background image

 

Ćwiczenie 2 

BUDOWA,  WŁAŚCIWOŚCI  I  FUNKCJA  BIAŁEK 

Część doświadczalna obejmuje: 

- ilościowe oznaczanie białek metodą biuretową 

- wytrącanie kazeiny w punkcie izoelektrycznym 

- frakcjonowanie białek surowicy krwi metodą wysalania siarczanem amonu 

denaturacja białek (termiczna, etanolem o wyŜszym stęŜeniu, niektórymi kationami i anionami) 

 

WPROWADZENIE 

Łączenie się aminokwasów wiązaniami amidowymi prowadzi do utworzenia liniowej makro-

cząsteczki – polipeptydu. Łańcuchy polipeptydowe zawierające ponad 100 reszt aminokwasowych 

przyjmuje się określać juŜ jako białkaWiązanie amidowe, nazywane równieŜ wiązaniem pep-

tydowym, powstaje z grupy 

α

-karboksylowej i grupy 

α

-aminowej. Na ryc. 1A przedstawiono di-

peptyd (seryloalaninę) utworzony z seryny i alaniny. Wiązanie peptydowe jest stabilizowane me-

zomerycznie,  gdyŜ  wiązanie  C-N  ma  częściowo  charakter  wiązania  podwójnego  C=N  (Ryc. 

1B). To usztywnienie wiązania peptydowego powoduje, Ŝe we wszystkich ułoŜeniach przestrzen-

nych białek grupy amidowe pozostają płaskie. Swobodna rotacja jest moŜliwa tylko wokół wią-

zania N-C

α

 i C

α

-C, a obroty są opisywane przez wartości kątów torsyjnych 

ϕϕϕϕ

 (fi) i 

ψ

ψ

ψ

ψ

 (psi) (Ryc. 

1A).  

 

Ryc. 1. Właściwości wiązania amidowego (peptydowego) (Koolman, Röhm 2005) 

background image

 

 

Ryc.  2.  Struktury  drugorzędowe  białek  (α-helisa,  helisa  kolagenu,  pofałdowanej  kartki,  β-pętla) 
(Koolman, Röhm 2005) 

background image

 

Konformacja łańcucha peptydowego utworzona przez kilka kolejnych reszt aminokwasowych 

definiuje strukturę drugorzędową stabilizowaną wiązaniami wodorowymi (Ryc. 2). 

Białka, ze względu na skład, dzieli się na białka proste i złoŜoneBiałka proste zbudowane są 

tylko z aminokwasów, natomiast białka złoŜone zawierają szereg róŜnych komponentów nieami-

nokwasowych, których rodzaj staje się podstawą podziału białek na:  

glikoproteiny - białka zawierające cukry obojętne (galaktoza, mannoza, fukoza), aminocukry 

(N-acetyloglukozamina,  N-acetylogalaktozamina) lub kwasy pochodne mono-

sacharydów (kwas uronowy, kwas sjalowy) 

lipoproteiny – zawierają fosfolipidy, cholesterol i inne związki lipidowe 

metaloproteiny – zawierają jony metali związane jonowo lub koordynacyjnie 

fosfoproteiny – reszty tyrozyny, treoniny lub seryny są zestryfikowane kwasem fosforowym  

nukleoproteiny – zawierają RNA lub DNA 

chromoproteiny – zawierają grupę prostetyczną, którą stanowią róŜne związki barwne  

Na  ryc.  3  pokazano  potencjalne  miejsca  modyfikacji  łańcucha  polipeptydowego.  Modyfika-

cjom ulegają zwykle polarne reszty aminokwasów, stanowiąc waŜne źródło róŜnorodności białek. 

