1. Które z poniższych dotyczących operonu tryptofanowego sa poprawne?

1. transkrypt operonu tryptofanowego koduje 5 enzymow przekształcających choryzmian w tryptofan

2. transkrypcja operonu trp jest regulowana miedzy innymi przez ……..odcinka liderowego (translację?)

3. tryptofan pelni role korepresora, gdyz może bezpośrednio ... (rozpycha podjednostki, pozwala na związanie DNA przez represor)

4. liderowy mRNA koduje krotki „peptyd testowy” (costam sobie koduje, zwał jak zwał, ważne czy się rybosom zatrzyma czy nie)

5. w przypadku niedoboru trp???

6. w przypadku mutacji w obrębie sekwencji Shine-Delgarno….???

2. Które z poniższych dotyczących sygnałów rozpoczynających i kończących transkrypcje są poprawne?

1. za prawidłowe rozpoznanie miejsca startu transkrypcji odpowiada podjednostka α polimerazy RNA (podjednostka σ)

2. Typowe promotory E.coli zawierają w obrebie -10 tzw. kasetę TATA o sekwencji zgodnej TATAA (u prokariota -10 TATAATA, -35 TTGACA, u eukariota kaseta TATA, CAT, GC,)

3. promotory genow szoku cieplnego roznia się w sposób zasadniczy od typowych promotorów rozpoznawanych przez inne warianty odpowiedniej podjednostki polimerazy RNA

4. sygnałem terminacji transkrypcji jest część RNA o strukturze spinki do włosów przed kilkoma resztami UUUU (lub sekwencja rozpoznawana przez białko rho)

5. heksametryczne bialko rho jest ATPazą w obecności jednoniciowego RNA i uczestniczy terminacji transkrypcji niektorych genow E.coli

6. u E.coli wyspecjalizowane sygnaly terminacji transkrypcji zwane atenuatorami dostosowują poziom transkrypcji określonych genów do potrzeb pokarmowych komorki

3. Które na temat aminoacylo-tRNA są poprawne?

1. wiazanie estrowe w aminoacylo-tRNA tworzone jest miedzy grupa karboksylowa aminokwasu a gr fosforanowa tRNA (estryfikacja gr. karboksylowej aminoklwasu grupą 3'-OH (lub 2') tRNA)

2. dla każdego aminokwasu istnieje inny enzym katalizujący tworzenie odpowiedniego tRNA (conajmniej jeden)

3. rodzaj aminokwasu przyłączanego do tRNA zależy od rodzaju syntetazy aminoacylo-tRNA, której jest on jest substratem (to enzym decyduje o specyficznym wiązaniu aminokwas-tRNA)

4. niektóre syntetazy aminoacylo-tRNA posiadają aktywność korekcyjna……….. niewłaściwym tRNA

5. wszystkie syntetazy aminoacylo-tRNA rozpoznają właściwy tRNA rozpoznając (niektóre rozpoznają na podstawie sekwencji antykodonu, ale mogą też inne elementy struktury)

6. aminokwas połączony z tRNA odgrywa istotną role w rozpoznaniu (czego?!)

4. Które z poniższych jest poprawne dla translacji u prokariota?

1. poszukiwanie pierwszego kodonu AUG od 5' końca transkryptu (e eukariota pierwszy kodon AUG jest startem u prokariota musi być sekwencjwa inicjatorowa)

2. Formylometionylo-tRNA_f powstaje w reakcji:

formylometionina+tRNA_f+ATP+H₂O-----fMet-tRNA

(poprawnie Met + tRNA-> Met-tRNA + N¹⁰-formylotetrahydrofolian-> fMet-tRNA)

3. czynnik elongacyjny Ts(EF-Ts) wiąże nukleotyd GTP (GTP wiążą EF-Tu i EF-G)

4. czynnik elongacyjny Tu(EF-Tu) oddziałuje ze wszystkimi miejscami na rybosomie (A, P, E, nieprawda - wiąże się z miejscem wiązania EF-Tu, a jego koniec karboksylowy oddziaływuje z miejscem A)

5. fMet-tRNA_f inicjatorowy wiąże się w przeciwieństwie do pozotałych tRNA w miejscu P rybosomu (inne najpierw wiążą się z miejscem A)

6. Peptydylo-tRNA może znajdować się zarówno w miejscu P rybosomy , jak i w A, w zależności od fazy cyklu translacyjnego

5. Pytania na temat syntezy białka u Prokaryota ?

1. hydroliza GTP przez czynnik elongacyjny EF-Tu umożliwia uwolnienie

2. energia potrzebna do utworzenia wiązań peptydowych ……. peptydylotransferazę (?)

