background image

 

 

Biologia z elementami 
mikrobiologii

Dr hab. Krystian Kubica

Politechnika Wrocławska

Instytut Inżynierii Biomedycznej

i Pomiarowej

background image

 

 

Biologia

Skaldowie

nie ma życia bez białka 

nauka o życiu

Życie?

Przeciętna komórka zawiera ok. 20 000 różnych typów białek z których 
ok. 2000 reprezentuje co najmniej 50 000 cząsteczek jednego typu co daje 
ok. 100 milionów cząsteczek białek w każdej komórce.

2002 r. Nagroda Nobla w dziedzinie chemii (proteomika)

John Fenn, Kurt Wüthrich, Korchi Tanaka

„...życie jest formą istnienia białka...”

a co z lipidami?

background image

 

 

Życie

Termodynamika

życie - złożona struktura dyssypatywna, mająca zdolność 
miejscowego odwracania kierunku zmian entropii.

Cybernetyka

życie - system sprzężeń zwrotnych ujemnych, 
podporządkowanych sprzężeniu zwrotnemu dodatniemu.

Informatyka

życie - czasowa zdolność systemu kodowego 
wykorzystywania i przekazywania zawartej w nim 
semantycznej informacji.

background image

 

 

Filozofia

Istota żywa – posiadająca jakikolwiek stopień świadomości

Fizyko-chemiczna

Życie – ogół specyficznych procesów fizyko-chemicznych 
zachodzących w pewnych zespołach materii organicznej

background image

 

 

Śmierć - stan charakteryzujący się ustaniem oznak życia, 
spowodowany nieodwracalnym zachwianiem równowagi 
funkcjonalnej i załamaniem wewnętrznej organizacji 
ustroju

u.

? Regeneracja 

? Formy przetrwalnikowe

? reanimacja

? transplantologia

Potrzeba prawnej definicji śmierci 
osobniczej człowieka

śmierć pnia mózgu jest niezbędnym i wystarczającym 
warunkiem do uznania osoby za zmarłą. 

Śmierć

background image

 

 

Komunikat Ministerstwa Zdrowia i Opieki Społecznej 1.07 1984

Komunikat Ministerstwa Zdrowia i Opieki Społecznej 1994

Komunikat Ministerstwa Zdrowia i Opieki Społecznej  1996

Obwieszczenie Ministra Zdrowia z dnia 17 lipca 2007.

background image

 

 

Obserwacja wstępna

I.

Czas obserwacji?

Śpiączka ?

Nieodwracalność uszkodzenia?

Efekty środków farmakologicznych/trucizn?

Hipotermia?

II.

Odruchy pniowe?

Bezdech?

background image

 

 

Jakiekolwiek wątpliwości powinny być rozwiane 

badaniami instrumentalnymi (EEG, metody 

badania krążenia mózgowego)

background image

 

 

Śmierć komórki i śmierć organizmu?

background image

 

 

Cechy życia (czynności życiowe)

Odżywianie się (pobieranie pokarmu)

Wzrost

Wydalanie

Reagowanie na bodźce

Ruch

Rozmnażanie się

background image

 

 

Cechy istot żywych:

Budowa komórkowa

Własny metabolizm

Posiadanie białek i kwasów nukleinowych

Zdolność do samoreprodukcji i dziedziczenia cech

Utrzymywanie homeostazy

background image

 

 

Właściwości istot żywych:

Solomon E., Berg L., Martin D., Villee C., Biologia. Ofic. Wyd. Multico, Warszawa 2000

specyficzna organizacja,

metabolizm,

homeostaza,

zdolność ruchów,

reakcja na bodźce,

wzrost i rozwój,

rozmnażanie się,

przystosowanie się do zmian środowiska.

?

background image

 

 

Każdy układ znajdujący się w stanie równowagi, który poddany jest 
działaniu czynnika zewnętrznego, zaczyna przeciwdziałać zmianom 
przez niego powodowanym

reguła przekory Le Chateliera i Brauna 1881

Każde zdarzenie wywołuje skutki, które działają przeciw zdarzeniu, 
które je wywołało.

