background image

L A B O R A T O R I U M   5 / 2 0 0 9

 

|

. . .

W

 

L A B O R A T O R I U M

 

10

Nowe metody stosowane
w analizie żywności

– aspekt mikrobiologiczny

W

 ciągu ostatniej dekady obser-
wowano wzrost infekcji wywo-
łanych spożyciem produktów 

żywnościowych o niedostatecznej ja-
kości. Epidemiologia tych zatruć wciąż 
ewoluuje nie tylko dlatego, że populacja 
stała się wyjątkowo wrażliwa, ale przede 
wszystkim z powodu zmiany stylu ży-
cia, tj. jemy coraz różnorodniej – żądni 
przygód kulinarnych, poświęcamy mniej 
czasu na przygotowanie posiłków, korzy-
stamy z wygodnej żywności. Rozwinęły 
się również nowe zagrożenia, nowe grupy 
patogenów związane z rozwojem tech-
nologii produkcji żywności, procesów 
przetwarzania i dystrybucji.

  

METODY IDENTYFIKACJI 
MIKROORGANIZMÓW

Do identyfikacji mikroorganizmów wy-
korzystujemy metody, które możemy 
podzielić na 3 grupy:
–  metody fenotypowe – wykorzystujące 

cechy fenotypowe mikroorganizmów, 
które można zaobserwować pod mi-
kroskopem. Na podstawie wyglądu 
zewnętrznego nie można zidentyfi-
kować bakterii ze względu na podo-
bieństwo komórek między różnymi 
filogenetycznie rodzinami,

–  metody biochemiczne – metody stosowa-

ne głównie w przemyśle i wykorzystujące 
produkty szlaków metabolicznych cha-
rakterystyczne dla danych drobnoustro-
jów. Na podstawie analizy metabolitów 
bakteryjnych jesteśmy w stanie zaklasyfi-
kować je do danej grupy, a porównując 
otrzymane wyniki z wynikami w bazach 
danych, często możemy precyzyjnie 
określić przynależność taksonomiczną 
mikroorganizmów,

–  metody genetyczne – najbardziej pre-

cyzyjne techniki wykorzystujące zdoby-
cze biologii molekularnej, opierające 
się głównie na materiale genetycznym 
drobnoustrojów, dzięki którym moż-

liwe jest bardzo dokładne określenie 
przynależności gatunkowej bakterii, 
a nawet określenie ich szczepu.

  

PRZYCZYNY ROZWOJU 
SZYBKICH TECHNIK 
IDENTYFIKACJI

Rozwój nowoczesnych technik z zakre-
su mikrobiologii, immunologii, biolo-
gii, biochemii i biofizyki przyczynił się 
do postępu w zakresie szybkich metod 
oznaczania i charakterystyki mikroorga-
nizmów w żywności. Nowoczesne meto-
dy mikrobiologiczne są ukierunkowane 
przede wszystkim na szybkie i niezawodne 
wykrywanie bakterii chorobotwórczych. 
W zakresie szybkiego wykrywania i iden-
tyfikacji mikroorganizmów prym wiodą 
nauki z zakresu medycyny. Postępujący 
rozwój metod instrumentalnych i testów 
diagnostycznych oraz postęp naukowy 
wykorzystuje się do ulepszenia metod 
izolacji, wczesnego wykrywania, liczenia, 
charakterystyki i identyfikacji mikroor-
ganizmów. Monitorowanie produkcji 
żywności poprzez system HACCP (Ha-
zard Analysis Critical Control Points
) oraz 
kontrolę higieny w ramach GHP (Good 
Hygienic Practice
), GMP (Good Manufactu-
ring Practice
), MRA (Microbial Risk Asses-
sment
), RM (Risk Management), RC (Risk 
Communication
) oraz TQM (Total Quality 
Management
) jest skutecznym, zgodnym 
z obecnymi trendami sposobem zarządza-
nia jakością i bezpieczeństwem żywności. 
Systemy te wymagają jednak nowocze-
snych, a przede wszystkim szybkich i jed-
noznacznych testów oceny m.in. stanu 
mikrobiologicznego maszyn i urządzeń 
produkcyjnych, surowca i produktu. 
Dlatego w ostatnich latach obserwuje 
się szybki transfer technik wykrywania 
i identyfikacji drobnoustrojów z za-
kresu medycyny klinicznej do praktyki 
przemysłowej. Adaptacja metod wymaga 
jednakże opracowania właściwych proce-

