  i  rozgałęzionych  niż  w 
komórkach innych drobnoustrojów,

Wytwarzanie  tzw.  psychroenzymów

  –  mają  zdolność  katalizowania 

reakcji  w  niskich  temperaturach  (większa  elastyczność  tych 
cząsteczek  dzięki  obecności  dodatkowych  powierzchniowych  pętli 
polarnych),

Zdolność  do  syntezy  białek  zapobiegających  powstawaniu  dużych 
kryształków lodu

 

(tzw. białka termicznej histerezy)

 – ulegają adsorpcji 

na kryształkach lodu, nie dopuszczając do ich wzrostu,

Synteza  białek  nukleacyjnych  lodu

  –  działają  jako  zarodki 

krystalizacji, ale powstające kryształki lodu mają minimalne rozmiary,

Biosynteza  białek  szoku  zimna  (Csp  –  Cold  shock  protein)

  – 

zaangażowane  w  zwiększenie  efektywności  replikacji,  transkrypcji  i 
translacji.

background image

 

 

Psychrofile – wykorzystanie

Psychrofile – wykorzystanie

Wykorzystanie  enzymów  drobnoustrojów  psychrofilnych 
do  skutecznej  degradacji  zanieczyszczeń  (odpadów 
przemysłowych) i ścieków w niskich temperaturach,

Produkcja detergentów i środków do prania skutecznych 
w niskich temperaturach (protezy i lipazy),

Przetwórstwo żywności w niskich temperaturach.

 

background image

 

 

Psychrofile – działalność niepożądana

Psychrofile – działalność niepożądana

Produkcja  żywności

  –  powszechna  obecności  psychrofili  w 

wodzie  i  surowcach  umożliwia  namnażanie  się  ich  w 
żywności podczas produkcji i  przechowywania,

produktach 

pochodzenia 

morskiego 

występują 

najczęściej 

psychrofile

,  natomiast 

psychrotrofy

   

występują 

w  nabiale,  wędlinach  oraz  owocach  i  warzywach 
przechowywanych w warunkach chłodniczych

Z  nabiału  i  mięsa  najczęściej  izolowane  są:  Acinetobacter, 
Alcaligenes, 

Flavobacterium, 

także 

Pseudomonas, 

Lactobacillus, Moraxella, Corynebacterium,

produktach 

przechowywanych 

niskich 

temp. 

szczególne 

niebezpieczeństwo 

stanowią 

patogenne 

psychrotrofy, 

takie 

jak:

L. monocytogenes, Y. enterocolitica i B. cereus.

background image

 

 

Acidofile i alkalofile

Acidofile i alkalofile

Obok temperatury, pH jest tym czynnikiem środowiska, 
który decyduje o możliwości wzrostu drobnoustrojów w 
danym ekosystemie

Neutrofile

 pH 6,5-7,5 (większość drobnoustrojów),

Acidifile 

pH 2,0-5,0,

Alkalofile

 pH 8,0-11,0.

background image

 

 

Acidofile i alkalofile

Acidofile i alkalofile

Acidofile 

–  prawie  wszystkie  gatunki  Thiobacillus  oraz  Sufolobus

bakterie  octowe  (szczególnie  z  rodzaju  Gluconacetobacter
stosowane  w  przemysłowej  produkcji  octu  met.  wgłębną  w 
acetatorach), drożdże i grzyby strzępkowe (pH 4,0-6,0),

Najbardziej  typowym  gatunkiem  przystosowanym  do  ekstremalnie 
niskiego pH są bakterie siarkowe Thiobacillus tiooxibacillus
, których 
wzrost obserwowano przy pH poniżej 0,5,

Alkalofile

  –  bakterie  nitryfikacyjne  z  rodzajów  Nitrosomonas  i 

Nitrobacter  (  rosną  przy  pH  ok.  10,0),  Vibrio  cholerae
Streptococcus  pneumoniae,  Enterococcus  faecalis,  Azotobacter
,  a 
także niektóre gat. z rodzaju Bacillus 
(B. circulans),

Najmniejszą 

wrażliwością 

wobec 

alkalicznego 

środowiska 

odznaczają  się  sinice  (Plectonema  nostrocorum),  które  zachowują 
zdolność wzrostu przy pH=13,0

background image

 

 

Występowanie acidofili

Występowanie acidofili

Obszary 

naturalnej 

aktywności 

geotermicznej 

wysokiej 

kwasowości  (wytwarzanie  gazów  zawierających  związki  siarki  w 
wylotach hydrotermalnych i gorących źródłach),

Hałdy przy kopalniach węgla.

        

        

Oporność acidofili na niskie pH

Oporność acidofili na niskie pH

Kwasolubne  ekstrmemofile  nie  tolerują  niskiego  pH  wewnątrz 
komórki,  gdyż  może  to  prowadzić  do  uszkodzenia  DNA  i  innych 
oraganelli.  We  wnętrzu  komórki  pH  utrzymywane  jest  na  poziomie 
obojętnym, co zapobiega  rozkładowi wrażliwych makromolekuł  pod 
wpływem 

kwasów. 