 

 

Ryc. 3. Potranslacyjne modyfikacje łańcucha polipeptydowego (Koolman, Röhm 2005) 

 

background image

 

Białka ze względu na pełnione funkcje moŜna podzielić na:  

enzymatyczne – najliczniejsza grupa białek (ponad 2000) o zróŜnicowanej masie cząsteczkowej  

strukturalne – są odpowiedzialne za mechaniczną stabilność narządów i tkanek (kolagen, ela-

styna, tubulina, aktyna, 

αααα

-keratyna). Do białek strukturalnych zalicza się tak-

Ŝe histony pełniące kluczową rolę w upakowaniu DNA w chromatynie 

transportujące – np. hemoglobina uczestniczy w transporcie tlenu i CO

 Niektóre białka oso-

cza  (prealbumina)  transportujące  hormony,  transferyna  przenosząca  Ŝelazo, 

niektóre białka błonowe np. kanały jonowe pośredniczące w transporcie jonów, 

nośniki w transporcie metabolitów i jonów, pompy funkcjonujące w transpor-

cie aktywnym jonów i metabolitów 

-  regulacyjne  –  białkami  są  niektóre  hormony  (somatotropina,  insulina),  a  takŜe  receptory 

uczestniczące w percepcji róŜnych cząsteczek sygnałowych. Białkami regulato-

rowymi są takŜe czynniki transkrypcyjne, regulujące ekspresję genów 

-  odpornościowe  –  białka  układu  immunologicznego  (np.  immunoglobuliny)  chronią  organizm 

przed  czynnikami  chorobotwórczymi  i  ksenobiotykami  (substancjami  obcymi 

dla organizmu) 

-  motoryczne  –  uczestniczą  w  procesach  związanych  z  ruchem  (aktyna,  miozyna);  kinezyna 

funkcjonuje w przemieszczaniu organelli w komórce 

zapasowe – owoalbumina w białku jaja stanowi źródło aminokwasów dla rozwijającego się za-

rodka;  ferrytyna  wiąŜe  Ŝelazo  w  wątrobie,  kazeina  jest  białkiem  zapasowym 

mleka, niektóre białka budujące mięśnie mogą być wykorzystywane jako mate-

riał energetyczny; takŜe wiele białek roślinnych pełni funkcję zapasową  

Ze  względu  na  rozpuszczalność i kształt, białka dzielą się na: globularne (kuliste) i fibrylarne 

(włókienkowate, skleroproteiny).  

Do  białek  fibrylarnych  naleŜą:  α-keratyny  włosów,  wełny,  piór,  paznokci,  kolageny  zawarte 

głównie w tkance łącznej, elastyny, fibroina jedwabiu. 

 Białka globularne obejmują: 

-białka obojętne (albuminy, globuliny) 

-kwaśne (prolaminy, gluteiny) 

-zasadowe (histony, protaminy)  

Na ryc. 4 przedstawiono półschematycznie, w około 1,5-milionowym powiększeniu, struktury 

kilku wewnątrz- i pozakomórkowych białek. 

background image

 

 

 

Ryc. 4. Strukturalne i funkcjonalne zróŜnicowanie białek (półschematyczne struktury w około 1,5 
mln powiększeniu; długość kolagenu w tym powiększeniu wynosi około 30 cm) (Koolman, Röhm 
2005)  
 

background image

 

 

Rozpuszczalność białek globularnych 

Cząsteczki białka są amfoterami tworzącymi w roztworach wodnych koloidy. Fazę rozproszo-

ną stanowią cząsteczki białka o wymiarach 5-100 nm i masach cząsteczkowych sięgających nawet 

miliona Daltonów (Da). Większość białek wykazuje duŜe powinowactwo do wody. Takie koloidy 

nazywamy hydrofilowymi

Białka,  podobnie  jak  aminokwasy,  posiadają  ładunek,  lecz  w  pH  równym  punktowi  izoelek-

trycznemu  (pI)  są  elektrycznie  obojętne  (Rys.  5).  RóŜne  białka  mają  róŜne  wartości  punktu  izo-

elektrycznego. W pH powyŜej i poniŜej pI białka mają ładunek odpowiednio ujemny i dodatni, w 

wyniku  czego  białko  zostaje  otoczone  dipolami  wody  (hydratacja).  Zjawisko  to  warunkuje  roz-

puszczalność  w  wodzie  tak  duŜych  cząsteczek  jak  białka.  Pozbawienie  białek  ładunku  powoduje 

dezintegrację  otoczki  wodnej  i  utratę  rozpuszczalności.  Białka  róŜniące  się  wartościami  punktu 

izoelektrycznego w tym samym pH środowiska będą posiadały róŜny ładunek i róŜne powinowac-

two do wody, co umoŜliwia ich frakcjonowanie i rozdział. 