STRESZCZENIE

     Główne 

niebezpieczeństwo dla zdrowia, 

a nawet życia konsumenta związane 

jest z pogorszeniem jakości zdrowotnej 

produktu, co wynika z obecności 

i rozwoju mikroorganizmów, przede 

wszystkim chorobotwórczych. Dlatego 

też jednoznaczna i szybka identyfi kacja 

zagrożeń mikrobiologicznych w surowcu, 

na wszystkich etapach procesu 

technologicznego i w samym produkcie 

jest konieczna. W artykule przedstawiono 

zestawienie głównych nurtów i technik 

mikrobiologicznych stosowanych obecnie 

w praktyce laboratoryjnej i przemysłowej.

SŁOWA KLUCZOWE

  

 

 

metody 

detekcji mikroorganizmów

SUMMARY

  

 

 

The main hazard 

to consumer’s health, or even  life, 

is connected with the decrease of 

product’s health quality which is the 

fi rst of a number of consequences of 

the presence and growth of pathogenic 

microorganisms. Therefore unequivocal 

and fast identifi cation of microbiological 

risks in raw material, at all stages of 

production process and in fi nished 

product is necessary. In the paper 

the review of the main trends and 

microbiological techniques being used 

at present in laboratory and industrial 

practice has been presented.

KEY WORDS

  

 

 

methods of 

microorganisms detection

dr inż. Kamila Goderska
dr inż. Artur Szwengiel

  

INSTYTUT TECHNOLOGII ŻYWNOŚCI POCHODZENIA ROŚLINNEGO
UNIWERSYTET PRZYRODNICZY W POZNANIU

background image

. . .

W

 

L A B O R A T O R I U M

 

|

L A B O R A T O R I U M   5 / 2 0 0 9

11

dur analizy skomplikowanej matrycy, jaką 
jest żywność, i dotyczy głównie sposobu 
przygotowywania próbki.

Analiza mikrobiologiczna żywności 

sprowadza się do oznaczenia ogólnej 
liczby drobnoustrojów oraz stwierdzenia 
obecności i poziomu patogenów. Licz-
bę drobnoustrojów oznacza się poprzez 
posiewy płytkowe metodą wgłębną oraz 
metodą powierzchniową. Tradycyjne 
procedury są wieloetapowe, czasochłon-
ne, materiałochłonne, ponadto często 
wymagają dużego doświadczenia perso-
nelu. Zaletami nowoczesnych technik 
są przede wszystkim: oszczędność czasu, 
możliwość oceny liczebności populacji, 
identyfikacja gatunkowa oraz możliwość 
zróżnicowania w obrębie gatunku.

Nowe narzędzia, jakie dają nam osią-

gnięcia naukowe w dziedzinie immuno-
logii, biologii molekularnej, biochemii, 
biologii z elementami chemii, fizyki 
i biofizyki, powinny być wykorzystywa-
ne w dwóch płaszczyznach w celu kom-
pleksowego zapewnienia bezpieczeństwa 
zdrowotnego żywności. Z jednej strony 
powinno się prowadzić badania monito-
ringowe obejmujące zakład produkcyjny. 
Z drugiej strony szczegółowa wiedza o za-
chowaniu się mikroorganizmów w odpo-
wiedzi na określone warunki środowi-
ska pozwala na obiektywne określenie 
wpływu procesu technologicznego oraz 
warunków dystrybucji i magazynowania 
na stopień skażenia mikrobiologicznego 
i jego jakość; wiedzę tę, jak i procedu-
ry, powinny z kolei zakładom zapewnić 
placówki naukowe.

