background image

 
 
 

 

PODSTAWY BIOTECHNOLOGII 

(WYKŁADY prof. dr hab. inŜ. W. Grajek) 

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

background image

 

Metody unieszkodliwiania odpadów: 

-

 

chemiczne; 

-

 

biologiczne – prowadzą do zniszczenia, mikroorganizmy rozkładają wszystko do H

2

O i CO

2

). 

 
BIOKATALIZATORY 

-

 

mikroby (mikroorganizmy) – bakterie, grzyby 

 

róŜny metabolizm; 

-

 

technologie związane z roślinami (technologia trzcinowa) – oczyszczalnie oparte na trzcinach; 

-

 

biokatalizatory – enzymy. 

 
Enzymy – związki, które katalizują wszystkie reakcje na Ziemi (w komórkach, roślinach) 

-

 

regulują przebieg procesów Ŝyciowych (są to białka, bez nich nie ma nic). 

 

 

Kataliza – jeśli energia aktywacji wysoka – musimy dodać energię. 
 
Katalizatorem  nazywa  się  substancję,  która  zwiększa  szybkość  reakcji  lecz  sama  nie  ulega  przemianom  – 
budowa i właściwości katalizatora po reakcji są takie same jak przed reakcją (obniŜa E

akt

). 

 
W  reakcji  mogą  wziąć  udział  tylko  te  cząsteczki,  które  zawierają  odpowiedni  zasób  energii  swobodnej,  tzn. 
znajdują się w stanie aktywnym. Substraty mogą przekształcić się w produkty wówczas, gdy energia swobodna 
stanu aktywnego jest większa od energii swobodnej produktów E

sa

 

>

 E

p

. 

W  temperaturach  występujących  w  przyrodzie  odpowiednio  wysoki  stan  aktywny  ma  niewiele  cząstek,  stąd 
większość reakcji zachodzi z małą szybkością albo wogóle nie moŜe zajść. 
Konieczne  jest  dostarczenie  określonej  ilości  energii,  aby  cząsteczki  substratu  podnieść  z  ich  podstawowego 
poziomu energetycznego na poziom odpowiadający barierze energetycznej. 
Mianem  energii  aktywacji  nazywa  się  najmniejszą  ilość  energii,  którą  trzeba  dostarczyć  jednemu  molowi 
substratu, aby stał się reaktywny. 
Dwie moŜliwości zwiększenia szybkości reakcji: 

-

 

dostarczenie dodatkowej energii, zwykle w postaci ciepła; 

-

 

obniŜenie bariery energetycznej reakcji. 

 
Katalizatory obniŜają barierę energetyczną reakcji, a tym samym energię aktywacji. 
ZaleŜność między E

akt

 a szybkością reakcji: 

 

E

akt

 

Połowiczny czas reakcji 

62,7 

125,4 

0,007 

384 

 

 

Enzymy to białka 

Białka – polimery złoŜone z aminokwasów (aminokwasów 2D – duŜo moŜliwości) 

 

Enzym – białko lub białka powiązane z innym elementem niebiałkowym (kofaktor) 

Kofaktorami mogą być niskocząsteczkowe związki organiczne lub jony nieorganiczne. Są one obecne w centrum 
aktywnym  enzymu  [ich  obecność  jest  niezbędna  do  utrzymania  aktywności  katalitycznej  centrum  aktywnego 
enzymu]. 
WyróŜnia się 3 typy kofaktorów: 

-

 

koenzymy, związki organiczne; 

-

 

grupy protetyczne, ściśle związane z białkiem; 

-

 

jony metalowe

 
HOLOENZYM = APOENZYM + KOFAKTOR 
 
Apoenzym i kofaktory współdziałają ze sobą w katalizie reakcji chemicznych. 
Ten  sam  kofaktor  (koenzym)  moŜe  wchodzić  w  skład  wielu  róŜnych  enzymów  i  moŜe  katalizować  odmienne 
reakcje  chemiczne.  MoŜe  być  jednak  tak,  Ŝe  obecność  danego  koenzymu  wiąŜe  się  tylko  z  katalizą  jednego 
rodzaju reakcji. Mówimy wówczas o swoistości enzymu

 

zwykle enzymy przekształcają tylko określone wiązania. 

Rodzaje specyficzności

-

 

specyficzność wobec jednej reakcji chemicznej; 

-

 

specyficzność wobec jednego substratu (duŜo bardziej pogłębiona) 

 

Enzymy powodują degradację wiązania (w przypadku polimerów – depolimeryzacja) 

background image

 

Szerokie spektrum aktywności jest potrzebne, bo rozłoŜy więcej polimerów. 
Wiele koenzymów to witaminy: 

-

 

tiamona – witamina B

1

 

-

 

pirydoksal – witamina B

6

 

 

Witaminy powodują syntezę enzymów. 
 
Metaloproteiny – białka zawierające jon metalu, np.: Zn

2+

, Mg

2+

, Fe

2+

, Fe

3+

, Cu

2+

, Na

+

 
Budowa białek. 
Masa cząsteczkowa moŜe wynosić od kilkuset do kilkuset tysięcy. 
RozróŜniamy: 

 

struktura pierwszorzędowa – sekwencja kolejnych aminokwasów w cząsteczce (polipeptydzie) 

peptyd – kilka aminokwasów 
polipeptyd – wiele aminokwasów. 

 

struktura drugorzędowa: 

-

 

w formie helisy 

-

 

w formie harmonicznej (nitki polipeptydów ułoŜone równolegle w harmonijkę). 

 

struktura trzeciorzędowa: 

-

 

kłębuszek (pojawia się tutaj centrum aktywne; nie mówi się o polipeptydzie, ale białku) 

Wszystkie enzymy są globulinami – kształt kulisty. 
Centrum aktywne = 3-5 aminokwasów, sztywno ułoŜone. Reszta stabilizuje połoŜenie tych aminokwasów. 

 

struktura czwartorzędowa 

-

 

kilka połączonych kłębuszków (podjednostki) 

Rola enzymu: 

-

 

aktywność  enzymatyczna  –  jest  to  zmierzona  szybkość  reakcji  (określamy  ubytek  substratów  lub 
przyrost produktów w czasie); lepiej mierzyć pojawianie się małych cząsteczek z duŜych polimerów. 

Jednostka  aktywności  –  1  j.a.  –  ilość  mikromoli  produktu  utworzonych  w  czasie  1 min  reakcji  przebiegającej 
w optymalnych warunkach. 
Jednostkę aktywności odnosimy do: 

-

 

1 g lub 

-

 

1 ml roztworu, w którym ten enzym się znajduje, np.: enzymy w proszku do prania lub w człowieku. 

„Optymalne warunki” – w jednakowych warunkach. 

 

albumina bydlęca – do określonej szybkości reakcji (jakiejkolwiek) 

-

 

w cząsteczce białka moŜe być 1 lub kilka centrów aktywnych 

-

 

bywają centra przesłonięte. 

 

inŜynieria  białkowa  –  bada  dokładną  strukturę  przestrzenną  białek,  bada  się  czy  centra  są 
przesłonięte czy nie. Odcina się nić enzymu nad centrum. 

-

 

wszystkie  enzymy  są  rozpuszczalne  w  wodzie  (woda  jest  podstawowym  medium,  w  którym  działają 
enzymy; bakterie połykają cząstki o stopniu polimeryzacji = 2 czasem 3). 

-

 

 

    





       







    

 

liczba  obrotów  –  ile  razy  enzym  moŜe  utworzyć  kompleks  i  rozpaść  się  (liczba  stała  dla  danego  enzymu;  ile 
cząstek moŜe zmodyfikować w najbardziej optymalnych warunkach). 
 

1.

 

Inhibicja – hamowanie. 

Inhibitory – hamują reakcję. 
Inhibicja enzymów – rodzaje: 

-

 

współzawodnicza  (kompetencyjna)  –  substrat  i  inhibitor  współzawodniczą  o  dostęp  do  centrum 
aktywnego.  Konieczne  jest  duŜe  podobieństwo  strukturalne  obu  cząsteczek.  Zwiększając  stęŜenie 
jednego z „rywali” moŜemy zwiększać jego szanse wiązania się z centrum. 

-

 

niewspółzawodnicza – inhibitor jest wiązany przez enzym w innym miejscu, poza centrum aktywnym. 
Dochodzi wtedy do odkształcenia cząsteczki enzymu, tak, Ŝe substrat nie moŜe się związać z aktywnym 
centrum. Zmiana stęŜenia substratu nic nie daje, gdyŜ nie zwiększa się szansa jego przyłączenia. 

-

 

hamowanie  przez  substrat  i  przez  produkt  –  niekiedy  przy  zwiększonym  stęŜeniu  substratu  nie 
następuje  zwiększenie  szybkości  reakcji,  gdyŜ  prawdopodobnie  cząsteczki  substratu  przyłączone  do 

background image

 

centrum  nakładają  się  na  siebie,  co  utrudnia  reakcję.  DuŜe  stęŜenie  produktów  faworyzuje  z  kolei 
reakcja w odwrotnym kierunku. 

2.

 

Denaturacja  białek  –  wszechobecna,  zaleŜy  od  temperatury,  powyŜej  80 

°

C  zachodzi  gwałtownie, 

zachodzi teŜ w niskich temperaturach. 

Czynniki wpływające na aktywność enzymów: 

-

 

stęŜenie  substratu  i  stopień  jego  rozpuszczalności  –  rozpuszczalność:  większe  prawdopodobieństwo 
zajścia reakcji (zetknięcie się 2 cząsteczek) 

-

 

temperatura reakcji – minimalna, optymalna, maksymalna; przyspieszenie reakcji [waŜne, by optimum 
buło  przesunięte  w  kierunku  niskich  temperatur  –  działają  tu  enzymy  z  niskimi  temperaturami  - 
psychrofile].  

Ekstremalne warunki: 

-

 

Ekstremofile – wytrzymują wysokie temperatury, np. w gejzerach, wulkanach – termofile

-

 

Halofile – lubiące sól. 

-

 

Alkalofile – w skrajnie zasadowych pH. 

-

 

Acidofile - w skrajnie kwaśnych pH. 

 

stęŜenie jonów wodorowych (pH) 

-

 

min., opt., max. 

-

 

punkt izoelektryczny – białko ma ładunek elektryczny 0 (pH 4,8-4,9 dla większości białek) 

-

 

siła jonowa roztworu (zasolenie – sole mineralne, chlorki, siarczany...) 

-

 

stała dielektryczna środowiska 

-

 

obecność inhibitorów i czynników denaturujących (metale cięŜkie) 

-

 

obecność kofaktorów i aktywatorów. 

 
Synteza enzymów 

 

ekspresja informacji genetycznej 

 

geny  kodują  białka  –  enzymy  (regulacja  naszego  metabolizmu).  W  genach  zakodowane  są 
katalizatory. 

 

geny zapisane są w kwasach nukleinowych 

I.

 

DNA ulega replikacji – podwojeniu. 

GENOM  –  całość  genów  (geny  zawarte  w  kwasach  nukleinowych  stanowią  odcinki  kwasu.  Jest  rozdzielony 
między 2 potomne komórki. MoŜe dojść do błędów – MUTACJA, mutanty). 

 

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Gen decyduje syntezą 1 białka. Informacja jest przepisana na inną cząsteczkę.  
m  RNA  –  TRANSKRYPCJA  (w  komórce).  Taka  kopia  w  formie  DNA  odrywa  się  od  jądra,  przechodzi  do 
cytoplazmy.  Tam  –  rybosomy.  Kwas  RNA  przechodzi  przez  rybosomy,  one  odczytują  informację.  Powstają 
polipeptydy. 
 