3. Puromycyna powoduje przedwczesną terminację łańcucha działając jako analog aminoacylo-tRNA

6. Które dotyczące transkrypcji genow u E.coli sa prawdziwe??

1. produktem może być policistronowy mRNA

2. faza elongacji podczas transkrypcji jest przeprowadzana przez rdzen polimerazy

3. polimeraza RNA wykazuje aktywność egzonukleazowa, która umozliwia jej korekcję błędów ( w ogóle nie ma akt. nukleazowej)

4. rRNA(tzw.odwrotny RNA, ) jest syntetyzowany w kierunku odwrotnym do typowego 5'---3' stąd jego nazwa (rybosomowy RNA, wszystkie RNA są syntezowane 5'->3')

5. Pre-mRNA podlega procesowi składania(slipingu) jeszcze zanim zajdzie translacja (splicing u eukariotów!)

6. ekspresja genow jest kontrolowana głównie na poziomie transkrypcji

7. Co jest prawdą dla eukariota?

1. ponieważ transkrypcja zachodzi w jadrze komórkowym a translacja w cytoplazmie konieczny jest transport transkryptow z jadra do cytozolu

2. ponieważ wszystkie pierwotne transkrypty zawieraja introny konieczny jest splicing

3. pierwotne transkrypty tRNA podlegaja intensywnej obróbce potranskrypcyjnej, po……. transestryfikacji zbliżone mechanizmem do splicingu pre-mRNA (nie wiem jaki jest mechanizm, więc nie wiem, czy jest zbliżony)

4. struktura określana mianem „kap” tworzona jest na końcu 5' większości mRNA

5. większość genow kodujących mRNA jest rozcinana przez endonukleazę rozpoznająca odpowiedni sygnał, a następnie do końca 3' dadawny jest ogon poliA przez polimerazę poli(a)

6. cząsteczki pre-mRNA kodujące część białek podlegają procesowi redagowania co, sprawia, że częsć transkryptu nie jest w pełni zgodna z sekwencja odpowiedniego ekzonu w genie kodującym

8. Które z ponizyszych stwierdzen o roli bialek ochronnych w …

a)wiaza się one z rosnącym łańcuchem polipeptydowym ,utrzymuje…

b)umożliwiają one zwykle niedozwolone interakcje pomiedzy czasteczkami

c)sa powolnie działającymi ATPazami

d)przykładem takich bialek jest kinaza bialek szoku termicznego hsp 70

e)Kompleks ADP-chaperon ma duze powinowactwo do bialek rozfaldowanych

f)żadna z odp nie jest prawidlowa

9. Miejsce wazne w splicingu spliceosomu

1. Gr 2OH (m. rozgałęzienia) atakuje

2. Gr adenylo-2OH (m. rozgałęzienia) atakuje (jak wyżej)

3. E1 tworzy lasso (intron)

4. 3OH E1 atakujeE2

5. 5OH E1 atakuje E2

6. Zajdzie splicing

7. To nie skroci produktu

8. Powstanie takie samo bialko

10. Gdzie zachodzi aktywny splicing przez spliceosomy

ATP nie ma nic wspolnego

Tworzy się lasso

Taki pierwotny transkrypt - pre-mRNA - musi jednak zostać poddany obróbce posttranskrypcyjnej, aby można go było wykorzystać do translacji. W przeciwnym wypadku mRNA po wydostaniu się zjądra zostałoby zniszczone w cytozolu przez białka, których zadaniem jest niszczenie kwasów nukleinowych. 

11. Kompleks cAMP-CAP

1. chroni przez DNAza -87 do -49

2. po jego związaniu do atenuatora trp może być transkrypcja genow struktury (nie wiaze się do miejsc atenuatora)

3. represor transkrypcji (aktywator)

4. w operonie ara wpływa na geny struktury (aktywuje transkrypcje)

5. chroni miejsca -48 do +5 (polimeraza)

6. w obecności arabinozy wpływ na geny struktury

12. Bialko C operonu ara

1. wiaze z araO1 hamujac transkrypcje genu

2. wiaze araO2 aktywuje geny struktury (represor)

3. w obecności cAMP-CAP aktywuje transkrypcję genów struktury przez przyłączenie arabinozy i związanie do araO₁ i araI

4. powoduje wypetlenie gdy zwiaze się z araO2 i araI

5. wiaze się specyficznie z DNA w obecności arabinozy (wiąże się w obecnoci i nieobecnosci, zmienia się specyfika wiązania)

13. Bakteriofag λ

1. syntetyzuje tylko represor λ w bakterii lizogenicznych

2. ssDNA zw. z recA oddzialywuje na represor λ

3. zostaje uwolnione z chromosomu bakteryjnego z kompleksu rexDNA (związanie ssDNA-recA powoduję degradację represorów λ i recA)

4. gdy nic nie atakuje/zmienia to w fazie lizogenicznej jest on obecny w formie profaga z uwagi na represor który ulega autoregulacji

5. profag (DNA) jest także lizogenicznej gdy nie aktywuje zmiany bo represor λ

6. cro wiaze się do or3 i wtedy hamuje represor (gen c1 - syntezę represora)

7. bialko cro związany z or1 to hamuje synteze represora (Or3)

14. Operon arabinozowy

1. konstutywna synteza bialka C

2. w obecności cAMP-CAP i arabinozy nie da się zapętlić

3. cAMP-CAP i arabinoza przeprowadza transkrypcje genow struktury,

4. cAMP-CAP i arabinoza nie znacznie obniżają szybkość

5. może syntezowac ara przy wykorzystaniu bialek powstałych z bialek (?)