Cząsteczki 

wchodzące 

kontakt 

ze 

środowiskiem  muszą  być  zdolne  do  działania  w  ekstremalnej 
kwasowości. 

background image

 

 

Obecność w ścianie komórkowej i błonie cytoplazmatycznej 
ekstremozymów zdolnych do działania w pH nawet poniżej 
1,0,

środowisku 

kwaśnym 

utrzymanie 

wewnątrzkomórkowego 

pH 

na 

poziomie 

bliskim 

obojętnemu  jest  możliwe  dzięki  nie  przepuszczaniu  jonów 
H cytozolu lub ich natychmiastowego usuwania z komórek.

Aciodofile – zastosowanie

Aciodofile – zastosowanie

wykorzystanie  ekstremozymów  tolerująch  niskie  pH  soku 
żołądkowego,  jako  dodatku  paszowego  w  celu  poprawy 
strawności pasz gorszej jakości

background image

 

 

Alkalofile

Alkalofile

Występowanie:

  gleby  i  wody  przesycone  węglanami,  tzw. 

jeziora sodowe (Egipt, zachodnie stany USA) oraz  ścieki,

Czynniki  warunkujące  oporność  na  wysokie  pH:

 

alkalofile 

podobnie  jak  acidofile  utrzymują  odczyn  obojętny  w 
komórkach,  tak  by  nie  doszło  do  degradacji  kwasów 
nukleinowych;  ich  ekstremozymy  zlokalizowane  są  na 
powierzchni komórek lub wydzielane są do środowiska,

Zastosowanie:

 

dodatek  zimnolubnych  enzymów  do   

środków piorących i innych detergentów celu skutecznego 
usuwania  zanieczyszczeń  białkowych  i  lipidowych  w 
niskiej 

temp.; 

enzymatyczne 

odbarwianie 

tkanin 

(częściowa degradacja celulozy w włóknach naturalnych).

background image

 

 

Anaeroby

Anaeroby

Anaeroby  obligatoryjne  to  drobnoustroje  żyjące  w  środowisku 
pozbawionym tlenu atmosferycznego (potencjał redox nawet poniżej 

-300 mV), czyli ekstremalnym z naszego punktu widzenia,

Najpowszechniej  spotykane  beztlenowce  z  królestwa  Eubacteria  to 
gatunki  z  rodzajów 

Clostridium

    i 

Bacterioides

  (B.  fragilis, 

gramujemne  pałeczki,  wytwarzają  bakteriocyny,  stymulują  wzrost 
Bifidibacterium 
– naturalna mikroflora jelitowa ludzi i zwierząt) oraz 
metanogeny 

– 

Methanobacterium, 

Methanobrevibacter, 

Methanococcus, Methanothermus

 (królestwo Archaea),

W  produktach  żywnościowych  beztlenowce  mogą  występować 
w konserwach oraz w głębokich warstwach mięsa i serów,

Toksyczność  tlenu  dla  tych  drobnoustrojów  wynika  z  braku 
mechanizmów  ochronnych  wobec  nadtlenku  wodoru  oraz  rodnika 
hydroksylowego  i  nadtlenkowego;  beztlenowce  nie  posiadają 
katalazy,  peroksydazy  i  dysmutazy,  rozkładających  toksyczne 
połączenia tlenu.

background image

 

 

Anaeroby – zdobywanie energii

Anaeroby – zdobywanie energii

Bezwzględne beztlenowce uzyskują energię na drodze fermentacji 
lub oddychania beztlenowego,

W  procesach  fermentacji  akceptorem  wodoru  są  związki 
organiczne,  natomiast  w  procesie  oddychania  beztlenowego 
związki  nieorganiczne;  do  akceptorów  tego  typu  należą  jony: 
azotanowe, siarczanowe, węglanowe, fumarowe a także siarka,

Na 

podstawie 

przeprowadzanych 

procesów 

bakterie 

te 

klasyfikowane  są  do  fizjologicznych  grup  bakterii  redukujących 
azotany,  denitryfikacyjnych,  desulfurykacyjnych,  metanogennch  i 
do bakterii redukujacych siarkę.

Znaczenie  anaerobów:

  krążenie  pierwiastków  w  przyrodzie, 

tworzenie  złóż  siarki  i  metanu,  utylizacja  odpadów  organicznych 
(odchody  zwierzęce  oraz  odpady  zawierające  celulozę),  przemysł 
włókienniczy-hydroliza pektyn, produkcja związków zapachowych.

background image

 

 

Barofile

Barofile

Kolejnym  przykładem  środowiska  ekstremalnego  są 
ekosystemy  o  wysokim  ciśnieniu  hydrostatycznym 
(hiperbaria)

Podział  drobnoustrojów  ze  względu  na  możliwości 
wzrostu przy wysokim ciśnieniu:

Wrażliwe 

-  do  300  MPa  –  bakterie  G(-)  np. 

Pseudomonas, Escherichia,

Średniowrażliwe 

-  do  400  MPa  –  grzyby  np. 