Reguła Lentza 1834

Adaptacja i reguła przekory?

Życie nie zachodzi w stanie równowagi termodynamicznej

background image

 

 

Pytanie o początek?

background image

 

 

Ewolucja chemiczna

background image

 

 

1924 r. Teoria Oparina (koacerwaty)

Sidney Fox (mikrosfery)

background image

 

 

1953 r. Doświadczenie Millera i Ureya

Substraty: CH

4

, NH

3

, H

2

,H

2

O

Produkty: CHCOOH, CH

3

COOH, (NH

2

)

2

CO, 

HN

2

CH

2

COOH, CH

3

CH(NH

2

)COOH, 

HOOC(CH

2

)

2

CH(NH

2

)COOH,

background image

 

 

1981 r. Rybozymy - Thomas Cech – 
autokataliczne wycinanie intronów

Q ß replikaza – prawdopodobieństwo błędu 10

-4

Teoria Eigena (Peter Schuster) 1973

DNA         RNA         białko  

background image

 

 

background image

 

 

RNA   DNA?

background image

 

 

? Stężenie substratów w praoceanie

Rola powierzchni 

Konieczność utrwalenia i przekazywania nowych własności 

Aminokwasy 
      

polipeptydy

białka

?

background image

 

 

Kodowanie i przekazywanie informacji

? Eksperymenty z gąbkami

? Ekspetymenty z kapsydem  
      

wirusowym

? Eksperymenty z bakteriami

? PrPc ->PrPsc

background image

 

 

Białka nie kodują i nie przekazują informacji

?

PrPsc

PrPc

PrPsc

background image

 

 

Interacja kwasów nukleinowych i białek

wirusy

background image

 

 

background image

 

 

background image

 

 

3’5’cAMP

ATP

CoA

NADP

background image

 

 

Życie i woda

background image

 

 

Woda (tlenek wodoru, IUPAC – oksydan)

Własności:

1. Trwały związek chemiczny  (dipol)

2. Główny składnik organizmów ok. 

78%

 wagowych

3. Duża wartość przenikalności dielektrycznej 

~80

4. Relatywnie wysoka temperatura wrzenia w porównaniu do cieczy o 

podobnej masie cząsteczkowej

5. Duża wartość współczynnika napięcia powierzchniowego 

~7x10

-2

 N/m

6. Maksymalna gęstość w 

4

o

 C

7. Duża wartość ciepła właściwego 

~4kJ/(kgK)

8. Duża wartość ciepła parowania 

~2000kJ/kg

background image

 

 

samoogranizacja

background image

 

 

Woda i związki amfifilowe 

Efekt hydrofobowy

background image

 

 

background image

 

 

+ H

2

O

background image

 

 

+ H

2

O

background image

 

 

background image

 

 

background image

 

 

Model płynnej mozaiki

Model płynnej mozaiki

background image

 

 

A co z tlenem?

background image

 

 

Fotosynteza:

CO

2

, H

2

O -> O? (1941- metody izotopowe)

Czy fotosynteza musiała doprowadzić do pojawienia 
się tlenu w atmosferze?

Bakterie purpurowe

H

2

S + CO

2

 węglowodany +S

Secenedesmus - glon nie wytwarzający tlenu 
(Gaffron)

background image

 

 

Tlenowe (aerobowe)

Beztlenowe (anaeroby obligatoryjne i 
fakultatywne):

Fermentacja np. cukry ->kwas mlekowy

Redukcja azotanów do azotynów

Redukcja siarczanów do siarkowodoru

Oddychanie beztlenowe u ludzi?