15. Odcinek liderowy mRNA

1. w obrebie genu trpD

2. transkrypcja operonu trp kontrolowana atenuatorem

3. krotki transkrypt liderowy konczy sekwencja poliU

4. reszty trp obecne obok siebie

5. niedobor trp bo brak tryptofanylo-tRNA rybosom zatrzymuje na kodujących trp

6. rybosom zatrzymuje tak ze transkrypcja ponizej atenuatora (powyżej)

7. koduje krotki peptyd testowy z 2 resztami trp

16. tRNA

1. antykodon i miejsce wiazania aminokwasu na przeciwległym koncu

2. zawiera od 70-90 nukleotydow (73-93)

3. duza czesc jest sparowana

4. CCA na koncu 3

5. wiele zmodyfikowanych nukleotydow

6. zawiara ACC gdzie przyłączone aminokwasy (nie bo CCA)

7. zbudowany z heliakalnych końców tworzących litre U (zawiera pętle)

17. Translacja mRNA u eukariota

1. formylometionylo-tRNA rozpoczyna lancuch

2. kodon AUG wybierany przez parowanie rejonu mRNA (rybosom przesuwa się wzdłuż mRNA, aż anytkodon metioniny nie sparuje się z kodonem metiony)

3. mala podjednostka powyżej miejsca transkrypcji

4. konczy czynnik uwalniający (jeden - u prokariota 2)

5. biora udział bialka wiążące z 5'-mRNA i inne czynniki inicjujące

6. może być regulowane przez kinazy białkowe (?)

18. Translacja

1. aminokwasy dodawane do N-konca

2. aminokwasy aktywowane przez przyłączenia do tRNA

3. rozpoczęcie na kodonie przez specyficzne pre tRNA i kodonu (fMet-tRNA)

4. wiązanie peptydowe aminoacylo-tRNA miejsce A a reszta peptydylowa miejsca P (?)

19. Inicjacja translacji u prokariota

1. fenyloaminoacylo-tRNA wiaze się do miejsca P

2. IF2 oddzialywuje z podjednostka duza (z małą)

3. IF2 zdolny do hydrolizy GTP dzieki czemu dostarcza energii do translacji (pozwala na powstanie kompleksu inicjującego 70S, o energii nic nie wiem)

4. IF1 i IF3 dostarczaja aminoacylo-tRNA do rybosomu (IF2)

5. tRNA komplementarny do dużego segmentu (?)

20. Translacja mRNA u prokariota

1. mRNA policistronowe

2. miejscem translacji jest kodom met AUG za sekwencja bogata w puryny komplementarna do 16s tRNA

3. czynniki elongacyjne EF-Ts i EF-Tu

4. formylimet-tRNA powstaje w reakcji

Met + tRNA -> Met-tRNA+kw. foliowy-> fMet-tRNA

(syntetaza i transformylaza)

5. EF-Ts wiaze nukleotyd podlegający hydrolizie (EF-Tu wiąże GTP)

6. Tu oddzialuje z tRNA oprocz fmet-tRNA

21. Syntetaza aminoacylo-tRNA

1. estry aminokwasow syntetyzowane na koncu 3 tRNA (gr 3'-OH tRNA i gr. karboksylowa aminokwasu)

2. reakcja katalizowana I etepowa (nie bo II etepowa - najpierw tworzenie aminoacyloadenylanu z aminokwasu i ATP, potem przeniesienie grupy aminoacylowej na tRNA )

3. produkt przejściowy którego gr karboksylowa tworzy wiazanie bezwodnikowe z ortofosforanem

4. większość syntetazy ma walsciwosci korekcyjne

5. wszystkie syntetazy rozpoznaja tRNA oddzialywuja z petla antykodonu

6. potrzebne ATP (do złączenia aminokwasu i tRNA przez produkt posredni)

22. Rybosomy

Prokariota 70S:

30S:

16s RNA, 21 bialek

50S:

5s i 23s RNA, 34 bialka

Eukariota 80S:

40S:

18s RNA

60S:

5s 5,8s 28 s RNA

23. Białka zaangażowane w regulacje transkrypcji

1. musza aktywowac polimerze DNA

2. musza aktywowac polimerze RNA

3. musza mieć zdolność wchodzenia do jaderka

4. mogą się wiazac do DNA

5. musi wiazac się do histonow

6. zdolność wchodzenia do jadra (tylko u Eukariota)

24. Represor λ

1. wiaze jako monomer (dimer)

2. ma miejsce wiazanie ara (Or1,2,3)

3. wiaze specyficznie do sekwencji DNA rozpoznawanych przez bialko cro

4. rozne powinowactwo do miejsc OR

5. rozne powinowactwo przez bialko lex A (nie bo rec A)

25. Splicing alternatywny

1. + segregacje selektywna RNA

2. + regulacja kompleksu inicjującego translacje

3. + przetasowanie ekspresji genow

26. β - galaktozydaza

1. obecny w roznych stężeniach zalezne od źródła wegla uwywanego do wzrostu

2. jest produkowana z jednostki genu zwanej operonem

3. hydrolizuje wiazanie 1,4 β oligosacharydy laktozy i tworzy galaktore i glukoze