 

Geny regulujące przemianę np. laktozy: 

-

 

kaŜdy szlak metaboliczny moŜe zajść jeśli jest komplet biokatalizatorów 

-

 

biokatalizatory kodowane przez zestaw genów (dotyczą 1 przemiany metabolicznej) – OPERON (grupa 
genów kontrolnych przez wspólny system regulujący) 

-

 

część genów nie koduje białek, ale pełni role regulatorowe, są to: 

R – regulator 
P – promotor 
O – operator 
t – terminator. 

terminator – pełni rolę kropki w zdaniu, cała informacja zawarta między 1 a 2 terminatorem. 
regulator – poza kompletem genów, nie kontrolowany. 

background image

 

Tylko GENY STRUKTURALNE kodują białka (enzymy); (z, y, a). 

 

3 enzymy kodujące: 
- gen dla 

β

 - galaktozydazy 

 

z – rozbija na 2 kawałki 

 

      permeazy 

 

 

y – odpowiada za wprowadzenie cukru do komórki 

 

      transacetylazy 

 

a – modyfikuje laktozę 

 

 

laktoza = glukoza + galaktoza (wiązanie 

β

 - 1,4 – glikozydowe) 

y – permeaza – odpowiedzialna za wprowadzenie cukru do komórki 
a – modyfikuje laktozę 
z – rozbija na 2 kawałki 

 

regulator  –  znajduje  się  poza  układem  produkuje  białko  REPRESOROWE.  Represor  ma  duŜe 
powinowactwo  do  operatora,  przyłącza  się  do  niego  (blokuje  go).  UniemoŜliwia  to  przyłączenie 
polimerazy RNA do promotora. 

 

promotor  –  wiąŜe  inne  białko  (polimerazę),  które  potrafi  przepisać  te  3 geny  na  RNA.  Polimeraza 
przyczepia się do promotora. 

-

 

CAMP – cykliczny AMP adenozynomonofosforan (produkowany w komórce; magazyn energii). 

-

 

aktywuje białko CAP – przyłącza się do promotora, a do tego polimeraza się przyłącza. Ta polimeraza 
zaczyna się przesuwać do przodu; gdy dojdzie do genów strukturalnych – przepisuje informację z DNA 
na  RNA.  Jeśli  blokuje  ją  represor  informacja  nie  moŜe  być  przepisana  –  STAN  UŚPIENIA.  (30 tys. 
genów w człowieku). Wszystkie w organizmie są zablokowane przez represor. 

-

 

jeśli w środowisku jest glukoza, nie produkowane są enzymy. 

-

 

glukoza –  najłatwiej przyswajalny związek,  ulega  utlenieniu, zyskiem ze spalenia jest 36 ATP (Ŝaden 
inny nie jest potrzebny, wszystkie geny są uśpione). [tzw. REPRESJA KATABOLICZNA; pojawienie 
się glukozy blokuje syntezę AMP. Jeśli nie produkuje AMP, polimeraza nie moŜe przyłączyć do białka] 

-

 

pojawia  się  laktoza  –  ma  większe  powinowactwo  do  białka  represorowego,  niŜ  operator.  Przechwyca 
represor (staje się on nieczynny), moŜe być, (INDUKCJA – pojawienie się substratu indukuje syntezę 
enzymu; informacja, przepis, produkcja enzymu). 

-

 

gdy kończy się glukoza: CAMP aktywuje białko CAP 

 do promotora. Polimeraza przyczepia się do 

promotora, przesuwa się dalej, kopiuje informacje z genów strukturalnych w postaci RNA. 
 

(znikła glukoza, została laktoza) 

-

 

przy braku glukozy następuje synteza CAMP. 

-

 

aktywuje ono białko CAP. 

-

 

powoduje  to,  Ŝe  CAP  przyłącza  się  do  promotora.  Jest  to  warunek  sine  qua  non 
(konieczny) przyłączenia się polimerazy. 

-

 

równolegle z tym laktoza, która pojawiła się w komórce, przechwytuje białko represorowe i odciąga je 
od operatora. 

-

 

dzięki  temu  następuje  odblokowanie  polimerazy,  moŜe  się  ona  przesuwać  w  prawo  i  rozpocząć 
kopiowanie  informacji  z  DNA  na  RNA  i  umoŜliwić  syntezę  3  enzymów  w  rybosomach 
(przeznaczonych do rozkładu laktozy). 

-

 

laktoza  pełni  w  tym  przypadku  rolę  induktora  –  indukuje  syntezą  białek  przeznaczonych  do  jej 
rozkładu. Wszystkie pozostałe operony są zablokowane przez inne białka represorowe i pozostają  

w uśpieniu.  
 

Wpływ róŜnych rodzajów indukcji na syntezę enzymów. 

 

 

background image

 

np.: enzym celufaza indukowany przez celulozę, celobiozę, laktozę (laktoza ma takie same wiązania jak 

celuloza), więc: niekiedy induktorami mogą być substancje zawierające jakieś charakterystyczne wiązanie.  

Interfaza  –  induktorem:  celuloza,  monopalmitynian  sacharozy  (100  x  większa  aktywność  (cukier 

inwertowany – sztuczny miód). Łączenie z kwasami tłuszczowymi podwyŜsza aktywność enzymów. 

 

Wykorzystanie enzymów: 

-

 

detergenty (np. proszek do prania zawiera lipazy – rozkładają tłuszcze i profeazy – rozkładają białka 

-

 

starch (skrobia): maltodekstryny – po rozbiciu skrobi; syropy glukozowe i maltozowe – słodziki 

-

 

dainy (mleczarstwo) – ścinanie kazeiny (z niej sery białe, Ŝółte) 

-

 

tekstylia:  wełna  –  białko  (dlatego  nie  moŜna  prać  na  gorąco  bo  białko  denaturuje);  bawełna  –  cotton 
(czysta celuloza) 

-

 

inne (aplikacje związane z ochroną środowiska): 

 

oczyszczanie  gleby  z  ropopochoodnych 

mikrobami  produkującymi  biodetergenty, 

powierzchniowa emulgacja tych substancji ropopochodnych 

 

preparaty do szamb (mieszaniny bakterii i enzymów) 

 

zwiększanie przepustowości oczyszczalni 

-

 

alkohol: napój, silniki samochodowe 

-

 

wino i sok – do klarowania 

-

 

piwowarstwo 

-

 

piekarstwo – by cukry w mące przeprowadzić w (...) 

 

Głównymi kryteriami wyboru enzymu są: 

-

 

specyficzność substratowa enzymu – na jakie substraty działają. 

-

 

optimum pH – gdzie jest max aktywność. 

-

 

optimum temperaturowe 

T ,

szybkości reakcji do pewnego momentu. 

-

 

termostabilność. 

 
Mikroorganizmy produkujące enzymy 

-

 

SCREENING  enzymów  –  analiza  przesiewowa  (screen  –  sito;  szukanie  enzymów  o  wybitnych 
zdolnościach); np. w lesie – mikroby rozkładające skrobię. 

I. Pobieramy próbkę. 

-

 

wylewamy na płytki Petriego. 

-

 

powstają kolonie. 

-

 

z 1 komórki wyrasta 1 kolonia. 

-

 

potrafią robić duŜo amylaz. 

-

 

wprowadzamy do poŜywki skrobię (ale tam są inne składniki - dajemy coraz więcej skrobii). 

-

 

przeprowadzamy „pasaŜe”, zostaną tylko te, które rozkładają skrobię (zdolne do syntezy amylaz). 

-

 

inkubujemy je wcześniej w 50 

°

C – zostają mikroorganizmy termofilne potrafiące rozkładać skrobię. 

II. Szukamy testu (jod w KJ – płyn Lugola). 

-

 

te bakterie na płytce Petriego wkładamy do  inkubatora, powstają kolonie. 

-

 

na kaŜdą płytkę Petriego nalewamy płyn Lugola, następuje reakcja barwna. 

-

 

skrobia + płyn Lugola = niebieski (mało enzymów rozkładających skrobię. 

-

 

duŜo  enzymów  –  większa  zdolność  amylolityczna,  bo  cała  skrobia  została  rozłoŜona  i  wyŜółciła 
preparat. 

 

 

III. Hodowle mikroorganizmów w kolbach Erlenmayera. 

-

 

dodajemy skrobię, minerały. 

-

 

umieszczamy na wytrząsarce (korek z waty, napowietrza się). 

-

 

po zakończeniu hodowli robimy analizy chemiczne: 

 

ile skrobi na początku, ile na końcu. 

 

jakie cukry się pojawiły. 

 

jaka aktywność enzymów. 

IV. Identyfikacja. 

-

 

musimy się dowiedzieć, czy ten mikroorganizm nie jest patogenny (chorobotwórczy); sprawdzamy czy 
jest na liście takich mikrooraganizmów – jeśli tak – odrzucamy. 

-

 

identyfikujemy następne (vice-mistrza), jeśli tak: 

V. Podrasowujemy go; metody: 

background image

 

1

°

  mutagenizacja  –  działamy  mutagenami  (czynniki  mutacyjne),  np.:  promieniowanie  UV,  względnie  związki 

chemiczne niszczące DNA (głównie pochodne guanidyny), np. HNO

3

Dodajemy  taką  dawkę  mutagenu,  by  99,7 %  zginęło,  a  0,3 przeŜyło.  Są  to  mutanty.  Mutacje  są 
nieprzewidywalne.  Dla  nich  powtarzamy  procedurę,  sprawdzamy,  czy  powstają  gorsze  czy  lepsze.  Czasem 
100 mutacji.  Jeśli  mutant  jest  stabilny  po  roku,  moŜemy  się  cieszyć  (czasem  potrafią  się  odrodzić  po  tych 
mutacjach). 
2

°

 inŜynieria genetyczna – polega na świadomym wprowadzaniu genu z 1 mikroorganizmu do 2. Pobieramy gen 

z  mikroorganizmu  kłopotliwego,  wymagającego  (o  bardzo  dobrych  zdolnościach)  do  taniego,  łatwego 
w hodowli mikroorganizmu. MULTIPLIKUJEMY ten gen. 
 
Główne grupy enzymów. (1 + 3 najwaŜniejsze) 
 

1.

 

Oksydreduktazy np. związki aromatyczne, cykliczne. 

A (utleniacz) + B (reduktor) = A (zredukowane) + B (utlenione) 

 
2.

 

Transferazy 

Ax + B = A + Bx 

 
3.

 

Hydrolazy 

A – B + H

2

O = AH + B-OH 

 
4.

 

Liazy 

C – XY = C-X + Y 

 
5.

 

Izomerazy 

B = B 

 
6.

 

Ligazy 

A + B = AB 
 
OKSYDOREUKTAZY 
 

1.

 

Dysmutazy nadtlenkowe 

Posiadają  w  swoich  centrach,  jako  grupy  prostetyczne  aktywne  jony:  Fe,  Mn,  Ni  lub  Cu  +  Zn  (są 
meteloproteinami). Najszerzej spotykane są dysmutazy zawierające Fe lub Mn. 
 
Mn – dysmutazy: Propionibacterium sp., Thermus thermophilus. 
Fe – dysmutazy: Propionibacterium sp., Mycobacterium vaccae, E. Coli, Pseudomonas oralis. 
 
Występują  powszechnie  u  mikroorganizmów  tlenowych.  Rozkładają  anionowe  ponadtlenkowe  H

2

O

2

  do  tlenu 

cząsteczkowego i nadtlenku wodoru i w ten sposób chronią organizmy przed niszczącym działaniem rodników 
ponadtlenkowych.  
 
wolny rodnik – atomy lub cząsteczki posiadające na zewnętrznej orbicie pojedynczy elektron. 
DąŜąc  do  przyłączenia  lub  oddania  elektronu  wykazują  duŜą  aktywność  chemiczną  UTLENIAJĄC  kaŜdy 
związek,  z  którym  mają  kontakt.  Preferowanym  obiektem  „ataku”  rodników  są  związki  zawierające  podwójne 
wiązanie. U organizmów Ŝywych system ten jest zabójczy – skuteczną obronę stanowi GLUTATION. 
 
