Witaminy
Witamina |
Pochodny koenzym |
Tiamina (Wit. B1) |
Pirofosforan tiaminy |
Ryboflawina (Wit B2) |
FAD dinukleotyd flawinoadeninowy, FMN i mononukleotydy |
Kwas nikotynowy (niacyna) |
Dinukleotyd nikotynoamidoadeninowy NAD |
Pirydoksyna, pirydoksal, pirydoksamina (B6) |
Fosforan pirydoksalu |
Kwas pantotenowy |
Koenzym A |
Odgrywają role prekursorów koenzymów
KWASY NUKLEINOWE
DNA:
Struktura alfa-helis
Składa się z:
Cukier deoksyryboza
Zasady: puryny (AG) lub pirymidyny (CT)
Nukleozyd = cukier + zasada azotowa wiązanie miedzy zasada a cukrem to wiązanie N-glikozydowe
Jeżeli przy 6 węglu cukry będzie fosforylacja to powstanie nukleotyd bo dołączane są reszty fosforanowe
Ułożenie zasad nie jest przypadkowe
Końce 5' leżą na przeciwległych końcach
Kwas DNA w wyższe temperaturze ulega topnieniu i następuje rozpad II rzędowej struktury DNA (mostki wodorowe zaczynają się rozpadać)
Replikacja - podwojenie ilości DNA w komórce
Transkrypcja
Translacja - tłumaczenie (przepisywanie na białko)
Enzym odwrotna transkryptaza (RNA-DNA polimeraza) u niektórych wirusów Np. zarażenie wirusem HIV
Replikacja DNA
Polimeraza DNA1 - enzym
Pojedynczy łańcuch polipeptydowy 103 kDa
Katalizuje krok po kroku dodawanie jednostek deoksyrybonukleotydowych do łańcuch DNA
Do syntezy łańcucha DNA potrzeba:
Wszystkich 4 aktywowanych prekursorów 5'trifosforanow deoksyrybonukleozydow dATP, dGTP, dTTP, dCTP
Odcinek starterowy (primer) gdyż polimeraza DNA1 dołącza deoksyrybonukloezydy do wolnej grupy 3'-hydroksylowej już istniejącego odcinka DNA
Matryce DNA - może być 1 lub 2 niciowy DNA
kz - tysiące par zasad lub w mikrometrach
Wydłużanie zawsze zachodzi od 5' 3'
!!! ACG TO NIE JEST TO SAMO CO GCA !!!
TRANSKRYPCJA z DNA na RNA
RNA rybonukleinowy
Cukier ryboza niepozbawiony grupy hydroksylowej
Zamiast tyminy uracyl
RNA ma strukturę łańcuchową - jedna nic
DNA jest jeden
RNA jest kilka
rRNA - rybosomowy
tRNA - transportujący
mRNA - informacyjny (Messenger)
Różnią się od siebie masa i wielkością (najdłuższy rybosomalny)
Synteza RNA
Polimeraza RNA zależna od DNA
Polimeraza RNA katalizuje inicjacje syntezy i stopniowe wydłużanie łańcuchów RNA
Wszystkie 3 rodzaje komórkowego RNA tj. mRNA, tRNA i rRNA syntetyzowane są u E.Coli przez ta sama polimerze DNA, zgodnie z w matrycy DNA
Do syntezy łańcucha RNA potrzeba
Wszystkich 4 aktywnych prekursorów 5'-fosforanow rybonukleozydow ATP, GTP, UTP, CTP
Dwuwartościowego jonu metalu Mg2+ lub Mn2+
Matrycy - optymalna matryca jest dwuniciowy DNA
Różnice w syntezie DNA i RNA
Polimeraza RNA nie wymaga odcinka starterowego (primera)
Synteza RNA na matrycy DNA jest w pełni konserwatywna, synteza RNA jest semikonserwatywna
Polimeraza RNA nie ma aktywności nukleazowej, która polimeraza DNA wykorzystuje do usuwania błędów
Biochemia wykład 5
2