4. tworzy wiazanie 1,6 β oligosacharydu allolaktozy

5. jest allosterycznie aktywowana przez niemetaboliczny składnik IPTG (izopropylotiogalaktozyd) (wiąże się inaczej niż substrat)

6. jej poziom wzrasta w koordynacji z primazy galaktozydowej acetylofransferazy tiogalaktozydowej

27. Operon laktozowy

i - koduje bialka które zakloca aktywność polimerazy RNA

- koduje bialko wiążące allolaktore

- jest genem regulatorowym

- koduje represor lac

p - jest promotorem lac operonu

- zawiera specyficzne sekwencje wiazania dla polimerazy RNA

- zawiara miejsce wiazania dla kompleksu cAMP-CAP

o - jest operonem lac

- zawiera specyficzne sekwencje wiazanie dla represora lac

z - koduje bialko wiążące allolaktore

y - koduje premaze galaktozydowa

a - koduje transacetylazę

miejsce wiążące CAP - zawiara miejsce wiazania dla kompleksu cAMP-CAP

28. Bakteriofag λ w fazie litycznej;

1. syntetyzuje 3 rozne klasy mRNA które sa wyznaczane poprzez czas po infekcji ich pojawienia

2. niosa programowana synteze bialek potrzebnych do replikacji genow i produkcja ich strukturalnych komponentow

3. tworza produkty genow N i Q które działają jako bialka regulacji pozytywnej, prowadzace sekwencyjna λ- kodującego bialka

4. początkowo produkuje dwoe czasteczki jadra, pelni role inhibitora syntezy λ represora, a iina gra role konca transkrypcji

5. N i Q zapobiagaja konca transkrypcji

6. N powoduje produkcje bialka niezbędnego do replikacji DNA faga i rekombinacji

7. Q potrzebne gdy sa transkrybowane geny bialka glowki i ogonka wirusa oraz bialka konieczne do lizy komrki gospodarza

29. Operon Trp

1. kontrola ilości policystronowego mRNA tworzącego na poziomie inicjacji transkrypcji (represor)

2. kontrola ilości policystronowego mRNA tworzącego na poziomie terminacji transkrypcji (atenuator)

3. sekwencja i skoordynowana produkcja 5 enzymow metabolizmu tryptofanowego z pojedynczej nici RNA (prod. trp z choryzmianu)

4. sekwencja i skoordynowana produkcja 5 enzymow metabolizmu trptofanowego z 5 roznych mRNA produkujących w roznych stężeniach

5. produkcja transkryptow roznych rozmiarow zalezna od poziomu tryptofanu w komorce (krótki fragment liderowy lub cały transkrypt)

30. RNA liderowy operonu trp

1. mutacja delecji w DNA kodującym 3 koniec RNA daje powod do wzrostu poziomu biosyntezy enzymow biosentyzowanych przekształcających trp (powstawanie nie przekształcanie trp)

2. krotki otwarcie ramki odczytu zawierającego kodon trp , wśród innych istnieje wewnątrz liderowego RNA

3. liderowy RNA koduje peptyd którego zdlonosc syntezy monitoruje poziom trp-tRNA w komorce

4. liderowe RNA zawiera wiazanie rybosomowe Shinego-Dalgaro

5. liderowy RNA może tworzyc dwie alternatywne i wzajemnie wykluczające się drugorzędowe struktury

6. struktura liderowego RNA In vivo zalezy od pozycji rybosomy translacyjnego

31. lac represor

1. wiaze sekwencje DNA z rejonami o podwojnej symetrii

2. przeszkadza w funkcjonowaniu polimerazy RNA przez związanie z DNA

32. λ represor - wiaze sekwencje DNA z rejonami o podwojnej symetrii

1. przeszkadza w funkcjonowaniu plimerazy RNA przez związanie z DNA

2. efekty regulatorowe sa antagonizowane bialkiem rho (?!)

3. inaktywowane przez recA

4. reguluje wlasna synteze

5. wspodziala z powtarzalna sekwencja wariantow z ich operonami

6. stymuluje inicjacje transkrypcji

7. bierze udzial jako pozytywny i negatywny regulator (własnej transkrypcji, genów strukturalnych tylko negetywny)

33. trp represor

1. wiaze sekwencje DNA z rejonami o podwojnej symetrii

2. przeszkadza w funkcjonowaniu plimerazy RNa przez związanie z DNA

34. kompleks cAMP-CAP

1. wiaze sekwencje DNA z rejonami o podwojnej symetrii

2. stymuluje transkrypcje roznych operonow katabolicznych

3. stezenie zalezy od poziomu glukozy

4. stymuluje inicjacje transkrypcji

35. bialko araC

1. reguluje wlasna synteze

2. bierze udzial jako pozytywny i negatywny regulator

3. przeszkadza w funkcjonowaniu plimerazy RNA przez związanie z DNA

4. stymuluje inicjacje transkrypcji

36. bialka N i Q λ

1. stymuluje transkrypcje przez stlumienie terminacji transkrypcji

37. atenuator operonu trp

1. wymaga syntezy bialka do funkcjonowania

2. zaley od ścisłego powiazania transkrypcji i translacji

3. oddzalywuje przez poziom aminoacyloacylo tRNA w komorce

4. wymaga rybosomow

38. Które z poniższych dotyczących operonu tryptofanowego sa poprawne?

1. transkrypt operonu tryptofanowego koduje 5 enzymow przekształcających choryzmian w tryptofan