Toksyczne rodniki ponadtlenkowe tworzą się w czasie cyklu redukcji chinonu. 
 



 

!"#$%$

&'()*+,-,

.......



/0

1

"'&2%!"#$%$

redukcja 

 



 

"'&2%!"#$%$

 3

/

4,,-,

....



0

5

6

(7)#!"#$%$

 3

/

0

5

6

2%&$#

utlenianie 

 



/0

1

(7)#!"#$%$

 3

/

&'()*+,-,

....... 

 

!"#$%$

 35

/

0

6

2%&$#

utlenianie 

 

background image

 

Uwolnione rodniki ponadtlenkowe działają, jako czynniki redukujące lub utleniające i w ten sposób biorą udział 
w  rozkładzie  ligniny,  np.  przez  rozcinanie  pierścieni,  demytylację,  itp.  System  ten  rozkłada  wiele  innych 
związków  aromatycznych.  Rodnik  ponadtlenkowy  moŜe  działać  jako  czynnik  utleniający,  tworzący  wysoko 
reaktywny jon Mn

3+

O

2

-

 + Mn

2+

 + 2H

+

 

 Mn

3+

 + H

2

O

 
lub jako czynnik redukujący Ŝelazo z uwolnieniem tlenu cząsteczkowego: 
 

O

2

-

 + Fe

3+

 

 O

2

 + Fe

2+ 

 

Dalej,  2-wartościowe  jony  Ŝelaza  wchodzą  w  reakcję  z  nadtlenkiem  wodoru  i  tworzą  ekstremalnie  reaktywne 
rodniki hydroksylowe: 
 

Fe

2+

 + H

2

O

2

 

 Fe

3+ 

+ HO

 + OH

-

 (reakcja Fentona) 

 

Rodniki ponadtlenkowe mogą takŜe tworzyć rodniki hydroksylowe: 
 

O

2

-

 + H

2

O

2

 

 HO

 + OH

-

 + O

2

 (reakcja Hober-Weisa) 

 

Rodniki  ponadtlenkowe  w  połączeniu  z  duŜą  ilością  uwalnianego  tlenu  oraz  wespół  z  rodnikami 
hydroksylowymi  tworzą  system  OKSYDO-REDUKUJĄCY  rozkładający  wiele  związków  pierścieniowych. 
System ten jest jednak zabójczy dla organizmów Ŝywych, dlatego produkują one dysmutazy w celu neutralizacji 
tych rodników: 

235

/

0

 295

&'()*+,-,

....... 9

/

3

/

 3

/

 

 

Ogólnie  zostało  zaakceptowane,  iŜ  u  wszystkich  dysmutaz  jon  metalu  (M)  katalizuje  reakcję  dysmutacji 
rodników ponadtlenkowych na drodze cyklicznego mechanizmu redukcyjno-utleniającego: 
 

M

3+ 

+ O

2

-

 

 M

2+ 

+ O

M

2+ 

+ O

2

-

 + 2H

+

 

 M

3+

 

+ H

2

O

 

Usuwanie nadtlenku wodoru przeprowadza katalaza: 
 

29

/

3

/

,+,4,-,

..... 39

/

3  3

/

 

 

2.

 

Peroksydazy – to enzymy katalizujące utlenianie nadtlenkiem wodoru róŜnych substratów, w tym  

aromatycznych. W reakcji dochodzi do redukcji nadtlenków. Peroksydazy zawierają w swojej cząsteczce Fe, Mn 
lub  Se.  Najpierw  tworzony  jest  kompleks  Ŝelaza  z  wodą  a  następnie  utlenianie  donatora  wodoru  AH

2

  do 

produktu A. Donatorami wodoru mogą być łańcuchy alifatyczne: 
 

Fe

3+

 (H

2

O) + H

2

O

2

 

 Fe

3+

 (H

2

O

2

) + H

2

Fe

3+

 (H

2

O

2

) + AH

 Fe

3+

 (OH) + AH + H

2

AH + Fe

3+

 (OH) 

 Fe

3+

 (H

2

O) + A 

 
Inhibitorami  peroksydazy  są  cyjanki,  azydki,  hydroksyloamina,  NO  i  H

2

S.  Do  najbardziej  znanych  enzymów 

z tej grupy naleŜy PEROKSYDAZA GLUTATIONOWA, odkryta w 1970 r. Jest to enzym zaleŜny od Se, gdyŜ 
selen, jako jedyna grupa prostetyczna, wchodzi w skład centrum aktywnego w formie selenocysteiny. Enzym ten 
ma 4 identyczne podjednostki.  
 
PEROKSYDAZA  LIGNINOWA  (Fe)  katalizuje  wiele  reakcji  utleniania  w  alkilowym  łańcuchu  bocznym 
związków  ligninowych.  Do  utleniania  potrzebuje  nadtlenku  wodoru.  Rozrywa  wiązania  C

α

-C

β

  w  łańcuchach 

bocznych, wiązania eterowe i utlenia benzylowe grupy alkoholowe do ketonów lub aldehydów. Przy utlenianiu 
ligniny peroksydaza współdziała z alkoholem weretrylowym. 
 

3.

 

Oksydaza cytochromowa – enzym z grupy oksydaz zawierający Fe i Cu, uŜywający tlen jako akceptor  

wodoru. Stanowi ostatnie ogniwo łańcucha oddechowego. Znana jest pod nazwami „kompleks cytochrom a”  
i „cytochrom a

3

”. Występuje u wszystkich organizmów tlenowych. 

 

background image

 

4.

 

Monoksygenazy  –  katalizują  wbudowanie  jednego  atomu  cząsteczkowego  tlenu  do  substratu,  podczas 
gdy 2 jest redukowany do wody. 

5.

 

Dioksygenazy  –  katalizują  wbudowanie  2 atomów  cząsteczkowego  tlenu  (z  atmosfery)  do  substratu. 
Substratami są często katechol i kwas protokatechinowy. Przy wbudowaniu tlenu do cząsteczki zostaje 
rozerwany  pierścień  aromatyczny.  W  ten  sposób  następuje  rozerwanie  pierścieni  benzenowych, 
katecholowych i innych. 

6.

 

Lakkaza  –  jest  oksydoreduktazą.  Produkują  ją  grzyby,  szczególnie  tzw.  „białej  zgnilizny  drewna”. 
Katalizuje utlenianie takich monofenoli jak fenol, tyrozyna, naftol i krezol oraz utlenia difenole a takŜe 
kwas  indoliooctowy  i  askorbinowy.  Fenole  zawierające  dłuŜsze  łańcuchy  boczne  są  lepszymi 
substratami. Kompleksy: 

 
Enzym-Cu

2+ 

+AH

2

 

Enzym-Cu

2+

 + (AH

2

)

+

 

Enzym-Cu

2+

 + Cu

+

 + O

2

 + H

+

 

Enzym-Cu

2+

 + H

2

 
AH

2

 – substrat; 

(AH

2

)

- substrat utleniony 

 

HYDROLIZA 

1.

 

SKROBIA + polimer glukonowy. 

Dwie  funkcje:  liniowa  amyloza  (

α

-1,4-glikozydowe  wiązania)  i  rozgałęziona  amylopektyna  (

α

-1,4  i 

α

-1,6 

boczne rozgałęzienia). 
Kompleks enzymów amylolitycznych obejmuje: 

-

 

α

-amylaza – tnie na duŜe kawałki gdzie popadnie (chaotycznie) 

-

 

β

-amylaza – odcina od nieredukującego końca dwucukier (maltozę) 

-

 

glukoamylaza – odcina od końca po 1 glukozie 

-

 

pullulanaza i izoamylaza – odcinają wiązania boczne 

α

-1,6. Działają synergistycznie (1 wspomaga 2). 

Efektem jest powstanie glukozy. 

2.

 

Celuloza – równolegle ustawione łańcuchy tworzą kryształy zwane fibrylami. Obszary krystaliczne  

praktycznie nierozkładalne [atak enzymatyczny następuje tylko w obszarach amorficznych (bezpostaciowych)]. 
 
Kompleks enzymów obejmuje: 

-

 

endoglukanaza 

-

 

celobiohydraza – odcina dwucukier (celobioza), który jest rozkładany do glukozy przez CELOBIAZĘ 

-

 

egzoglukanoza – odcina po 1 glukozie. 

Celuloza jest bardzo trudna do hydrolizy. Przygotowuje się ja przez: 

-

 

moczenie w 4% NaOH lub Ca(OH)

2

 lub NH

4

OH, względnie w rozcieńczonych kwasach 

-

 

parowanie pod ciśnieniem z dodatkiem alkaliów.] 

 
Budowa komórki: 
Procariota – bez jąder: bakterie, sinice 
Eucariota – z jądrem komórkowym otoczone błoną komórkową 
 

 

Ch – chromosom, w nim cała informacja genetyczna 
P  –  plazmidy  (małe  pierścienie  zbudowane  z  DNA) 
posiadające swoją informację genetyczną 
W – wakuole 
 

 
Eucariota: 

-

 

reticulum endoplazmatyczne 

-

 

aparat Golgiego 

-

 

mitochondria 

-

 

chloroplasty 

-

 

plasmodesmy 

-

 

wakuole 

-

 

błona plazmatyczna 

-

 

ś

ciana komórkowa 

-

 

cytoplazma 

-

 

mikrokanaliki 

-

 

krople tłuszczu 

background image

 

10 

 

DNA – największe cząstki chemiczne (ogromne, długie łańcuchy) 

Budowa: 

-

 

nukleotyd: - grupa fosforanowa PO

4

 

-

 

cukier (dezoksyryboza) 

-

 

zasady purynowe (tylko zasady purynowe, róŜne) 

-

 

sekwencja nukleotydów (szkielet fosforanowo – cukrowcowy) + zasady azotowe 

 

 

 

 

Zasady azotowe: 

 

 

 

ZaleŜnie od rodzaju zasady: ATGGC 

 

A-T; C-G w parach występuje wysokie powinowactwo chemiczne 

 

Kwas nukleinowy zwykle postać 2-niciowa helisa 

 

 

Formy występowania cząsteczek DNA 

- liniowa 

 

- kolista otwarta (2 pojedyncze cząsteczkowe (oc)  

 

- kolista superkręcona (ccc)  

 

 

 

 

Przy rozdziale nici dobudowuje się 2 nitka na zasadzie komplementarności. 

