Rok III	Semestr	VI
Nazwa przedmiotu	BIOLOgia molekularna
Jednostka organizacyjna	Katedra i Zakład Biologii Molekularnej
Kierownik przedmiotu	Prof. Dr hab. U. Mazurek
Kontakt	telefon:	32 364 10 20		e-mail:	[e-mail]
Liczba godzin	Wykłady	15
		Seminaria	0
		Ćwiczenia	15
		Ogółem
Punkty ECTS
Opis przedmiotu	Zasadnicze treści przedmiotu: Poznanie podstaw biologii molekularnej, niezbędnych do zrozumienia mechanizmów działania leku na poziomie przepływu informacji genetycznej w komórkach prokariotycznych, eukariotycznych i wirusach (wpływ leku na replikację, transkrypcję i translację), ze szczególnym zwróceniem uwagi na rekombinację i klonowanie DNA. Poznanie podstawowych metod biologii molekularnej stosowanych w biotechnologii leków, w diagnostyce laboratoryjnej, monitorowaniu skutecznosci leczenia (lekooporność) oraz terapii genowej.
		Efekty kształcenia: Rozumienie budowy i funkcji kwasów nukleinowych i białek; opisu i analizy podłoża molekularnego procesów patologicznych; izolowania, oznaczania i amplifikacji kwasów nukleinowych; posługiwania się współczesnymi technikami badania genomu; stosowania technik biologii molekularnej w biotechnologii farmaceutycznej, terapii genowej i diagnostyce
Zaliczenie/Egzamin/ Metody Oceny	Egzamin
Literatura	1. Węgleński P. (red.) Genetyka molekularna. PWN, Warszawa 1995, 2007 2. Brown T.A. Genomy. PWN, Warszawa 2009 3. Słomski R. (red.): Analiza DNA teoria i praktyka. Wydawnictwo . . Uniwersytetu Przyrodniczego, Poznań 2008 4. Bal J. (red): Biologia molekularna w medycynie, elementy genetyki . . . klnicznej. PWN, Warszawa 2001 2006, 2008
Uwagi

BIOLOGIA MOLEKULARNA III ROK 2009/2010

Lp.	Data	Temat	uwagi
1	15-19 luty	Genomika strukturalna i funkcjonalna w naukach farmaceutycznych.
2	22-26 luty	Struktura i funkcja DNA od A-Z.
3	01-05 marzec	Replikacja DNA (inicjacja, elongacja i terminacja). Znaczenie replikacji DNA w diagnostyce klinicznej i terapii.
4	08-12 marzec	Mutageneza i polimorfizm genetyczny enzymów metabolizujących ksenobiotyki.
5	15-19 marzec	Porównanie replikacji i mechanizmów naprawy DNA w komórkach prokariotycznych, eukariotycznych i wirusach (kolokwium).
6	22-26 marzec	Rekombinacja i mechanizmy naprawy DNA.
7	29 III - 02 IV	Transkryptomika. Mechanizmy regulacji transkrypcji w komórkach prokariotycznych.
8	12 - 16 kwiecień	Eukariotyczne czynniki transkrypcyjne i regulacja transkrypcji. Czynniki epigenetyczne w regulacji ekspresji genów.
9	19-23 kwiecień	RNA w regulacji ekspresji genów (kolokwium)
10	26 -30 kwiecień	Prezentacja sprzętu i aparatury Katedry i Zakładu Biologii Molekularnej wykorzystywanej do analizy kwasów nukleinowych.
11	03 - 07 maj	Proteomika Synteza i obróbka proteomu.
12	10 - 14 maj	Mechanizmy regulacji translacji, modyfikacje potranslacyjne białek.
13	17 - 21 maj	Ksenobiotyki w regulacji aktywności translacyjnej.
14	24-28 maj	Porównanie mechanizmów translacji (kolokwium.)
15	31V-04 czerwiec	Perspektywy biologii molekularnej w medycynie i farmacji.

Zagadnienia do przygotowania na ćwiczenie I

(15-19 luty 2010)

Genomika strukturalna i funkcjonalna w naukach farmaceutycznych

• Genomika - dziedzina wiedzy XXI wieku- cele i zadania.

• Genomika funkcjonalna: transkryptomika i proteomika.

• Genomika strukturalna.

• Genomika teoretyczna.

• Genomika porównawcza.

• Genomika indywidualnych różnic.

• Farmakogenetyka a farmakogenomika.

Zadanie:

Podaj przykłady zastosowania genomiki strukturalnej i funkcjonalnej w naukach farmaceutycznych.

Zalecana literatura:

„Genomika - dziedzina wiedzy XXI wieku.” P. Mickiewicz, J. Zakrzewska-Czerwińska, S. Cebrat. Biotechnologia 3(70), 2005 str. 7-22.

Zagadnienia do przygotowania na ćwiczenie II

(22-26 luty 2010)

Struktura i funkcja DNA od A-Z

• Powtórzenie wiadomości na temat struktury i funkcji DNA (nukleozydy, nukleotydy, wiązanie fosfodiestrowe, nukleoid, nukleosom).

• Kwasy dezoksyrybonukleinowe (struktury jednoniciowe,struktury dwuniciowe, trójniciowe i  czteroniciowe).

• Tautomeria zasad, Reguły Chargaffa.

• Sekwencje powtarzające się w DNA (sekwencje typu  satelitarnego DNA).

• Struktura chromosomu prokariotycznego.

• Struktura chromosomu eukariotycznego.

• Żródła obecności uracylu w DNA

Zadanie:

Sekwencja DNA 5^' -AGTCTGACT-3^' jest odpowiednikiem jakiej sekwencji RNA?

Zalecana literatura:

M. Bukowiecka-Matusiak. LA Wodniak. Struktura DNA od A-Z - biologiczne implikacje różnorodności strukturalnej DNA. Postępy Biochemii 2006 (52) 3.229-238.

Oliński R., Jurgowiak M. Uracyl w DNA - przyjaciel czy wróg? Postępy Biochemii 2009, vol. 55 nr 1, str 25 - 35

Zagadnienia do przygotowania na ćwiczenie III

(01-05 marca 2010)

Replikacja DNA  (inicjacja, elongacja i terminacja). Znaczenie replikacji DNA w diagnostyce klinicznej i terapii.

• Enzymy biorące udział w replikacji.

• Etapy replikacji: inicjacja, elongacja, terminacja.

• Replikacja DNA w komórkach eukariotycznych.

• Replikacja DNA mitochondrialnego.

• Replikacja DNA w komórkach prokariotycznych.

• Replikacja DNA wirusowego.

• Mechanizmy regulacji replikacji.

• Mechanizmy wierności replikacji DNA

Zadanie:

Podaj przykłady leków które hamują poszczególne etapy replikacji.

Zalecana literatura:

Kowala Piaskowska A. Wirus zapalenia wątroby typu C - budowa i replikacja a możliwości terapeutyczne i zjawisko oporności Postępy Biochemii 2006, vol. 52, nr 4 str 399-407

Bębenek A. Mechanizmy wierności replikacji DNA. Postępy Biochemii 2008 vol. 54, nr 1, str 43-56

---