Zajęcia dokształcające z języka angielskiego w chemii nr. 12
Zajęcia będą dotyczyły przyswojenia terminów z języka angielskiego w obszarze chemii strukturalnej tzn. symetrii
molekuł, geometrii i siły oddziaływań, stereochemii oraz wykorzystania krystalografii oraz metod obliczeniowych do
ustalania struktur związków chemicznych, szczególnie tych o skomplikowanej strukturze.
Proponowane teksty do tłumaczenia:
„The hydrogen bonds in solid state” T. Steiner, Angew. Chem. Int. Ed. 2002, 41, 48-76.
„Polyether antibiotic CP44,161” Acta Cryst. 2001, C57, 95-96 (P. Allen et al.)
“Conformational analysis of gossypol and its derivatives by molecular mechanics”J. Mol. Struct.
TEOCHEM, 2005, 730, 51-58 (Beisel et al.)
“Synthesis and Crystallographic Analysis of 5-Se-Thymidine DNAs” Organic Letters 2009,
11, 2503-2506 (A.A.E. Hassan et al.)
Tłumaczenie wybranych fragmentów tekstu publikacji „The hydrogen bonds in solid state” T. Steiner, Angew.
Chem. Int. Ed. 2002, 41, 48-76.
GLOSSARY:
hydrogen bond
– wiązanie wodorowe
intermolecular interaction –
oddziaływanie międzycząsteczkowe
molecular conformation
– konformacja cząsteczki
molecular aggregation
– agregacja cząsteczkowa
phenomenon
– zjawisko
condensed phase
– faza skondensowana
dissociation energy
– energia dysocjacji
order of magnitude
– rząd wielkości
electrostatic, covalent and dispersion contributions
– wkłady elektrostatyczny, kowalencyjny i dyspersyjny
transition region
– zakres przejścia
van dre Waals interactions
– oddziaływania van der Waalsa
ionic interaction
– oddziaływanie jonowe
cation-π interaction
– oddziaływanie kation - chmura elektronów pi
proton transfer reactions
– reakcje z przeniesieniem protonu
impotrance
– ważność
biological chemistry
– chemia biologiczna
mineralogy
– mineraologia
materials science
– nauki o materiałach
supramolecular chemistry
– chemia supramolecularna
biochemistry
– biochemia
molecular medicine
– medycyna molekularna
pharmacy
– farmacja
inorganic chemistry
–chemia nieorganiczna
organic chemistry
– chemia organiczna
hydrogen-bond research
– badania wiązań wodorowych
outdated
- przestarzały
difference
– różnica
electronegativity
– elektroujemność
polar
– polarny
partial atomic charges
– łądunki cząstkowe atomów
to orient
– zorientować
local dipoles
– lokalne dipole
negative partial charges
– ujemne ładunki cząstkowe
electron lone pairs
– wolne pary elektronowe
filled orbital
– wypełniony orbital
water dimer
– dimery wody
geometrical parameters
– parametry geometryczne
distance
– odległość
angle
– kąt
shortened
– skrócony
overlap of electron orbitals
– nakładanie się orbitali elektronowych
van der Waals radii
– promienie van der Waalsa
three center four electron bond
– wiązanie trójcentrowe czteroelektronowe
charge transfer
– przeniesienie ładunku
electrostatic interaction
– oddziaływanie elektrostatyczne
bond length
– długość wiązania
structural chemistry
– chemia strukturalna
resemble
– przypominać
covalent bond
– wiązanie kowalencyjne
reverse polarity
– odwrotna polarność
metal hydrides
– wodorki metali
parallel hydrogen bond
- równoległe wiązania wodorowe
molecular recognition
– rozpoznanie molekularne
crystalline architecture
- krystaliczna architektura
crystal engineering
– inżynieria kryształów
net charge
– ładunek formalny
crystalline compounds
– związki w postaci krystalicznej
involved
– zaangażowany
electron-deficient center
– centrum z deficytem elektronów
acid/base properties
– właściwości kwasowo/zasadowe
crystal structure
– struktura krystalograficzna
symmetric hydrogen bonds
– symetryczne wiązania wodorowe
proton donor
– donor protonu
proton acceptor
– akceptor protonu
linear angle
– liniowy kąt
red-shift
– przesunięcie (pasma) w kierunku niższych częstości
bond critical point
– krytyczny punkt wiązania
discrepancy
– rozbieżność
bifurcated hydrogen bond
– wiązanie wodorowe rozwidlone
hydrogen bridge
– mostek wodorowy
attractive force
– siła przyciągania
repulsive force
– siła odpychania
attractive interaction = bonding interaction
hydrogen bond potential
– potencjał wiązania wodorowego
constituent interactions
– składowe oddziaływania
repulsion
– odpychanie
antibonding orbital
– orbital antywiążący
computational chemistry
– chemia obliczeniowa (teoretyczna)
high level of theory
– wysoki poziom teorii
logarithmic scale
– skala logarytmiczna
bond energy
– energia wiązania
computed
– policzony
optimal geometry
– optymalna geometria
network
- sieć
Tłumaczenie publikacji z Acta Crystallographica Section C, P Allen et al. Acta Cryst. 2001, C57, 95-96
GLOSSARY:
crystal structure
– struktura krystalograficzna
antibiotic
– antybiotyk
monohydrate
– monohydrat
adopt
- przyjmować
cyclic conformation
– cykliczna konformacja
centrally located water molecule
– centralnie umiejscowiona cząsteczka wody
stability of conformation
– stabilność konformacji
hydrogen-bonding interactions
– oddziaływania typu wiązań wodorowych
ionophore
– jonofor
biological membranes
– biologiczne membrany
backbone of the molecule
– szkielet cząsteczki
lipophylic
– lipofilowy
isolated
– izolowany
moiety
– część cząsteczki o specyficznych właściwościach chemicznych
bis-spiroacetal ring system
– układ dwóch pierścieni spiroacetalowych
anticoccidial activity
– aktywność przeciwko kokcydiom
to estabilish the stereochemistry
– aby ustalić stereochemię
synthetic intermediates
– syntetyczne produkty pośrednie
unequivocally
– jednoznacznie
participate
– brać udział
oligomeric hydrogen bond network
– oligomeryczna sieć wiązań wodorowych
weak interaction
– słabe oddziaływanie
neighbouring molecule
– sąsiednia cząsteczka
recrystallized
- rekrystalizowany
crystal data
– dane krystalograficzne
cell parameters
– parametry komórki elementarnej
reflections
– refleksy
radiation
- promieniowanie
independent reflections
– niezależne refleksy
hydrogen-bonding geometry
– geometria wiązań wodorowych
symmetry code
– kod symetrii
diffractometer
– dyfraktometr
Tłumaczenie fragmentów pracy z J. Mol. Struct. TEOCHEM, 2005, 730, 51-58 (Beisel et al.)
