Ezamin z Biochemii dla wydziału WTŻ 2008
1. Co to są aminokwasy egzogenne, pierwotne, kontaktowe. Podaj ich przykłady (nazwy + wzory)
Aminokwasy egzogenne - to takie, które nie mogą być syntetyzowane przez organizm zwierzęcy dlatego dostarczane są do organizmu wraz z pokarmem.
Przykłady
- a. aromatyczne (fenyloalanina, tyrozyna, tryptofan)
- a. z rozgałęzionym rodnikiem (walina, leucyna, izoleucyna)
- metionina, treonina, lizyna
Aminokwasy kontaktowe - są to aminokwasy tworzące centrum aktywne. Wśród nich wyróżniamy:
- seryna
- cysteina
- asparagina
- mationina
2. Podać klasy enzymów i w jakich reakcjach uczestniczą?
oksydoreduktazy - katalizują reakcje oksyredukcji, polegające na przeniesieniu elektronu lub protonu lub bezpośrenie włączenie tlenu do substratu. W tej klasie wyróżnia się wiele podklas najwazniejsze z nich to: dehydrogenazy, reduktazy, oksydazy, peroksydazy
transferazy - katalizują reakcje przenoszenia grup po między związkami substratów.
hydrolazy - katalizują reakcje rozkładu wiązań przy udziale wody.
liazy - rozkładają wiązania bez udziału wody.
izomerazy - katalizują reakcje przekształcania czas substratu bez zmiany ich składu chemicznego (przekształcenie wewnątrzkomórkowe)
ligazy - katalizują reakcje syntezy wiązań.
3. Do której klasy należą enzymy: arginaza, aldoza 1,6 - bisfruktozy, fosforylaza glikogenowa, alfa-amylaza, karboksylaza pirogronianowa, trypsyna, heksokinaza?
arginaza - hydrolaza,
aldoza 1,6 - bisfruktozy - liaza,
fosforylaza glikogenowa - transferaza,
alfa-amylaza - hydrolaza,
karboksylaza pirogronianowa - syntetaza,
trypsyna - hydrolaza,
heksokinaza - transferaza
4. Napisz wzór i nazwę witaminy spokrewnionej z NAD+, wymień 2 enzymy współdziałające z tym koenzymem i napisz reakcje jedną z nich. Wymień 2 inne przykłady współdziałania koenzymów z wit (nazwy i wzory obu witamin).
Jest to witamina PP
Współdziała z dehydrogenaza mleczanowa (fermentacja - kws mlekowy do kw pirogronowego), dehydrogenaza ald. 3 fosfoglicerynianowa (szlak glikolizy - aldehyd 3-fosfoglicerynowy do 1,3 -bisfosfoglicerynianu)
Przykłady współdziałania koenzymów z wit :wzory, nazwy
Podam tylko nazwy z wzorami byłoby raczej trudno; )
Są to: tiamina-wit DPT, ryboflawina FAD, fosforan pirydoksalu
5. Wymień enzymy uczestniczące w rozkładzie glikogenu w mięśniach. Podaj klasy enzymów. Napisz reakcję aktywnej glukozy w procesie syntezy glikogenu.
Enzymy:
Fosforylaza glikogenowa - transferaza
Transferaza glikogenowa - transferaza
Alfa-1,6-glikozydaza - hydrolaza
Jest to reakcja przekształcenia glukozo-1-fosforanu do UDP-glukozy. To jest na kserówkach, które nam dawał.
6. Cykl mocznikowy - reakcje w których powstaje mocznik. Jaką rolę pełni cykl mocznikowy u zwierząt. Wymień aminokwasy białkowe i niebiałkowe tego cyklu.
A) NH4 + CO2 +H2O + 2ATP------- karboilofosforan + 2 ADP + P
B) L-ornityna przekształca się do L-cytruliuny (enzym: karbomoilotransferaza ornitynowa)
C) L-cytrulina przekształca się do kwasy arginobursztynianowego (enzym syntetaza arginobursztynianowa)
D) kwas arginobursztynianowy przekształca się do L-argininy (enzym: liaza)
E) L- arginina + kw fumaranowy daje ponownie L-ornitynę.