2. transkrypcja operonu trp jest regulowana miedzy innymi przez ……..odcinka liderowego

3. tryptofan pelni role korepresora, gdyz może bezpośrednio

4. liderowy mRNA koduje krotki „peptyd testowy”

5. w przypadku niedoboru trp

6. w przypadku mutacji w obrębie sekwencji Sine-Dolgarno….

39. Które z poniższych dotyczących sygnałów rozpoczynających i kończących transkrypcje sa poprawne?

1. za prawidłowe rozpoznanie miejsca startu transkrypcji odpowiada podjednostka α polimerazy RNA

2. Typowe promotory E.coi zawiera w obrebie -10 tzw.kasete tata o sekwencji zgodnej TATAA

3. promotory genow szoku cieplnego roznia się w sposób zasadniczy od typowych promotorow rozpoznawanych przez innewarianty odpowiedniej podjednostki polimerazy RNA

4. sygnalem terminacji transkrypcji jest czesc RNA o strukturze spinki do włosów przed kilkoma resztami UUU

5. heksametryczne bialko rho jest ATPazą w obecności jednoniciowego RNA i uczestniczy ……….niektorych genow E.coli

6. u E.coli wyspecjalizowane sygnaly terminacji transkrypcji zwane atenuatorami …..okreslonych genow do potrzeb pokarmowych komorki

40. Które na temat aminoacylo-tRNA są poprawne?

7. wiazanie estrowe w aminoacylotRNA tworzone jest miedzy grupa karboksylowa aminokwasu a gr fosforanowa tRNA

8. dla każdego aminokwasu istnieje inny enzym katalizujący tworzenie odpowiedniego

9. rodzaj aminokwasu przylaczanego do tRNA zalezy od rodzaju syntetazy……….. jest substratem

10. niektóre syntetay aminoacylo-tRNA posiadają aktywność korekcyjna……….. niewłaściwym tRNA

11. wszystkie syntetazy aminoacylotRNA rozpoznaja właściwy tRNa rozpoznając

12. aminokwas polaczony z tRNA odgrywa istotna role w rozpoznaniu

41. Pytania na temat syntezy białka u Prokaryota ??

4. hydroliza GTP przez czynnik elongacyjny EF-Tu umożliwia uwolnienie

5. energia potrzebna do utworzenia wiązań peptydowych ……. peptydylotransferazę

6. Puromycyna powoduje przedwczesną terminację łańcucha……..

42. które dotyczące transkrypcji genow u E.coli sa prawdziwe?

7. produktem może być policistronowy mRNA

8. faza elongacji podczas transkrypcji jest przeprowadzana przez rdzen polimerazy

9. polimeraza RNA wykazuje aktywność egzonukleazowa, która umozliwia jej korekcję błędów

10. rRNA(tzw.odwrotny RNA, ) jest syntetyzowany w kierunku odwrotnym do typowego 5'---3' stąd jego nazwa

11. Pre-mRNA podlega procesowi składania(slipingu) jeszcze zanim zajdzie translacja

12. ekspresja genow jest kontrolowana głównie na poziomie transkrypcji

43. (brak pytania)

7. ponieważ transkrypcja zachodzi w jadrze komórkowym a translacja w cytoplazmie konieczny jest transport transkryptow z jadra do cytozolu

8. ponieważ wszystkie pierwotne transkrypty zawieraja introny konieczny jest splicing

9. pierwotne transkrypty tRNA podlegaja intensywnej obróbce potranskrypcyjnej, po……. transestryfikacji zbliżone mechanizmem do splicingu pre-mRNA

10. struktura określana mianem „kap” tworzona jest na końcu 5' większości mRNA oraz...

11. większość genow kodujących mRNA jest rozcinana przez endonukleazę rozpoznająca …..od konca 3' przez polimerazę poli(a)

12. cząsteczki pre-mRNA kodujące część białek podlegają procesowi redagowania co, ….. transkryptu nie jest w pełni zgodna z sekwencja odpowiedniego eksonu w genie kodującym

44. Translacja mRNA u Procariota:

a) pierwszy kodon AUG od konca 5' transkryptu hydrolizującego ATP

b) równanie reakcji:

c) czasteczka elongacyjna Ts wiaze GTP,podlega hydrolizacji EF-Ts do GDP

d) czasteczka elongacyjna Tu oddzialuje ze wszystkimi czasteczkami aminiacetylo-tRNA oprocz fMet-RNAf

e) peptydylo-tRNA może zajmowac miejsce P lub A zalezne od tego, w którym cyklu się znajduje

1. fMet-tRNA zajmuje miejsce P(jako jedyne)