Saccharomyces, Rhizopus oryzae,

Niewrażliwe

  –  możliwy  wzrost  do  600  MPa  –  bakterie 

G(+) np. Lactobacillus lactis, Staphylococcus aureus.

background image

 

 

Barofile

Barofile

Szczególnie  dużą  wytrzymałość  na  wysokie  ciśnienie 
wykazują formy przetrwalne bakterii,

Przetrwalniki 

B. subtilis

 nie tracą zdolności do kiełkowania 

nawet  po  zadziałaniu  ciśnienia  900  MPa.  Podobna 
wytrzymałość wykazują zarodniki 

A. niger

 (do 1000 MPa),

przypadku 

większości 

bakterii 

wzrost 

zostaje 

zahamowany przy ciśnieniu 60 MPa,

Najmniejszą  oporność  na  ciśnienie  wykazują  drożdże 
(zwykle do 0,8 MPa)

Na  szczególna  uwagę  zasługują  te  bakterie,  które  żyją  na 
dnie  oceanów  (ciśnienie  do  1100  atm.).  Zwykle  najlepiej 
rozwijają się przy ciśnieniach 300-600 atm. ( 3000-6000 m).

background image

 

 

Podział bakterii żyjących w morzach i 

Podział bakterii żyjących w morzach i 

oceanach

oceanach

Barotolerancyjne  – 

izolowane  z  głębokości  ok.  4000  m.  Minimalnym 

ciśnieniem, przy którym  obserwuje się ich wzrost jest 50 atm.,

Barofile

 

– 

izolowane z głębokości 5000-6000 m. Optymalny wzrost przy 

ok. 400 atm.,

Bezwzględne  barofile  –

  izolowane  z  głębokości  10000-11000  m. 

Optymale  ciśnienie  dla  barofilów  izolowanych  z  Rowu  Mariańskiego 
wynosiło 700-800 atm. W tych warunkach przy temp. 2,5˚C
 rozwijają się 
do 1000 razy szybciej niż po zredukowaniu ciśnienia (np.do 50 atm.) 

Mechanizmy niszczącego działania wysokiego ciśnienia na drobnoustroje

Mechanizmy niszczącego działania wysokiego ciśnienia na drobnoustroje

Zmiany 

strukturach 

komórkowych 

składzie 

chemicznym:

 

zmniejszenie  zawartości  polisacharydów  i  fosfolipidów,  zmiany 
w  błonie  cytplazmatycznej,  dysocjacja  rybosomów  na  podjednostki 
i zahamowanie translacji, zmiany konformacyjne białek strukturalnych i 
enzymatycznych  (inaktywacja  enzymów),  zmiany  konformacyjne 
kwasów nukleinowych)

background image

 

 

Barofile

Barofile

Inaktywacja  enzymów  pod  wpływem  wysokiego  ciśnienia 
hydrostatycznego,  stwarza  możliwość  zastosowania  tej 
metody do utrwalania żywności (UHP)

przy ciśnieniu 350-400 MPa w temp. pokojowej można uzyskać 
obniżenie  zawartości  żywych  form  wegetatywnych  bakterii  o 
kilka  cykli  logarytmicznych 

(np.  zmniejszenie  zawartości 

tlenowców  mezofilnych  o  4  D  w  przyprawach)

  oraz  całkowite 

zniszczenie drożdży i zarodników pleśni,

z  dotychczasowych  badań  wynika,  że  nie  ma  możliwości 
uzyskania  produktu  w  pełni  bezpiecznego  dla  zdrowia 

(12  D 

dla Cl. botulinum)

 przy użyciu tylko UHP.

Stosowanie 

UHP 

do 

dezintegracji 

komórek 

celu 

pozyskiwania składników cytozolu, 

Poprawianie  niektórych  właściwości  żywności  –  np.  przy 
ciśnieniu  200  MPa  pod  wpływem  termolizyny  następuje 

hydroliza  β-laktoglobuliny,  stanowiącej  czynnik  alergizujący 
mleka.

background image

 

 

Halofile

Halofile

Halofile  to  drobnoustroje  żyjące  w  środowiskach  zasolonych. 
Zostały podzielone na trzy grupy wg optymalnej NaCl:

Słabe – 

1-6% NaCl,

Umiarkowane –

 6-15% NaCl,

Skrajne (halofile ekstremalne) –

 15-30% NaCl.

Halofile słabe –

 występują w wodzie morskiej o zasoleniu ok. 3%, 

są to bakterie, których odpowiedniki wystepują w środowisku 
lądowym,  jednak  ich  wzrost  w  wyniku  adaptacji  do 
podwyższonych  stężeń  NaCl  jest  możliwy  tylko  w  jego 
obecności

Halofile  umiarkowane  –

  należą  tu  bakterie  z  rodziny 

Pseudomonadaceae

Spirillaceae 

i 

Neiseriaceae

Ich 

występowanie  stwierdzono  w  solankach  przemysłowych,  a 
także w produktach solonych,

background image

 

 

Halofile

Halofile

Halofile  skrajne  (Archaea)  –

  gramujemne  bakterie  z  rodzajów: 

aeroby  - 

Halomonas,  Halovibrio,  Halobacterium  (H.  salinarum), 

Halococcus 
(H.  morrhuae
)

  i  anaeroby  –  np. 

Haloanaerobium.