CO2 +NH4 + Asp + 3ATP + 2H2O ------- MOCZNIK + FUMARAN + 2ADP +2P + AMP
U zwierząt gdzie jest nadmiar azotu cykl ten wytwarza mocznik, który jest usuwany z organizmu. A tak przy okazji u roślin jest główną drogą syntezy L-argininy. Cykl ten wytwarz związki w których magazynowany jest azot w formie nietoksycznej.
Aminokwasy białkowe: kwas asparaginowy
Aminokwasy niebiałkowe: L-ornityna, L-cytrulina
7. Wymień zasadnicze różnice w procesach betaoksydacji i syntezy kw. Tłuszczowych. Napisz reakcje redukcji, zachodzące w czasie biosyntezy kwasów. Z jakich przemian pochodzi forma zredukowana tego koenzymu (pochodzi z cyklu pentozofosoranowego). Napisz 2 reakcje w których koenzym ten ulega redukcji.
Różnice:
- Synteza ma miejsce w cytozolu a rozkład w matrix
- Związki pośrednie biosyntezy kwasów tłuszczowych sa kowalencyjnie związane z gr SH białkowego nośnika gr acylowych ACP podczas gdy produkty pośrednie rozkładu kwasów są z CoA
- Enzymy odpowiedzialne za syntezę kwasów tłuszczowych tworzą wielofunkcyjny kompleks zbudowany z 2 podjednostek, a enzymy rozkładające kwasy tłuszczowe występują w formach niezasocjowanych
- Syntetyzowany łańcuch kwasów tłuszczowych ulega wydłużeniu przez dołączenie jednostek dwuwęglowych pochodzących z malonylo APC
- W syntezie związkiem redukcyjnym jest NADPH a w rozkładzie uczestniczą FADH2
Reakcje redukcji:
AcetoacetyloACP do D-3-hydrosybutyryloACP (enzym: redukatza beta-ketoacyloACP)
KrotonyloACP do butyrylo ACP (enzym: reduktaza enoiloACP)
8. Podaj ile czas ATP powstaje w wyniku utleniania czas kw palmintynowego do CO2 odpowiedź uzasadnij.
Tu trzeba napisac wszystko co on nam dawała na kserówkach o tych bilansach energatycznych.
9. Podaj reakcję sumaryczną CKT i wymień funkcje tej przemiany.
AcetyloCoA+3NAD+FAD+GDP+Pi+H2O-----2CO2+ 3NADH+FADH2+GTP+3H+CoA
Funkcje:
- jest źródłem energii dla wielu procesów u organizmów. Powstałe w tym procesie 3 czas NADH i 1 czas FADH2 są utleniane w łańcuchu oddechowym dostarczając 9 czas ATP
- dostarcza szkieletów węglowych do syntezy aminokwasów i porfiryn
- 2-oksoglutaran, fumaran i szczawiooctan są substratami w procesie syntezy aminokwasów
- cykl ten jest końcowym wspólnym szlakiem utleniania różnych makroczs (białka, aminokwasy, kw tłuszczowe, cukry)
2- oksoglutaran i szczawiooctan bezpośrenio przechodzą w aminokwasy w reakcji transaminacji.
10. Podaj definicje translacji i replikacji.
Translacja (biosynteza białka) - przepisywanie inf zawartej e mRNA na kolejność aminokwasów w łańcuchu polipeptydowym. Składa się z 3 etapów: inicjacja, elongacja, terminacja.
Za proces aktywacji odpowiada syntetaza aminoacylotransferaza tRNA
Replikacja (biosynteza DNA) - proces powielania DNA który odbywa się dzięki modelowi semikonserwatywnemu nowa czas DNA ma jedną nic starą (macierzysta) a jedną nową. Przed podziałam musi nastąpić powielenie DNA, by po podziale kazda komórka potomna miałatyle samo inf genetycznej co macierzysta. Najważniejsze enzymy to polimeraza DNAI i DNAIII