 

 

Ryc. 5. Udział ładunku elektrycznego w procesach wytrącania białka w roztworze 

 

Z  powyŜszego  wynika,  Ŝe  wytrącanie  białka  zachodzi  najłatwiej  w  punkcie  izoelektrycz-

nym.  Jeśli  proces  ten  będzie  przebiegał  w  niskiej  temperaturze  (0-5

C),  to  uzyskane  w  osadzie 

białko, po rozpuszczeniu zachowa cechy charakterystyczne dla białka natywnego. 

Na ryc. 6 pokazana jest zaleŜność rozpuszczalności białka od pH w warunkach zróŜnicowa-

nego stęŜenia NaCl. Rozpuszczalność białka wyraźnie maleje w pH zbliŜonym do pI. Największy 

spadek rozpuszczalności obserwuje się w warunkach niskiego stęŜenia soli (1 mM NaCl).  

background image

 

 

Ryc. 6. Wpływ pH i niewielkich stęŜeń NaCl na rozpuszczalność β-laktoglobuliny w 25

(Lehninger 1979) 

Wpływ stęŜenia soli na rozpuszczalność białek 

 Rozpuszczalność  jest  funkcją  zarówno  stęŜenia  soli  obojętnej,  jak  teŜ  ilości  ładunków  wszyst-

kich rodzajów jonów znajdujących się w roztworze. Wartości te określają siłę jonową roztworu: µ 

= 1/2Σc

i

z

i

2

 (c – stęŜenie jonówz – ładunek jonów

 

Ryc. 7. Zasalanie (wsalanie) i wytrącanie białek (wysalanie) w warunkach rosnącej siły jonowej 

roztworu (Koolman, Röhm 2005) 

background image

 

Rozpuszczalność  białka  w  wodzie  destylowanej  jest  bardzo  mała,  natomiast  rośnie  wraz  ze 

wzrostem siły jonowej, gdyŜ rośnie liczba jonów nieorganicznych na powierzchni białka zapobie-

gających  ich  agregacji.  Zjawisko  to  nazywa  się  wsalaniem  lub  zasalaniem  (Ryc.  7).  Przy  odpo-

wiednio duŜej sile jonowej, sól odciąga  cząsteczki wody od powierzchni białek i doprowadza do 

ich  agregacji  (wysalanie  białka)  (Ryc.  7).  Białko(a)  wysolone  rozpuszcza  się  ponownie  po  usu-

nięciu soli lub po rozcieńczeniu roztworu. 

Zdolność  wysalająca  soli  zaleŜy  zarówno  od  charakteru  kationu,  jak  i  anionu.  Ze  względu  na 

siłę wysalającą moŜna uszeregować kationy i aniony w następujący sposób: 

Aniony: cytrynian

3-

 > winian

2-

> siarczan

2-

 > octan

-

 > chlorek

-

 > azotan

-

 > rodanek

-

 

Kationy: Th

3+

 > Al

2+

 > Se

2+

 > Sr

2+

 > Ca

2+

 > Mg

2+

 > NH

4

+

 > Na

+

 > Li

+

 

Szeregi te noszą nazwę szeregów liotropowych lub szeregów Hofmeistera.  

Rozpuszczalność  białek  jest  takŜe  funkcją  stałej  dielektrycznej  środowiska,  gdyŜ  w  warun-

kach  nie  zmieniającego  się  pH  i  siły  jonowej  maleje  po  dodaniu  rozpuszczalników  o  niskiej 

stałej  dielektrycznej  takich  jak:  etanol,  aceton,  glikol  etylenowy.  Białka  w  takich  warunkach 

agregują,  gdyŜ  dodany  rozpuszczalnik  zmniejsza  stopień  uwodnienia  grup  jonowych  przez 

zmniejszenie  ilości dipoli wodnych na powierzchni cząsteczki białka. ObniŜenie stałej dielek-

trycznej  roztworu  przez  dodanie  rozpuszczalnika  powoduje  wzrost  siły  przyciągania  pomiędzy 

przeciwnie naładowanymi grupami.   