  

CELE I ZAKRES 
OCENY STANU 
MIKROBIOLOGICZNEGO

Mikrobiologiczne badania monitoringowe 
powinny zatem uwzględniać:
–  mikrobiologiczną ocenę surowców,
–  higienę zakładu (personelu, urządzeń 

i pomieszczeń produkcyjnych),

–  konfekcjonowanie, dystrybucję i trans-

port produktów oraz ich przechowy-
wanie.
Monitorowanie, w tym rutynowa 

kontrola jakości i bezpieczeństwa surow-
ców oraz gotowych produktów, wymaga 
posługiwania się odpowiednimi i specy-
ficznymi dla mikrobiologii wskaźnika-
mi. Wskaźniki mikrobiologiczne można 
podzielić na:
–  wskaźniki jakości produktu (oznacze-

nie typowych, pożądanych bądź też 

nietypowych i niekorzystnych mikro-
organizmów oraz ich metabolitów, 
które można szybko zidentyfikować 
i oznaczyć),

–  wskaźniki bezpiecznej żywności (wykry-

wanie niepożądanych i patogennych 
mikroorganizmów w sposób szybki, 
łatwy i pewny, np. E. coliEnterobacter
KlebsiellaSalmonellaListeria monocy-
togenes
Staphylococcus aureus),

–  wskaźniki matematycznego mode-

lowania wzrostu niepożądanych mi-
kroorganizmów w danym produkcie, 
służące do przewidywania jakości mi-
krobiologicznej żywności (Predictive 
Microbiology
).

  

CHARAKTERYSTYKA 
TECHNIK DETEKCJI

Największą uwagę skupia się obecnie 
na szybkich metodach detekcji mikroor-
ganizmów i ich automatyzacji. Praktycz-
ne znaczenie mają testy biochemiczne 
do identyfikacji mikroorganizmów. Naj-
bardziej znanymi testami biochemicznymi 
są testy API. W zasadzie oparte są one 
na prostych reakcjach chemicznych, któ-
re zachodzą w podłożach wzrostowych; 
niekiedy zachodzi potrzeba dodania 
do podłoża po inkubacji odpowiedniego 
odczynnika. Do badań używa się także 
mikrotitrera płytkowego, wykorzystujące-
go inokulację za pomocą wielopunktowej 
pipety inokulacyjnej. W badaniach mi-
krobiologicznych stosowane są również 
testy immunoenzymatyczne, które oparte 
są na metodach ELISA. Służą one głównie 
do szybkiego wykrywania drobnoustro-
jów patogennych, takich jak: Salmonella, 
Listeria, Staphylococcus, E
. coli 0157:H7. 
Do identyfikacji pałeczek Salmonella 
oraz gronkowców chorobotwórczych 
stosowane są testy serologiczne, czyli te-
sty hemaglutacyjne oraz testy lateksowe. 
Modyfikacją płytkowej metody oznacza-
nia liczby mikroorganizmów w produk-
tach jest Petrifilm, złożony z podwójnej 
warstwy zawierającej podłoże wzrostowe 
w postaci żelu rozpuszczalnego w zimnej 
wodzie i tworzącego błonkę. Petrifilmy 
służą do oznaczenia ogólnej liczby bak-
terii tlenowych, drożdży i pleśni oraz 
E. coli. Inna metoda to zastosowanie 
płytki pokrytej podłożami, w przypadku 
której posiew przeprowadza się przez za-
nurzenie, pocieranie lub metodą kontak-
tową (dociskową). Wykorzystywany jest 
także system płytki spiralnej, polegający 
na rozprowadzeniu płynnej próbki na po-

reklama

ANALIZATOR 

BAKTERII

MODEL

BACTRAC 4300

Cechy:

t

   w pełni zautomatyzowany 

pomiar

t

 metoda 

impedancyjna

 

z pomiarem parametrów

 

M i E

t

 zastępuje 

metodę

 płytkową

t

 redukuje 

kilkakrotnie

 czas 

detekcji

 mikroorganizmów

t

 

łatwa preparatyka dla analiz 
ilościowych i jakościowych

t

 redukuje 

koszta

 

analizy i nakład pracy

t

wysoka wydajność

 

(do 64 stanowisk

 pomiarowych
 

i powyżej, aż do 768)

t

  upraszcza i kompletuje

 dokumentację 

analiz 

Zastosowania:

t

 screening 

patogenów

t

  całkowita liczba bakterii

t

 testy 

sterylności

t

 detekcja 

wzrostu

 mikroorganizmów

t

 testy 

aktywności

t

 kinetyka 

wzrostu

t

 testy 

inhibitorów

t

  analiza grzybów i pleśni

t

 optymalizacja 

składu

 artykułów 

spożywczych

t

 badania 

biofilmów

 

i wiele innych

Legislacja:
*DIN 10115/10120
+ §35 LMBG,
OeNORM,
GOSSTANDARD, AFNOR

zzzÝv|odqwÝso

inż. JÓZEF NITKA

44-172 Niewiesze k. Gliwic, ul. Pyskowicka 12

tel. 032 230 32 01, fax 032 230 33 01

e-mail: info@sylant.pl

ANALIZATOR

background image

L A B O R A T O R I U M   5 / 2 0 0 9

 

|

. . .