 

Replikacja DNA 

-

 

białko  helikaza  przyczepia  się  do  widełek  replikacynych  –  jego  zadaniem  jest  rozplecienie  podwójnej 
helisy  (przesuwa  się  wzdłuŜ  łańcucha).  Do  mostka  dołącza  się  primaza;  syntetyczny,  krótki  odcinek 
RNA,  jako  starter.  Polimeraza  dobudowuje  do  RNA  nić  DNA  (na  prawej  nici  dobudowywane  są 
krótkie odcinki, na lewej w sposób ciągły; słuŜą, jako starter) 

-

 

primer  DNA  zostaje  usunięty  dzięki  egzonuklearnej  aktywności  polimerazy,  a  powstała  luka  zostaje 
wypełniona przy udziale aktywności polimerazycyjnej tego enzymu 

-

 

ligaza DNA odtwarza wiązanie fosfodiestrowe (2 – prawa nić jest nieciągła) 

 

 

 

 

Jakikolwiek błąd w zapisie powoduje mutację 

background image

 

11 

 

Właściwości kodu genetycznego: 

-

 

informacja genetyczna zapisana w DNA jest transkrybowana (przepisana) do m-RNA i ujawnia się 
w formie łańcucha polipeptydowego syntetyzowanego w procesie translacji (kaŜda 3 nukleotydów – 
triplet koduje inne aminokwasy; transkrypcja informacji genetycznej to synteza białka)  

       COOH-NH

2

 – wiązanie peptydowe 

-

 

kod zapisu aminokwasów ma charakter 3: 3 zasad m-RNA determinuje przyłączenie 1aminkwasu 

-

 

zasady 1 trójki nie biorą udziału w funkcjonowaniu 3 sąsiednich (niezachodzący) 

-

 

kod jest bezprzecinkowy (nie istnieją nukleotydy spełniające rolę znaku przystankowego 
oddzielającego kodony) 

-

 

znak startu (metionina i końca (3 bezsensowne)reguluje translację peptydów) 

-

 

kod jest wieloznaczny (kaŜdy aminokwas moŜe być kodowany przez pewną liczbę trójek zasad 

-

 

kod jest uniwersalny dla wszystkich organizmów Ŝywych. 

 

 

W komórkach bakterii oprócz chromosomów są PLAZMIDY 

-

 

bakterie tego samego gatunku są zróŜnicowane (jedne mają plazmid – komórki F

+

; inne nie F

-

). 

 

                  

 

komórki z czynnikiem F 

 ma on tendencję do włączania się do chromosomu: 

 kon. Hfr. 

 

 

Plazmid  pełni  funkcję  czynnika  powodującego  wymianę  genów  między  komórkami.  Zjawisko  to 
KONIUGACJA. 
3 nić zostaje rozłoŜona przez enzymy: 

-

 

jest to naturalna wymiana genów między plazmidami 

-

 

geny zawarte w plazmidach  

-

 

kodują one: 

  bakteriocyny  –  drobne  białka  produkowane  prze  bakterie  fermentacji  mlekowej.  Potrafią  się  przyłączyć  do 

innej komórki, która ginie. Jest to broń skierowana w stosunku do sąsiadów, walka o pokarm 

 antybiotyki – białka/nie-białka, działają w większym zasięgu drobnoustrojów 

 enzymy potrafiące rozłoŜyć antybiotyki (nie mają tego inne komórki i giną); oporność na antybiotyki 

 oporność na nadfiolet 

 wytwarzanie enterotoksyn 

 czynniki zjadliwości wytwarzanie hemolizyny 

 nowotwory roślin 

 restrykacja, modyfikacja 

 

Mapa genetyczna 

 
II TRANSDUKCJA 

-

 

związana z wirusami 

-

 

wirusy bakterii – bakteriofagi 

 

background image

 

12 

 

ATAK WIRUSA: 

-

 

płytka  omiata  się  do  powierzchni 
komórki  i  sprawdza  czy  jest  tam 
receptor. 

Jeśli 

płytka 

znajdzie 

receptor, mocno się przyczepia 

-

 

połączenie 

płytki 

receptorem 

powoduje 

powstanie 

centrum 

enzymatycznego.  To  centrum  działa 
na  komórkę  powodując  hydrolizę  – 
powstaje  dziura.  Cała  zawartość 
wirusa 

zostaje 

wstrzyknięta 

do 

komórki. 

Następuje 

zakaŜenie 

bakterii wirusowym DNA. Teraz: 

Jeśli  wirus  jest  agresywny  (złośliwy)  potrafi 
wykorzystać aparat enzymatyczny komórki by 
rozłoŜyć  wszystkie  polimery  w  komórce 
(białka 

– 

na 

aminokwasy). 

Następuje 

depolimeryzacja  duŜych  polimerów.  Dalej 
następuje  synteza  poszczególnych  elementów 
wirusa.  Oddzielenie  syntez.  Zaczyna  się 
namnaŜanie wirusa: 

-

 

składanie wirusów

 

-

 

do główki wprowadza DNA, ogonek, płytka, główka. Pod koniec składania wytwarzają one LIZOSOM 
– rozpuszcza ściany kom. bakterii. Z tej komórki wypływają wirusy i atakują następne komórki. 

Jeśli wirus jest łagodny

-

 

włączają się do chromosomu bakterii (DNA). MoŜe tkwić w komórkach przez setki pokoleń i nic im 
złego nie robi. Jak wystąpi czynnik STRESOWY wtedy zdarzy się coś złego, np.: 

 

nagle opadnie w wysokiej temperaturze 

 

pojawią się metale cięŜkie 

 

duŜa dawka pokarmu 

 

kancerogenny. 

Wirus z łagodnego staje się złośliwy. Nagle z tego chromosomu się wycina i na ogół robi błędy – porywa ze 
sobą kilka genów od gospodarza. Niszczy tą komórkę, namnaŜa się i atakuje inne komórki (wprow. komórki 
z innego organizmu). MoŜe tam być łagodny. 

-

 

jest 2 naturalną mat. przenoszenia genów. 

 

III TRANSFORMACJA 

-

 

jak komórka ginie, rozpuszcza się 

-

 

fragmenty DNA w środowisku mogą zostać przez komórki przyłączone. 

-

 

 

Strategia inŜynierii genetycznej 

-

 

pozyskanie genu kodującego określoną cechę (wtedy, jeśli komórki mają niedostateczną syntezę) 

-

 

gdy komórka ma niezłe geny, ale jest niekorzystna, wtedy pobiera się te geny i pakuje do innych 
komórek 

-

 

bakterie mlekowe 

-

 

włączenie tego genu do genomu korzystnego dla nas mikroorganizmu. Wymaga to przygotowania 
odpowiedniego wektora – konstrukcji (wektor = plazmid lub wirus – to, co nasz gen przeniesie do 
2 organizmu) 

-

 

wprowadzenie wektora do obcej komórki i integracja z chromosomem

Zabiegi słuŜące do oddzielania DNA od innych składników komórki: 

-

 

usuwanie białek na drodze ekstrakcji (fenol, chloroform – alkohol izoamylowy) 

-

 

usuwanie białek przy uŜyciu proteaz (np. promazy) 

-

 

usuwanie RNA przy uŜyciu  rybonukleaz 

-

 

wirowanie lizatu (po lizie) w gradiencie gęstości CsCl lub sacharozy 

-

 

wytrącenie DNA za pomocą izopropanolu i etanolu 

-

 

adsorpcja DNA na hydroksyapatycie 

 

wirówki – superwirówki 

 
 
 

background image

 

13 

 

 

Enzymy RESTRYKACYJNE (restryktazy) – potrafią przeciąć DNA 
 
Obróbka enzymatyczna DNA 

 

 

 
Endonukleaza – jak znajdzie miejsce gdzie ciąć. 
Sekwencja palindromiczna 
 

 

 

Najlepiej, by enzymy cięły w 1 miejscu. 
 
Drogi pozyskiwania genów: 

-

 

izolacja genów zw. źródeł naturalnych 

-

 

synteza biochemiczna z udziałem odwrotnej transkryptazy, wychodząc z sekwencji RNA 

 

prawdziwa rewolucja w biotechnologii 

 

retrowirusy (HIV) – bardzo dziwne, brak DNA, jest RNA.  

Jest tam białko potrafiące odtworzyć DNA na bazie RNA (ODWROTNA TRANSKRYPTAZA). 
 
 

background image

 

14 

Peptyd 

 

RNA 

 
OD 
WR 
OT 
NA 
 
TRAN 
SKRY 
PTA 
ZA 

 

DNA 

aminokwas 



nukleotyd 
nukleotyd 
nukleotyd 









aminokwas 



 

 
 

 

 

 

Wygodne to do ceny skutków manipulowania. 

 

Synteza antybiotyków: 

 

Chemiczna 

(maszyny  specjalne  do 
syntezowania  genów  – 
krótkie odcinki) 
 
 
 

 

Biochemiczna 

(z odwrotną transkryptazą; najpopularniejsza): 

-

 

rozcinamy plazmid 

-

 

+ obcy gen 

-

 

+ enzym ligaza, wkleja on do plazmidu obcy gen 
w miejscu przecięcia. 

Otrzymujemy  nowy  plazmid.  Wrzucamy  go  do  hodowli 
bakterii. Są one wraŜliwe na 2 antybiotyk (giną od tego) – 
takie  wybieramy.  Po  dodaniu  hodujemy  przez  taki  czas, 
aby pojawiły się kolejne pokolenia. Wrzucamy te komórki 
do  poŜywki  z  antybiotykiem  nr 2.  Jeśli  plazmid  uległ 
włączeniu,  komórki  przeŜyją  (te,  które  przeŜyły  musiały 
mieć  włączony  ten  plazmid).  Analizujemy  metabolity  tej 
komórki.  Jeśli  jest  metabolit,  -  wprowadziliśmy  obcy 
gen!, np. armata genetyczna. 

Izolacja genów 

(trzeba  wiedzieć,  który  gen, 
co koduje) 

 

background image

 

15 

 

Organizmy modyfikowane genetycznie (GMO – genetycznie modyfikowany organizm) 

-

 

Ŝ

ywność transgeniczna (z hodowli roślin modyfikowanych genetycznie) 

 ułatwienie rolnikom hodowli – herbicydy niszczą chwasty (odkaŜa się nimi glebę). Jeśli roślina odporna. 

 gen odporności na owady np. stonka (bakterie prod. endotoksyny niszczą jelita owadów) 

 np. pomidory 

-

 

mięknięcie owoców spowodowane rozkładem pektyn 

-

 

dochodzi do syntezy barwników. 

W pomidorze: 
-

 

zablokowano enzym powodujący rozkład pektyn 

-

 

wprowadzono geny przyspieszające syntezę barwnika czerwonego 

Inne: 

-

 

do niektórych roślin wprowadzamy białko kobiece. 

ZagroŜenia (dla nas) 

-

 

mogą  być,  bo  oprócz  zamierzonych  skutków  teŜ  inne  białka  mogą  się  tworzyć,  np.  alergeny  lub 
toksyczne 

-

 

ale: badania, analizy szczegółowe 

dla przyrody: 

-

 

tak: pyłki roślin genetycznie zmodyfikowanych mogą zapylać inne rośliny spokrewnione (POZIOMY: 
horyzontalny TRANSFER GENÓW), mogą powstać rośliny odporne na jakieś np. herbicydy. 

Jak wykryć: 

-

 

badamy czy w danej roślinie jest obcy DNA 

-

 

badamy czy w danej roślinie jest obcy RNA 

-

 

badamy czy w danej roślinie jest obce białko. 

Analiza: 

-

 

produkowane  są  sondy  wykrywające  geny,  którymi  najczęściej  się  manipuluje  (producent  musi 
powiedzieć, jakiego plazmidu uŜył. Jak nie powie, nie jesteśmy w stanie tego wykryć). 

 
HODOWLA DROBNOUSTROJÓW 

-

 

tylko procesy mikrobiologiczne niszczą zanieczyszczenia (remediacje, fitoremediacje (...)). 

 
Systematyka metod hodowli mikroorganizmów: 

-

 

wg rodzaju poŜywki hodowlanej: 

 

hodowle wgłębne (np. osad czynny) 

 

hodowle w podłoŜach stałych (substrat jest nierozpuszczalny), np. kompostowanie 

-

 

wg warunków natlenienia: 

 

hodowle tlenowe, np. osad czynny czy złoŜa biologiczne 

 

fermentacje beztlenowe biomas (fermantacja metanowa) 

-

 

wg sposobu prowadzenia procesu: 

 

hodowle okresowe (jednorazowe) 

 

okresowo-dolewowe półciągłe 

 

ciągłe (np. miejskie oczyszczalnie) 

-

 

wg rodzaju kultury mikroorganizmów: 

 

hodowle zawiesinowe, np. osad czynny 

 

hodowle z unieruchomionymi komórkami (immobilizacjowanymi), np. złoŜa biologicznymi 

Rośnie ich rola, oczyszczanie ścieków coraz częściej w zakładach. 
 