  Bakterie  te 

wytwarzają  barwniki  z  grupy  karotenoidów  od  odcienia  od 
żółtego poprzez różowy, czerwony aż do brązowego. Barwniki te 
stanowią  ochronę  przed  fotooksydacyjnym  działaniem  światła 
słonecznego  na  bakterie  rosnące  w  płytkich  solankach. 

Halobacterium  halobium  –

  fotoautotrofy  (bakteriorodopsyna  i 

halorodopsyna)

Występowanie halofili:

woda morska,

naturalne  zbiorniki  o  b.  dużym  zasoleniu  (Morze  Martwe,  Morze 
Kaspijskie, słone jeziora w USA i Australii),

miejsca otrzymywania soli przez odparowanie wody morskiej,

żywność utrwalana solą. 

background image

 

 

Halofile – przystosowanie do życia w 

Halofile – przystosowanie do życia w 

solankach

solankach

Przeciwdziałanie 

procesowi 

plazmolizy 

prowadzącej 

odwodnienia  komórek  w  roztworach  o  wysokim  ciśnieniu 
osmotycznym 

– 

biosynteza 

rozpuszczalnych 

składników 

wewnątrzkomórkowych  (np.  glicerolu)  lub  utrzymywanie 
podwyższonego stężenia kationów – Halobacterium salinarum

Enzymy  halofili  często  wymagają  aktywacji  przez  jony  sodu  i 
potasu  (jony  potasu  stabilizują  podjednostki  bakteryjnych 
rybosomów 70S),

Wysokie  wewnątrzkomórkowe  stężenie  potasu  równoważy 
wysokie stężenie jonów sodu środowiska zewnętrznego,

Inna  struktura  ściany  komórkowej  (brak  typowej  mureiny  – 
psudomureina),

Silny  wypadkowy  ładunek  ujemny  zewnętrznej  warstwy  ściany 
komórkowej – równoważony przez wysokie stężenie jonów sodu 
w środowisku.

background image

 

 

Halofile - wykorzystanie

Halofile - wykorzystanie

Próby  zastosowania  bakterii  halofilnych  do  zwiększenia 
ilości wydobywanej ropy z szybów naftowych (

Robert M. 

Kelly –North Carolina State University

)

Wytworzenie 

przejść 

umożliwiających 

przepływ 

uwięzionej  ropy  do  czynnych  szybów  polega  na 
wtłoczeniu  pod  ziemię  mieszaniny  piasku  i  gumy  guar
 
oraz 

przeprowadzeniu 

eksplozji 

materiałów 

wybuchowych.  Do  powstałych  szczelin  przedostaje  się 
mieszanina  piasku  i  gumy  guar
.  Guma  rozprowadza 
piasek  przez  pęknięcia  i  utrzymuje  szczeliny  otwarte. 
Aby  ropa  mogła  płynąć  przez  te  szczeliny  guma  guar
 
musi  ulec  biodegradacji.  Tę  rolę  pełnią  enzymy 
pozyskiwane  z  halofili,  które  są  aktywne  w  tych 
ekstremalnych warunkach.

background image

 

 

Metalotoleranty

Metalotoleranty

Metalotoleranty – drobnoustroje zdolne do życia w środowisku 
zawierającym  duża  koncentrację  kationów  (np.:  żelazo,  cynk, 
ołów,  miedź,  arsen,  kadm,  chrom,  nikiel,  uran,  srebro,  złoto). 
Oporność  na  wysokie stężenia tych jonów w środowisku  wiąże 
się  zwykle  z  tolerancją  na  silne  zakwaszenie  środowiska 
(acidofile).

Wrażliwość  na podwyższone stężenia metali w roztworze może 
być  zróżnicowana  nawet  u  poszczególnych  szczepów  danego 
gatunku i zależy od:

pH,

substratów,

fazy wzrostu,

czasu adaptacji.

Mimo  wysokiej  toksyczności  metali  ciężkich,  większość 
drobnoustrojów  jest  zdolna  dożycia  w  ich  środowisku,  dzięki 
wykształceniu  mechanizmów  obronnych  przed  abiotycznym 
oddziaływaniem tych pierwiastków.

background image

 

 

Metalotolerenty – mechanizmy obronne

Metalotolerenty – mechanizmy obronne

Modyfikacje  w  strukturze  błony  cytoplazmatycznej  ograniczające  jej 
przepuszczalność w stosunku do metali ciężkich,

  Chelatowanie  metali  przez  zewnątrzkomórkowe  biopolimery  (białka  i 
polisacharydy), siderofory, etc.,

Modyfikacje w strukturze ściany komórkowej,

Precypitacja metali w postaci siarczków lub szczawianów,

Wiązanie i wewnątrzkomórkowa separacja w wakuolach oraz wiązanie w 
postaci polifosforanów,

Zwiększona  produkcja  melaniny  (melanocyty  produkujące  melaninę 
układają  się  w  formie  parasola  nad  jądrem  komórkowym,  chroniąc 
zawarty  w  nich  DNA  przed  uszkodzeniem  –  im  większe  narażenie 
komórki, tym większa zawartość melanin),