W

 

L A B O R A T O R I U M

 

12

wierzchni i tworzeniu spirali Archime-
desa poprzez osadzenie smugi zawiesiny 
w strumieniu próby zmniejszającym  się 
od środka płytki do brzegów.

Metoda Droplette polega na zmie-

szaniu rozcieńczonej próby z upłynnio-
nym podłożem agarowym w stosunku 
1:9. Następnie zaszczepione podłoże 
nanosi się w postaci kropelki o objętości 
0,1 ml na plastikowe płytki i po skoń-
czonym czasie inkubacji liczy się mi-
krokolonie. Kolejną metodą są pomiary 
turbidymetryczne. Analizator Bioscreen 
jest całkowicie zautomatyzowanym syste-
mem analizy. Złożony jest z inkubatora, 
wytrząsarki i automatycznego urządzenia 
do jakościowego i ilościowego wykrywa-
nia mikroorganizmów. Próby lub ich roz-
cieńczenia są zaszczepiane automatycznie 
w płytkach mikrotitrera. Wzrost mikroor-
ganizmów monitoruje się przez pomiar 
gęstości optycznej co 10 minut.

Mikroskopia fluorescencyjna DEFT 

ma szczególne znaczenie w ocenie jakości 
bakteriologicznej mleka i mięsa oraz przy 
produkcji piwa. Technika ta obejmuje 
filtrowanie próby wstępnie traktowanej 
enzymem celem lepszej filtracji próby 
i separacji optycznej bakterii od otacza-
jącego tła. Oranż akrydyny barwi osiadłe 
bakterie, a żywe komórki świecą na po-
marańczowo lub żółto, natomiast martwe 
– na zielono. Modyfikacją tej metody jest 
membrane filter microcolony fluorescent me-
thod
 (MMCF), stosowana do oceny ilości 
drożdży i pleśni w piwie. Unieruchomione 
na filtrach mikroorganizmy hoduje się 
na selektywnych podłożach agarowych, 
umożliwiających tworzenie się mikrokolo-

ni, które następnie barwione są oranżem 
akrydyny. Niebieskie mikrokolonie liczo-
ne są w mikroskopie fluorescencyjnym 
lub za pomocą analizatora.

Kolejną metodą jest pomiar aktywności 

metabolicznej oparty na testach redukta-
zowych, metodzie impedymetrycznej, mi-
krokalorymetrii, cytometrii przepływowej, 
biosensorach i pomiarze ilości enzymów. 
Testy reduktazowe bazują na obserwacjach 
zmian zachodzących w pożywkach w wy-
niku aktywności metabolicznej mikroorga-
nizmów. Enzymy bakteryjne, takie jak np. 
dehydrogenaza, przenoszą atom wodoru 
z substratu na barwniki typu redox, powo-
dując zmianę ich zabarwienia. Aktywność 
enzymu jest zależna od liczby mikroorga-
nizmów, a miernikiem ich ilości jest czas, 
w którym zajdzie zmiana zabarwienia 
stosowanego barwnika redox. Stosuje się 
takie barwniki, jak: błękit metylenowy, 
resazuryna i chlorek tetrazoliowy.