 

 

1 – faza spoczynkowa 
2 – faza logarytmiczna 
3 – faza wzrostu stacjonarnego 
4 – faza obumierania

 

Faza wzrostu utajonego 
stęŜenie komórek x = const = x 
szybkość wzrostu dx/dt = 0 
właściwa szybkość wzrostu 

µ

 = dx/dt 

 1/x = 0 

(- w powietrzu, glebie są mikroorganizmy 80 % kału to bakterie: mezofile, psychrofile, termofile). 

background image

 

16 

-

 

mikroorganizmy, gdy dostają się do poŜywienia, najpierw rozpoznają środowisko 

-

 

pronina, alkohole hydroksylowe 

-

 

zmiana  ciśnienia  osmotycznego  środowiska,  w  którym  się  znalazły  mikroorganizmy,  powoduje,  Ŝe 
syntez.  nowe  enzymy,  by  mogły  przeŜyć.  Mijają  godziny;  muszą  się  dostosować,  stąd:  szybkość 
wzrostu = 0. 

-

 

właściwa szybkość wzrostu: 
dx(g)/dt(h) 

 1/x = 1/h = h

-1 

Ile g biomasy przyrośnie w jednostce czasu w stosunku do jednostki biomasy, która była na początku, np.: 
0,15 h

-1

 – ilość biomasy przyrosła 15 % na h. 

Wzrost komórek: 

-

 

faza wzrostu logarytmicznego. 

TROFAZA 
Ilość komórek bakteryjnych i droŜdŜowych wzrasta przez proste podziały od x

p

 do x

k

x

x

 = x

p

 

 2

n

 

Szybkość  przyrostu  komórek  ma  postać  linii  prostej.  W  czasie  wzrostu  logarytmicznego  właściwa  szybkość 
wzrostu przybiera wartość max i stałą: 

µ

 = 

µ

max

 = const 

Kinetyką wzrostu kultury w przypadku braku czynników ograniczających opisuje MODEL MONODA 

µ

 = (x

µ

max

S)/(K

s

 + S) 

gdzie: 

µ

max

 – maksymalna właściwa szybkość wzrostu, cecha charakterystyczna mikrobów 

x – stęŜenie Ŝywych komórek 
S
 – stęŜenie substratu 
K

s

  –  stała  stęŜenia  substratu,  przy  którym  wzrost  mikroorganizmu  jest  równy  połowie  maksymalnej  właściwej 

szybkości wzrostu. 
Wartość K

s

 jest charakterystyczna dla danego mikroorganizmu i dla danych warunków hodowli. 

Skutki dla oczyszcz. ścieków: 

-

 

szybciej oczyszczane na początku. 

Przykładowe wartości maksymalnej właściwej szybkości wzrostu (

µ

): 

0,53 h

-1 

0,36 
0,12 
4,24 
 
Praktyczny bilans materiałowy hodowli tlenowej: 
 
 

 

beztlenowce 

Wzrost biomasy komórkowej 

40-45 % 

10 % 

Produkcja metabolitów pozakomórkowych 

10 % 

40-45 % 

Utrzymanie czynności Ŝyciowych 

45-50 % 

proces wolny 

 
W warunkach beztlenowych proporcje te są znacznie zmienione. 
 
Do biomasy dodaje się wapno. 
Jak liczyć biomasę? 
Bezpośrednie metody pomiaru biomasy: 

-

 

liczenie komórek w hemacytometrze (komora Thoma) – na szkiełku podstawowym z wyrysowanymi 5-
liniami 

-

 

liczba  komórek  tworzących  kolonie  (metoda  płytkowa)  –  płytki  Petriego.  Z  1 komórki  wyrasta 
1 kolonia (liczymy tylko Ŝywe komórki) 

-

 

cytometr przepływowy 

-

 

pomiar mokrej biomasy (osad po wirowaniu) 

-

 

pomiar suchej biomasy (po wysuszeniu). 

 
Pośrednie metody pomiaru biomasy: 

-

 

stęŜenie białka 

-

 

stęŜenie kwasów nukleinowych 

-

 

stęŜenie ergodterolu (tylko w grzybach wyst.) 

-

 

pomiar zmętnienia – nelelometria, turbinometria (

ilość b. 

 mętność) 

-

 

pomiar fluorescencji (ATP, NAD, DNA, białka (...) ; niektóre skł. komórek świecą) 

background image

 

17 

-

 

stęŜenie metabolitów pierwszorzędowych 

-

 

pobór tlenu (bakt. 

 

 

 tlen) 

-

 

produkcja CO

2

 

-

 

wydzielanie  ciepła  (przy  intensywnym  oczyszczaniu  i  wzrostu  mikr.  rośnie  temperatura  – 
r. egzotermiczna) 

-

 

zmiany w przewodności elektrycznej poŜywki (sole dysocjują na jony, przykładamy ładunek. Mikroby 
pobierają te mikroelementy, przewodność maleje) 

-

 

zmiany lepkości poŜywki 

-

 

zmiana barwy 

-

 

zmiana ciśnienia osmotycznego 

-

 

zmiana pH 

 
Czynniki hamujące poj. się, to: 

-

 

za mało: 

 

kończy się poŜywka (teŜ tlen – czynnik limitujący) 

 

brak źródła węgla, azotu 

Pojawienie się czynnika powoduje osłabienie oczyszczania. 

-

 

za duŜo: 

 

droŜdŜe wytrzymują 15-18 % stęŜ. alkoholu 

 

inne mikr. prod. toksyny. 

 

Faza stacjonarna (IDIOFAZA) 
Pojawienie się czynników ograniczających powoduje hamowanie wzrostu.  
Najczęściej występujące czynniki ograniczające: 

-

 

wyczerpanie cukru 

-

 

zuŜycie azotu lub fosforu 

-

 

brak rozpuszczonego tlenu 

Model wzrostu w warunkach wystąpienia czynnika ograniczającego: 

µ

 = 

µ

max

 

 x 

 P/(K

s

 +P) 

K

s

 – stęŜenie inhibitora (P), przy którym 

µ

 = 0,5

µ

max

 

 
Faza obumierania: 

-

 

w komórkach pojawiają się pewne substancje zapachowe w formie ziarnistości 

-

 

często komórki stają się agresywne 

 
Zjawiska fizjologiczne: 

-

 

zwolnienie podziałów komórkowych aŜ do ich zahamowania 

-

 

gromadzenie substancji zapachowych (lipidów, węglowodanów i białek) 

-

 

produkcja  metabolitów  wtórnych  (antybiotyki,  barwniki,  witaminy,  enzymy,  toksyny  komórkowe, 
związki zapachowe, lipidy). 

 
PROCES OKRESOWO – DOLEWOWY 
 

 

 
Do zbiornika wprowadza się porcję ścieku, który podlega przemianom typowym dla procesu okresowego: faza 
spoczynkowa.  W  momencie,  gdy  dochodzi  do  zwolnienia  wzrostu  komórek,  wprowadzamy  świeŜy  ściek,  co 

background image

 

18 

powoduje  spadek  stęŜenia  komórek,  ale  jednocześnie  stanowi  proces  oczyszczania  się  wydłuŜa.  W  praktyce 
proces uzupełniania (wymiany) części ścieku, moŜe być prowadzony przez długi okres. 
 
PROCES CIĄGŁY 
Warunek podstawowy: 

µ

 = D 

D – szybkość rozcieńczania (odwrotność czasu retencji), np.: 
W ciągu 1 h wymieniliśmy 15% nowej poŜywki.  

µ

 = 0,15 h

-1

 – w ciągu 1 h urodziło się 15 % nowych komórek. 

Razem  ze  zuŜytą  poŜywką  bioreaktora  wypływa  część  komórek  zawartych  z  odcieku.  Aby  moŜna  mówić 
o procesie  ciągłym  liczba  komórek,  które  zostały  wypłukane  z  poŜywką  opuszczającą  bioreaktor  musi  zostać 
zrekompensowana przez nowe komórki. 
Jeśli 

µ

 

>

 D  ilość  komórek  systematycznie  wzrasta.  Mają  większy  potencjał  oczyszczania  niŜ  jest  ścieków 

(zabraknie im jedzenia) – niewykorzystany potencjał ścieków. 

µ

 

<

 D – ilość komórek, które wypłynęły jest większa od tych, które napłynęły. Następuje wymywanie komórek. 

Ś

ciek jest nieoczyszczony. 

 
Hodowle na podłoŜach stałych: 

-

 

musi się pojawić odpowiednia ilość wody 

 

faza stała (matryca organiczna) 

 

woda 

 wymiana masy między komórką Ŝywą a otoczeniem (metabolity, pokarm (...)) 

 woda czasem wchodzi w reakcje, np. hydrolizy 

 4 struktury – 1,2,3,4 – rzędowe (3 – przestrzenna) 

 cząsteczki wody stabilizują przestrzenne uwodnienie. 

 
Woda odgrywa w komórkach zasadniczą rolę metaboliczną: 

-

 

jest rozpuszczalnikiem poŜywek 

-

 

wpływa na pH i siłę jonową poŜywki 

-

 

stabilizuje strukturę polimerów i determinuje ich aktywność 

-

 

jest  medium  transportowym  dla  enzymów  innych  substancji  chemicznych,  np.  poŜywek,  metabolitów 
komórkowych 

-

 

reguluje ciśnienie wewnątrzkomórkowe (turgor) 

-

 

wpływa na wymianę masy, w tym na aktywność kanałów jonowych 

-

 

bierze aktywny udział w reakcjach hydrolizy 

-

 

wpływa na kierunki metabolizmu 

-

 

(dostosowanie metabolizmu do zmiany aktywności wody) a

w

 

-

 

zawartość wody i ciśnienie osmotyczne – parametry wykazujące relacje między wodą i substratem (opis 
stanu wody w roztworach) 

-

 

stęŜenia:  

 

molowe 

 

normalne 

 

molalne (kg rozpuszczalnika – w nim 1 gramocząsteczka) 

 

molarne 

-

 

potencjał chemiczny, np.: zaprawa solna do śledzi – woda jest związana przez jony Na

+

 i Cl

-

 nie moŜe 

przejść tak związana przez kanały w ścianie komórkowej mikrobów. 

W  roztworach  rzeczywistych  relacje  między  rozpuszczalnymi  substancjami  a  polarnymi  cząsteczkami  wody 
zaleŜą od stęŜenia substancji rozpuszczonych i ich charakteru jonowego. Dlatego teŜ w równaniu Raoulta naleŜy 
uwzględnić współczynnik aktywności (

γ

) subst. rozpuszczonej: 

 
a

w

 = 

γ

 

 n

1

/(n

1

 +n

2

 
Aktywność wody jest miarą dostępności wody – opisuje związanie wody w układzie. 
n

1

 – ilość moli wody w 1 kg; n

1

 = 55,51 (1000/cząst. wody) 

n

2

 – dodana substancja rozpuszczalna (ile moli), np. NaCl 

γ

 - współczynnik aktywności – jak silny jest jon Na

+

 i Cl

-

Aktywność wody określa proporcje między wodą zawartą w danym systemie biologicznym a wodą dostępną dla 
reakcji biologicznych (biochemicznych) i reakcji chemicznych. 
Prawo Raoulta dla roztw. idealnych: 
 a

w

 = 

γ

 n

1

/(n

1

 + n

2

) = P/p

0

 = 

ϕ

/100 

background image

 

19 

P – pręŜność par roztworu 
p

0

 – pręŜność par rozpuszczalnika (woda) 

ϕ

 - wilgotność względna powietrza 

n

1

 – ilość moli rozpuszczalnika 

n

2

 – ilość moli substancji rozpuszczonej 

Oznacza to, Ŝe a

w

 czystej wody 1, natomiast a

w

 całkowicie wysuszonego roztworu = 0. 

