Wykład 12 Metody oznaczania białek


25.02.2012

Wykład 12

Metoda spektrofotometryczna

Madaje się do pomiaru stężenia białka w płynie mózgowo-rdzeniowym nie mętnego i nie podbarwionego.

Zasada metody: W skład większości białek wchodzą aminokwasy aromatyczne (fenyloalanina, tyrozyna i tryptofan). Obecność tych aminokwasów powoduje charakterystyczną absorpcję przy λ=280 nm. Nasilenie tej absorpcji jest proporcjonalne do stężenia aminokwasów, a tym samym do ilości białka.

Kwasy nukleinowe przeszkadzają przy oznaczaniu białka w ekstraktach białkowych. Jednak kwasy te dają wyższą absorpcję przy 260 nm niż 280 nm. W związku z czym możliwe jest eliminowanie ich wpływu podczas dwukrotnego pomiaru przy λ=260 i 280 nm.

C=C280-C260

Metody refraktometryczne

Zasada metody: Wielkość współczynników załamania (refrakcji) dla płynów ustrojowych jest wprost proporcjonalne do zawartości w nich białka. Po oznaczeniu refrakcji badanej surowicy ze specjalnych tablic odczytuje się stężenie białka w procentach.

Metody oznaczania albumin

  1. Sucha chemia (surowica)

  2. Metoda kolorymetryczna z zielenią bromokrezolową (surowica)

  3. Metoda kolorymetryczna z czerwienią bromokrezolową (surowica)

  4. Metoda elektroforetyczna (surowica)

  5. Immunonefelometryczna (PMR, mocz)

  6. Elektroimmunodyfuzji radialnej lub Laurella (PMR, mocz).

Metoda kolorymetryczna

Zasada metody: Zieleń bromokrezolowa reaguje w środowisku kwaśnym z albuminami surowicy, tworząc barwny kompleks. Ilość powstałych kompleksów jest wprost proporcjonalna do stężenia albumin w badanej próbce.

Odczynniki:

Metody frakcjonowania białek

  1. Elektroforeza

    1. elektroforeza pasmowa

      • na bibule

      • na octanie celulozy

      • na żelach: skrobiowym, agarowym, agarozowym, poliakrylamidowym

  2. elektroforeza z powinowactwem

  • elektroforeza kapilarna

  • ogniskowanie izoelektryczne

  • immunoelektroforeza

  • immunofiksacja

  • Chromatografia

  • Ultrawirowanie

  • Elektroforeza

    Białka są wielkocząsteczkowymi związkami amfoterycznymi, zmieniającymi swój ładunek w zależności od pH środowiska. Każde białko ma swój punkt izoelektryczny - takie pH, przy którym dodatnie i ujemne ładunki w cząsteczce się równoważą.

    pI=4,6-7,9

    pI=2-9 - białka osocza

    pH<pI białka = kation, wędruje do katody

    pH>pI białka = anion, wędruje do anody

    Ruchliwość w polu elektrycznym opisywana jest wzorem:

    Q - stopień zjonizowania cząsteczki

    K - stała ocenia właściwości elektroosmotyczne podłoża

    r - promień cząsteczki białka

    η - lepkość roztworu, w którym zachodzi migracja (lepkość buforu)

    suma ilości stężeń i wartościowości do kwadratu

    1. Właściwe przygotowanie materiału do rozdziału

      1. surowica - rozcieńczenie stosownym buforem

      2. mocz, PMR - historycznie zagęszczenie, poprzez:

        • filtry w formie probóweczek uwzględniające średnicę białka, które chcemy zagęścić (PMR)

        • Aqvacid w woreczku dializującym zamykamy mocz, wkładamy do zlewki i zasypujemy preparatem, który odwadnia mocz (historycznie)

  • Przygotowanie aparatu do rozdziału (Backman, Cormay, Corning, Sebia)

  • Naniesienie surowic badanych na płytki wraz z kontrolą lub wzorcami

  • Przeprowadzenie rozdziału elektroforetycznego (zachowanie odpowiednich warunków czasu rozdziału)

  • Utrwalanie (kwas i alkohol) oraz suszenie ok. 25 minut

  • Barwienie (oraz fiksacja = przyklejenie białka do podłoża przez denaturację alkoholem [5% TCA] lub przez alkohol czy inny detergent zawarty w barwniku)

  • Densytometrowanie

  • Automatyczny odczyt jest korzystniejszy, bo:

    0x08 graphic

    techniki immunochemiczne na egzaminie

    Bufor

    Podłoże

    Barwnik

    Barbituranowy pH=8,6

    bibuła Wathmann (16-18 h)

    0,3% czerń amidowa

    5% błękit bromofenolowy

    TRIS pH=8,2

    octan celulozy (40 minut)

    0,3% czerń amidowy, ponseau S

    Barbituranowy

    żel agarozowy (25 minut)

    0,3% czerń amidowa, coomassie brillant blue

    TRIS

    żel poliakrylamidowy

    czerń amidowa, fuksja zasadowa, sudan czarny (lipoproteiny)

    Bibuła

    Octan celulozy

    Żel agarozowy - biały proszek polisacharydów: α-D-galaktopiranozy, α-D-dehydrogalaktopiranozy, który rozpuszcza się w buforze - odpowiednia endosmoza.

    Żel poliakrylamidowy - polimer akrylu i bisakrylamidu rozpuszczony w buforze TRIS w obecności nadsiarczanu amonu i 4-metylenodwuaminy wraz z SDS, który likwiduje ładunki. Denaturacja białka i przyłączenie siarczanów nadaje białku ładunek ujemny i przyłączenie SDS znosi ładunek warunkując wędrówkę białka tylko w zależności od masy cząsteczkowej.

    Należy wykonywać krzywą kalibracji mierząc stosunek Rf

    Prawidłowy rozdział elektroforetyczny białek surowicy krwi

    0x08 graphic
    Do elektroforezy używa się raczej surowicy, gdyż fibrynogen jako duże białko wędruje we frakcji φ znajduje się między γ a β, co może sugerować patologiczny obraz elektroforezy (białko monoklonalne).

    Z rozdziału elektroforetycznego oprócz wartości odsetkowych uzyskujemy jeszcze obraz poszczególnych frakcji.

    0x08 graphic
    Proteinogram informuje nas o:

    Elektroforeza z powinowactwem