Rozpuszczalność większości białek zwiększa się w ograniczonym zakresie (0 – 40

C) wraz ze 

wzrostem temperatury. W temperaturze powyŜej 40-50

C większość białek zaczyna tracić trwa-

łość i ulega denaturacji. Białka mogą takŜe denaturować w szczególnie drastycznych warunkach tj. 

skrajne pH, wysoka temperatura, promieniowanie jonizujące. Denaturacja pociąga trwałą utratę 

funkcji biologicznych i wiąŜe się ze zmianami w strukturze drugo-, trzecio- i czwartorzędo-

wej białka.  

 

 

 

 

 

 

 

 

 

background image

 

WYKONANIE  

Kolorymetryczne oznaczanie białek metodą biuretową 

Zasada metody: 

Metoda  polega  na  oznaczaniu  natęŜenia  barwy  powstałej  w  wyniku  wytworzenia  związków 

kompleksowych białek z jonami miedzi (II) w środowisku zasadowym, z maksimum absorbancji 

przy 

λ

 = 540 nm. Intensywność barwy w reakcji biuretowej jest proporcjonalna do liczby wiązań 

peptydowych.  ZaleŜność  ta  jest  wykorzystywana  do  ilościowego  oznaczania  białek.  Czułość  me-

tody - 0,1 mg/ml. 

 

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Nazwa reakcji pochodzi od biuretu - związku powstającego w wyniku kondensacji dwóch cząste-
czek mocznika, zawierającego w swej cząsteczce wiązania amidowe  

 

 

 

Metoda  biuretowa  nie  nadaje  się  do  oznaczania  białek  w  obecności  soli  amonowych,  gdyŜ  jon 

amonu daje równieŜ barwne kompleksy z jonami miedzi (II). W reakcji przeszkadza takŜe siarczan 

(VI) magnezu, poniewaŜ wytrącający się w środowisku nierozpuszczalny  wodorotlenek magnezu 

maskuje właściwy odczyn. 

 

background image

 

10 

Odczynniki: 

- standardowy roztwór albuminy - 10 mg/ml w 0,9% NaCl 

-  odczynnik  biuretowy:  1,5  g  5hydratu  CuSO

4

  i 6,0  g  winianu  sodu  i  potasu  rozpuścić  w  500  ml 

wody dest. w kolbie miarowej na 1000 ml. Następnie małymi porcjami stale mieszając dodać 300 

ml

 

10% NaOH i uzupełnić objętość wodą dest. do 1 l. Dodać 2g KJ. Odczynnik jest stabilny.  

 

Wykonanie krzywej standardowej i oznaczenie stęŜenia białek w surowicy krwi  

Do  suchych  probówek  odmierz  pipetą  kolejno  podane  w  tabeli  objętości  standardowego  roz-

tworu albuminy, wody i odczynnika biuretowego. KaŜdą próbę wykonaj w dwóch powtórzeniach. 

 

 Nr próby

 

1 

2 

3 

4 

5 

6 

 

StęŜenie albuminy  (mg/próbę)

 

1 

2 

3 

4 

5 

0 

 Roztwór standardowy (ml) 

 Woda destylowana (ml) 

 Odczynnik biuretowy (ml) 

 

                      A

1

 

  A

540nm

         A

2

 

                      A

śr

 

 K   =  

 mg albuminy w próbie

 

                         A

540 nm

 

0,1 

0,4 

2,0 

 

 

 

 

 

 

0,2 

0,3 

2,0 

 

 

 

 

 

 

0,3 

0,2 

2,0 

 

 

 

 

 

 

0,4 

0,1 

2,0 

 

