1. Gdzie w cyklu kw. cytrynowego bierze udział kw. liponowy+schemat.
W 2-gim etapie powstawania acetylo-CoA z pirogronianu.
Grupa hydroksyetylowa przyłączona do TPP jest utleniana do grupy acetylowej i jednocześnie przenoszona
na lipoamid (pochodną kwasu liponowego)
Utleniaczem w tej reakcji jest wiązanie disiarczkowe lipoamidu, który ulega redukcji do formy
dihydrosulfidowej. W wyniku tej reakcji tworzy się acetylolipoamid.
2. Narysuj schemat przemieszczenia elektronów i transport protonów przez Q-oksyreduktazę cytochromu
c (kompleks III). Pogaj ogólne równanie katalizowanej reakcji.
4 cyt c
zred
+ 8H
+
matrix
+ O
2
-----> 4 cyt c
utl
+2 H
2
O + 4H
+
cytosol
1. QH
2
(ubichinol) wiąże się do miejsca Q
0
(przenosi po jednym elektronie)
pierwszy: przechodzi do centrum Fe-S Rieskiego
cytochromu c
1
cytochromu c (zredukowany odłącza się do enzymu)
drugi: przechodzi do cytochromu b
L
cytochromu b
H
ubichinonu (Q) związanego w miejscu Q
i
(to cząsteczka ulega redukcji do Q
.-
(anionu
semichinowego)
2. Druga cząsteczka QH
2
wiąże się do miejsca Q
0
(działa w ten sam sposób jak pierwsza)
3. Rodnik Q
.-
przyjmuje 2 protony (2 H
+
) ze strony matrix (przyczynia się to do tworzenia gradientu
protonowego)
4 Usunięcie 2 protonów z matriź – tworzy się gradient protonowy.
3. Wymień etapy działania dehydrogenazy aldehydu 3-fosfoglicerynianowego.
Proces 1 – utlenianie aldehydu z udziałem NAD
+
do kwasu karboksylowego
Proces 2 – połączenie kwasu karboksylowego i ortofosforanu z utworzeniem acylofosforanu
Etap I –reakcja aldehydu 3-fosfoglicerowego z grupą sulfhydrylową Cys149 enzymu z utworzeniem
hemitioacetalu
Etap II –przeniesienie jonu hydroniowego na NAD
+
(związanego z enzymem)
His176 deprotonuje hemiacetal
produkty: NADH i intermediat tioestrowy
Etap III –ortofosforan atakuje tioester z utworzeniem 1,3 bisfosfoglicerynianu.
Korzystna termodynamicznie reakcja utleniania i niekorzystna termodynamicznie fosforylacja są sprzężone
przez intermediat tioestrowy, który magazynuje większość energii powstałej podczas utleniania.
4. Przedstaw reakcję katalizowaną przez fosfofruktokinazę.
3-cia reakcja glikolizy (2-ga fosforylacja)
5. W jakich reakcjach powstaje ATP jako produkt glikolizy
1 Powstawanie 3-fosfoglicerynianu z 1,3-bisfosfoglicerynianu na drodze fosforylacji substratowej
(7-ma
reakcja) (kinaza fosfoglicerynianowa)
2 Defosforylacja fosfoenolopirogronianu do pirogronianu
(ostatnia-10-ta reakcja) (kinaza pirogronianowa)
6. Jakie aminokwasy pracują w centrum aktywnym TIM (izomerazy triozofosforanowej).
His 95
Glu 165
(TIM kat izomeryzację DHAP do GAP)
7. Narysuj schemat ogólny cyklu kwasu cytrynowego.
8. Mechanizm działania heksokinazy. Co jest niezbędne aby wystąpiło działanie kataboliczne.
Katalizuje reakcję fosforylacji glukozy – przeniesienie grupy fosforanowej z ATP na grupę hydroksylową c-6
glukozy.
Mechanizm indukowanego dopasowania:
Składa się z dwóch części, które zbliżają się do siebie podczas wiązania glukozy. Szczelina między nimi
zamyka się, a związaną glukozę, z wyjątkiem jej grupy -OH przy węglu C-6 otacza białko.
Środowisko wokół glukozy staje się bardziej niepolarne i łatwiej przyłączyć fosforan
Do aktywności enzymu konieczna jest obecność jonów Mg
2+
, który tworzy kompleks z ATP.