Np.: 
Oblicz a

w

 roztworu po wprowadzeniu 1 mola substancji rozpuszczalnej do 1 kg wody. 

a

w

 = 55,51/(55,1 + 1) = 0,9923 (99 % stan nasycenia pary nad wodą) 

 
Wilgotność wzgl. atmosfery w stanie równowagi termodynamicznej (

ϕ

) jest liczbowo = a

w

 substancji, które 

w tej atmosferze długo przebywają 
a

w

 = 

ϕ

/100 

Wielu mikrobiologów preferuje powyŜszą zaleŜność, gdyŜ łatwo jest dokonać pomiaru a

w

 poprzez pomiar 

wilgotności wzgl. powietrza w stanie równowagi z danym substratem wzgl. bezpośredni pomiar ciśnienia 
(pręŜności) pary wodnej. 

 

-

 

stała temperatura 

-

 

2-3 tygodnie 

-

 

przechodzenie  wody  następuje 
do  czasu,  gdy  ustali  się  stan 
równowagi,  wtedy  a

w

  jest 

  do 

wilg. powietrza 

 
(...) wody jest często mierzona przez: 
POTENCJAŁ WODY (chem.) 
Istnieje matematyczna zaleŜność między potencjałem wody a aktywnością wody: 

Ψ

 = [ -RT ln qw/Vw = 2,303 RT log a

w

]/V

w

 

gdzie: 
– temp. Absolutna (

°

K) 

V

w

 – objętość molowa wody [m

3

/mol] 

Przykład obliczania potencjału wody dla roztworu molarnego (1 mol rozpuszczony w 1 l wody) w temp. 25 

°

C. 

Ψ

= [-2,303 

 8,313 (273 + 25) log 0,9823]/(0,01805 

10-3) = 2,4 MPa (24 atm.) 

a

w

 

↑ϕ

 

NIE! Związek między ciśnieniem osmotycznym a a

w

 oparty na molowym współczynniku osmotycznym. 

Relacja między a

w

 a rozmiarami kapilar ln a

w

 = -2

γ

M/rdRT 

Woda jest związana z subst. rozpuszczonymi - ograniczenie dostępu wody do komórek. 
! Wpływ aktywności wodnej podłoŜa na wzrost poszczególnych mikroorganizmów. 
 

 

A  –  monowarstwa  wody  na  wszystkich  polimerach  (całość 
materiału się nią pokryła) 
B  –  pojawia  się  woda  wolna  –  punkt,  od  którego  moŜe  zacząć 
się  Ŝycie  (medium  transportowe  umoŜliwiające  rozwój 
mikroorganizmów). 
Zaczynają  cię  reakcje  enzymatyczne,  pokarm  dla  rozwoju 
mikrobów. Pierwsze pojawiają się grzyby. Bakterie muszą mieć 
bardziej nawilŜone środowisko. 
0,61 – graniczna a

w

, poniŜej której nie ma Ŝycia (Ŝaden mikrob 

się  nie  rozwija).  Minimalny  poziom  a

w

  niezbędny  do  rozwoju 

mikroorganizmów: 

-

 

poniŜej 0,90 – bakterie raczej nie rosną 

-

 

droŜdŜe 0,85 

-

 

pleśnie 0,80 

-

 

pleśnie kserofilne 0,65 (środowisko suche) 

-

 

droŜdŜe osmofilne 0,61 (środowisko słone, brak wody) 

 

background image

 

20 

Kompostowanie 
Wykorzystanie odpadów komunalnych w Polsce.  
W  1996 r.  usunięto  46,45 m

3

  stałych  odpadów  komunalnych,  co  stanowi  55 %  masy  wytwarzanych  odpadów. 

Wykorzystanie odpadów komunalnych jest niewielkie i sprowadza się do: 

-

 

wytwarzania kompostu (218,6 tys. ton odpadów poddano kompostowaniu) 

-

 

wykorzystania do celów energetycznych gazu wysypiskowego (produkcja energii elektrycznej) 

-

 

wyselekcjonowania w systemie zbiórki i segregacji składników o charakterze surowców wtórnych: 

 

papier, makulatura 

 

opakowania szklane, stłuczka szklana 

 

metale Ŝelazne i nieŜelazne 

 

tworzywa sztuczne. 

Ś

rednio w kraju wykorzystanie składników wyselekcjonowanych z odpadów komunalnych nie przekracza 0,5 % 

ogólnej masy usuwanych odpadów. 
 
Charakterystyka odpadów komunalnych: 

-

 

odpady domowe 

-

 

odpady z obiektów uŜyteczności publicznej 

-

 

odpady z terenów zieleni 

-

 

ś

nieg i lód 

-

 

urobek ziemny 

-

 

gruz 

-

 

odpady gospodarczo-bytowe. 

 
Materiał wykorzystywany w produkcji kompostu: 

-

 

surowiec powinien zawierać odpowiednio duŜą ilość substancji organicznej, która musi być większa niŜ 
30 % i dostateczną ilość azotu, a takŜe brak związków toksycznych. 

 
Do kompostowania stosuje się: 

-

 

odpady komunalne 

Zawierające  35-50 %  składników  organicznych.  Pozostałą  część  masy  stanowią  róŜnorodne  odpady  mineralne 
i tworzywa  sztuczne.  Szacuje  się,  ze  w  odpadach  komunalnych  znajduje  się  około  1 mln  ton  suchej  masy 
organicznej, która moŜe być kompostowana. Zawiera ona średnio ok. 1,5 % azotu. 

-

 

masa roślinna z terenów zieleni miejskiej, rekreacyjnej i przemysłowej 

Zieleń  miejska  i  osiedlowa  zajmuje  ok.  65000 ha  na  terenie  całego  kraju.  Przyjmując  5 ton  rocznej  produkcji 
masy roślinnej z hektara otrzymujemy ok. 325 tys. ton surowca o zawartości ok. 1,5 % N. 

-

 

odpady z zakładów przetwórstwa rolno-spoŜywczego 

-

 

odpady z zakładów produkcji drewna i wyrobów 

-

 

osady z biologicznego oczyszczania ścieków 

Głównym  źródłem  osadów  ściekowych  są  oczyszczalnie  ścieków  miejskich.  Chemiczne  właściwości  osadów 
z tych  oczyszczalni  są  zbliŜone  do  osadów  z  miejskich  oczyszczalni  ścieków.  Do  nawoŜenia  gleb 
najkorzystniejsze są osady ze ścieków przemysłu rolno-spoŜywczego. Osad czynny – dobry, bakterie. 
 
Warunki kompostowania: 

-

 

odpowiedni skład chemiczny materiału wyjściowego 

-

 

odpowiedni stosunek węgla organicznego do azotu (C:N) – materiał wyjściowy C:N = 17-30:1  

gotowy kompost C:N = 20-30:1 

-

 

temperatura – pryzma zagrzewa się do 60-70 

°

C. Utrzymanie tej temperatury przez kilka dni gwarantuje 

pełną higienizację kompostu i zniszczenie organizmów chorobotwórczych 

-

 

wilgotność – optymalny poziom zwilgocenia masy kompostowej z 40-50% 

-

 

utrzymanie odpowiedniego pH (6,5-7,5) 

-

 

napowietrzanie 

-

 

rozdrobnienie materiału. 

 
Podstawowe operacje technologiczne: 

-

 

waŜenie i rejestracja (z archiwizacją) dowoŜonych odpadów z terenu miasta na składowisko 

-

 

hala  przyjęć  i  segregacji  odpadów.  Wyładunek  dowoŜonych  odpadów  na  platformę  przyjęć  oraz  ich 
załadunek  za  pomocą  ładowarki  kołowej  na  taśmę  linii  segregacji.  Segregacja  mechaniczna  w  sicie 
i ręczna z podziałem na strumienie: 

 

odpady mineralne o frakcji do 20 mm, kierowane na składowisko odpadów 

background image

 

21 

 

odpady o frakcji powyŜej 100 mm,  głównie odpady surowcowe i balastowe,  kierowane są na 
taśmę sortowniczą segregacji pozytywnej i negatywnej i dalej na składowisko. 

 
Zagęszczenie  na  prasie  wysegregowanych  odpadów  nieorganicznych  bale  o  wymiarach  80x100 cm  do 
składowania. 
 
Rozgraniczenie wysegregowanych odpadów organicznych. 
Mieszanie wysegregowanych odpadów organicznych z osadami ściekowymi. 

-

 

kompostowanie wysegregowanych i rozdrobnionych odpadów organicznych. 

Wysegregowane  odpady  organiczne  po  rozdrobnieniu  i  zmieszaniu  z  osadem  ściekowym  przewoŜone  są 
z oddziału  segrtegacji  za  pomocą  ładowarki  kołowej  do  miejsca  kompostowania  pod  wiatą  (ograniczenie 
parowania). Miejsce to  wyposaŜone jest  w  instalację do nawadniania i  napowietrzania (metodą rurową) pryzm 
oraz  odwodnienia  (zbierania  i  odprowadzania  odcieków).  Odpady  formowane  są  w  pryzmy  kompostowe 
o podstawie ok. 6 m, wys. 48 m i dł. 65 m. Tak uformowane odpady podlegają procesowi kompostowania przez 
okres  ok.  4-6 tyg.  Ogółem  jest  10 linii  pryzmowych,  w  tym  2 rezerwowe  na  za  i  wyładunek  kompostowni. 
Pojemność 1 linii pryzmowej odpowiada tygodniowemu przerobowi odpadów organicznych. 

 napowietrzanie, bo CO

2

 wydzielające się zatrzymuje (Ŝeby nie uciekło). 

Obróbka (uszlachetnianie) kompostu. 
Sortowanie frakcyjne kompostu na sicie bębnowym o prześwicie 22mm. Oczyszczanie mechaniczne kompostu 
na  stole  balistycznym  z  zanieczyszczeń  mineralnych  tzw.  twardych  spręŜystych  (szkło,  kamienie,  ceramika, 
metale itp.). 

-

 

oczyszczanie  kompostu  z  zanieczyszczeń  nieorganicznych  lotnych  (tworzyw  sztucznych  i  folii 
opakowaniowych)  metodą  pneumatyczną  w  cyklonie.  Odsiew  i  wydzielone  zanieczyszczenia 
w procesie  uszlachetniania  kierowane  są  na  taśmę  odpadów  nieorganicznych  przed  prasę  i  dalej  na 
kwatery składowania odpadów. 

Tymczasowe składowanie i dojrzewanie gotowego kompostu. 
Składowanie  sprasowanych  w  bele  odpadów  org.,  oraz  wysegregowanych  odp.  m.in.  drobnych  w  kwaterze 
ziemnej;  odpady  są  formowane  w  warstwy  o  wys.  2 m.  KaŜda  2 m  warstwa  odp.  przesypywana  jest  warstwą 
izolacyjną o grub.0,2 m. Stanowią ją odpady min. o frakcji do 20 mm i inne odp. mineralne oraz masy ziemne 
pozostałe z robót ziemnych przy budowie kwatery.  
 