45. Podjednostki polimerazy RNA :

α wiaze bialko regulatorowe

β wiaze trifosfanow rybonukleotydow

β wiaze matryce DNA

σ odszukuje miejsca promotorowe, pomaga zainicjowac synteze i oddysocjowuje od enzymu

46. Miejsca promotorowe E.coli

a) mogą wykazywac rozna wydajność transkrypcji

b) dla wkiekszosci genow zawiera rozne zgodne sekwencje

c) okresla strone startu dla transkrypcji na matrycy DNA

d) maja identyczne i określone sekwencje

e) sa aktywne kiedy G lub C sa zamienione w ich -10 rejon w czasie mutacji (mutacja powoduje utrate aktywności)

f) te które maja sekwencje prawie zgodne z sekwencjami zgodnymi i sa separowane przez 17 par zasad sa bardzo wydajne

47. Bombel transkrypcyjny

a) czesc polimeryzacje enzymu (??)

b) podjednostka σ (utrata tej podjednostki, bo wtedy rdzen silniej się wiaze do matrycy DNA)

c) w przybliżeniu 17 nukleozydow nici kodującej DNA w formie pojedynczej

d) w przybliżeniu 12 nukleozydow konce 5 lini wydłużającej się RNA

e) w przybliżeniu 12 bp helisy DNA-RNA (8pz)

48. Polimeraza RNA I

1. Jest zlokalizowana w jąderku

2. Tworzy prekursory 18s 5,8s 28s rRNA

3. Syntezuje RNA w kierunku 5-3

4. Jest zbudowana z kilku podjednostek

5. jest niewrażliwa na α-amanitynę

49. polimeraza RNA II

1. Jest zlokalizowana w nukleoplazmie

2. Tworzy prekursorowi mRNA

3. Silnie inhibowany przez amanityne

4. Syntezuje RNA w kierunku 5-3

5. Jest zbudowana z kilku podjednostek

6. Ma podjednostke z powtarzalna sekwencja aminokwasow regulowana w fosforylacji

50. Polimeraza RNA III

1. Jest zlokalizowana w nukleoplazmie

2. Tworzy prekursorowi tRNA

3. Tworzy 5s rRNA

4. Syntezuje RNA w kierunku 5-3

5. Jest zbudowana z kilku podjednostek

51. I grupa splicingowa

1. Reakcje transestryfikacji zrywania i tworzenia wiązań

2. Wymaga nukleozyd guanozowy albo nukleotyd

52. II grupa splicingowa

1. Wymagane wiazanie 2-5 fosfodiestrowe

2. Reakcje transestryfikacji zrywania i tworzenia wiązań

3. Spliceosom jest wymagany

4. Produkt pośredni o kształcie lassa

53. Splicing mRNA

1. Wymagane wiazanie 2-5 fosfodiestrowe

2. Reakcje transestryfikacji zrywania i tworzenia wiązań

3. Spliceosom jest wymagany (nie w splajsingu autokatalitycznym)

4. Produkt pośredni o kształcie lassa

5. snRNPs sa wymagane (nie w splajsingu autokatalitycznym)

54. Splicing eukariotyczny tRNA

Aktywności ligazy i nukleazy sa potrzebne

55. Podjednostka σ

1. Zdolność inerakcji transkrypcji w miejscach paromotorowych

2. Znajduje się w polimerazie do promotorowych rejonow RNA

3. Oddysocjowuje od enzymu

4. Ulatwia terminacja: NIE

56. Ogony poliA

1. Dolaczone przy udziale ligaz

2. Kodowane fragmenty polideoksyadenylanu

3. Dodawane przez polimerze poliA

4. Zuzywane ATP

57. Rho

1. Aktywowane przez jednoniciowe RNA

2. Rozpoznaje sekwencje w matrycy DNA (bogate w cytozynę, ubogie w guanine)

3. Czy dziala helikaza DNA-RNA

4. Posiada niekodujace sekwencje

58. Transkrypcja to przeply informacji :

Odp. DNA do RNA, RNA do DNA

59. Jakie funkcje sa charakterystyczne dla tRNA:

1. zawiera antykodon,

2. może być polaczony z aminokwasem wiazaniem estrowym,

3. oddzialywuje z mRNA na drodze translacji,

4. może posiadac rozna liczne roznych sekwencji,

5. sluzy jako polaczenie miedzy mRNA a pojedynczym aminokwasem

60. podjednostka ε polimerazy DNA III - wykonuje `czytani i sprawdzanie' większości syntez DNA

61. Sygnały rozpoczynające i kończące sygnał:

a) za prawidłowe rozpoznanie miejsca startu transkrypcji odpowiada podjednostka sigma polimerazy RNA
b) typowe promotory E.Coli zawierają w obrębie -10 tzw. Kasete tata, o sekwencji zgodnej TATAA
c) promotory genów szoku cieplnego różnią się w sposób zasadniczy od typowych promotorów rozpoznawanych przez inne warianty odpowiedniej podjednostki polimerazy RNA (różnią się, ale nie jest napisane jak bardzo)
d) sygnałem terminacji transkrypcji jest część RNA o strukturze spinki do włosów przed kilkoma resztami UUU (albo sekwencja dla rho)
e) heksametryczne białko RHO jest ATPazą w obecności jednoniciowego RNA i uczestniczy (...) niektórych genów E.coli
f) u E.coli wyspecjalizowane sygnały terminacji transkrypcji zwane atenuatorami podlegając regulacji określonych genów dostosowują się do potrzeb pokarmowych komórki