9. W którym miejscu szlaku oksydacyjnej fosforylacji mogą powstawać reaktywne formy tlenu i w jaki
sposób komórka się przed nimi zabezpiecza.
Transport przez oksydazę cytochromu c
Reaktywne formy tlenu: H
2
O
2
,OH
Ochrona prze ROS:
-dysmutaza ponadtlenkowa: 2O
2
-
+ 2H
+
-> O
2
+ 2 H
2
O
2
(enzym usuwa rodniki ponadtlenkowe kat
przekształcenie dwóch rodników w nadtlenek
wodoru i wodę)
-katalaza: H
2
O
2
->O
2
+ 2 H
2
O (rozkłada nadtlenek wodoru po dysmutazie i innych procesach)
-antyoksydacyjne witaminy E i C (przeciwutleniacze)
10. Wymień podjednostki struktury jednostki F1 syntazy ATP. Podaj role podjednostki γ.
F1- jednostka katalityczna (w matrix mitochondrialnej)
pięć polipeptydów α
3
, β
3
, γ, δ, ε
α, β
tworzą główkę leżąc naprzemiennie w 6-członowy pierścień
γ, ε tworzą człon
F0- jednostka transportująca protony (w błonie wewnętrznej
mitochondrialnej)
10-14 podjednostek c tworzy pierścień
1 podjenostka a
POŁĄCZENIE
trzon γε
kolumna z podjednostki a, dwóch podjednostek b, podjednostki δ
Jednostki β nie są równocenne (trzy konformacje: T,L,O). Wzajemne przechodzenie form w siebie jest
napędzane przez rotację jednostki γ. Można syntetyzować ATP napędzając obrót podjednostki γ we
właściwym kierunku.
11. Przedstaw etapy fotosyntezy w postaci schematu Z.
11. Jak nazywa się główny barwnik fotosyntezy? Jaka jest rola barwników pomocniczych. (2 przykłady i
właściwości)
Główny barwnik: chlorofil a
Barwniki pomocnicze: chlorofil b, karotenoidy
- absorbują światło w szerszym zakresie
- przenoszą energię fotonów do centrum reakcji
13. Która z reakcji jest katalizowana przez aldolazę:
a. Izomeryzacja DHAP do GAP
b. Ligacja DHAP i GAP
c. Odwracalne rozpszczpienie frukto-1,6-bifosforanu do DHAP i GAP
d. Rozszczepienie DHAP do GAP
e. Nieodwracalna kondensacja aldolowa DHAP i GAPKtóra reakcja jest katalizowana przez aldolazę?
14. Metabolit potrzebny, aby przekształcić 3-fosfogliceryniam do 2 fosfoglicerynianu:
a. 1-fosfoglicerynian
b. diacyloglicerol
c. NADH
d. 2,3-bifosfoglicerynian
e. 1,3-bifosfoglicerynian
15. Mechanizm katalizy z udziałem syntazy cytrynowej polega na:
a. Zbliżeniu substratów, odpowiedniej ich orientacji i polaryzacji wybranych wiązań chemicznych
b. Utworzeniu 3 wysokoenergetycznych wiązań estrowych
c. Zbliżeniu substratów, odpowiedniej ich orientacji i utworzeniu nietypowego stanu przejściowego
d. Wszystkie
e. Żadne
16. Jakie zadanie ma fosforylacja glukozy w cytozolu:
a. Zatrzymanie glukozy w komórce
b. Destabilizacja glukozy i ułatwienie następnych etapów metabolizmu
c. Przekształcenie glukozy w bardziej rozpuszczalną
d. Wszystkie
e. A i B
17. W której reakcji cyklu kwasu cytrynowego tworzy się bezpośrednio GTP:
a. Przekształcenie bursztynylo-CoA do bursztynianu
b. Dekarboksylacja α-ketoglutaranu
c. Przekształceniu izocytrynianu do α-ketoglutaranu
d. Wszystkie
e. Żadna
18. Co to znaczy ze mitochondriom jest semiautonomiczne.
-zawierają swój własny DNA kodujący różne białka i RNA (13 białek łańcucha oddechowego; rybosomy
RNA małej i dużej podjednostki; tRNA niezbędny do translacji)