Biosynteza  niskocząsteczkowych  substancji  organicznych  takich  jak: 
glicerol,  arabitol,  mannitol,  sorbitol  –  wzrost  ciśnienia  osmotycznego  w 
komórce.

background image

 

 

Metalotolerenty – mechanizmy obronne

Metalotolerenty – mechanizmy obronne

Biosynteza  metalotionein  i  fitochelatyn  do  wiązania  toksycznych 
kationów (np. kadmu, cynku i ołowiu),

Zmniejszanie toksyczności kationów, które wniknęły do komórki w 
wyniku ich redukcji (np.: reduktaza rtęciowa u bakterii – redukcja 
kationów rtęci do rtęci metalicznej; system redukcji  Cr (VI) do Cr 
(III)  w  komórkach  drożdży)  –  geny  determinujace  oporność  na 
toksyczne metale są zwykle kodowane na plazmidach R).

Metalotolerenty – wykorzystanie

Metalotolerenty – wykorzystanie

Eliminacja  toksycznych  kationów  lub  odzykiwanie  cennych 
pierwiastków  z  zanieczyszczonej  wody  i  gleby  metodami 
biotechnologicznymi  przy  pomocy  żywej  lub  martwej  biomasy 
drobnoustrojów  –  przyjmuje  się,  że  technologie  są  ekonomicznie 
opłacalne,  jeżeli  ilość  związanego  metalu  przekracza  150  mg/g 
s.s.,

background image

 

 

Metalotolerenty – wykorzystanie

Metalotolerenty – wykorzystanie

Przeprowadzone  badania  wykazały,  że  hodowla  grzybów 
strzępkowych Verticillium marquandii 
IM6003 na podłożach 
z dodatkiem odpadów hutniczch zwierających cynk (20%) i 
ołów  (3,5%)  pozwala  na  selektywny  i  wydajny  odzysk 
cynku,

Najczęściej stosowane drobnoustroje w procesach wiązania 
kationów: 

Pseudomonas, 

Citrobacter, 

Aeromonas, 

Arthrobacter – kadm, nikiel, kobalt, ołów, chrom;  Chlorella 
vugalis
 – złoto; Actinomyces i Streptomyces – uran, 

Wiązanie 

metali 

można 

prowadzić 

przy 

pomocy 

drobnoustrojów  unieruchomionych  na  nośnikach,  co 
pozwala  na  wielokrotne  użycie  i  obniżenie  kosztów 
(biosorpcja  i  desorpcja  przy  pomocy  kwasów  mineralnych 
lub EDTA)

background image

 

 

Drobnoustroje radiooporne

Drobnoustroje radiooporne

Radiooporność 

–  niska  wrażliwość  na  promieniowanie 

elektromagnetycze  –  drobnoustroje  tolerujące  wysokie  dawki 
promieniowania    (1  kwant  światła  widzialnego  do  5  eV;  UV 
powyżej 100 eV, promieniowanie jonizujące powyżej 1,0 MeV),

Drobnoustroje wg malejącej radiooporności: 

     - wirusy, 
     - przetrwalniki bakterii G(+), 
     - grzyby, 
     - bakterie G(-),

Metody  radiacyjne  są  dopuszczone  do  utrwalanie  niektórych 
środków spożywczych pod warunkiem nie przekroczenia dawki 
10 KGy/kg (wartość D dla Cl. botulinum
 wynosi 3 KGy, czyli ich 
liczbę  można  zmniejszyć  o  3  rzędy  log,  a  nie  o  12  D  –  do 
poziomu gwarantującego bezpieczeństwo mikrobiologiczne).

background image

 

 

Drobnoustroje radiooporne – 

Drobnoustroje radiooporne – 

Deinococcus 

Deinococcus 

radiodurans

radiodurans

Deinococcus radiodurnas – bakterie odkryte w 1956 r. w 
stanie Oregon, podczas badań nad sterylizacją konserw 
przy 

pomocy 

promieniowania 

jonizującego. 

Promieniowanie  zniszczyło  wszystkie  drobnoustroje  z 
wyjątkiem tych dwoinek

W  warunkach  laboratoryjnych  Deinococcus  radiodurnas 
przetrwały 

ekstremalne 

poziomy 

promieniowania, 

temperatury,  odwodnienia  oraz  działania  chemicznych 
czynników mutagennch,

Bakterie  te  mogą  występować  w  tak  ekstremalnych 
środowiskach  jak:  woda  chłodząca  reaktory  jądrowe, 
kopalnie  rud  uranu,  skały  antarktydy,  przestrzeń 
kosmiczna.

background image

 

 

Deinococcus radiodurans

Deinococcus radiodurans

 - pochodzenie

 - pochodzenie

Pochodzi z kosmosu (oporność na promieniowanie kosmiczne) 

i przedostała się na Ziemię wraz z meteorytem,

Jest  jedną z najwcześniejszych form życia  powstałych na Ziemi – 
istnieje  od  przeszło  3,5  mld  lat  (panowały  ekstremalne  warunki, 
w tym wysokie promieniowanie jonizujące).