IMMOBILIZACJA MIKROORGANNIZMÓW 

-

 

złoŜa biologiczne 

-

 

schematy osłon bakteryjnych 

-

 

 

W Gram (+): 

 

warstwa białkowa 

 

mureina 

 

fosfolipidy 

 

 

W Gram (-): 

 

białko 

 

fosfolipidy 

 

mureina 

 

fosfolipidy 

 

 

 

 fosfolipidy: 

-

 

transmembranowe białka – przez całość, słuŜą do transportu 

-

 

Gram (+) mają najbardziej złoŜoną budowę 

  alanina  wiąŜe  się  z  kwas3m  diaminopimelinowym  –  silne  wiązanie  –  wykorzystywane  w  wielu  technikach 

immobilizacji 

background image

 

22 

Metody wiązań komórek: 
 

całe komórki 

metody immobilizowania komórek „zmodyfikowanych” 

metody wiązania komórek wolnych 

wiązanie 

 

 

wiązanie 

 

paletyzacja, 

flokulacja 

(np. polielektrolity) 

dializa, filtracja, 

sedymentacja 

(bioreaktor 

membranowy) 

poprzeczne 

do 

nośnika 

Ŝ

ele 

włókna 

mikrokapsułki 

 

 

 

 

 

adsorpcja 

chelacja 

lub 

wiązania 

metalami 

kowalencyjne 

 

 

 

 

 

 

 

 

Wiązania poprzeczne. 
Metoda  wiązania  komórek  poprzez  w.  p.  dotyczy  wyłącznie  agregacji  komórek  bez  przyłączania  do  nośnika. 
Wykorzystuje się do tego celu siły chemiczne i fizyczne. 
Przy  wiązaniu  chemicznym  wykorzystane  są  wiązania  kowalencyjne  z  uŜyciem  2 i  wielofunkcyjnych 
czynników. 
Najczęściej stosowane są: 

-

 

aldehyd glutarowy 

-

 

di-izocyjanian toluenu 

-

 

di-izocyjanian toluenu + 1,6-di-aminoheksan. 

Wszystkie  są  toksyczne,  stąd  r.  immobilizacji  musi  być  dobrze  kontrolowana  i  odbywa  się  poza  układem  do 
oczyszczania  ścieków.  Komórki  wiązane  w.  poprzecznymi  wykorzystuje  się  przede  wszystkim  do  reakcji 
katalizowanych przez pojedyncze enzymy. Wiązania te są niezwykle silne – praktycznie nierozerwalne. Z uwagi 
na  toksyczny  charakter  aldehydu  glutanowego  część  komórek  ginie,  co  nie  przeszkadza  w  zachowaniu  ich 
aktywności  enzymatycznej,  (komórka  –  nośnik  enzymów),  np.  wiązanie  poprzeczne  między  grupami 
aminowymi z aldehydem glutarowym 
H

2

N – komórka – NH

2

 

 

 

 

 

 

        - CH = N – komórka – N =CH(CH

3

)

3

 

-

 

te układy stosuje się do oczyszczania ścieków 

 wiązania przez flokulację (do poprz.) 

Związki chemiczne stos. do flokulacji komórek: 

-

 

polielektrolity kationowe: 

 

poliaminy 

 

polietyleniminy 

 

poliakrylamidy 

-

 

polielektrolity anionowe: 

 

poliakrylamidy podstawione grupami karboksylowymi 

 

siarczki polistyrenowe 

 

kwasy polikarboksylowe 

-

 

związki zawierające metale Mg, Mn, Ca, Fe, Al.: 

 

tlenki 

 

wodorotlenki 

 

siarczany 

 

fosforany 

-

 

inne flokulanty: 

 

bentonit 

 

chitozan 

 

ziemia okrzemkowa 

 

garbniki 

 

azbest (zakazany) 

 

estry akrylowe 

np.: 
bentonity (do usuwania mikroorganizmów) 

-

 

do oczyszczania np. kwasu fumarowego 

 

background image

 

23 

Wiązanie do nośnika. 

-

 

wymagania stawiane nośnikom: 

 

ułatwienie adhezji komórek (by były przeciwne ładunki) 

 

rozwinięta  powierzchnia  lub  porowatość  (większa  ilość  moŜe  być  zaadsorbowana,  komórki 
w zagłębieniach) 

 

stabilność  chemiczna  (odporność  na  korozję  mikrobiologiczną;  mikroby  produkują  kwasy 
organiczne – agresywne) 

 

stabilność mikrobiologiczna 

 

odporność na siły mechaniczne (+ na nacisk) 

 

ochrona właściwości technologicznych komórek 

 

przydatność do stosowania w procesach ciągłych 

 

zapewnienie  dobrego  przepływu  cieczy  przez  warstwę  nośnika  (kolmatacja  –  zaczopowanie 
złoŜa  wskutek  przyrostu  biomasy  bakteryjnej.  Drobnoziarniste  materiały  się  podrzuca  – 
zmiana ciśnienia – złoŜe się odkorkowuje) 

 nośniki stosowane do wiązania komórek: 

-

 

nośniki organiczne (celuloza, dekstron, agaroza, Ŝelatyna, kolagen, drewno, lignity, antracyt, polimery 
organiczne typu plastików, syntetyczne wymienniki jonowe) 

-

 

nośniki nieorganiczne (szkło, szkło porowate, szkło borosilikatowe, ceramika, uwodnione tlenki metali, 
kiselgur,  korolierit,  diatomit,  Ŝwir,  silikochrom,  stal  nierdzewna,  ŜuŜel  wielkopiecowy,  piasek,  cegły, 
ziemie diatomiczne, węgiel aktywny, perlit, glina) 

  przyczepianie  się  komórek  do  powierzchni  ciał  stałych  występuje  zwykle  większa  koncentracja  pokarmu 

(adhezja biopolimerów i minerałów; ciała stałe mają ładunki, do nich przyczepia się pokarm) 

-

 

przyczepienie  do  powierzchni,  wzdłuŜ  której  przepływa  ciecz,  stanowi  alternatywę  ruchu  komórki 
w celu poszukiwania pokarmu (oszczędność energetyczna) 

-

 

ochrona komórki przed niszczącymi siłami mechanicznymi 

Sensing  quorum  –  komórki  zachowują  się  jak  1  organizm,  np.  poświęcają  1 warstwę  zewnętrzną  na  śmierć, 
chroniąc dalsze warstwy, broniąc dostępu. Komórki przyczepione są bardziej odporne od komórek wolnych. 

-

 

bliskość  innych  komórek  ułatwia  wymianę  materiału  genetycznego  (wymiana  seksualna 
i paraseksualna; mating type) 

 siły interakcji typu komórka – powierzchnia 

 

siły przytrzymujące komórki w bliskości powierzchni: elektrostatyczne i elektrodynamiczne 

 

siły  hydrodynamiczne  i  agrodynamiczne,  które  decydują  o  dyfuzji  cząstek  (komórek) 
i o szybkości osiągania stanów równowagi 

 

siły wywołane przez silne pola, jak pole elektryczne, magnetyczne, ścinanie hydrodynamiczne 
i pole grawitacyjne. 

 
Energię  interakcji  cząstek  z  powierzchnią  nazywamy  energią  (V)  potrzebną  do  zbliŜenia  cząsteczki  do 
powierzchni stałej o określony dystans (l). W wypadku adhezji wartość tej energii jest (-). 
Siły decydujące o adhezji do nośnika: 

-

 

przyciągania Van der Waalsa 

Energia przyciągania się 2 duŜych komórek poprzez siły Van der Waalsa wynosi: 
V

A

 = [A (r

1

 r

2

)]/[6 (r

1

 + r

2

)] 

 0,5 

r

1

r

2

 – promienie cząstek 

A – stała zaleŜna od zakresu częstotliwości pola elektromagnetycznego 
l – odległość między cząstkami w momencie ich duŜego zbliŜenia 
 
WNIOSEK 
W  przypadku,  gdy  komórka  zbliŜa  się  do  duŜego  ciała  –  nośnika,  to  korzystne  jest,  aby  nośnik  miał  duŜy 
promień, natomiast komórka bakterii miała promień jak najmniejszy. Preferowane są więc kształty wydłuŜone. 
Wszelkiego rodzaju wypustki, np. Rzęski, silnie faworyzują przyciąganie do ciała stałego. 
 
adhezyny – związki decydujące o adhezji, ich odpowiednikiem jest receptor. 
 

-

 

odpychania elektrostatycznego wynosi: 

 

;

<

=

>
4

@

/

@

/

ABC

@



Φ

/

D

/

B1  

"

D  BC

@

 C

/

D

/

B1  

"

DF 

 

Φ

1

Φ

2

 – potencjał powierzchniowy (zeta) obu cząstek 

background image

 

24 

k – parametr Debye’a – Huckla określa grubość warstwy jonowej wokół cząstek stałych 

ε

 – ładunek protonów 

 
Większość  baterii  posiada  (-)  ładunek  na  swej  powierzchni  i  wokół  bakterii  tworzy  się  przeciwstawnie 
naładowana warstwa jonów (+). Całkowita energia interakcji komórki z powierzchnią jest determinowana przez 
energię oddziaływań typu Van der Waalsa i energię elektrostatyczną: V

r

 = V

A

 +V

R

Energia  interakcji  Gibbsa  między  2  powierzchniami  jest  przedstawiona,  jako  funkcja  odległości.  Najsilniejsza 
adhezja  do  powierzchni  występuje,  gdy  odległość  komórki  jest  mała  i  nie  przekracza  1  nm.  Występuje  wtedy 
pierwsze  min  energetyczne.  2 obszarem  korzystnym  dla  adhezji  jest  odległość  5nm,  gdzie  występuje  2 min 
energetyczne.  Między  obu  min.  energetycznymi  występuje  zjawisko  odpychania,  związane  z  max 
energetycznym i występowaniem sił elektrostatycznych. 
 

 

 

Powierzchnia komórek nie jest gładka, lecz występują na niej nierówności i wypustki. Te zaokrąglenia mają 
mniejsze promienie krzywizn niŜ cała komórka. Przy mniejszych promieniach siły przyciągania są większe niŜ 
siły odpychania.  
W zaleŜności od stęŜenia elektrolitów w poŜywce mogą wystąpić następujące sytuacje: 

-

 

wypadkowa energia powoduje odpychanie komórek na wszystkich odległościach od powierzchni. Obie 
powierzchnie nie mogą znaleźć wzajemnego kontaktu, sytuacja taka występuje, gdy stęŜenie elektrolitu 
jest małe a komórkę otacza silna podwójna warstwa jonowa 

-

 

przy średnim stęŜeniu elektrolitu, tworzy się płytkie drugie min energetyczne przy odległości 5-15 nm 
komórki mogą się ze sobą połączyć, jednak słabo i odwracalnie 

-

 

przy duŜym stęŜeniu elektrolitów wypadkowe oddziaływanie jest silnie przyciągające na wszystkich 
odległościach. Adhezja jest silna i nieodwracalna. 

 
Mechanizm tworzenia flokulacji oraz mostkowania komórek przez polimery. 
 

Bakterie posiadające  
poza-komórkowe,  
zaadsorbowane polimery. 

 

Bakterie posiadające  
tylko małe ilości  
poza-komórkowych polimerów. 
 

Odpychania przestrzenne. 

 

Odpychanie przez podwójną 
warstwę jonową. 
 

 

Obróbka przy pomocy polimerów, 
enzymów depolimeryzujących lub 
wzrost przy głodzie węglowym. 

