W 23.04

Interferencja RNA - kompleksy enzymatyczne są niszczone

Regulacja postranskrypcyjna

-składanie mRNA

splicing Sharp dostał Nobla za snRNA występują w kompleksach z białkami (snRP) i służą jako podpórka gdy pęknie egzon - intron; tworzy strukturę, by ligaza połączyła egzony ze sobą

Alternatywne składanie mRNA... nie zawsze

Tom Cech (nobel 1989)- wykrył, że są przypadki w genie rRNA jest intron, który się sam wycina; self-splicing samoskładanie RNA; atak nukleofilowy, bez udziału enzymów.Sklonował ten gen na RNA E.Coli bo u prokariota nie ma intronów, i te introny były wycinane. Wycinanie intronów to relikt prehistoryczny

- rybozymy - enzymy z RNA

Edytowanie RNA

• gotowa cząsteczka nie koduje białka i zyskuje sensowny zapis kiedy dodane są głównie uryny i powstaje białko o innym składzie aminokwasowym

• guide RNA - naprowadzające RNA u Trypanosoma zmienność białek

• u wyższych organizmów edytowanie mRNA apolipoproteiny B

• kodon CAA może być zmieniony na UAA (stop) powstanie krótsze białko

• edytowanie zachodzi tylko w jelitach a w wątrobie powstaje normalne białko

Modyfikacje białek

• dołączenie ubikwityny

• acetylacja

• metylacja

• małe białka działąją i łacza się - sumoilacja powstają z określonymi białkami

• ubikwitynowane białko jest sumoilowane i to białko jest likwidowane przez proteazy (SUMOilacja)

• białka chaperoniny - ochraniają białka przed degradajcą procesy zachodzące na poziomie białka

• wyciszanie genów

Wirusy onkogeniczne u zwierząt poznano dużo wcześniej niż u człowieka

-wirus RSV - mięsak - komórki rakowe dzielą się w sposób niekontrolowany i nie mają inhibicji konaktowej; powstaje ognisko komórek nowotworowych; bezładny podział (guzy); powstają naczynia oplatające guzy, bo muszą być one odżywione

• linie komórek 3T3 - mysie fibroblasty - łątwo ulegają transformacji nowotworowej; można na nich sprawdzać czy coś jest rakotwórcze czy nie

• wprowadzanie do badań nagich myszy - mają słąby system immunologiczny; łatwiej zapadjaa na choroby nowotworowe; komórki nowotworowe mają antygeny i system obronny (limfocyty) rozpoznają ją i niszczą

• z wiekiem układ odpornościowy słabnie i nie niszczy kom. rakowych

• nagim myszom wstrzykuje się coś i sprawdza czy coś jest rakotwórcze

• p 53 - supresor nowotworowy wirusy onkogeniczne

• z DNA na RNA

• DNA - sr40,adenowirusy, herpes i papiloma (rak szyjki macicy) w pewnym czasie po infekcji transformacja komórek nowotworowych trudne do wyleczenia

• Ludzie który przeszli żółtaczkę mają większą szansę na zachorowanie na żółtaczkę

Sr40

• wirus nerki małpiej

• DNA

• 2 antygeny T - późny i T-wczesny; onkogenne

• powoduje zniszczenie komórek nerki małpiej,a u człowieka nie niszczy ale powoduje transformację nowotworową

Adenowirus

• 2 geny (E1a i E1b) z których powstają transkrypty i białka powodują transformacje używane jako wektory w terapii genowej

• DNA- wirus; może przetrwać w komórce w formie DNA razem z genem, który wszczepiony (leczenie SCIT)

Retrowirus

• materiałem jest RNA i są najważniejszą grupą wirusów onkogenicznych

• ma 2 otoczki : zewnętrzną i wewnętrzną (z białek błony komórkowej gospodarza - zewnętrzna i wewnętrzna z białek kodowanych przez gen gag ) w środku 2 kopie RNA; odwrotna transkryptaza - potrafi przepisać informację z RNA na DNA (enzym) przepisuje swoje RNA na DNA

Drzewo filogenetyczne retrowirusów

• odwrotna transkryptaza RNADNARNA

• powtarzają się sekwencje ppt, U3 i U 5 na końcach

• starter RNA wozi się w wirusie

• starter przeskakuje na drugą nić powstaje 2- niciowe DNA zintegrowane z chromosomem gospodarza

• odwrotna transkryptaza - Baltimore ja wyizolował i dostal Nobla ; ważne narzędzie

Genom retrowirusa

• geny gag

• - pol - polimeraza - gen na nią

• env - gen na otoczkę wewnętrzną

• LTR - długie terminalne powtórzenia na końcach by cząsteczka mogła się integrować z DNA gospodarza

• transpozony - ruchome elementy genetyczne

• retrowirusy też są ruchomymi elementami (retrotranspozony) w genomach organizmów wyższych

• H.E. Varmus - Nobel za pochodzenie wirusowych onkogenów. Retrowirusy to łągodne onkogeny i mogą przechodzić w formy ostre.