Deinococcus radiodurans

 – toleruje dawkę 1,5 mln radów (15.000 

Gy), czyli 3000 razy większą niż dawka śmiertelna dla człowieka, 
jest  niewrażliwy  na  całkowite  wysuszenie  i  zabójcze  dla  innych 
organizmów  stężenia  mutagennych  związków  chemicznych 
(bromek etydyny, związki alkilujące – np. pochodne iperytu, kwas 
azotowy (III), barwniki akrydynowe, analogi zasad – bromouracyl, 
sole metali ciężkich).

Przy pochłonięciu dawki 1,5 mln radów w genomie 

D. radiodurans

 

powstaje  ok.  200  uszkodzeń,  które  w  ciągu  kliku  godzin  zostają 
naprawione i genom powraca do stanu pierwotnego. 

background image

 

 

Deinococcus radiodurans

Deinococcus radiodurans

 – czynniki oporności

 – czynniki oporności

Dwa chromosomy bakteryjne –

 2,6 Mpz i 0,4 Mpz,

Dwa megaplazmidy

 

 177 Kpz i 45 Kpz,

Prawie połowa z 3100 genów tej bakterii zaangażowana jest 
w systemy popromiennej naprawy DNA,

komórce 

może 

występować 

kilka 

(2-10) 

kopii 

chromosomu  bakteryjnego  w  zależności  od  stadium 
rozwojowego,

Komórka 

posiada 

unikalny 

mechanizm 

usuwania 

uszkodzonych nukleotydów,

Obecność    dużej  ilości  enzymów  chroniących  przed 
toksycznymi  związkami  (np.  dysmutaza  nadtlenowa  –  50 
razy więcej niż u E. coli
),

Obecność katotenoidów

 – ochrona przed wolnymi rodnikami.

background image

 

 

Deinococcus radiodurans

Deinococcus radiodurans

 – możliwości 

 – możliwości 

zastosowania

zastosowania

Utylizacja  radioaktywnych  odpadów  (elektrownie 
atomowe, kopalnie rud uranu),

Biodegradacja  toksycznych  związków  organicznych 
(np. toluen, chlorobenzen, indol),

Badania  podstawowe  z  zakresu  mechanizmów 
naprawczych komórek D. radiodurans, 
mogą znaleźć 
zastosowanie 

powstrzymywaniu 

rozwoju 

nowotworów.

background image

 

 

Nanobakterie – fikcja, czy rzeczywistość ?

Nanobakterie – fikcja, czy rzeczywistość ?

Mikroskopijne  rozmiary  nanobakterii  (średnio  50  nm)  powodowały,  że  poddawano  w  wątpliwość  w  ich  istnienie,  a  dopiero  najnowsze  badania  potwierdziły  ich 
występowanie w środowiskach ekstremalnych

1990 

 

Prof. 

R. 

Folk 

University 

of 

Texas

 

– 

obserwacje 

za 

pomocą 

skaningowego 

mikroskopu 

elektronowego 

powierzchni 

minerałów 

(kalcyty  i  aragonity),  pochodzących  z  gorących  źródeł    (podłużne  i  okrągłe  obiekty  o  średnicy  25–250  nm,  występujące  pojedynczo  lub  tworzące  charakterystyczne 
układy paciorkowców, gronkowców lub laseczek)

początkowo uznawano je za karłowate formy bakterii (1/10 wielkości) lub ich prehistoryczne „ nanoskamieliny „

znajdowane twory były martwe i zmineralizowane, nie było zatem dowodów, że kiedykolwiek były organizmami żywymi 

Sposród  znanych  obecnie  najmniejszych  bakterii  tylko mykoplazy  sa  zdolne do  samodzielnego  życia (DNA  wielkości 0,5  Mpz),  pozostałe jak chlamydia, czy  riketsje są 
wewnątrzkomórkowymi pasożytami obligatoryjnymi wykorzystującymi metabolizm żywiciela.

1999 australijscy geolodzy z University of Queensland, badający mineralne próbki z dna oceanicznego zaobserwowalui pierwsze wolno żyjące nanobakterie, które potrafiły się rozmnażać 

odkrywca nanobakterii prof. Folk sądzi, że organizmy te są bardzo rozpowszechnione na ziemi, a jako bakterie chemolitotroficzne są odpowiedzialne za rdzewienie metali i biomineralizację ( dzięki swym niewielkim rozmiarom skutecznie wymykały się metodom badawczym stosowanym przez 

mikrobiologów dla „ konwencjonalnych „ bakterii ). Nanobakterie wytwarzają mineralne otoczki chroniące je przed ekstremalnymi warunkami środowiskowymi. 

Obecnie trwają badania nad wyizoloawniem DNA z litotroficznych nanobakterii co umożliwi ich klasyfikacje i ustalenie względnego podobieństwa do innych znanych form mikroorganizmów

Nanobakterie stanowią również zainteresowanie astrobiologów  z NASA, którzy badając powierzchnie meteorytów ( w tym marsjańskiego ALH84001 ), zaobserwowali na nich mikroskopijne twory podobne do spotykanych na powierzchni ziemskich skał

1988 fińscy naukowcy z uniwersytetu w Kuopio odkryli w surowicy bydlecej ( stosowanej w hodowlach komórkowych ) obecność nieznanego czynnika, który powodował zahamowanie wzrostu fibroblastów. Przyczyna były mikroskopijne twory, które przechodziły przez filtry mikrobiologiczne i można je 

było obserwować przy użyciu mikroskopu elektronowego. Były to nanobakterie o wielkości 20 – 200 nm wykazujące możliwość samodzielnego wzrostu ( rozmnażanie przez podział )  na pożywkach do hodowli komórkowych. 