Metoda impedymetryczna jest pomia-

rem oporności, jaką stawia podłoże dla 
prądu zmiennego. Wykorzystuje się w niej 
najnowszy analizator mikrobiologiczny 
BacTrac. Kompleksowe składniki pożywek 
(sacharydy, białka, tłuszcze) są katabolizo-
wane do naładowanych produktów meta-
bolizmu, takich jak: aminokwasy, kwasy 
organiczne i inne niskocząsteczkowe me-
tabolity. Rozwój mikroorganizmów pro-
wadzi do obniżenia całkowitej impedancji 
podłoża. Miernikiem detekcji mikroor-
ganizmów jest czas detekcji, po którym 
następuje mierzalna zmiana impedancji 
środowiska. Do określenia profilu wzro-
stu drobnoustrojów skażających próby 
wykorzystywane są pomiary dwóch para-

metrów impedancyjnych próbki: M-value 
(impedancja podłoża) i E-value (impe-
dancja elektrod). Mierzalna impedancja 
środowiska następuje, gdy liczba bakterii 
osiąga poziom 10

komórek, a drożdży 

i grzybów – po osiągnięciu poziomu ok. 
10

4

 komórek. Stosując tę technikę, można 

określić całkowitą liczbę mikroorganizmów, 
a po zastosowaniu pożywek selektywnych 
również bakterii chorobotwórczych, droż-
dży i pleśni. Technika ta znajduje zasto-
sowanie w analizie mleka, soków, jarzyn, 
produktów mlecznych i przypraw. Zna-
mionuje ją szybkie testowanie aktywności 
szczepionek przed ich wprowadzeniem 
do procesów fermentacyjnych.

Mikrokalorymetria oparta jest na zja-

wisku wydzielania się ciepła podczas 
wzrostu mikroorganizmów. Minimalny 
poziom tworzenia ciepła dają próby za-
wierające ok. 1000 bakterii/ml.

Cytometria przepływowa opiera się 

na pomiarze fizycznych i niekiedy che-
micznych cech komórek, które są zawie-
szone w roztworze i pojedynczo przepły-
wają przez sensory optyczne. Komórki 
poruszają się w płynie o szybkości prze-
pływu od 10 m/s do 20 m/s; po oświe-
tleniu ich światłem rejestruje się liczbę 
i rozmiar cząsteczek. W tej metodzie 
wykorzystuje się również znakowanie 
składników komórkowych, takich jak: 
białka, kwasy nukleinowe, lipidy czy 
antygeny powierzchniowe, za pomocą 
fluorochromów. Metodę tę stosuje się 
do określenia ogólnej liczby drożdży i pa-
łeczek mlekowych, coraz częściej jednak 
wykorzystywana jest też do wykrywania 
poszczególnych grup mikroorganizmów. 

M

ikroskopia 

fluorescencyjna DEFT 

ma szczególne znaczenie 

m.in. w ocenie jakości 

bakteriologicznej mleka.

fot

. Shutt

erst

ock

background image

. . .

W

 

L A B O R A T O R I U M

 

|

L A B O R A T O R I U M   5 / 2 0 0 9

13

Biosensory dają sygnał w odpowiedzi 
na zmiany środowiskowe, reagując np. 
na ciepło, światło i pH. Sensorami są róż-
nego typu elektrody.

Bakterie z rodzaju Enterobacteriaceae 

wytwarzają enzym ß-D-glukuronidazę. 
Jest on produkowany przez E. coli i część 
szczepów z rodzaju ShigellaSalmonella 
Arizona. Pozostałe bakterie z rodziny 
Enterobacteriaceae  nie wytwarzają tego 
enzymu. MUG jest substratem, który 
pozwala dość szybko wykryć aktywność 
tego enzymu. Związek ten, w wyniku 
hydrolizy przez enzym glukuronidazę, 
ulega rozkładowi z wydzieleniem 4-me-
tyloumbeliferolu, wykazującego niebieską 
fluorescencję w świetle UV.

Kolejną metodą jest pomiar metabo-

litów pośrednich lub produktów koń-
cowych. Oznacza się np. pirogronian. 
W tym celu wykorzystuje się metodę enzy-
matycznej redukcji kwasu pirogronowego 
przez dehydrogenazę mleczanową.

Inną znaną metodą jest biolumine-

scencyjny pomiar ATP. Wszystkie żywe 
komórki zawierają ATP – nukleotyd, 
który pełni rolę magazynu energii. Stę-
żenie ATP może być mierzone w prosty 
sposób w reakcji z zastosowaniem lucy-
feryny i lucyferazy. W wyniku tej reakcji 
wydzielane jest światło w ilościach rów-
noważnych do ilości ATP. Stosując tę me-
todę, w ciągu 1 minuty można ocenić 
stan sanitarny powierzchni.