 

 

 

 

 

0,5 

2,0 

0,5 

2,0 

 

Równocześnie oznacz zawartość białka w 10-krotnie rozcieńczonej surowicy krwi (do oznaczeń 

pobierz  0,5  i  0,1  ml;  w  tym  drugim  przypadku  próbę  uzupełnij  wodą  do  0,5  ml).  Po  upływie  30 

min zmierz absorbancję  prób przy  długości fali 

λ

 = 540 nm w 1 cm kuwetach. Pomiaru dokonaj 

względem próby zerowej nie zawierającej białka (próba 6). Zapisz wyniki w tabeli. Oblicz współ-

czynnik  kierunkowy  K.  Narysuj  krzywą  wzorcową  (zaleŜność  wartości  absorbancji  od  stęŜenia 

białka w próbie). Przy obliczaniu ilości białka w próbie stosuj obliczony współczynnik K. Z ozna-

czonej w próbie zawartości białka oblicz stęŜenie białka w surowicy. 

 

 

 

background image

 

11 

Wytrącanie i denaturacja białek 

Wytrącanie białek 

 

Wytrącanie białek w punkcie izoelektrycznym 

Do  1  ml  0,1%  roztworu  kazeiny,  rozpuszczonej  w  50  mM  roztworze  octanu  sodu,  dodawać 

bardzo  powoli  pipetą  Pasteura,  cały  czas  delikatnie  wytrząsając,  około  1,5  ml  0,5  M  roztworu 

kwasu  octowego.  Obserwować  pojawianie  się  zmętnienia  pochodzącego  od  wytrącającego  się 

białka, które powinno rosnąć z upływem czasu. Po 5 min dodać porcjami jeszcze około 1,5 ml 

0,5 M roztworu kwasu octowego i obserwować czy wytrącona w pI kazeina rozpuszcza się po ob-

niŜeniu pH roztworu (wartość pI kazeiny wynosi 4,7) 

 

Frakcjonowanie białek surowicy krwi metodą wysalania siarczanem amonu 

Do  wysalania  białek  stosujemy  najczęściej  związki  o  wysokim  powinowactwie  do  wody  tj. 

siarczan (VI) amonu lub siarczan (VI) sodu.  

Ćwiczenie  wykonujemy  w  probówkach  wirówkowych.  Do  2  ml

 

surowicy  (10-krotnie  roz-

cieńczonej  0,9%  roztworem  NaCl)  dodać  2  ml  nasyconego  roztworu  (NH

4

)

SO

4

.  Po  zmieszaniu 

roztworów uzyskuje się półnasycenie (50% nasycenie) siarczanu (VI) amonu. Agregujące globuli-

ny odwirować w wirówce stołowej, a następnie zlać klarowny supernatant do suchej probówki 

wirówkowej.  Do  osadu  globulin  dodać  niewielką  ilość  wody  destylowanej  do  całkowitego  roz-

puszczenia  białek.  Do  przelanego  supernatantu  dodawać,  cały  czas  wytrząsając,  kryształki 

(NH

4

)

2

SO

4

,  tak  by  uzyskać  roztwór  nasycony  (kryształki  siarczanu  amonu  przestają  się  rozpusz-

czać). Wzrost siły jonowej roztworu powoduje wytrącanie się frakcji albumin.  

 

Wytrącanie białek surowicy krwi etanolem 

Do 0,5 ml surowicy 10x rozcieńczonej 0,9% roztworem NaCl i oziębionej w lodzie dodać 1 ml 

96% etanolu. Powstaje zmętnienie, które znika po natychmiastowym rozcieńczeniu 0,9% NaCl lub 

wodą.  

 

Denaturacja białek 

Termin ten dotyczy wszystkich zmian w strukturze cząsteczki białka, w wyniku których białko 

traci  swoje  biologiczne  właściwości.  Denaturacja  następuje  wówczas,  gdy  pod  wpływem  czynni-

ków fizycznych lub chemicznych ulega zniszczeniu struktura IV-, III- lub II-rzędowa. 

background image

 

12 

Denaturacja cieplna białek 

2 ml

 

1% roztworu albuminy lub 1% roztworu białka jaja kurzego ogrzać do zagotowania. Two-

rzy się biały osad wytrąconego białka.  