Mimo niewielkich rozmiarów nie były to wirusy, których rozwój jest uzależniony od komórki gospodarza. Wykryto w nich obecność kwasów nukleinowych, poliamin, 30 rodzajów białek ( a zatem są to organizmy żywe ), co zostało potwierdzone analizą ich DNA

Inne cechy charakterystyczne nanobakterii ( Nanobacterium sanguineum ) z surowicy i krwi:

Bardzo powolny wzrost i metabolizm

Czas generacji w warunkach optymalnych wynosi 3 –6 dni

Zdolność do tworzenia wokół komórki wapiennej otoczki, która pełni funkcję ochronną i scala w strukturę odpowiadającą kolonii bakteryjnej

W warunkach hodowli komórkowych zwapnienia te staja się ośrodkiem krystalizacji dla apatytów ( fosforanów wapnia ) – ta cecha nanobakterii doprowadziła naukowców do kamieni nerkowych, we wnetrzu których znajdują się apatyty

Przeprowadzone w Finlandii badania usuniętych kamieni nerkowych wykazały, że 90% z nich zawierało nanobakterie

Nanobakterie jako potencjalne patogeny:

Czynnik stymulujący krystalizację kamieni nerkowych

Arterioskleroza ( miażdżyca ) – wyizolaowano Nanobacterium sanguineum  blaszek miażdżycowych

Nanobakterie wykryto również w stosowanych od wielu lat w szczepionkach przeciwko wirusowi polio ( niewykluczone, że może mieć to związek ze wzrastająca zachorowalnością na miażdżycę )

Kamień nazębny ( paradontoza)

Katarakta

Choroba Alzheimera

Autyzm

Niektóre cechy nanobakterii charakterystyczne dla organizmów 

Obecność kwasów nukleinowych

Obecność elementów zewnętrznych błon komórkowych ( poryny, kwas muraminowy, polisacharydy )

Wzrost nanobakterii może być zahamowany przez podanie niektórych antybiotyków ( tetracykliny, antybiotyki aminoglikozydowe )

Noanobakterie można oznaczyć przez podanie im radiaktywnie wyznakowanych związków wykorzystywanych w ich metabolozmie

Zabicie nanobakterii dużą dawką promieniowania gamma całkowicie zahamowuje powstawanie mikroinkluzji i mineralizację pożywki hodowlanej

background image

 

 

Nanobakterie – fikcja, czy rzeczywistość ?

Nanobakterie – fikcja, czy rzeczywistość ?

Komórki  nanobakterii  poniżej  50  nm  wydawały  się  zbyt  małe  aby 
pomieścić całość kwasów nukleinowych i rybosomów, aby zapewnić 
jej niezależne życie (jednak obserwowano przypadki występowania 
w  przyrodzie  ultramikroskopijnych  bakterii  mających  rozmiary 
poniżej 200 nm jak też przypadki gdy zwykłe bakterie  w warunkach 
stresowych  same  znacznie  redukowały  swe  rozmiary  do  wielkości 
zbliżonych do nanobakterii)

1999  australijscy  geolodzy  z  University  of  Queensland

,  badający 

mineralne  próbki  z  dna  oceanicznego  zaobserwowali  wolno  żyjące 
nanobakterie, które potrafiły się rozmnażać. Odkrywca nanobakterii 
prof.  Folk  sądzi,  że  organizmy  te  są  bardzo  rozpowszechnione  na 
ziemi,  a  jako  bakterie  chemolitotroficzne  są  odpowiedzialne  za 
rdzewienie  metali  i  biomineralizację  (dzięki  swym  niewielkim 
rozmiarom  skutecznie  wymykały  się  metodom  badawczym 
stosowanym 

przez 

mikrobiologów 

dla 

„konwencjonalnych„ bakterii). 

Nanobakterie  wytwarzają  mineralne  otoczki  chroniące  je  przed 
ekstremalnymi warunkami środowiska). 

background image

 

 

Nanobakterie – fikcja, czy rzeczywistość ?

Nanobakterie – fikcja, czy rzeczywistość ?

Obecnie  trwają  badania  nad  wyizoloawniem  DNA  z 
litotroficznych  nanobakterii  co  umożliwi  ich  klasyfikację  i 
ustalenie względnego podobieństwa do innych znanych form 
mikroorganizmów 

(1998 

– 

na 

podstawie 

sekwencji 

kodujących 16S rRNA zaliczane są do Eubacteria) ,

Nanobakterie 

stanowią 

również 

zainteresowanie 

astrobiologów    z  NASA,  którzy  badając  powierzchnie 
meteorytów 

(w 

tym 

marsjańskiego 

ALH84001), 

zaobserwowali  na  nich  mikroskopijne  twory  podobne  do 
spotykanych na powierzchni ziemskich skał.

background image

 

 

Nanobakterie – fikcja, czy rzeczywistość ?