Test LAL jest szybką metodą wykrywa-

nia endotoksyn, czyli obecności bakterii 
G(-). Składają się one z kompleksów lipi-
dów i polisacharydów o różnym składzie 
chemicznym. Techniki radiometryczne 
są oparte na pomiarze pobierania lub 
znakowania substratów lub produktów. 
Najczęściej stosowane metody radio-
metryczne wykorzystują pomiar 

14

CO

2

 

– tworzonego przez mikroorganizmy 
w wyniku metabolizowania znakowanych 
izotopowo substratów, np. glukozy czy 
laktozy, wprowadzonych do podłoża 
hodowlanego. Szybkość czasu detekcji 
jest skorelowana z początkową liczbą 
mikroorganizmów w badanej próbie. 
Trudność w usuwaniu odpadów izoto-
powych wyklucza tę metodę z zastoso-
wań w analizie żywności. Różnicowanie 
do rodzajów możliwe jest na podstawie 
analizy lotnych produktów końcowych 
przy pomocy chromatografii gazowej. 
Można stosować ją do bakterii z rodza-
ju  Bacillus  i  Clostridium. W przypadku 
oznaczeń dotyczących grzybów możliwa 

jest charakterystyka ściany komórkowej, 
która zawiera chitynę, oraz membran 
cytoplazmatycznych, zawierających er-
gosterol. Poziom ergosterolu świadczy 
o jakości żywności i może być oznacza-
ny za pomocą chromatografii HPLC, 
chromatografii gazowej i cienkowarstwo-
wej oraz spektrometrii w ultrafiolecie 
i podczerwieni.

  

NAJNOWOCZEŚNIEJSZE 
METODY

Biologia molekularna stanowi najno-
wocześniejsze narzędzie do oznaczeń 
mikrobiologicznych. Można stosować 
sondy, które łączą się z określonym 
mikroorganizmem, wirusem czy też 
specyficznym składnikiem organizmu, 
a następnie wykorzystywać detekcję 
kompleksu sonda – analizowany skład-
nik. Najczęściej stosowanymi sondami 
są kwasy nukleinowe do detekcji DNA 
lub RNA oraz cząsteczki przeciwciał 
do detekcji białek, węglowodanów lub 
lipidów. Jeżeli sekwencja zasad w son-
dzie jest komplementarna do sekwen-
cji charakterystycznej dla oznaczanego 
mikroorganizmu, wówczas sonda wiąże 

się jedynie z DNA oznaczanego mikro-
organizmu. W oznaczeniach systemu 
Gene-Trak stosowane są fluorescencyj-
nie znakowane sondy DNA, natomiast 
w systemie Gene-Probe wykorzystywane 
są sondy znakowane akrydynowym es-
trem. W obydwu systemach oligonukle-
otydowe sondy DNA są komplementarne 
wobec charakterystycznych dla anali-
zowanego mikroorganizmu sekwencji 
rybosomalnego RNA. RRNA występuje 
w komórce w dużej liczbie kopii, ponie-
waż jest integralną częścią bakteryjnego 
rybosomu. Analiza taka składa się z czte-
rech etapów. Lizę próbki dla bakterii 
G(-) powoduje zasadowe środowisko, 
a dla G(+) wspomaga się ją lizozymem. 
Następnie następują hybrydyzacja, zwią-
zanie hybrydu i detekcja. Do unikalnych, 
sąsiadujących ze sobą regionów tej samej 
cząsteczki rRNA testowanego organizmu 
dodawane się dwie sondy wykazujące 
homologię. Jedna umożliwia wiązanie 
hybrydu z nośnikiem dzięki połącze-
niu do jej 3’ końca poli dA, natomiast 
druga służy do detekcji, gdyż do jej oby-
dwu końców przyłączone są specjalne 
związki chemiczne wywołujące zmianę 

reklama

background image

L A B O R A T O R I U M   5 / 2 0 0 9

 

|

. . .