62. o splicingu tzn. co się stanie jak przesuniemy miejsce rozałęziające o 9 reszt w stronę 5`
    

63. Było pytanie o tRNA, bardzo podobne do tego na liście

a) zawiera antykodon
b) zawiera kodon
c) aktywacja aminokwasu zachodzi poprzez przyłączenie do tRNA
d) czy na końcu 3` jest sekwencja ACC
e) czy przy tworzeniu aminoacylo-tRNA, powstaje produkt pośredni aminoacylo-AMP

64. Był opisany eksperyment, w którym do operonu tryptofanowego wsadzono sekwencję regulatorową operonu lac, która była wrażliwa na IPTG, a operator tryptofanowy nie wiązał tryptofanu, czyli nie był wrażliwy na stężenie Trp. Kiedy zachodziła synteza enzymów trp.

Tylko wtedy kiedy nie było IPTG, bo ten operon jest wrażliwy tylko na stężenie IPTG.

65. Dany jest cDNA i trinukleotyd AUG kodujący `start'
    AgCCACATAgCgA
    TCggTgTATCgCT
    Która nic jest matrycowa, a która kodujaca ?
    Która tworzy przejsciowa hybryde RNA-DNA ?
    Jaka sekwencje na powstający transkrypt ?
    

66. Bialka rybosomowe
    Powstaja w wyniku translacji rRNA:
    rRNA katalityczna i strukturalna funkcja
    

67. Czy cDNA powstaje w odwrotnej transkryptazie mRNA?
    

68. W laboratorium biochemicznym utworzono 2 mutanty dzikiego szczepu E.coli mutanta A, ktory posiada delecje segmentu 3 w regionie liderowego RNA oraz mutanta B, ktory nie posiada sekwencji wiazacej rybosom przed kodonem START dla peptydu liderowego. ktore z ponizszych stwierdzen na temat mutantow A iB sa prawdziwe?
    

a) w przypadku obu mutantow mamy do czynienia ze zjawiskiem represji katabolicznej operonu
b) mutant b wykazuje nizszy poziom ekspresji genow struktury niz mutant A w obecnosci jak i w nieobecnosci Trp
c) oba mutanty wykazuja konstytutywna ekspresje genow struktury
d) oba mutanty wykazuja ten sam fenotyp jesli chodzi o zaleznosc ekspresji genow struktury od poziomu tryptofanu w komorce
e) z powodu delecji w obrebie liderowego mRNA mutant A nie syntetyzuje peptydu liderowego
f) zadne nie jest prawdziwe

69. Ktore z ponizszych stwierdzen dotyczacych funkcjonalnych czasteczek tRNA sa prawdziwe?
    

a) zadne nie jest prawdziwe
b) w czasteczkach tRNA okolo polowa nukleotydow wystepuje w sparowanych regionach helikalnych
c) zbudowane sa z helikalnych regionow polaczonych petlami tak, ze tworza strukture w ksztalcie litery U
d) petla antykodonu to wewnetrznie sparowany region helikalny, ktory moze zawierac inozyne oprocz typowych nukleotydow A, U, C i G (nie jest sparowany)
e) zawiera sekwencje CCA na koncu 5'
f) koniec 3' wszystkich tRNA jest fosforylowany

70. Ktore z ponizszych stwierdzen dotyczacych redagowania RNA sa prawdziwe?
    
    a) redagowane RNA jest jednym z rodzajow splicingu alternatywnego
    b) ...
    c) redagowanie RNA moze polegac na insercji lub delecji nukleotydow...
    d) zmiana w transkrypcie RNA moze zajsc przez reakcje chemiczna powodujaca zmiane kodonu jakiegos aminokwasu na kodon STOP
    e) w niektorych mitochondrialnych mRNA sekwencje, ktore maja byc zmodyfikowane, rozpoznaje specyficzna czasteczka RNA zwana przewodnikiem
    f)...
    

71. Ktore z ponizszych stwierdzen dotyczacych modyfikacji koncow 5' transkryptow mRNA sa prawdziwe?
    

72. Ktore z ponizszych stwierdzen dotyczacych wyboru miejsca startu translacji w przypadku organizmow eukariotycznych sa prawdziwe?
    