Nanobakterie – fikcja, czy rzeczywistość ?

1988  fińscy  naukowcy  z  Uniwersytetu  w  Kuopio

  odkryli  w 

surowicy  bydlecej  (stosowanej  w  hodowlach  komórkowych  ) 
obecność nieznanego czynnika, który powodował zahamowanie 
wzrostu  fibroblastów.  Przyczyna  były  mikroskopijne  twory, 
które przechodziły przez filtry mikrobiologiczne i można je było 
obserwować  przy  użyciu  mikroskopu  elektronowego.  Były  to 
nanobakterie  o  wielkości  20  –  200  nm  wykazujące  możliwość 
samodzielnego  wzrostu  (rozmnażanie  przez  podział)    na 
pożywkach do hodowli komórkowych. 

Mimo niewielkich rozmiarów nie były to wirusy, których rozwój 
jest  uzależniony  od  komórki  gospodarza.  Wykryto  w  nich 
obecność  kwasów  nukleinowych,  poliamin,  30  rodzajów  białek 
(a  zatem  są  to  organizmy  żywe),  co  zostało  potwierdzone 
analizą ich DNA.

background image

 

 

Inne cechy charakterystyczne nanobakterii 

Inne cechy charakterystyczne nanobakterii 

(Nanobacterium sanguineum

(Nanobacterium sanguineum

) z surowicy i krwi:

) z surowicy i krwi:

Bardzo powolny wzrost i metabolizm,

Czas generacji w warunkach optymalnych wynosi 4–10 dni,

Zdolność  do  tworzenia  wokół  komórki  wapiennej  otoczki, 
która  pełni  funkcję  ochronną  i  scala  w  strukturę 
odpowiadającą kolonii bakteryjnej,

W warunkach hodowli komórkowych zwapnienia te staja się 
ośrodkiem krystalizacji dla apatytów (fosforanów wapnia) – 
ta cecha nanobakterii doprowadziła naukowców do kamieni 
nerkowych, we wnętrzu których znajdują się apatyty,

Przeprowadzone  w  Finlandii  badania  usuniętych  kamieni 
nerkowych 

wykazały, 

że 

90% 

nich 

zawierało 

nanobakterie.

background image

 

 

Nanobakterie jako potencjalne patogeny:

Nanobakterie jako potencjalne patogeny:

Czynnik stymulujący krystalizację kamieni nerkowych,

Arterioskleroza (miażdżyca) – wyizolaowano 

Nanobacterium 

sanguineum

  z blaszek miażdżycowych,

Nanobakterie wykryto również w stosowanych od wielu lat 
w  szczepionkach  przeciwko  wirusowi  polio  (niewykluczone, 
że  może  mieć  to  związek  ze  wzrastająca  zachorowalnością 
na miażdżycę),

Kamień nazębny (paradontoza),

Katarakta,

Choroba Alzheimera,

Autyzm.

background image

 

 

Niektóre cechy nanobakterii charakterystyczne dla 

Niektóre cechy nanobakterii charakterystyczne dla 

organizmów żywych

organizmów żywych

Budowa komórkowa typowa dla prokariotów,

Obecność kwasów nukleinowych (DNA i RNA),

Obecność 

elementów 

zewnętrznych 

błon 

komórkowych 
(poryny, kwas muraminowy, polisacharydy),

Wzrost  nanobakterii  może  być  zahamowany  przez 
podanie  niektórych  antybiotyków  (tetracykliny, 
antybiotyki aminoglikozydowe),

Zabicie  nanobakterii  dużą  dawką  promieniowania 
gamma 

całkowicie 

hamuje 

powstawanie 

mikroinkluzji i mineralizacji pożywek hodowlanych.

background image

 

 

Drobnoustroje – kosmonauci na gapę

Drobnoustroje – kosmonauci na gapę

Nie 

Amstrong

  nie  był  pierwszym  przybyszem  z  Ziemi, 

który  wylądował  na  Księżycu  –  pierwszym  żywym 
organizmem były paciorkowce 

Streptococcus mitis,

Streptococcus  mitis

  –  przez  31  miesięcy  przebywały 

zamknięte 

wewnątrz 

kamery 

pojazdu 

Suvoyer-3; 

wytrzymały  pobyt  w  próżni  przy  amplitudach  temperatur 
250˚C; w tych ekstremalnych warunkach bakterie zapadły 
w  stan  anabiozy  –  uśpienia;  powróciły  na  Ziemię  wraz  z 
aparaturą przywiezioną przez załogę Apollo 12,

Drobnoustroje  mogą  stanowić  zagrożenie  dla  misji 
kosmicznych  –  analiza  mikrobiologiczna  wody,  powietrza, 
aparatury 

powierzchni 

wewnętrzenej 

pojazdu 

kosmiczego  wykazała  obecność  108  gat.  bakterii 

(Bacillus, 

Staphylococcus, 

Corynebacterium, 

Flavobacterium)

  i  126  gat.  grzybów 

(Penicillium, 

Aspergillus, Cladosporium). 


Document Outline