W

 

L A B O R A T O R I U M

 

14

barwy lub luminescencję. Wstawienie 
do testowanej mieszaniny stałego no-
śnika zawierającego poli dT umożliwia 
wychwycenie powstających wcześniej 
hybrydów. Detekcja odbywa się poprzez 
pomiar zmiany barwy (Gene-Trak) lub 
luminescencji (Gene-Probe) wywołanych 
po zanurzeniu nośnika z przyłączonym 
hybrydem w specjalnych odczynnikach. 
Sondy wymagają obecności 10

5

-10

6

 ko-

pii charakterystycznej sekwencji DNA. 
Można to pokonać poprzez powielenie 
DNA charakterystycznego mikroorga-
nizmu techniką PCR. Inną metodą jest 
analiza poliformizmu miejsc restrykcyj-
nych RFLP. Polega ona na wyizolowaniu 
DNA z testowanego mikroorganizmu, 
trawieniu odpowiednio dobranymi en-
zymami restrykcyjnymi i rozdzieleniu 
ze względu na wielkość powstających 
fragmentów DNA metodą elektrofore-
zy żelowej. Następnie rozdzielane frag-
menty przenoszone są na membranę 
i dodawana jest chemiluminescencyjnie 
znakowana, specyficzna sonda genetycz-
na. Z różnorodności sekwencji wynika 
obecność miejsc restrykcyjnych lub ich 
brak, a konsekwencją tego jest hybrydy-
zacja sond z fragmentami o różnej wiel-
kości. Sondy pozwalają uzyskać rozkład 
prążków unikalny dla danego szczepu 
mikroorganizmu.

Metody immunologiczne bazują 

na zastosowaniu przeciwciał reagujących 
z antygenami obecnymi na powierzch-
ni testowanego mikroorganizmu. Naj-
powszechniej stosowaną techniką jest 

TECHNOLOGIA DETEKCJI

ZALETY

WADY

Hybrydyzacja „kanapkowa”  (sandwich 
hybridisation) – Advantages of HybriScan®

–  różnicowanie żywych/martwych komórek, 

minimalna interferencja z matrycą próbki, 
wysoka specyficzność,

–  łatwe wiązanie (hybrydyzacja),
–  możliwość oznaczania wielu próbek (płytka 

z 96 mikrostudzienkami),

–  oznaczenia jakościowe i ilościowe,
–  detekcja mikroorganizmów nie rosnących 

w warunkach laboratoryjnych

–  nierozróżnianie serotypu lub podgatunku,
–  limitowane przeznaczenie sondy

PCR

– duża wydajność,
– czułość,
– oznaczenia ilościowe

–  brak rozróżnienia między żywymi i martwymi 

komórkami,

–  duża interferencja z matrycą,
– inhibicja polimerazy

ELISA

–  rozróżnianie serotypu lub podgatunku,
–  możliwość oznaczania wielu próbek (płytka 

z 96 mikrostudzienkami),

–  oznaczenia jakościowe i ilościowe 

– niska czułość,
–  niska specyficzność, reaktywność krzyżowa,
–  wolna i droga procedura

Metody konwencjonalne
(bazujące na hodowli komórek)

– relatywnie niedrogie,
– proste procedury,
– specyficzne,
–  szeroko akceptowane metody

–  czasochłonne (około 10 dni),
–  brak detekcji mikroorganizmów nie 

rosnących w warunkach laboratoryjnych,

– niska wydajność,
–  wymagają dużego nakładu pracy

Tabela 1. Wady i zalety różnych technik detekcji mikroorganizmów (na podstawie Advantages of HybriScan

®

 over other detection techniques, pobrano ze strony internetowej www.sigmaaldrich.com)

metoda immunoenzymatyczna ELISA. 
Przeciwciało w stosunku do testowanego 
mikroorganizmu połączone jest z enzy-
mem. Po reakcji przeciwciało – antygen 
obmywany jest nadmiar przeciwciała, 
a obecność organizmu może być stwier-
dzona przez dodanie odpowiedniego 
substratu, zmieniającego kolor w obec-
ności enzymu. Zmiana koloru dowodzi 
obecności danego organizmu. W technice 
immunologicznej stosowane są latekso-
we, różnokolorowe kuleczki, specyficzne 
dla poszczególnych mikroorganizmów. 
Obecność testowanych organizmów 
w roztworze powoduje łączenie się 
ze sobą kuleczek ze względu na reakcję 
przeciwciała z antygenami obecnymi 
na powierzchni drobnoustrojów, co jest 
widoczne w formie powstających agrega-
tów. Przeciwciała mogą być przyłączone 
do kuleczek magnetycznych i wówczas 
komórki testowanych organizmów będą 
się z nimi łączyć. Magnes umieszczony 
pod pojemnikiem z testowaną próbką 
powoduje przyciąganie kuleczek wraz 
z testowanymi drobnoustrojami i oczysz-
czenie roztworu. Immunomagnetyczna 
separacja usuwa określone mikroorga-
nizmy i stosowana jest do usuwania 
komórek Salmonella z przypraw i E. coli 
0157:H7 z żywności. Jeśli przykłado-
wo przeciwciała szczepów Salmonella 
połączymy z czerwonymi kuleczkami, 
a z niebieskimi – przeciwciała Listeria 
spp
., to istnieje możliwość identyfiko-
wania obecności kilku rodzajów mikro-
organizmów.