Glikoliza we włóknach 
mięśniowych 

background image

 

 

porfiryna

1909r. Leon Marchlewski -

Podobieństwo hemu i chlorofilu

Ewolucja życia a układy porfirynowe

Pojawienie się O

2

 w atmosferze

konieczność jego transportu – porfiryny

porfiryny

: hemoglobina, mioglobina, cytochromy, chlorofile

background image

 

 

Sztuczne życie?

background image

 

 

1961r . Nirenberg i Matthei

Ekstrakt enzymów z Escherichia Coli + ATP+aa+ 
systetyczny RNA poliUracyl -> polipeptyd 
zbudowany z fenyloalaniny

1970 r. Khorana – pierwszy sztuczny łańcuch DNA

background image

 

 

Wirtualna komórka

http://www.e-cell.org

http://www.copasi.org

http://www.vcell.org

Mycoplasma genitalium – wzorzec 
minimum informacji genetycznej 
580 000 nukleotydów

background image

 

 

Teorie pochodzenia życia na Ziemi

Samorództwo (autogonia)

Kreacjonizm

Panspermia

Samoistnie (proste związki chemiczne, 
samoorganizacja, ewolucja)

Szczypce laserowe

lata 80-te XX w. zespół Ashkina użyli wiązki laserowej do schwytania
wirusa mozaiki tytoniowej i bakterii Escherichia Coli. 

film

background image

 

 

Pytanie o początek?

background image

 

 

1970 rok

matematyk John Conway

Gra life

(S. Wolfram)

Pytanie o początek w świetle automatów komórkowych

background image

 

 

background image

 

 

Okres - 6

Okres - 24

background image

 

 

Teoria ewolucji

background image

 

 

Jean Lamark (1744-1829)

Przystosowanie do nowych warunków środowiska

Wzrost doskonałości poprzez „pęd wewnętrzny”

Dziedziczenie cech nabytych

Używanie/nie używanie narządów

background image

 

 

G. Cuvier (1769-1832)

Zasada korelacji

Narządy homologiczne

Narządy analogiczne

background image

 

 

William Paley (1743-1805)

Wszystkie organizmy są idealnie przystosowane do 
środowiska

August Weismann (1834-1914)

Komórki somatyczne i płciowe

A zmiany w komórkach 
zarodka?

background image

 

 

Teoria ewolucji Darwina 1859

Dobór naturalny i dobór sztuczny (hodowlany)

Dobór naturalny i konkurencja (przeżycie 
najstosowniejszego)

Reprodukcja (liczebność i przeżywalność)

Potomstwo płodne

Ziemby? Gołębie?

background image

 

 

Dobór stabilizujący (żywe skamieliny?)

Dobór kierunkowy (gwałtowne zmiany środowiskowe?)

Dobór rozrywający (mocno różniące się fenotypowo a 
konkurencja?)

Dobór płciowy (konkurencja o partnera seksualnego)

background image

 

 

Matematyka matrymonialna?

background image

 

 

Dowody ewolucji

Bezpośrednie – kopalne 

Żywe skamieliny ?

Anatomia porównawcza (gruczoły mleczne, kręgosłup, 
kończyny kręgowców, narządy szczątkowe ?)
Embriologia – prawo rekapitulacji - Ernst Haeckel

Ontogeneza - filogeneza

Biogeorgafia – szczerbaki i leniwce A. Południowa

Genetyka i biochemia (kod genetyczny, cytochrom c, 
ATP)

background image

 

 

Specjacja – powstawanie nowych gatunków (izolacja rozrodcza)

•Specjacja allopatryczna (różne terytoria)

•Specjacja sympatryczna (ekologiczne, 
behawioralne na podłożu genetycznym)

background image

 

 

Wielkie wymierania a tempo 

ewolucji

background image

 

 

?

background image

 

 

Datowanie

Metoda stratygraficzna (względna)

Metoda faunistyczna

Datowanie izotopowe 

14

C  do 50 000 (70 000 lat)

40

K/

40

Ar  1250 mln lat do 200 000 lat

238

U  

206

 Pb

235

U  

207

 Pb   miliardy lat

background image

 

 

Izotopy C

11

C

12

C

13

C

14

C

Czas połowicznego rozpadu

?

syntetyczny

98,9%

1,1%

Śladowo –10

-6

background image

 

 

Datowanie

14

C do ok. 50 000lat

Niepewność datowania?


Document Outline