 

background image

 

25 

 

 

 

 
 

 

 

MECHANIZMY TWORZENIA BIOFILMU 

 

 

 

Konsekwencje adhezji mikroorganizmów w procesach biotechnologicznych 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
CHELACJA 
Do  wiązania komórek  wykorzystuje się uwodnione tlenki  metali 3 i 4  wartościowych, głównie Zr i Tl. W tym 
celu do zawiesiny komórek wprowadza się tlenek metalu, który ulega uwodnieniu i rozpuszczeniu, a po regulacji 
pH  ulega  Ŝelowaniu.  W  przypadku  Ti  Ŝelowanie  zachodzi  przy  pH  kwaśnym  (~5),  a  w  przypadku  Zr  w  pH 
neutralnym lub lekko alkalicznym.  
 

Rodzaj powierzchni  Proces/Konsekwencje 

Ś

ciany bioreaktora 

Zapychanie aparatury: 

-

 

wymienniki ciepła 

-

 

filtry, wirówki, zawory. 

Konieczność intensywnego mycia. 
Korozja biologiczna. 

Nośniki stałe 

Tworzenie filmów biologicznych na nośnikach 
w reaktorach ze złoŜem stałym i fluidalnym. 

PoŜywki 

Rozkład celulozy (SSF). 
ś

ywność fermentowana. 

Mikroorganizmy 

Flokulacja. 
Tworzenie cienkich filmów. 

Wymienniki jonowe  Separacja mikroorganizmów. 

Minerały 

BIO-kopalnie metali. 
Gleba. 

background image

 

26 

Wiązania za pomocą WIĄZAŃ KOWALENCYJNYCH: 

-

 

stosuje się reakcje silanowania powierzchni stałej a następnie wiązania komórki przy pomocy aldehydu 
glutarowego. (tri-amino-propylo-tri-etoksy-silan rozpuszcza się na gorąco w toluenie). 

 
Wiązanie nośnika metalowego z pochodną tri-alkoksy-silanu. 
 
Wiązanie: metal-O-Si- 

-

 

metoda OSADU CZYNNEGO oczyszczania ścieków 

Otrzymujemy odpad w postaci biomasy komórkowej 

 

pierwiastki  biogenne:  C,  N,  P,  (O)  –  musi  być  dostarczony  do  ścieku,  pobierany  przez 
mikroorganizmy, albo tlen w substancjach organicznych jest wykorzystywany przez mikroby. 
Jeśli napowietrzamy ściek – komórki mogą się rozmnaŜać, jeśli nie – tylko taki rozwój, na jaki 
pozwoli ilość substancji organicznej – ograniczona ilość. 

12 kg/m

3

 – limit rozpuszczania tlenu 

 

 ChZT – chemiczne zapotrzebowanie na tlen 

 

BZT

5

 – biologiczne zapotrzebowanie na tlen (katalizatorami są mikroorganizmy) 

3 róŜne parametry: 
BZT

5

 – mikroby utleniają ściek przez 5 dni 

BZT 

20

 – przez 20 dni 

BZT

Z

 – aŜ się stwierdzi, ze układ w kolejnej dobie nie pobrał ani mg. 

 

w niektórych układach nie moŜna zastosować 1 metody a moŜna 2 i odwrotnie 

 
GŁÓWNE STADIA OCZYSZCZANIA BIOLOGICZNEGO: 

-

 

uśrednianie  i  klarowanie  wód  ściekowych  przez  próbkę  mechaniczną  (zbiorniki  wyrównawcze, 
piaskowniki, osadniki; zatrzymanie duŜych ciał) 

-

 

tlenowe oczyszczanie ścieków (komory napowietrzania, regeneratory osadu czynnego, osadniki wtórne) 

-

 

doczyszczanie wód ściekowych (stawy biologiczne, stacje filtracji) 

-

 

obróbka  osadów  (uwodniony  98-99 %;  poletka  osadowe,  suszarnie,  kompostownie,  piece  itp., 
sanityzacja) 

Czynniki limitujące wprowadzanie osadu czynnego do kompostu – zawartość metali cięŜkich w osadzie. 
 
Schemat ideowy urządzeń napowietrzających. 
 

 

 
Uśredniacz  –  tu  dokonuje  się  poboru  próbek  do  analizy,  bilans  biogenów  –  jeśli  nieprawidłowy  –  korekta; 
kontrola  obciąŜenia  (jeśli  obciąŜenie  za  duŜe  to  rozcieńcza  się,  wzmacnia  ilość  biomasy  –  zawracanie, 
regeneracja  osadu  –  natlenianie;  korekta  pH  NH

4+   

i  SO

4

2-

  -  źródło  azotu  –  napowietrzanie,  moŜe  być  źródłem 

zmiany pH – zakwaszenie. Azotany NO

3

-

 będzie konsumowany, K zostaje. 

Odstojniki  pierwotne,  wtórne  –  usuwa  się  koloidy,  drobne  zawiesiny  (flotacja,  flokulacja);  zaleta  osadu  – 
sedymentuje. 
 
 
 

background image

 

27 

Komora napowietrzania  
(następują zmiany w układzie: 

-

 

wraz  z  przesuwaniem  się  osadu  w  komorze  są  tam  heterotrofy,  ale  pokarm  się  kończy  i  zostają  same 
substancje trudno przyswajalne i bakterie posiadające enzymy do ich rozkładu 

-

 

pojawiają się chemotrofy 

-

 

w ścieku pojawiają się autotrofy – energia ze słońca, węgiel z CO

2

  

 

sukcesja mikroorganizmów – jedne ustępują miejsca drugim. 
 

Te zjawiska zachodzą równolegle obok siebie. Niektóre z nich odbywają się w warunkach BEZTLENOWYCH. 
Komora napowietrzania – duŜy zbiornik – z strefą beztlenową. 
 
OSAD CZYNNY: 
70 % organizmów Ŝywych 
30 % stałych cząsteczek pochodzenia nieorganicznego. 
Zooglea – wydziela duŜo lepkich substancji. 
Pierwotniaki – jedzą słabe o martwe bakterie. 
ś

ywe  mikroorganizmy  +  nośnik  stały  =  zooglea,  tj.  populacja  mikroorganizmów  pokryta  wspólną  błoną 

ś

luzową. 

Zooglea ramigera: 

-

 

stosunek  form  kapsułkowych  błona  śluzowa  do  form  wolnych  nosi  nazwę  WSPÓŁCZYNNIKA 
ZOOGLEALNOŚCI. Powinien mieć on jak największą wartość. 

-

 

Szybkość sedymentacji jest proporcjonalna do kwadratu średnicy cząstki. 

 
Główne rodzaje pierwotniaków: 
Vorticella 

Carchesium 

Opercularia 

Orzęski posiadające wici – Mastigophora 
Orzęski rzęskowe – Ciliata 
Orzęski ssące – Sarcodina. 
 
1 orzęsek spoŜywa 20-40 tys. bakterii/dobę.  
Proporcja: 10-15 pierwotniaków/mln bakterii. 
 
WSPÓŁCZYNNIK PROPORCJONALNOŚCI – stosunek pierwotniaków do bakterii. 
Wiciowce – Anthophysa vegetans 
DuŜa liczba wiciowców – przeciąŜenie osadu czynnego związkami organicznymi i zła praca osadu. 
DuŜa liczba orzęsek, szczególnie Vorticella i Aspidisca costata, oznacza prawidłową pracę osadu. 
Orzęski są b. czułe na róŜne trucizny. 
 
ZDOLNOŚCI FERMENTACYJNE poszczególnych rodzajów drobnoustrojów. 
Pseudomonas – alkohole, tłuszcze, parafiny, węglowodany, węglowodory. 
Bacterium – ropa naftowa, parafiny, nafteny, fenole, aldehydy, kwasy tłuszczowe. 
Bacillus – węglowodory alifatyczne. 
 
PĘCZNIENIE OSADU: 

 

rozwój  bakterii  nitkowatych  –  pęcznienie  osadu  (niemoŜliwe  jest  zsedymentowanie)  – 
potrzebna dezynfekcja całej oczyszczalni 

-

 

Sphaerotilus natans, rzadziej Beggiata sp. lub Thiothrix sp. 

 
Przyczyny: 

-

 

zbyt mało tlenu 

-

 

zagniwanie substancji organicznych 

-

 

wysoki stosunek C i N, szczególnie obecność azotu organicznego. 

 
Czynniki środowiskowe regulujące pracę osadu czynnego: 

-

 

temperatura (mezo-, psychro-) 

-

 

rozpuszczalność tlenu (latem mało O

2

 szybszy wzrost mikroorg.) 

 
 
 

background image

 

28 

Wpływ temp. na rozpuszczalność tlenu w czystej wodzie: 
 

Temp. 

Rozpuszczalność tlenu [mg/l] 

10 
15 
20 
30 
40 

10,93 

9,90 
8,87 
7,46 
6,59 

 

-

 

zimą znacznie większa rozpuszczalność tlenu – poniŜej 1g/l 

-

 

pH: 5,5-8,5 

-

 

biogeny: proporcje między nimi 

-

 

metoda ZŁÓś BIOLOGICZNYCH z fermentacją metanową 

 

 

 
Najmniej obciąŜone są z. zraszane – odkryte zbiorniki: 

-

 

wys. ok. 2,5 m (

<

 3) 

-

 

nie jest mech. napowietrzany 

-

 

do  góry  belka  zraszająca  z  dziurkami  lekko  z  boku  po  1 stronie.  Belka  kręci  się  sama  napędzana 
strumieniem wody 

-

 

złoŜe wypełnione: kamienie, ŜuŜel, cegły klinkierowe lub kształtki tworzyw sztucznych 

-

 

latem: kamienie są chłodzone – powietrze spływa w dół – cięŜsze 

-

 

nocą: kamienie są cieplejsze – powietrze samoczynnie w górę 

-

 

są tam: kilka mm bakterii, grzyby, mikrofagi 

-

 

o pracy decyduje kolor. 

 
Barwa powierzchni złóŜ zraszanych, jako wskaźnik stanu błony biologicznej: 

Czerwona

 – obecność bakterii purpurowych siarkowych, brak tlenu. 

Mlecznobiała

 – obecność bakterii siarkowych, brak tlenu. 

ś

ółto

-

oranŜowa

 – początek masowego rozwoju grzyba fusarium, groźba zarośnięcia złoŜa. 

Czarna – siarczek Ŝelaza, brak tlenu. 

Zielona

 – zielone grzyby, zmiana czystości wody z klasy II do III. 

Brunatna

 – prawidłowy rozwój błony, dobrze pracujące złoŜe. 

Kakaowa

 – obecność okrzemków, przejście do II klasy czystości. 

 
ZłoŜa spłukiwane: 

-

 

do oczyszczania ścieków średnio-obciąŜonych 

-

 

zbiornik zamknięty 

-

 

sztuczne mechanizmy napowietrzania 

-

 

wys. ok. 4 m  

 

 

-

 

zraszanie duŜo intensywniejsze 

(więcej  jest  w  stanie  utlenić  –  moŜna  dać 
większy przepływ ścieków) 
-

 

błona  biologiczna  1 mm  zawiera  wyłącznie 
bakterie 

-

 

czasem  błona  odrywa  się  całymi  płatami  – 
za tym powinien stać osadnik wtórny 

 

 

Rodzaje: 

 

-

 

zraszane 

-

 

spłukiwane 

-

 

wieŜowe 

-

 

działają w oparciu o błonę biologiczną. 

ZłoŜe oparte na nośniku, który jest zraszany 

(mniej lub bardziej intensywnie). 

background image

 

29 

ZłoŜa wieŜowe – najbardziej skuteczne 

-

 

nawet do 10 m wys. 

-

 

materiały: raczej plastikowe (kamienne za cięŜkie) 

 

 
ZłoŜa obrotowe 

-

 

tarczowe – tarcze (na nich błona biologiczna) obracają się i zawierają ściek 

 

 

Lepsze: 
wieŜowe 

>

 spłukiwane 

>

 przemienne 

>

 zraszane