Kolejną metodę stanowi identyfikacja 

widma w podczerwieni, które jest odzwier-
ciedleniem składu chemicznego komórek 
mikroorganizmów. Reprezentuje ono biał-
ka, elementy ściany komórkowej i błony 
cytoplazmatycznej oraz kwasy nukleinowe. 
Analiza korelacji widm umożliwia różnico-
wanie szczepów. Jednakże niektóre z obser-
wowanych prążków mogłyby już obecnie 
być przypisane grupom funkcyjnym okre-
ślonych związków chemicznych struktur 
komórkowych. Widma w podczerwieni 
są unikalne dla poszczególnych organizmów, 
więc dysponując odpowiednimi bazami 
danych, można je porównać, i obliczając 
współczynnik korelacji, ustalić przyna-
leżność diagnostyczną mikroorganizmu.

Szybką i wiarygodna metodą identy-

fikacji i klasyfikacji mikroorganizmów 
jest spektrometria MALDI-TOF (matrix-
 -assisted laser desorption/ionization-time
of flight
). Współczesne systemy spektrome-
trii MALDI-TOF umożliwiają wykonanie 
analizy pozwalającej na jednoznaczną 
identyfikację bakterii, drożdży czy grzy-
bów w ciągu kilku minut.

Zalety i wady wybranych technik de-

tekcji mikroorganizmów przedstawiono 
w tabeli 1. Wybór właściwej techniki 
warunkowany jest czasem, jakim dyspo-
nuje się do momentu uzyskania wyniku, 
ściśle sprecyzowanym celem i zakresem 
identyfikacji, liczbą próbek oraz akcep-
towanymi kosztami analiz. 

Piśmiennictwo dostępne na stronie

www.laboratorium.elamed.pl

background image

Piśmiennictwo

1. Stanley P.E., McCarthy B.J., Smither R.: ATP – Luminescence rapid methods 

in microbiology. Blackwell Sci. Pub., Oxford 1989.

2. Barker J.M., Griffiths M.W., Collins-Thompson D.L.: Bacterial bioluminescence 

applications in food microbiology. „J. Food Prot.”, 1992, 55, 62-70.

3. Czajkowska D.: Nowoczesne metody diagnostyczne w mikrobiologii żywności

Materiały Konferencji Naukowej „Bezpieczeństwo mikrobiologiczne produkcji 

żywności”, PTTŻ, Warszawa 1997, 83-93.

4. Czaczyk   K.,   Trojanowska   K.:  Zastosowanie   szybkich   metod   oznaczania   i 

identyfikacji drobnoustrojów. „Przemysł Spożywczy”, 2006, 2, 14-21.

5. Palka   R.:  Zastosowanie   osiągnięć   biologii   molekularnej   w   mikrobiologii  

żywności. „Przemysł Spożywczy”, 2007, 2, 6-8.

6. Sałek   A.:  Nowoczesne   metody   badań   mikrobiologicznych.  „Przemysł 

Spożywczy”, 2004, 2, 28-32.

7. Ilinicka-Olejniczak O., Hornecka D.: Prognozowanie w mikrobiologii żywności

„Przemysł Spożywczy”, 1995, 2, 57-58.

8. HybriScan

®

 

Rapid   Test   Systems. 

Materiały   reklamowe

 on-line

www.sigmaaldrich.com.

9. Meng   J.,   Doyle   M.P.:  Introduction.   Microbial   food   safety.  „Microbes   and 

Infection”, 2002, 395-397.