GLOSSARY:
molecular simulations
– symulacje, modelowanie molekularne
default parameters
– parametry domyślne
directed outward
– skierowane na zewnątrz
center of the molecule
- środek cząsteczki
DFT /Density Functional Theory/ calculations
– obliczenia metodą opartą na teorii funkcjonału gęstości
crystal forms
– formy krystaliczne
minimal energy structures
– struktury o minimalnej energii
enantiomer
– enancjomer
axis
- oś
minimal-energy state
– stan o najniższej energii
forced
– wymuszony
invert
- odwracać
clash –
kolidować, nakładać się na siebie
substituent
- podstawnik
planarity
- planarność
strain
– naprężać, napinać
energy barier
– bariera energetyczna
out-of-plane
– poza płaszczyzną
angle
– kąt
the extent of puckering of each inner naphthalene ring
– rozmiar wykrzywienia każdego z pierścieni
naftalenowych
the average deviation of atoms
– średnie wychylenie atomów
dihedral angle
– kąt dwuścienny
torsional angles
– kąty torsyjne
symmetrical nature
– symetryczna natura
perpendicular to each other
– wzajemnie prostopadłe
best fit naphthalene planes
– najlepsze płaszczyzny pierścieni naftalenowych
rotate
– rotować
conformation
- konformacja
opposing forces
– przeciwstawne siły
conjugation
– sprzężenie
tautomer
– tautomer
distortion
– odkształcenie
quinoid ring
– chinoidowy pierścień
principal tautomer in solution
– główny tautomer w roztworze
Tłumaczenie publikacji z pracy „Organic Letters” 2009, 11, 2503-2506 (A.A.E. Hassan et al.)
Glossary:
backbone –
szkielet
atomic probe
– sonda atomowa
selenium
– selen
electrophilic addition
– addycja elektrofilowa
biophysical
– biofizyczne
structural investigations
– badania strukturalne
crystallographic analysis
– analiza krystalograficzna
phosphate group
– grupa fosforanowa
hydrogen-bond formation
– tworzenie wiązań wodorowych
hydrogen bond in proteins
– wiązania wodorowe w białkach
uracil
– uracyl
guest-host system
– układ gość-gospodarz
nonconventional reactions
– niekonwencjonalne reakcje
molecular recognition
– rozpoznanie molekularne
negatively charged
– ujemnie naładowany
excellent electron donor
– doskonały donor elektronów
phosphorylation
– fosforylacja
cellular regulation mechanism
– komórkowy mechanizm regulacji
DNA duplex
- dwuniciowe DNA
thymidyne
– tymidyna
rotational flexibility
– dowolność obrotu
proximity
– bliskość
electron density
– gęstość elektronowa
steric-hindrance
– zawada steryczna
major groove
– duża bruzda (w DNA)
chemical incorporation into DNA
– włączenie do struktury DNA na drodze reakcji chemicznej
oligonucleotides
– oligonukleotydy
pyrimidines
– pirymidyny
intermediate
– produkt pośredni
Lewis acid
– kwas Lewisa
deprotection
– odblokowanie
quantitative yield
– ilościowa wydajność
nucleobase
– zasada kwasu nukleinowego
coupling reaction
– reakcja sprzężenia
tritylation
– tritylowanie
HPLC /High Performance Liquid Chromatography/
- wysokosprawna chromatografia cieczowa
MALDI-TOF MS
/
M
atrix
A
ssisted
L
aser
D
esorption
I
onisation-
T
ime
O
f
F
light
M
ass
S
pectrometry/- spektrometria
masowa z jonizacją opartą na desorpcji laserowej z udziałem matrycy z analizatorem czasu przelotu
melting temperature
– temperatura topnienia
structure perturbation
– zaburzenie struktury
superimposition
– nałożenie
entropy
– entropia
single strand of DNA
– pojedyncza nić DNA
design
– projektować
new insight
– nowy wgląd