73. Ktore z ponizszych stwierdzen dotyczacych aktywacji korekcyjnej syntetaz aminoacylo tRNA sa prawdziwe?

74. Przypożądkuj literom ABDCEFGH odpowiednie wartości dla prokariota (chodzi o rybosomy):
    
    
    
    
    
    A=70S
    B=30S
    C=50S
    D=16S
    E=21 bial
    F=34 bial
    G= 23S
    H= 5S

75. które z poniższych stwierdzeń można potwierdzić lub obalić opierając się wyłącznie o zasadę tolerancji Cricka?

a) Alanina jest kodowana przez 4 kodony:
b) Antykodon IGC może parować zarówno z ACG jak i z CCG (nie wiem, czy nie powinno też być od 5' czyli GCA i GCC, wtedy byłoby źle)
c) Jeśli jedno aminoacylotRNA zawiera antykodon UCG a drugie ICG to w niezmutowanej komórce łączą się one do jednego...
d) żadnego z podanych stwierdzeń nie można jednoznacznie obalić ani potwierdzić

76. Które z poniższych stwierdzeń dotyczących funkcjonalnych cząsteczek tRNA są prawdziwe?

a) wszystkie mają fosforylowany koniec 5'
b) składają się z 75nukleotydów (73-93)
c) pętla antykodonu to wewnętrznie sparowany region helikalny, który może zawierać tylko A, C, U, G i I
d) zawiera sekwencje ACC na końcu 3'
e) żadne nie jest prawdziwe
f) coś że rybotymina i pseudouracyl (pewnie, że może zawierać nietypowe zasady)

77. zmodyfikowany operon laktozowy w ktorym i-, p+, o+, z-, y+, a+// i+, p-, o+, z+, y+, a+ i do tego byly pytania

1.

1. prawda

2. I niewrażliwa, II bardzo wrażliwa, III na duże

3. nie

4. ryfampicyna

5. aktynomycyna nie pozwala na wyk dsDNA jako matrycy, bo go interkaluje

6. prawda

2.

1. prawda

2. fałsz

3. podczas lizogenicznej

4. stymulacja, przełamują miejsca terminacji transkrypcji

5. prawda

6. recA

5.

1. prawda

2. prawda

3. fałsz

4. induktorem genów araBAD i represorem araC

5. nie ma araI są araO

6. induktorem

6.

1. fałsz

2. fałsz

3. prawda

4. tylko AUG

5. zawsze?

6. fałsz

7.

1. prawda, aczkolewiek dziwnie to jest napisane

2. prawda

3. prawda

4. prawda

5. prawda

6. prawda?

8.

1. prawda

2. fałsz

3. fałsz

4. kodon rozpoznawany przez więcej niż jeden antykodon

9.

1. prawda (synteza z choryzmianu)

2. fałsz, zmianę transkrypcji powoduje powstające białko, a więc trans

3. fałsz

4. prawda

5. odcinek literowy może powodować represje, a nie inicjacje

6. prawda - będzie powstawała pętla z braku tRNA

10.

u prokariota 70S

30S - 21 białek, 16S RNA

50S - 34 białek, 5SRNA, 23S RNA

u eukariota 80S

40S - 18S RNA

60S - 5S, 5,8S, 28S RNA

A rybosom 70 S

B duża podjednostka 50S

C mała podjednostka 30S

D 34 białka (L1-L34)

E 5SRNA

F 23S RNA

G 21 białek (S1-S21)

H 16S RNA

11.

1. fałsz

2. prawda

3. prawda (tak mówi lubercik)

12.

1. on nie jest sparowany, prawda?

2. CCA

3. koniec 5'

4. prawda

5. 73-93nukleotydy

6. polimeraza ich nie wprowadza, to jest modyfikacja postranskrypcyjna

13.

1. prawda

2. prawda

3. fałsz

4. hę?

5. jednego policistronowego

6. białko represorowe owszem, ale nie CAP tylko lac

Które z poniższych stwierdzeń dotyczących sekwencji sygnałowych są poprawne?

1. wewnętrzne sekwencje sygnałowe nie są odcinane po przejściu przez błonę ER

2. cząst. rozpoznajaca sygnal (SRP) jest bialkiem składającym się z

3. uwolnienie SRP z rybosomy powoduje zahamowanie elongacji polipeptydu

4. SRP zapobiega przedwczesnej elongacji, a przez to faldowaniu się bialka

5. cykl ATP-ADP…sekwencje sygnalowa z SRP i odlącza ją od

6. rozfaldowane łańcuchy polipeptydowe sa optymalnymi substratami do transportu przez blone

Dostępne mutanty:

i+ typ dziki

ic konstytutywna mutacja

is niewrażliwy na atak

o+ sekwencja dzikiego typu

oc mutacja konstytutywna

z+ sekwencja dzika

mutacja konstytutywna = nieregulowana, prowadzi do konstytutywnej aktywności

1. ic o+ z+

sekwencja nietypowa(nieregulowana) nie ma represora, bo substancja nieaktywna, -, niewrazliwa na laktoze = konstytutywna ekspresja zachodzi

2. is o+ z+

niewrazliwa na laktoze bo ona nie jest zwiazana, -, laktoza jest obecna i tak (jest represja bo nie ma laktozy lub IPTG który …… represor)

3. i+ oc z+

4. ic o+ z+

represor nierozrozniany, typ dziki

5. is o+ z+

typ dziki, bo z dominujący, brak syntezy genu

ic nie jest dominujący względem i+

1,2,3 ich synteza nie zalezy od laktozy

2 nie zalezy od IPTG

4 ma fenotyp typu dzikiego

TWÓJ BIOTECHNOLOG https://www.facebook.com/twoj.biotechnolog

---