 

Denaturacja białek etanolem 

Rozpuszczalniki organiczne (etanol, aceton, eter) i detergenty działają na strukturę przestrzen-

ną  cząsteczki  białka,  osłabiając  wiązanie  hydrofobowe,  reagują  bezpośrednio  z  naładowanymi 

grupami na powierzchni cząsteczki i dezorganizują płaszcz wodny cząsteczki. Działanie denatu-

rujące etanolu objawia się dopiero przy większych jego stęŜeniach, po dłuŜszym czasie dzia-

łania i w wyŜszej temperaturze (20

0

- 30

C)

Do probówki dodać 1 ml 1% albuminy i 1 ml 96% etanolu. Po godzinie rozcieńczyć zawartość 

probówki wodą. Osad nie rozpuszcza się. Porównaj z ćwiczeniem, w którym białka były wytrą-

cane etanolem.  

 

Strącanie białek za pomocą kationów 

Białka w pH wyŜszym od pI posiadają ładunek ujemny i mogą reagować z kationami. Kationy 

metali alkalicznych dają sole dobrze dysocjujące i rozpuszczalne w wodzie, natomiast kationy me-

tali cięŜkich (Fe

2+

, Cu

2+

, Hg

2+

, Pb

2+

, Ag

+

) tworzą sole nierozpuszczalne

Do  0,5  ml  1%  roztworu  albuminy  dodać  parę  kropel  1%  roztworu  FeCl

3

.  Wytrąca  się  osad 

białczanu Ŝelaza (III). Wykonać analogiczną próbę z HgCl

2

, Pb(CH

3

COO)

2

 oraz AgNO

3

 

Strącanie białek kwasem sulfosalicylowym i trójchlorooctowym 

                                  

     

COOH

OH

HO

3

S

                            

C

Cl

Cl

Cl

COOH

    

                                  

                                        

Kwas sulfosalicylowy                                       Kwas trójchlorooctowy 

Do  0,5  ml  1%  roztworu  albuminy  dodać  0,5  ml  10%  roztworu  kwasu  trójchlorooctowego.      

Końcowe stęŜenie kwasu niezbędne do odbiałczania nie powinno być niŜsze niŜ 5%. 

Do 0,5 ml

 

1% roztworu albuminy dodać kilka kropel 20% roztworu kwasu sulfosalicylowego. 

 

 

background image

 

13 

Zagadnienia do przygotowania: 

- budowa i właściwości wiązania amidowego (peptydowego) 

- struktury drugorzędowe białek (wiązania stabilizujące strukturę) 

-wiązania stabilizujące III- i IV- rzędową strukturę białek 

- białka proste i złoŜone; przykłady potranslacyjnej modyfikacji łańcuchów bocznych  

aminokwasów 

-podział białek ze względu na funkcję (przykłady) 

- kolorymetria (zasada ilościowego oznaczania białek metodą biuretową) 

-właściwości białek w roztworze (zaleŜność rozpuszczalności białek od pH, siły jonowej, stałej 

dielektrycznej rozpuszczalnika, temperatury) 

-zasada wytrącania białek w pI, wytrącania przez wysalanie lub obniŜenie stałej dielektrycznej 

roztworu 

- denaturacją białek (termiczna, wyŜsze stęŜenie etanolu, kationy metali cięŜkich, niektóre kwasy 

organiczne) 

Piśmiennictwo: 

Biochemia – JM Berg, JL Tymoczko, L Stryer PWN, Warszawa, 2005 

Biochemia – AL. Lehninger PWR i L, Warszawa, 1979  

Ćwiczenia z biochemii - (pod redakcją L. Kłyszejko-Stefanowicz) PWN, Warszawa, 2005 

Biochemia. Ilustrowany przewodnik – J Koolman, K-H Röhm, PZWL, Warszawa 2005